MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 44131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017300	GTG	2	6	26851	26856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503638
502	NC_017300	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503638
503	NC_017300	CAG	3	9	26901	26909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503638
504	NC_017300	TCA	2	6	26948	26953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503638
505	NC_017300	CGG	2	6	27022	27027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503639
506	NC_017300	AAG	2	6	27089	27094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503639
507	NC_017300	TGA	2	6	27103	27108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503639
508	NC_017300	TAC	2	6	27215	27220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503639
509	NC_017300	CTG	2	6	27514	27519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503639
510	NC_017300	ACC	2	6	27549	27554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503639
511	NC_017300	GCT	2	6	27555	27560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503639
512	NC_017300	CAC	2	6	27562	27567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503639
513	NC_017300	AGTGCT	2	12	27579	27590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384503639
514	NC_017300	GAA	2	6	27606	27611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503639
515	NC_017300	AGC	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503639
516	NC_017300	AATT	2	8	27658	27665	50 %	50 %	0 %	0 %	384503639
517	NC_017300	GA	3	6	27709	27714	50 %	0 %	50 %	0 %	384503639
518	NC_017300	AGG	2	6	27756	27761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503639
519	NC_017300	CA	3	6	27783	27788	50 %	0 %	0 %	50 %	384503639
520	NC_017300	TGG	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503639
521	NC_017300	TGGA	2	8	27815	27822	25 %	25 %	50 %	0 %	384503639
522	NC_017300	CAG	2	6	27911	27916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503639
523	NC_017300	GCG	2	6	27935	27940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503639
524	NC_017300	GAAG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	384503639
525	NC_017300	GAA	2	6	28170	28175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
526	NC_017300	GGT	2	6	28221	28226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503640
527	NC_017300	GTT	2	6	28353	28358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503640
528	NC_017300	ACT	2	6	28419	28424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503640
529	NC_017300	AGA	2	6	28508	28513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
530	NC_017300	TGC	2	6	28517	28522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503640
531	NC_017300	CTGAT	2	10	28531	28540	20 %	40 %	20 %	20 %	384503640
532	NC_017300	GC	3	6	28556	28561	0 %	0 %	50 %	50 %	384503640
533	NC_017300	TCT	2	6	28603	28608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503640
534	NC_017300	GAAA	2	8	28631	28638	75 %	0 %	25 %	0 %	384503640
535	NC_017300	CTTC	2	8	28640	28647	0 %	50 %	0 %	50 %	384503640
536	NC_017300	AGAA	2	8	28672	28679	75 %	0 %	25 %	0 %	384503640
537	NC_017300	CAG	2	6	28738	28743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503640
538	NC_017300	CTT	2	6	28758	28763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503640
539	NC_017300	CAA	2	6	28796	28801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503640
540	NC_017300	TC	3	6	28803	28808	0 %	50 %	0 %	50 %	384503640
541	NC_017300	TGA	2	6	28862	28867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503640
542	NC_017300	TC	3	6	28882	28887	0 %	50 %	0 %	50 %	384503640
543	NC_017300	TCT	2	6	28921	28926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503640
544	NC_017300	GAA	2	6	28988	28993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
545	NC_017300	GAA	2	6	29006	29011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
546	NC_017300	GAC	2	6	29034	29039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503640
547	NC_017300	GAA	2	6	29085	29090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
548	NC_017300	AAG	2	6	29109	29114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503640
549	NC_017300	GCTA	2	8	29131	29138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_017300	TC	3	6	29159	29164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_017300	TAT	2	6	29177	29182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017300	CAT	2	6	29327	29332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503641
553	NC_017300	TAG	2	6	29375	29380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503641
554	NC_017300	ATG	2	6	29403	29408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503641
555	NC_017300	GGAGC	2	10	29484	29493	20 %	0 %	60 %	20 %	384503641
556	NC_017300	TA	3	6	29537	29542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017300	CGG	2	6	29711	29716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503642
558	NC_017300	TGAG	2	8	29779	29786	25 %	25 %	50 %	0 %	384503642
559	NC_017300	GCA	2	6	29812	29817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503642
560	NC_017300	TTG	2	6	29903	29908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503642
561	NC_017300	CAA	2	6	29945	29950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503642
562	NC_017300	GTAC	2	8	29980	29987	25 %	25 %	25 %	25 %	384503642
563	NC_017300	CAC	2	6	30048	30053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503642
564	NC_017300	TGA	2	6	30089	30094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503642
