MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 9450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TTTA	2	8	3	10	25 %	75 %	0 %	0 %	384359038
2	NC_017177	AAT	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359038
3	NC_017177	TTG	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359038
4	NC_017177	AT	3	6	169	174	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
5	NC_017177	AT	4	8	189	196	50 %	50 %	0 %	0 %	384359038
6	NC_017177	T	7	7	210	216	0 %	100 %	0 %	0 %	384359038
7	NC_017177	A	6	6	269	274	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
8	NC_017177	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
9	NC_017177	AGA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
10	NC_017177	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359039
11	NC_017177	A	6	6	354	359	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
12	NC_017177	A	6	6	371	376	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
13	NC_017177	AT	5	10	380	389	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
14	NC_017177	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
15	NC_017177	A	7	7	408	414	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
16	NC_017177	TAT	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
17	NC_017177	TAA	3	9	438	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
18	NC_017177	ATT	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
19	NC_017177	T	6	6	454	459	0 %	100 %	0 %	0 %	384359039
20	NC_017177	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
21	NC_017177	ATT	2	6	497	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
22	NC_017177	TA	3	6	533	538	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
23	NC_017177	TTTG	2	8	540	547	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
24	NC_017177	A	7	7	556	562	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
25	NC_017177	TGTT	2	8	606	613	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
26	NC_017177	TA	3	6	668	673	50 %	50 %	0 %	0 %	384359039
27	NC_017177	A	7	7	675	681	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
28	NC_017177	AATA	2	8	717	724	75 %	25 %	0 %	0 %	384359039
29	NC_017177	AAG	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
30	NC_017177	TAA	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
31	NC_017177	ATTT	2	8	935	942	25 %	75 %	0 %	0 %	384359039
32	NC_017177	A	6	6	979	984	100 %	0 %	0 %	0 %	384359039
33	NC_017177	TGTT	2	8	1010	1017	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
34	NC_017177	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
35	NC_017177	TTA	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017177	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017177	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017177	ATCAGA	2	12	1126	1137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017177	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017177	GAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017177	TCT	2	6	1153	1158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017177	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017177	AAGA	2	8	1184	1191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017177	TCTA	2	8	1210	1217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017177	ATTT	2	8	1218	1225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017177	TTTA	2	8	1261	1268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017177	TCT	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017177	CTC	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017177	T	7	7	1334	1340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017177	TA	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017177	T	6	6	1416	1421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017177	CAT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017177	ATT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017177	TCAA	2	8	1514	1521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017177	TTC	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017177	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017177	CATA	2	8	1591	1598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017177	ATAG	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017177	TTA	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017177	AAG	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017177	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017177	TATT	2	8	1698	1705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017177	TCCT	2	8	1748	1755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017177	TAT	2	6	1763	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017177	TAAA	2	8	1773	1780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017177	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017177	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017177	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017177	GAA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
70	NC_017177	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
71	NC_017177	CTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359040
72	NC_017177	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
73	NC_017177	TAA	2	6	2006	2011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
74	NC_017177	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	384359040
75	NC_017177	AT	4	8	2125	2132	50 %	50 %	0 %	0 %	384359040
76	NC_017177	A	6	6	2209	2214	100 %	0 %	0 %	0 %	384359040
77	NC_017177	CAG	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359040
78	NC_017177	ATT	2	6	2276	2281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359040
79	NC_017177	ATA	3	9	2338	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017177	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
81	NC_017177	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
82	NC_017177	GAA	3	9	2477	2485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
83	NC_017177	AATA	2	8	2495	2502	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
84	NC_017177	ATA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
85	NC_017177	ATT	4	12	2560	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
86	NC_017177	ATTT	2	8	2580	2587	25 %	75 %	0 %	0 %	384359041
87	NC_017177	ATT	3	9	2634	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
88	NC_017177	ATT	3	9	2646	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
89	NC_017177	TAA	2	6	2671	2676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
90	NC_017177	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
91	NC_017177	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
92	NC_017177	ATA	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
93	NC_017177	AT	3	6	2765	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
94	NC_017177	TA	4	8	2771	2778	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
95	NC_017177	ATATA	2	10	2824	2833	60 %	40 %	0 %	0 %	384359041
96	NC_017177	T	7	7	2868	2874	0 %	100 %	0 %	0 %	384359041
97	NC_017177	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
98	NC_017177	A	8	8	2903	2910	100 %	0 %	0 %	0 %	384359041
99	NC_017177	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359041
100	NC_017177	GA	3	6	2998	3003	50 %	0 %	50 %	0 %	384359041
101	NC_017177	TTA	2	6	3066	3071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
102	NC_017177	TA	4	8	3103	3110	50 %	50 %	0 %	0 %	384359041
103	NC_017177	TAAA	2	8	3113	3120	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
104	NC_017177	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017177	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017177	AT	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017177	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017177	ATGG	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017177	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017177	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017177	TA	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017177	AAATTA	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017177	TTA	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017177	TGA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017177	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017177	A	7	7	3419	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017177	AT	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017177	TAAA	2	8	3440	3447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017177	A	7	7	3456	3462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017177	A	7	7	3469	3475	100 %	0 %	0 %	0 %	384359042
121	NC_017177	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359042
122	NC_017177	ATA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359042
123	NC_017177	T	7	7	3582	3588	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
124	NC_017177	TTCTT	2	10	3599	3608	0 %	80 %	0 %	20 %	384359042
125	NC_017177	TTTA	2	8	3625	3632	25 %	75 %	0 %	0 %	384359042
126	NC_017177	GT	3	6	3744	3749	0 %	50 %	50 %	0 %	384359042
127	NC_017177	T	6	6	3785	3790	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
128	NC_017177	TC	3	6	3815	3820	0 %	50 %	0 %	50 %	384359042
129	NC_017177	TC	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	384359042
130	NC_017177	ACAT	2	8	3870	3877	50 %	25 %	0 %	25 %	384359042
131	NC_017177	TCT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
132	NC_017177	TA	3	6	3924	3929	50 %	50 %	0 %	0 %	384359042
133	NC_017177	AAC	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
134	NC_017177	T	7	7	3955	3961	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
135	NC_017177	TTC	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
136	NC_017177	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
137	NC_017177	CTTTT	2	10	4017	4026	0 %	80 %	0 %	20 %	384359042
138	NC_017177	T	6	6	4023	4028	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
139	NC_017177	T	8	8	4075	4082	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
140	NC_017177	T	9	9	4165	4173	0 %	100 %	0 %	0 %	384359042
141	NC_017177	TAAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	384359042
142	NC_017177	TAT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017177	ATT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017177	A	6	6	4255	4260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017177	TAT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017177	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017177	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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