MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 24915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017289	GTC	2	6	118931	118936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451219
2502	NC_017289	TGC	2	6	118943	118948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451219
2503	NC_017289	GT	3	6	119010	119015	0 %	50 %	50 %	0 %	384451219
2504	NC_017289	GTT	2	6	119076	119081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451219
2505	NC_017289	GAG	2	6	119159	119164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_017289	TTTAC	2	10	119191	119200	20 %	60 %	0 %	20 %	384451220
2507	NC_017289	AGTC	2	8	119220	119227	25 %	25 %	25 %	25 %	384451220
2508	NC_017289	ATG	2	6	119231	119236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451220
2509	NC_017289	AG	4	8	119296	119303	50 %	0 %	50 %	0 %	384451220
2510	NC_017289	ATT	2	6	119369	119374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451220
2511	NC_017289	AGA	2	6	119428	119433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2512	NC_017289	ATC	2	6	119444	119449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451220
2513	NC_017289	TTA	2	6	119468	119473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451220
2514	NC_017289	ATT	2	6	119518	119523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451220
2515	NC_017289	TGG	2	6	119566	119571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451220
2516	NC_017289	AAG	2	6	119604	119609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2517	NC_017289	TAC	2	6	119707	119712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451220
2518	NC_017289	CGT	2	6	119779	119784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451220
2519	NC_017289	AGA	2	6	119803	119808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2520	NC_017289	AAG	2	6	119883	119888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2521	NC_017289	A	6	6	119937	119942	100 %	0 %	0 %	0 %	384451220
2522	NC_017289	GAA	2	6	119950	119955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2523	NC_017289	GAA	2	6	119966	119971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451220
2524	NC_017289	TTC	2	6	120006	120011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451220
2525	NC_017289	AGTT	2	8	120015	120022	25 %	50 %	25 %	0 %	384451220
2526	NC_017289	TTA	2	6	120105	120110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451220
2527	NC_017289	A	6	6	120249	120254	100 %	0 %	0 %	0 %	384451220
2528	NC_017289	AGAA	2	8	120322	120329	75 %	0 %	25 %	0 %	384451221
2529	NC_017289	CCA	2	6	120396	120401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451221
2530	NC_017289	AGAA	2	8	120402	120409	75 %	0 %	25 %	0 %	384451221
2531	NC_017289	ACT	2	6	120415	120420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451221
2532	NC_017289	CGT	2	6	120442	120447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451221
2533	NC_017289	GAT	2	6	120459	120464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451221
2534	NC_017289	AAG	2	6	120548	120553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451221
2535	NC_017289	GGT	2	6	120568	120573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451221
2536	NC_017289	TGG	2	6	120654	120659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451221
2537	NC_017289	TAT	2	6	120714	120719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451221
2538	NC_017289	T	8	8	120743	120750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_017289	ACT	2	6	120760	120765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_017289	TTC	2	6	120845	120850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451222
2541	NC_017289	CAG	2	6	120937	120942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451222
2542	NC_017289	TTG	2	6	120967	120972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451222
2543	NC_017289	A	6	6	121077	121082	100 %	0 %	0 %	0 %	384451222
2544	NC_017289	TAC	2	6	121229	121234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451222
2545	NC_017289	AGA	2	6	121283	121288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451222
2546	NC_017289	ACC	2	6	121299	121304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451222
2547	NC_017289	CGC	2	6	121310	121315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384451222
2548	NC_017289	CA	3	6	121322	121327	50 %	0 %	0 %	50 %	384451222
2549	NC_017289	A	7	7	121349	121355	100 %	0 %	0 %	0 %	384451222
2550	NC_017289	GAA	2	6	121539	121544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451222
2551	NC_017289	GTT	2	6	121554	121559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451222
2552	NC_017289	AAG	2	6	121561	121566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451222
2553	NC_017289	AAG	2	6	121609	121614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451222
2554	NC_017289	TCT	2	6	121620	121625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451222
2555	NC_017289	TTC	2	6	121646	121651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451222
2556	NC_017289	TTA	2	6	121752	121757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451222
2557	NC_017289	TAAA	2	8	121778	121785	75 %	25 %	0 %	0 %	384451222
2558	NC_017289	AGC	2	6	121876	121881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451223
2559	NC_017289	TGT	2	6	121898	121903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451223
2560	NC_017289	T	6	6	121940	121945	0 %	100 %	0 %	0 %	384451223
2561	NC_017289	CTG	2	6	121981	121986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451223
