MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017028	TGT	2	6	115595	115600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017028	TCT	2	6	115706	115711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_017028	CTTT	2	8	115716	115723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_017028	TACT	2	8	115731	115738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_017028	CT	3	6	115759	115764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_017028	ACTTTA	2	12	115775	115786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3007	NC_017028	AT	3	6	115800	115805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017028	TTA	2	6	115845	115850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017028	T	6	6	115864	115869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017028	ATT	3	9	115919	115927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017028	CTT	2	6	115957	115962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017028	TGA	2	6	116024	116029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017028	ATT	2	6	116045	116050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017028	AAG	2	6	116122	116127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_017028	TGT	2	6	116136	116141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_017028	TA	3	6	116156	116161	50 %	50 %	0 %	0 %	383312021
3017	NC_017028	TTGC	2	8	116167	116174	0 %	50 %	25 %	25 %	383312021
3018	NC_017028	TTAT	2	8	116198	116205	25 %	75 %	0 %	0 %	383312021
3019	NC_017028	TAT	2	6	116211	116216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312021
3020	NC_017028	AT	3	6	116385	116390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017028	TTA	2	6	116391	116396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017028	AAT	2	6	116429	116434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017028	TTA	2	6	116444	116449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017028	ATAA	2	8	116487	116494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017028	T	6	6	116511	116516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017028	ATT	2	6	116693	116698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017028	GTA	2	6	116834	116839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312022
3028	NC_017028	ATT	2	6	116977	116982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312022
3029	NC_017028	TAAA	2	8	117045	117052	75 %	25 %	0 %	0 %	383312022
3030	NC_017028	GGT	2	6	117072	117077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312022
3031	NC_017028	ATT	2	6	117091	117096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312022
3032	NC_017028	ATT	3	9	117178	117186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312022
3033	NC_017028	AC	3	6	117280	117285	50 %	0 %	0 %	50 %	383312022
3034	NC_017028	T	6	6	117332	117337	0 %	100 %	0 %	0 %	383312022
3035	NC_017028	GAA	2	6	117338	117343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312022
3036	NC_017028	AC	3	6	117345	117350	50 %	0 %	0 %	50 %	383312022
3037	NC_017028	TTA	2	6	117380	117385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017028	TTGTA	2	10	117401	117410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017028	T	6	6	117443	117448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017028	TTA	2	6	117469	117474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017028	ATT	2	6	117487	117492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017028	TAT	2	6	117503	117508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_017028	GTG	2	6	117568	117573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017028	ACA	2	6	117675	117680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_017028	TGA	2	6	117739	117744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312023
3046	NC_017028	TTTA	2	8	117756	117763	25 %	75 %	0 %	0 %	383312023
3047	NC_017028	ATA	2	6	117765	117770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312023
3048	NC_017028	TAG	2	6	117788	117793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312023
3049	NC_017028	TAT	2	6	117878	117883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3050	NC_017028	AAC	2	6	117894	117899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312023
3051	NC_017028	TATT	2	8	117902	117909	25 %	75 %	0 %	0 %	383312023
3052	NC_017028	ATT	2	6	117966	117971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3053	NC_017028	AT	3	6	118028	118033	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3054	NC_017028	TA	3	6	118085	118090	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3055	NC_017028	TAA	2	6	118133	118138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312023
3056	NC_017028	ATAATT	2	12	118158	118169	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3057	NC_017028	GTT	2	6	118246	118251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312023
3058	NC_017028	TAA	2	6	118259	118264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312023
3059	NC_017028	TTC	2	6	118303	118308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3060	NC_017028	TAA	2	6	118349	118354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312023
3061	NC_017028	ATT	2	6	118365	118370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3062	NC_017028	TGAA	2	8	118395	118402	50 %	25 %	25 %	0 %	383312023
3063	NC_017028	ATT	2	6	118428	118433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3064	NC_017028	TAG	2	6	118457	118462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312023
3065	NC_017028	ATT	2	6	118512	118517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3066	NC_017028	CTT	2	6	118565	118570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3067	NC_017028	ATT	2	6	118596	118601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3068	NC_017028	ATT	2	6	118641	118646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3069	NC_017028	AAC	2	6	118659	118664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312023
3070	NC_017028	T	7	7	118716	118722	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3071	NC_017028	TCT	2	6	118807	118812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3072	NC_017028	TTC	2	6	118839	118844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3073	NC_017028	TAATGC	2	12	118896	118907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312023
3074	NC_017028	TACT	2	8	118952	118959	25 %	50 %	0 %	25 %	383312023
3075	NC_017028	TCT	2	6	118966	118971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3076	NC_017028	TTC	2	6	118974	118979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3077	NC_017028	AGGTA	2	10	118989	118998	40 %	20 %	40 %	0 %	383312023
