MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017028	AATA	2	8	566720	566727	75 %	25 %	0 %	0 %	383312423
14502	NC_017028	TAG	2	6	566738	566743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312423
14503	NC_017028	GCT	2	6	566769	566774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312423
14504	NC_017028	TATAT	2	10	566810	566819	40 %	60 %	0 %	0 %	383312423
14505	NC_017028	CAG	2	6	566827	566832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312423
14506	NC_017028	ATCAT	2	10	566843	566852	40 %	40 %	0 %	20 %	383312423
14507	NC_017028	TGA	2	6	566885	566890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_017028	ATT	2	6	566936	566941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_017028	TAA	2	6	566944	566949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_017028	TGG	2	6	566979	566984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_017028	GTA	2	6	567005	567010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_017028	ATTT	2	8	567040	567047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_017028	TAA	2	6	567061	567066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_017028	AAG	2	6	567072	567077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_017028	GCA	2	6	567083	567088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_017028	TAAT	2	8	567206	567213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_017028	GCAA	2	8	567222	567229	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14518	NC_017028	TTC	2	6	567251	567256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_017028	TAA	2	6	567265	567270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_017028	AAGC	2	8	567288	567295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14521	NC_017028	GAG	2	6	567332	567337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_017028	ATT	2	6	567385	567390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_017028	TTA	2	6	567441	567446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_017028	GA	3	6	567464	567469	50 %	0 %	50 %	0 %	383312424
14525	NC_017028	AAC	2	6	567489	567494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312424
14526	NC_017028	AGT	2	6	567540	567545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312424
14527	NC_017028	A	6	6	567579	567584	100 %	0 %	0 %	0 %	383312424
14528	NC_017028	GTT	2	6	567588	567593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312424
14529	NC_017028	TAT	2	6	567611	567616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312424
14530	NC_017028	TTA	2	6	567701	567706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312424
14531	NC_017028	GCA	2	6	567712	567717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312424
14532	NC_017028	AAT	2	6	567752	567757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312424
14533	NC_017028	TAAAT	2	10	567766	567775	60 %	40 %	0 %	0 %	383312424
14534	NC_017028	TGC	2	6	567834	567839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312424
14535	NC_017028	TA	3	6	567864	567869	50 %	50 %	0 %	0 %	383312424
14536	NC_017028	TTTCAG	2	12	567872	567883	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312424
14537	NC_017028	TAC	2	6	567939	567944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312424
14538	NC_017028	A	6	6	567960	567965	100 %	0 %	0 %	0 %	383312424
14539	NC_017028	A	8	8	568003	568010	100 %	0 %	0 %	0 %	383312425
14540	NC_017028	TAT	2	6	568068	568073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312425
14541	NC_017028	TA	3	6	568075	568080	50 %	50 %	0 %	0 %	383312425
14542	NC_017028	TCT	2	6	568088	568093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312425
14543	NC_017028	AT	3	6	568098	568103	50 %	50 %	0 %	0 %	383312425
14544	NC_017028	ATA	2	6	568139	568144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312425
14545	NC_017028	ATAAA	2	10	568173	568182	80 %	20 %	0 %	0 %	383312425
14546	NC_017028	TAA	2	6	568227	568232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312425
14547	NC_017028	AGA	2	6	568243	568248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312425
14548	NC_017028	T	7	7	568299	568305	0 %	100 %	0 %	0 %	383312426
14549	NC_017028	T	6	6	568322	568327	0 %	100 %	0 %	0 %	383312426
14550	NC_017028	CCG	2	6	568352	568357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383312426
14551	NC_017028	TGA	2	6	568377	568382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312426
14552	NC_017028	TGC	2	6	568413	568418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312426
14553	NC_017028	CTT	2	6	568434	568439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312426
14554	NC_017028	ATT	2	6	568474	568479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312426
14555	NC_017028	AGT	2	6	568484	568489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312426
14556	NC_017028	GAAAT	2	10	568493	568502	60 %	20 %	20 %	0 %	383312426
14557	NC_017028	TAA	4	12	568519	568530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312426