565	NC_017300	TTC	2	6	30177	30182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503642
566	NC_017300	CTT	2	6	30212	30217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503642
567	NC_017300	GC	3	6	30249	30254	0 %	0 %	50 %	50 %	384503642
568	NC_017300	AGA	2	6	30285	30290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503642
569	NC_017300	GTG	2	6	30307	30312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503642
570	NC_017300	T	7	7	30313	30319	0 %	100 %	0 %	0 %	384503642
571	NC_017300	TGA	2	6	30350	30355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503642
572	NC_017300	GCT	2	6	30413	30418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503642
573	NC_017300	TGC	2	6	30488	30493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503642
574	NC_017300	GCC	2	6	30522	30527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503642
575	NC_017300	TTGCT	2	10	30572	30581	0 %	60 %	20 %	20 %	384503642
576	NC_017300	GATC	2	8	30589	30596	25 %	25 %	25 %	25 %	384503642
577	NC_017300	TTC	2	6	30597	30602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503642
578	NC_017300	GTG	2	6	30712	30717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503642
579	NC_017300	AGC	2	6	30765	30770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503642
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581	NC_017300	GGA	2	6	30988	30993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503642
582	NC_017300	GA	3	6	31081	31086	50 %	0 %	50 %	0 %	384503642
583	NC_017300	TGG	2	6	31130	31135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503642
584	NC_017300	CGT	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503642
585	NC_017300	GC	3	6	31145	31150	0 %	0 %	50 %	50 %	384503642
586	NC_017300	ATC	2	6	31195	31200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503642
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589	NC_017300	CAA	2	6	31415	31420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503642
590	NC_017300	GCA	2	6	31505	31510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503642
591	NC_017300	CCT	2	6	31632	31637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503643
592	NC_017300	TGA	2	6	31719	31724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503643
593	NC_017300	GGAA	2	8	31727	31734	50 %	0 %	50 %	0 %	384503643
594	NC_017300	GGC	2	6	31788	31793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503643
595	NC_017300	AAC	2	6	31799	31804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503643
596	NC_017300	TTC	2	6	31883	31888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503643
597	NC_017300	ACT	2	6	31943	31948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503643
598	NC_017300	TCC	2	6	31961	31966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503643
599	NC_017300	CAA	2	6	31967	31972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503643
600	NC_017300	TGGC	2	8	31989	31996	0 %	25 %	50 %	25 %	384503643
601	NC_017300	TGC	2	6	32021	32026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503643
602	NC_017300	GAG	2	6	32027	32032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503643
603	NC_017300	TCC	2	6	32082	32087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503643
604	NC_017300	TTG	2	6	32095	32100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503643
605	NC_017300	GTG	2	6	32187	32192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503643
606	NC_017300	GGTT	2	8	32234	32241	0 %	50 %	50 %	0 %	384503643
607	NC_017300	CTG	2	6	32252	32257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503643
608	NC_017300	CTGA	2	8	32266	32273	25 %	25 %	25 %	25 %	384503643
609	NC_017300	GTA	2	6	32301	32306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503643
610	NC_017300	GTG	2	6	32419	32424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503643
611	NC_017300	GCC	3	9	32622	32630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503643
612	NC_017300	AGG	2	6	32679	32684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503643
613	NC_017300	AAT	2	6	32726	32731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503643
614	NC_017300	GCC	2	6	32745	32750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503643
615	NC_017300	GA	3	6	32813	32818	50 %	0 %	50 %	0 %	384503643
616	NC_017300	CAC	2	6	32821	32826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503643
617	NC_017300	GAT	2	6	32915	32920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503643
618	NC_017300	GTC	2	6	33026	33031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503643
619	NC_017300	GCC	2	6	33053	33058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503643
620	NC_017300	GTC	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503643
621	NC_017300	GC	3	6	33158	33163	0 %	0 %	50 %	50 %	384503644
622	NC_017300	GCT	2	6	33169	33174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503644
623	NC_017300	GCT	2	6	33178	33183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503644
624	NC_017300	GGC	2	6	33207	33212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503644
625	NC_017300	ACC	2	6	33219	33224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503644
626	NC_017300	TGC	2	6	33228	33233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503644
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628	NC_017300	T	6	6	33253	33258	0 %	100 %	0 %	0 %	384503644
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752	NC_017300	ATT	2	6	39333	39338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_017300	CAC	2	6	39343	39348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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