MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017290	GAA	2	6	660406	660411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452645
14003	NC_017290	AAC	2	6	660443	660448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452645
14004	NC_017290	CTTA	2	8	660451	660458	25 %	50 %	0 %	25 %	384452645
14005	NC_017290	TCT	2	6	660588	660593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452645
14006	NC_017290	TC	3	6	660635	660640	0 %	50 %	0 %	50 %	384452645
14007	NC_017290	CATC	2	8	660745	660752	25 %	25 %	0 %	50 %	384452645
14008	NC_017290	CAAA	2	8	660794	660801	75 %	0 %	0 %	25 %	384452645
14009	NC_017290	ATT	2	6	660835	660840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_017290	ATT	2	6	660864	660869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_017290	ATAA	2	8	660879	660886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_017290	TTTA	2	8	660900	660907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_017290	ATTCT	2	10	661009	661018	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14014	NC_017290	TCT	2	6	661034	661039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_017290	CATA	2	8	661040	661047	50 %	25 %	0 %	25 %	384452646
14016	NC_017290	T	6	6	661055	661060	0 %	100 %	0 %	0 %	384452646
14017	NC_017290	AAC	2	6	661071	661076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452646
14018	NC_017290	ATCAG	2	10	661134	661143	40 %	20 %	20 %	20 %	384452646
14019	NC_017290	TGA	2	6	661196	661201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452646
14020	NC_017290	CTC	2	6	661212	661217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452646
14021	NC_017290	CT	3	6	661324	661329	0 %	50 %	0 %	50 %	384452646
14022	NC_017290	CTT	2	6	661403	661408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452646
14023	NC_017290	CTT	2	6	661441	661446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452646
14024	NC_017290	TTC	2	6	661450	661455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452646
14025	NC_017290	CAGA	2	8	661471	661478	50 %	0 %	25 %	25 %	384452646
14026	NC_017290	CTT	2	6	661484	661489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452646
14027	NC_017290	TCA	2	6	661503	661508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_017290	ACA	2	6	661562	661567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_017290	ATT	2	6	661588	661593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_017290	TAT	2	6	661601	661606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_017290	AAT	2	6	661610	661615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_017290	GCT	2	6	661632	661637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_017290	GTC	2	6	661763	661768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_017290	A	6	6	661780	661785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_017290	AG	3	6	661797	661802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_017290	TA	3	6	661853	661858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_017290	AAATAC	2	12	661864	661875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14038	NC_017290	ATA	2	6	661915	661920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452647
14039	NC_017290	TGA	2	6	662024	662029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452647
14040	NC_017290	ATT	2	6	662058	662063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452647
14041	NC_017290	GT	3	6	662122	662127	0 %	50 %	50 %	0 %	384452647
14042	NC_017290	AAT	2	6	662186	662191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452647
14043	NC_017290	TCA	2	6	662260	662265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452647
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14045	NC_017290	TGC	2	6	662303	662308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452647
14046	NC_017290	AACTG	2	10	662338	662347	40 %	20 %	20 %	20 %	384452647
14047	NC_017290	A	6	6	662364	662369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_017290	AAT	2	6	662381	662386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_017290	TTA	2	6	662404	662409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14050	NC_017290	TAA	2	6	662426	662431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_017290	CAATCT	2	12	662450	662461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_017290	TAG	2	6	662464	662469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_017290	CATT	2	8	662479	662486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14054	NC_017290	TAA	2	6	662517	662522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452648
14055	NC_017290	TAA	2	6	662529	662534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452648
14056	NC_017290	CAA	2	6	662552	662557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452648
14057	NC_017290	TTCCG	2	10	662575	662584	0 %	40 %	20 %	40 %	384452648
14058	NC_017290	A	6	6	662683	662688	100 %	0 %	0 %	0 %	384452648
14059	NC_017290	GAT	2	6	662799	662804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452648
14060	NC_017290	TTAGGG	2	12	662812	662823	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384452648
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14063	NC_017290	GAA	2	6	662874	662879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452648
14064	NC_017290	CTG	3	9	662889	662897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452648
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14071	NC_017290	TAG	2	6	663203	663208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452648
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14075	NC_017290	TAT	2	6	663372	663377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_017290	TGA	2	6	663380	663385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14094	NC_017290	AC	3	6	664209	664214	50 %	0 %	0 %	50 %	384452650
14095	NC_017290	CTT	2	6	664300	664305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452650
14096	NC_017290	T	6	6	664304	664309	0 %	100 %	0 %	0 %	384452650
14097	NC_017290	A	6	6	664496	664501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_017290	TCTTA	2	10	664546	664555	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14099	NC_017290	CA	3	6	664563	664568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14100	NC_017290	AAATA	2	10	664577	664586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14101	NC_017290	A	7	7	664586	664592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_017290	T	6	6	664609	664614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_017290	AAG	2	6	664620	664625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_017290	CT	4	8	664631	664638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_017290	A	6	6	664680	664685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14106	NC_017290	TCATTC	2	12	664699	664710	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_017290	AGAA	2	8	664716	664723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_017290	T	7	7	664793	664799	0 %	100 %	0 %	0 %	384452651
14109	NC_017290	ATT	2	6	664829	664834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452651
14110	NC_017290	GCAT	2	8	664923	664930	25 %	25 %	25 %	25 %	384452651
14111	NC_017290	TTCT	2	8	664931	664938	0 %	75 %	0 %	25 %	384452651
14112	NC_017290	TTTGG	2	10	664954	664963	0 %	60 %	40 %	0 %	384452651
14113	NC_017290	TC	3	6	664984	664989	0 %	50 %	0 %	50 %	384452651
14114	NC_017290	TGT	2	6	665063	665068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452651
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14119	NC_017290	TTA	2	6	665181	665186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452651
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14121	NC_017290	CTT	2	6	665255	665260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452651
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14123	NC_017290	TTG	2	6	665296	665301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452651
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14125	NC_017290	GGA	2	6	665316	665321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384452651
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14496	NC_017290	CGT	2	6	683349	683354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452667
14497	NC_017290	TCAA	2	8	683358	683365	50 %	25 %	0 %	25 %	384452667
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14499	NC_017290	CTCA	2	8	683603	683610	25 %	25 %	0 %	50 %	384452667
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