MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 24915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017289	GTCC	2	8	236268	236275	0 %	25 %	25 %	50 %	384451325
5002	NC_017289	GTCT	2	8	236286	236293	0 %	50 %	25 %	25 %	384451325
5003	NC_017289	T	6	6	236293	236298	0 %	100 %	0 %	0 %	384451325
5004	NC_017289	GAA	2	6	236439	236444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451325
5005	NC_017289	ACA	2	6	236469	236474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451325
5006	NC_017289	CAA	2	6	236476	236481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451325
5007	NC_017289	ACT	2	6	236489	236494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451325
5008	NC_017289	TCT	2	6	236504	236509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451325
5009	NC_017289	TTA	2	6	236520	236525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451325
5010	NC_017289	GTA	2	6	236527	236532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451325
5011	NC_017289	TC	4	8	236539	236546	0 %	50 %	0 %	50 %	384451325
5012	NC_017289	ATC	2	6	236563	236568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451325
5013	NC_017289	TCT	2	6	236685	236690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451325
5014	NC_017289	TG	4	8	236703	236710	0 %	50 %	50 %	0 %	384451325
5015	NC_017289	TC	4	8	236795	236802	0 %	50 %	0 %	50 %	384451325
5016	NC_017289	CTT	2	6	236862	236867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451325
5017	NC_017289	ATG	2	6	236877	236882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451325
5018	NC_017289	TGT	2	6	236912	236917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451325
5019	NC_017289	TGG	2	6	236941	236946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451325
5020	NC_017289	AG	3	6	237008	237013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017289	AT	3	6	237078	237083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017289	CTA	2	6	237187	237192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_017289	CGA	2	6	237425	237430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5024	NC_017289	TGC	2	6	237436	237441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5025	NC_017289	T	6	6	237520	237525	0 %	100 %	0 %	0 %	384451326
5026	NC_017289	AAC	3	9	237595	237603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451326
5027	NC_017289	T	6	6	237610	237615	0 %	100 %	0 %	0 %	384451326
5028	NC_017289	GTT	2	6	237616	237621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451326
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5030	NC_017289	TGC	2	6	237683	237688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5031	NC_017289	CTT	2	6	237702	237707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451326
5032	NC_017289	ACT	2	6	237754	237759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451326
5033	NC_017289	CTTT	2	8	237779	237786	0 %	75 %	0 %	25 %	384451326
5034	NC_017289	TGC	2	6	237871	237876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5035	NC_017289	CATC	2	8	237906	237913	25 %	25 %	0 %	50 %	384451326
5036	NC_017289	GCT	2	6	237923	237928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5037	NC_017289	CTT	2	6	237984	237989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451326
5038	NC_017289	CGA	2	6	238040	238045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451326
5039	NC_017289	CATG	2	8	238164	238171	25 %	25 %	25 %	25 %	384451326
5040	NC_017289	CTTG	2	8	238182	238189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_017289	GAAT	2	8	238233	238240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017289	GAA	3	9	238247	238255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017289	T	6	6	238270	238275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017289	AAG	2	6	238279	238284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017289	T	7	7	238294	238300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017289	AAG	2	6	238333	238338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_017289	ACC	2	6	238352	238357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5048	NC_017289	AATT	2	8	238372	238379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017289	GAT	2	6	238413	238418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017289	TTTC	2	8	238472	238479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_017289	GTT	2	6	238500	238505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017289	A	8	8	238540	238547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017289	AGA	2	6	238582	238587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017289	GAG	2	6	238668	238673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451327
5055	NC_017289	T	6	6	238728	238733	0 %	100 %	0 %	0 %	384451327
5056	NC_017289	GTT	2	6	238784	238789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451327
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5058	NC_017289	AGC	2	6	238844	238849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451327
5059	NC_017289	TTG	2	6	238852	238857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451327
5060	NC_017289	CTC	2	6	238941	238946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451327
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5062	NC_017289	T	6	6	238992	238997	0 %	100 %	0 %	0 %	384451327
5063	NC_017289	AGA	2	6	239144	239149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451327
5064	NC_017289	GATT	2	8	239155	239162	25 %	50 %	25 %	0 %	384451327
5065	NC_017289	GCA	2	6	239188	239193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451327
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5071	NC_017289	T	7	7	239628	239634	0 %	100 %	0 %	0 %	384451327
5072	NC_017289	ATTATA	2	12	239714	239725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017289	A	6	6	239749	239754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017289	CTT	2	6	239786	239791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017289	TAT	2	6	239813	239818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_017289	ATAA	2	8	239854	239861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017289	GA	3	6	239896	239901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017289	A	6	6	239931	239936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017289	GCA	2	6	239949	239954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017289	GCA	2	6	239959	239964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_017289	CAA	2	6	240017	240022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_017289	GCTT	2	8	240032	240039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_017289	TTC	2	6	240075	240080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017289	TAAAA	2	10	240131	240140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017289	T	6	6	240175	240180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_017289	A	6	6	240441	240446	100 %	0 %	0 %	0 %	384451328
5090	NC_017289	TAG	2	6	240547	240552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451328
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5092	NC_017289	AAAT	2	8	240670	240677	75 %	25 %	0 %	0 %	384451328
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5096	NC_017289	GTTT	2	8	240903	240910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017289	TAG	2	6	240971	240976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017289	A	7	7	241063	241069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017289	AG	3	6	241105	241110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017289	TAT	2	6	241121	241126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017289	TCAT	2	8	241133	241140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_017289	ATA	2	6	241148	241153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017289	CGT	2	6	241169	241174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451329
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5107	NC_017289	GAG	2	6	241305	241310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451329
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5109	NC_017289	TTCAG	2	10	241359	241368	20 %	40 %	20 %	20 %	384451329
5110	NC_017289	TTG	2	6	241434	241439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451329
5111	NC_017289	CAT	2	6	241551	241556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451329
5112	NC_017289	ATT	2	6	241561	241566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
5113	NC_017289	GTTT	2	8	241672	241679	0 %	75 %	25 %	0 %	384451329
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5115	NC_017289	TG	3	6	241756	241761	0 %	50 %	50 %	0 %	384451329
5116	NC_017289	ATT	2	6	241796	241801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451329
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5122	NC_017289	TTG	2	6	241973	241978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451329
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5125	NC_017289	ATG	2	6	242110	242115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451329
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5499	NC_017289	TTTAA	2	10	260011	260020	40 %	60 %	0 %	0 %	384451349
5500	NC_017289	ATC	2	6	260040	260045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451349

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