MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 115447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359320
2	NC_017179	T	6	6	76	81	0 %	100 %	0 %	0 %	384359320
3	NC_017179	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359320
4	NC_017179	A	7	7	210	216	100 %	0 %	0 %	0 %	384359320
5	NC_017179	TGC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384359320
6	NC_017179	GTTGCA	2	12	376	387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384359320
7	NC_017179	T	7	7	416	422	0 %	100 %	0 %	0 %	384359320
8	NC_017179	GGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359320
9	NC_017179	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	384359320
10	NC_017179	TCA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359320
11	NC_017179	A	8	8	488	495	100 %	0 %	0 %	0 %	384359320
12	NC_017179	AGT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359320
13	NC_017179	TTC	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
14	NC_017179	GAA	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
15	NC_017179	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	384359320
16	NC_017179	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359320
17	NC_017179	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	384359320
18	NC_017179	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
19	NC_017179	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	384359320
20	NC_017179	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
21	NC_017179	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	384359320
22	NC_017179	AT	3	6	882	887	50 %	50 %	0 %	0 %	384359320
23	NC_017179	A	6	6	891	896	100 %	0 %	0 %	0 %	384359320
24	NC_017179	TTC	2	6	951	956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
25	NC_017179	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359320
26	NC_017179	GAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
27	NC_017179	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
28	NC_017179	A	7	7	1105	1111	100 %	0 %	0 %	0 %	384359320
29	NC_017179	CG	3	6	1157	1162	0 %	0 %	50 %	50 %	384359320
30	NC_017179	ACA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359320
31	NC_017179	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
32	NC_017179	GAA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
33	NC_017179	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017179	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017179	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017179	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017179	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017179	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017179	TA	4	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017179	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017179	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359321
42	NC_017179	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	384359321
43	NC_017179	GAATTG	2	12	1599	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
44	NC_017179	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359321
45	NC_017179	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359321
46	NC_017179	AGA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
47	NC_017179	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
48	NC_017179	TGT	3	9	1759	1767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
49	NC_017179	TTG	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
50	NC_017179	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359321
51	NC_017179	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359321
52	NC_017179	GAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
53	NC_017179	TA	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	384359321
54	NC_017179	A	6	6	1963	1968	100 %	0 %	0 %	0 %	384359321
55	NC_017179	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
56	NC_017179	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
57	NC_017179	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	384359321
58	NC_017179	TAG	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
59	NC_017179	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
60	NC_017179	A	7	7	2214	2220	100 %	0 %	0 %	0 %	384359321
61	NC_017179	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	384359321
62	NC_017179	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359321
63	NC_017179	A	6	6	2288	2293	100 %	0 %	0 %	0 %	384359321
64	NC_017179	CAG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359321
65	NC_017179	TTAAA	2	10	2322	2331	60 %	40 %	0 %	0 %	384359321
66	NC_017179	AG	4	8	2356	2363	50 %	0 %	50 %	0 %	384359321
67	NC_017179	A	7	7	2385	2391	100 %	0 %	0 %	0 %	384359321
68	NC_017179	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
69	NC_017179	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359321
70	NC_017179	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
71	NC_017179	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	384359321
72	NC_017179	ATC	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359321
73	NC_017179	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	384359321
74	NC_017179	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017179	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359322
76	NC_017179	AT	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	384359322
77	NC_017179	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359322
78	NC_017179	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359322
79	NC_017179	ATG	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359322
80	NC_017179	AAG	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359322
81	NC_017179	A	6	6	2951	2956	100 %	0 %	0 %	0 %	384359322
82	NC_017179	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	384359322
83	NC_017179	A	7	7	3010	3016	100 %	0 %	0 %	0 %	384359322
84	NC_017179	TTG	2	6	3111	3116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359323
85	NC_017179	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
86	NC_017179	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	384359323
87	NC_017179	GGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359323
88	NC_017179	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
89	NC_017179	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
90	NC_017179	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
91	NC_017179	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359323
92	NC_017179	TGT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359323
93	NC_017179	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	384359323
94	NC_017179	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	384359323
95	NC_017179	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
96	NC_017179	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
97	NC_017179	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
98	NC_017179	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
99	NC_017179	TTATAT	2	12	3586	3597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
100	NC_017179	A	6	6	3616	3621	100 %	0 %	0 %	0 %	384359323
101	NC_017179	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	384359323
102	NC_017179	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
103	NC_017179	TGA	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
104	NC_017179	TA	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	384359323
105	NC_017179	AT	3	6	3828	3833	50 %	50 %	0 %	0 %	384359323
106	NC_017179	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359323
107	NC_017179	TAA	2	6	3921	3926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
108	NC_017179	A	6	6	3925	3930	100 %	0 %	0 %	0 %	384359323
109	NC_017179	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359323
110	NC_017179	GAT	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
111	NC_017179	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
112	NC_017179	A	7	7	4061	4067	100 %	0 %	0 %	0 %	384359323
113	NC_017179	TGA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
114	NC_017179	A	7	7	4077	4083	100 %	0 %	0 %	0 %	384359323
115	NC_017179	TTA	2	6	4116	4121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
116	NC_017179	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359323
117	NC_017179	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	384359324
118	NC_017179	GTA	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
119	NC_017179	ATA	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359324
120	NC_017179	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	384359324
121	NC_017179	AGG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359324
122	NC_017179	GGA	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359324
123	NC_017179	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	384359324
124	NC_017179	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	384359324
125	NC_017179	AT	3	6	4559	4564	50 %	50 %	0 %	0 %	384359324
126	NC_017179	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
127	NC_017179	TGA	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
128	NC_017179	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	384359324
129	NC_017179	A	6	6	4776	4781	100 %	0 %	0 %	0 %	384359324
130	NC_017179	GGT	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384359324
131	NC_017179	AT	3	6	4816	4821	50 %	50 %	0 %	0 %	384359324
132	NC_017179	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	384359324
133	NC_017179	ATG	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
134	NC_017179	TA	3	6	4868	4873	50 %	50 %	0 %	0 %	384359324
135	NC_017179	TGA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
136	NC_017179	TTGTT	2	10	4891	4900	0 %	80 %	20 %	0 %	384359324
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