2562	NC_017289	AATTA	2	10	122084	122093	60 %	40 %	0 %	0 %	384451223
2563	NC_017289	AGC	2	6	122099	122104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451223
2564	NC_017289	GAA	2	6	122121	122126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2565	NC_017289	CTC	2	6	122155	122160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451223
2566	NC_017289	CTG	2	6	122170	122175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451223
2567	NC_017289	CTC	2	6	122182	122187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451223
2568	NC_017289	AGA	2	6	122239	122244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2569	NC_017289	A	7	7	122259	122265	100 %	0 %	0 %	0 %	384451223
2570	NC_017289	TAA	2	6	122267	122272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451223
2571	NC_017289	AGT	2	6	122285	122290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451223
2572	NC_017289	ATC	2	6	122294	122299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451223
2573	NC_017289	ATT	2	6	122307	122312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451223
2574	NC_017289	GAA	2	6	122325	122330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2575	NC_017289	GAA	2	6	122337	122342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2576	NC_017289	AAAT	2	8	122351	122358	75 %	25 %	0 %	0 %	384451223
2577	NC_017289	AGA	2	6	122368	122373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2578	NC_017289	ATT	2	6	122381	122386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451223
2579	NC_017289	CCT	2	6	122388	122393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451223
2580	NC_017289	AATT	2	8	122401	122408	50 %	50 %	0 %	0 %	384451223
2581	NC_017289	ATT	2	6	122535	122540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451223
2582	NC_017289	GAA	3	9	122547	122555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2583	NC_017289	CTT	2	6	122593	122598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451223
2584	NC_017289	AGA	2	6	122606	122611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451223
2585	NC_017289	TCT	2	6	122644	122649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_017289	AGT	2	6	122675	122680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_017289	T	6	6	122711	122716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017289	ATTT	2	8	122760	122767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017289	AAT	2	6	122772	122777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_017289	ATT	2	6	122792	122797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_017289	TGG	2	6	122805	122810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_017289	CTTTT	2	10	122882	122891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2593	NC_017289	AAAG	2	8	122935	122942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_017289	T	6	6	122951	122956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_017289	T	6	6	122969	122974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_017289	T	6	6	123022	123027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_017289	TTTCTT	2	12	123040	123051	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2598	NC_017289	TAAT	2	8	123104	123111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_017289	GCG	2	6	123130	123135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384451224
2600	NC_017289	TTC	3	9	123193	123201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451224
2601	NC_017289	AT	3	6	123215	123220	50 %	50 %	0 %	0 %	384451224
2602	NC_017289	AAC	2	6	123324	123329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451224
2603	NC_017289	AGCA	2	8	123354	123361	50 %	0 %	25 %	25 %	384451224
2604	NC_017289	TCCT	2	8	123363	123370	0 %	50 %	0 %	50 %	384451224
2605	NC_017289	AGAA	2	8	123420	123427	75 %	0 %	25 %	0 %	384451224
2606	NC_017289	GAGAT	2	10	123438	123447	40 %	20 %	40 %	0 %	384451224
2607	NC_017289	ACA	2	6	123493	123498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451224
2608	NC_017289	CAA	2	6	123518	123523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451224
2609	NC_017289	TGA	2	6	123547	123552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451224
2610	NC_017289	CAA	2	6	123581	123586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451224
2611	NC_017289	AAG	2	6	123747	123752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451224
2612	NC_017289	TAC	2	6	123782	123787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451224
2613	NC_017289	AGA	3	9	123852	123860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451224
2614	NC_017289	TTG	2	6	123885	123890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451224
2615	NC_017289	TA	4	8	124061	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_017289	TTG	2	6	124199	124204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451225
2617	NC_017289	AGC	2	6	124205	124210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451225
2618	NC_017289	AGC	2	6	124283	124288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451225
2619	NC_017289	GAG	2	6	124400	124405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451225
2620	NC_017289	GCT	3	9	124417	124425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451225
2621	NC_017289	AG	3	6	124469	124474	50 %	0 %	50 %	0 %	384451225
2622	NC_017289	TGT	2	6	124476	124481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451225
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2999	NC_017289	G	6	6	143021	143026	0 %	0 %	100 %	0 %	384451241
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