14558	NC_017028	TAT	2	6	568556	568561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312427
14559	NC_017028	T	6	6	568561	568566	0 %	100 %	0 %	0 %	383312427
14560	NC_017028	T	6	6	568570	568575	0 %	100 %	0 %	0 %	383312427
14561	NC_017028	ATA	2	6	568592	568597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312427
14562	NC_017028	AGT	2	6	568679	568684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312427
14563	NC_017028	TAC	2	6	568735	568740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312427
14564	NC_017028	CAGC	2	8	568745	568752	25 %	0 %	25 %	50 %	383312427
14565	NC_017028	AGT	3	9	568757	568765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312427
14566	NC_017028	GATAT	2	10	568775	568784	40 %	40 %	20 %	0 %	383312427
14567	NC_017028	TA	3	6	568841	568846	50 %	50 %	0 %	0 %	383312427
14568	NC_017028	AGCC	2	8	568893	568900	25 %	0 %	25 %	50 %	383312427
14569	NC_017028	AGC	2	6	568926	568931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312427
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14572	NC_017028	TCT	2	6	568980	568985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312427
14573	NC_017028	AT	3	6	569037	569042	50 %	50 %	0 %	0 %	383312427
14574	NC_017028	T	6	6	569128	569133	0 %	100 %	0 %	0 %	383312428
14575	NC_017028	T	6	6	569165	569170	0 %	100 %	0 %	0 %	383312428
14576	NC_017028	T	7	7	569175	569181	0 %	100 %	0 %	0 %	383312428
14577	NC_017028	CTT	2	6	569194	569199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312428
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14580	NC_017028	TAT	2	6	569264	569269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312428
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14582	NC_017028	ACG	2	6	569291	569296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312428
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14588	NC_017028	TA	3	6	569351	569356	50 %	50 %	0 %	0 %	383312428
14589	NC_017028	T	6	6	569366	569371	0 %	100 %	0 %	0 %	383312428
14590	NC_017028	T	6	6	569373	569378	0 %	100 %	0 %	0 %	383312428
14591	NC_017028	ATTTT	2	10	569380	569389	20 %	80 %	0 %	0 %	383312428
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14593	NC_017028	CTAT	2	8	569460	569467	25 %	50 %	0 %	25 %	383312429
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14596	NC_017028	CCT	2	6	569601	569606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383312429
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14598	NC_017028	GGT	2	6	569751	569756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312429
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14601	NC_017028	ACGA	2	8	569849	569856	50 %	0 %	25 %	25 %	383312429
14602	NC_017028	CTA	2	6	570028	570033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312429
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14604	NC_017028	TAG	2	6	570062	570067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312429
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14607	NC_017028	CCCG	2	8	570155	570162	0 %	0 %	25 %	75 %	383312429
14608	NC_017028	AGT	2	6	570169	570174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312429
14609	NC_017028	ATA	2	6	570244	570249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312429
14610	NC_017028	AGT	2	6	570254	570259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312429
14611	NC_017028	TAA	2	6	570371	570376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312429
14612	NC_017028	ATT	2	6	570524	570529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312429
14613	NC_017028	TAC	2	6	570530	570535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312429
14614	NC_017028	GTGTTG	2	12	570612	570623	0 %	50 %	50 %	0 %	383312429
14615	NC_017028	T	7	7	570687	570693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_017028	CATT	2	8	570723	570730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14617	NC_017028	TCA	2	6	570777	570782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312430
14618	NC_017028	CTTT	2	8	570871	570878	0 %	75 %	0 %	25 %	383312430
14619	NC_017028	TCA	2	6	570885	570890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312430
14620	NC_017028	CAA	2	6	571032	571037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312430
14621	NC_017028	AT	3	6	571048	571053	50 %	50 %	0 %	0 %	383312430
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14996	NC_017028	ATC	2	6	586754	586759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312444
14997	NC_017028	CTTCA	2	10	586787	586796	20 %	40 %	0 %	40 %	383312444
14998	NC_017028	TCT	2	6	586809	586814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312444
14999	NC_017028	TAC	2	6	586835	586840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312444
15000	NC_017028	GCT	2	6	586875	586880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312444

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