MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 24915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017289	AAAG	2	8	210759	210766	75 %	0 %	25 %	0 %	384451302
4502	NC_017289	TTG	2	6	210858	210863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451302
4503	NC_017289	CTC	2	6	210893	210898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451302
4504	NC_017289	CTAA	2	8	210917	210924	50 %	25 %	0 %	25 %	384451302
4505	NC_017289	GTC	2	6	211081	211086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_017289	T	6	6	211170	211175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_017289	AAT	2	6	211267	211272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451303
4508	NC_017289	AAGC	2	8	211282	211289	50 %	0 %	25 %	25 %	384451303
4509	NC_017289	ATT	2	6	211327	211332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451303
4510	NC_017289	AAG	2	6	211353	211358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451303
4511	NC_017289	GTT	2	6	211375	211380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451303
4512	NC_017289	GTA	2	6	211433	211438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451303
4513	NC_017289	GA	3	6	211467	211472	50 %	0 %	50 %	0 %	384451303
4514	NC_017289	GTAG	2	8	211754	211761	25 %	25 %	50 %	0 %	384451304
4515	NC_017289	TGA	2	6	211768	211773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451304
4516	NC_017289	TTG	2	6	211800	211805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451304
4517	NC_017289	AT	3	6	211828	211833	50 %	50 %	0 %	0 %	384451304
4518	NC_017289	TTC	2	6	211839	211844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451304
4519	NC_017289	GTTT	2	8	211879	211886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_017289	T	6	6	211898	211903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_017289	GGT	2	6	212080	212085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451305
4522	NC_017289	GAA	2	6	212205	212210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451305
4523	NC_017289	GTT	2	6	212311	212316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451305
4524	NC_017289	AGG	2	6	212331	212336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451305
4525	NC_017289	ATT	2	6	212487	212492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451305
4526	NC_017289	ATT	2	6	212691	212696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451305
4527	NC_017289	GTT	2	6	212697	212702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451305
4528	NC_017289	TCC	2	6	212731	212736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451305
4529	NC_017289	AGA	3	9	212739	212747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451305
4530	NC_017289	TGA	2	6	212829	212834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451305
4531	NC_017289	TTG	2	6	212999	213004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451306
4532	NC_017289	ATC	2	6	213079	213084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451306
4533	NC_017289	TGC	2	6	213195	213200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451306
4534	NC_017289	GAAG	2	8	213212	213219	50 %	0 %	50 %	0 %	384451306
4535	NC_017289	CAT	2	6	213249	213254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451306
4536	NC_017289	AT	3	6	213253	213258	50 %	50 %	0 %	0 %	384451306
4537	NC_017289	AAAG	2	8	213274	213281	75 %	0 %	25 %	0 %	384451306
4538	NC_017289	TAC	2	6	213300	213305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451306
4539	NC_017289	GGT	2	6	213354	213359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451306
4540	NC_017289	ATA	2	6	213430	213435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451306
4541	NC_017289	TCT	2	6	213478	213483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451306
4542	NC_017289	CATA	2	8	213551	213558	50 %	25 %	0 %	25 %	384451306
4543	NC_017289	CCT	2	6	213610	213615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451306
4544	NC_017289	ATGT	2	8	213667	213674	25 %	50 %	25 %	0 %	384451306
4545	NC_017289	ACA	2	6	213679	213684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451306
4546	NC_017289	GCC	2	6	213709	213714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384451306
4547	NC_017289	AAG	2	6	213719	213724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451306
4548	NC_017289	A	7	7	213753	213759	100 %	0 %	0 %	0 %	384451306
4549	NC_017289	T	7	7	213777	213783	0 %	100 %	0 %	0 %	384451307
4550	NC_017289	TTG	2	6	213814	213819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451307
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4552	NC_017289	ATG	2	6	213884	213889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451307
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4554	NC_017289	AGAT	2	8	214061	214068	50 %	25 %	25 %	0 %	384451307
4555	NC_017289	AGAA	2	8	214184	214191	75 %	0 %	25 %	0 %	384451307
4556	NC_017289	GAAAA	2	10	214213	214222	80 %	0 %	20 %	0 %	384451307
4557	NC_017289	TGC	2	6	214236	214241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451307
4558	NC_017289	T	7	7	214268	214274	0 %	100 %	0 %	0 %	384451307
4559	NC_017289	GTA	2	6	214305	214310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451307
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4574	NC_017289	T	6	6	215009	215014	0 %	100 %	0 %	0 %	384451308
4575	NC_017289	T	7	7	215042	215048	0 %	100 %	0 %	0 %	384451308
4576	NC_017289	T	6	6	215103	215108	0 %	100 %	0 %	0 %	384451308
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4580	NC_017289	TGA	2	6	215330	215335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_017289	TAA	2	6	215367	215372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_017289	T	6	6	215400	215405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4586	NC_017289	CT	3	6	215582	215587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_017289	T	6	6	215610	215615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_017289	T	6	6	215673	215678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_017289	T	6	6	215719	215724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017289	A	6	6	215770	215775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_017289	AG	3	6	215809	215814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_017289	TC	3	6	215868	215873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_017289	GAA	2	6	215911	215916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451309
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4596	NC_017289	GT	3	6	216130	216135	0 %	50 %	50 %	0 %	384451309
4597	NC_017289	GACA	2	8	216167	216174	50 %	0 %	25 %	25 %	384451309
4598	NC_017289	AG	3	6	216196	216201	50 %	0 %	50 %	0 %	384451309
4599	NC_017289	CTC	2	6	216253	216258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451309
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4605	NC_017289	AAG	2	6	216556	216561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451310
4606	NC_017289	GAAAG	2	10	216577	216586	60 %	0 %	40 %	0 %	384451310
4607	NC_017289	TAT	2	6	216665	216670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451310
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4609	NC_017289	ATTT	2	8	216748	216755	25 %	75 %	0 %	0 %	384451310
4610	NC_017289	TCA	2	6	216860	216865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451310
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4612	NC_017289	ACTC	2	8	216957	216964	25 %	25 %	0 %	50 %	384451310
4613	NC_017289	TTA	2	6	217051	217056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451310
4614	NC_017289	TGT	2	6	217109	217114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451310
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4616	NC_017289	TAG	2	6	217298	217303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451310
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4619	NC_017289	AGAA	2	8	217854	217861	75 %	0 %	25 %	0 %	384451311
4620	NC_017289	TTG	2	6	217866	217871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451311
4621	NC_017289	CAAC	2	8	217921	217928	50 %	0 %	0 %	50 %	384451311
4622	NC_017289	TTC	2	6	218260	218265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451311
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4626	NC_017289	GA	3	6	218383	218388	50 %	0 %	50 %	0 %	384451311
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4999	NC_017289	T	7	7	236145	236151	0 %	100 %	0 %	0 %	384451325
5000	NC_017289	GC	3	6	236216	236221	0 %	0 %	50 %	50 %	384451325

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