3078	NC_017028	CTT	2	6	119063	119068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3079	NC_017028	GAA	2	6	119095	119100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312023
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3081	NC_017028	CAT	2	6	119108	119113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
3082	NC_017028	T	6	6	119147	119152	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3083	NC_017028	TA	3	6	119187	119192	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3084	NC_017028	CTT	2	6	119201	119206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3085	NC_017028	TTC	2	6	119250	119255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3086	NC_017028	T	6	6	119258	119263	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3087	NC_017028	TA	3	6	119286	119291	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3088	NC_017028	ACA	2	6	119344	119349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312023
3089	NC_017028	ACT	2	6	119355	119360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
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3091	NC_017028	TAC	2	6	119390	119395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
3092	NC_017028	TCTTT	2	10	119489	119498	0 %	80 %	0 %	20 %	383312023
3093	NC_017028	CTT	2	6	119526	119531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3094	NC_017028	ATC	2	6	119541	119546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
3095	NC_017028	T	6	6	119597	119602	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3096	NC_017028	T	6	6	119807	119812	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3097	NC_017028	TCT	2	6	119962	119967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3098	NC_017028	AAT	2	6	119975	119980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312023
3099	NC_017028	TA	3	6	120080	120085	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
3100	NC_017028	TAAC	2	8	120109	120116	50 %	25 %	0 %	25 %	383312023
3101	NC_017028	TAG	2	6	120128	120133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312023
3102	NC_017028	T	6	6	120159	120164	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3103	NC_017028	AGCTTC	2	12	120213	120224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
3104	NC_017028	TAT	2	6	120248	120253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3105	NC_017028	GTT	2	6	120302	120307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312023
3106	NC_017028	GTTT	2	8	120311	120318	0 %	75 %	25 %	0 %	383312023
3107	NC_017028	AATA	2	8	120319	120326	75 %	25 %	0 %	0 %	383312023
3108	NC_017028	TAC	2	6	120366	120371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
3109	NC_017028	TTG	2	6	120416	120421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312023
3110	NC_017028	TAT	2	6	120474	120479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3111	NC_017028	TCT	2	6	120493	120498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3112	NC_017028	TTG	2	6	120504	120509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312023
3113	NC_017028	T	6	6	120565	120570	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3114	NC_017028	CATCTG	2	12	120635	120646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
3115	NC_017028	TAT	2	6	120653	120658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312023
3116	NC_017028	TCTGC	2	10	120670	120679	0 %	40 %	20 %	40 %	383312023
3117	NC_017028	T	8	8	120696	120703	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3118	NC_017028	ATC	2	6	120729	120734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312023
3119	NC_017028	CTG	2	6	120753	120758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312023
3120	NC_017028	GA	3	6	120767	120772	50 %	0 %	50 %	0 %	383312023
3121	NC_017028	CTT	2	6	120782	120787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
3122	NC_017028	ATTT	2	8	120818	120825	25 %	75 %	0 %	0 %	383312023
3123	NC_017028	T	7	7	120823	120829	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3124	NC_017028	GTT	2	6	120841	120846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312023
3125	NC_017028	CT	3	6	120860	120865	0 %	50 %	0 %	50 %	383312023
3126	NC_017028	T	6	6	120898	120903	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3127	NC_017028	TCC	2	6	120960	120965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383312023
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3132	NC_017028	T	6	6	121089	121094	0 %	100 %	0 %	0 %	383312023
3133	NC_017028	TTC	2	6	121119	121124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312023
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3231	NC_017028	TAA	2	6	125152	125157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_017028	TAA	2	6	125162	125167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_017028	T	7	7	125171	125177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3234	NC_017028	A	7	7	125178	125184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_017028	TAT	2	6	125189	125194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3236	NC_017028	TTG	2	6	125277	125282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3237	NC_017028	A	6	6	125344	125349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3238	NC_017028	T	7	7	125365	125371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_017028	ATT	2	6	125372	125377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_017028	GAC	2	6	125415	125420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3242	NC_017028	AAT	2	6	125544	125549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312026
3243	NC_017028	AC	3	6	125557	125562	50 %	0 %	0 %	50 %	383312026
3244	NC_017028	CAAG	2	8	125626	125633	50 %	0 %	25 %	25 %	383312026
3245	NC_017028	TAA	2	6	125688	125693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312026
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3247	NC_017028	AAGT	2	8	125789	125796	50 %	25 %	25 %	0 %	383312026
3248	NC_017028	GATATA	2	12	125830	125841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312026
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3250	NC_017028	AAT	2	6	125944	125949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312026
3251	NC_017028	AT	3	6	126097	126102	50 %	50 %	0 %	0 %	383312026
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3498	NC_017028	AAC	2	6	135342	135347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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