MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 24908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017290	CTC	2	6	544206	544211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452551
11503	NC_017290	CAT	2	6	544258	544263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452551
11504	NC_017290	AAT	2	6	544315	544320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452551
11505	NC_017290	CAA	2	6	544365	544370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452551
11506	NC_017290	ATGCT	2	10	544373	544382	20 %	40 %	20 %	20 %	384452551
11507	NC_017290	ATG	2	6	544442	544447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452551
11508	NC_017290	CTAT	2	8	544466	544473	25 %	50 %	0 %	25 %	384452551
11509	NC_017290	GTA	2	6	544475	544480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452551
11510	NC_017290	CAT	2	6	544497	544502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452551
11511	NC_017290	TAC	2	6	544642	544647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452551
11512	NC_017290	GTAG	2	8	544714	544721	25 %	25 %	50 %	0 %	384452551
11513	NC_017290	TGGA	2	8	544795	544802	25 %	25 %	50 %	0 %	384452551
11514	NC_017290	AAT	2	6	544853	544858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452551
11515	NC_017290	TTGAGC	2	12	544933	544944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384452551
11516	NC_017290	ATA	2	6	544955	544960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452551
11517	NC_017290	TAA	2	6	545095	545100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384452551
11518	NC_017290	TCA	2	6	545189	545194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452552
11519	NC_017290	TCA	2	6	545210	545215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452552
11520	NC_017290	TCG	2	6	545252	545257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452552
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11522	NC_017290	T	7	7	545305	545311	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11523	NC_017290	CTT	2	6	545313	545318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452552
11524	NC_017290	TTGGT	2	10	545345	545354	0 %	60 %	40 %	0 %	384452552
11525	NC_017290	GTA	2	6	545365	545370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452552
11526	NC_017290	T	6	6	545414	545419	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11527	NC_017290	TTC	2	6	545425	545430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384452552
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11530	NC_017290	TAT	2	6	545478	545483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384452552
11531	NC_017290	GAC	2	6	545489	545494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384452552
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11533	NC_017290	T	6	6	545508	545513	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11534	NC_017290	T	6	6	545519	545524	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11535	NC_017290	TGT	2	6	545531	545536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384452552
11536	NC_017290	T	6	6	545563	545568	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11537	NC_017290	AAC	2	6	545589	545594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384452552
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11539	NC_017290	TGC	2	6	545651	545656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452552
11540	NC_017290	T	6	6	545701	545706	0 %	100 %	0 %	0 %	384452552
11541	NC_017290	CT	4	8	545759	545766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11543	NC_017290	CCT	2	6	545824	545829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384452553
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11550	NC_017290	AGT	2	6	546162	546167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452553
11551	NC_017290	AG	3	6	546306	546311	50 %	0 %	50 %	0 %	384452553
11552	NC_017290	GGTA	2	8	546323	546330	25 %	25 %	50 %	0 %	384452553
11553	NC_017290	CCA	2	6	546331	546336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384452553
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11555	NC_017290	GTA	2	6	546376	546381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384452553
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11591	NC_017290	A	7	7	548323	548329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_017290	TA	3	6	548406	548411	50 %	50 %	0 %	0 %	384452554
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11601	NC_017290	TAAAA	2	10	549018	549027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_017290	T	6	6	549062	549067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_017290	TTTA	2	8	549069	549076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11605	NC_017290	A	6	6	549138	549143	100 %	0 %	0 %	0 %	384452555
11606	NC_017290	AAAG	2	8	549215	549222	75 %	0 %	25 %	0 %	384452555
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11612	NC_017290	GCT	2	6	549425	549430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384452555
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11739	NC_017290	T	7	7	555221	555227	0 %	100 %	0 %	0 %	384452560
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11986	NC_017290	AAG	2	6	565445	565450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384452568
11987	NC_017290	TAC	2	6	565492	565497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384452568
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