MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017028	T	6	6	529627	529632	0 %	100 %	0 %	0 %	383312390
13502	NC_017028	TAA	2	6	529769	529774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_017028	AGC	2	6	529814	529819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_017028	A	6	6	529844	529849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017028	TAA	2	6	529850	529855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_017028	GAC	2	6	529922	529927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_017028	CAA	2	6	529940	529945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_017028	AAT	2	6	529986	529991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_017028	A	6	6	530027	530032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13510	NC_017028	T	6	6	530033	530038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_017028	ATA	2	6	530040	530045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_017028	AAT	2	6	530156	530161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_017028	GTG	2	6	530173	530178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_017028	GTT	2	6	530181	530186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_017028	ATT	2	6	530325	530330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_017028	AT	3	6	530346	530351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_017028	A	6	6	530353	530358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_017028	AAT	2	6	530387	530392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_017028	TAG	2	6	530464	530469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_017028	AAT	2	6	530487	530492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017028	TA	3	6	530569	530574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017028	A	8	8	530623	530630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017028	GAA	2	6	530674	530679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017028	CTT	2	6	530684	530689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_017028	ATAA	2	8	530692	530699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_017028	TTA	2	6	530745	530750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_017028	TAA	2	6	530753	530758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_017028	AATC	2	8	530773	530780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13529	NC_017028	TA	3	6	530854	530859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_017028	GAA	2	6	530897	530902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017028	TAA	2	6	530909	530914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_017028	ATT	2	6	530929	530934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_017028	ATT	2	6	530956	530961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_017028	AGA	2	6	531014	531019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_017028	TAA	2	6	531023	531028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_017028	ATT	3	9	531040	531048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_017028	TAA	2	6	531071	531076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_017028	ATT	2	6	531091	531096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_017028	AAT	2	6	531177	531182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_017028	ATTT	2	8	531214	531221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_017028	ATT	2	6	531253	531258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017028	A	7	7	531261	531267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_017028	AT	3	6	531314	531319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_017028	TGC	2	6	531362	531367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_017028	TAA	2	6	531422	531427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017028	A	6	6	531441	531446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_017028	TAA	2	6	531594	531599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_017028	A	6	6	531598	531603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017028	AT	3	6	531605	531610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017028	AGA	2	6	531636	531641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_017028	T	6	6	531661	531666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_017028	CTT	2	6	531678	531683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_017028	TAT	2	6	531696	531701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_017028	T	6	6	531705	531710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_017028	ATT	2	6	531712	531717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_017028	TAA	2	6	531721	531726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_017028	ATTTA	2	10	531771	531780	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_017028	A	6	6	531798	531803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_017028	A	9	9	531825	531833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_017028	AAC	2	6	531997	532002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312391
13561	NC_017028	ATT	2	6	532007	532012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312391
13562	NC_017028	TGT	2	6	532014	532019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312391
13563	NC_017028	GTA	2	6	532042	532047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312391
13564	NC_017028	TTA	2	6	532065	532070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312391
13565	NC_017028	TCC	2	6	532074	532079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383312391
13566	NC_017028	A	6	6	532146	532151	100 %	0 %	0 %	0 %	383312391
13567	NC_017028	TAG	2	6	532208	532213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312391
13568	NC_017028	CAG	2	6	532220	532225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312391
13569	NC_017028	ATA	2	6	532247	532252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312391
13570	NC_017028	TAT	2	6	532306	532311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312391
13571	NC_017028	AGG	2	6	532346	532351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_017028	CT	3	6	532359	532364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_017028	AG	3	6	532397	532402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_017028	TAT	2	6	532424	532429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312392
13575	NC_017028	ATCA	2	8	532439	532446	50 %	25 %	0 %	25 %	383312392
13576	NC_017028	CCTG	2	8	532529	532536	0 %	25 %	25 %	50 %	383312392
13577	NC_017028	TAA	2	6	532598	532603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312392
13578	NC_017028	CTG	2	6	532606	532611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312392
13579	NC_017028	CCA	2	6	532676	532681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383312392
13580	NC_017028	TCA	2	6	532737	532742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312392
13581	NC_017028	GATA	2	8	532840	532847	50 %	25 %	25 %	0 %	383312392
13582	NC_017028	ACT	2	6	532865	532870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312392
13583	NC_017028	TGA	2	6	532925	532930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312392
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13585	NC_017028	CTT	2	6	532978	532983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312392
13586	NC_017028	ATT	2	6	533043	533048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312392
13587	NC_017028	GGA	2	6	533070	533075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383312392
13588	NC_017028	GTA	2	6	533076	533081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312392
13589	NC_017028	ATTTGA	2	12	533097	533108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383312392
13590	NC_017028	TAA	2	6	533140	533145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312392
13591	NC_017028	TAC	2	6	533200	533205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312392
13592	NC_017028	ATCAT	2	10	533268	533277	40 %	40 %	0 %	20 %	383312392
13593	NC_017028	TTC	2	6	533323	533328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312392
13594	NC_017028	TA	3	6	533336	533341	50 %	50 %	0 %	0 %	383312392
13595	NC_017028	TGCT	2	8	533348	533355	0 %	50 %	25 %	25 %	383312392
13596	NC_017028	AGCT	2	8	533371	533378	25 %	25 %	25 %	25 %	383312392
13597	NC_017028	GGT	2	6	533391	533396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312392
13598	NC_017028	T	7	7	533467	533473	0 %	100 %	0 %	0 %	383312392
13599	NC_017028	TCA	2	6	533496	533501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312392
13600	NC_017028	TAC	2	6	533596	533601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312392
13601	NC_017028	CTT	2	6	533648	533653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312392
13602	NC_017028	TGC	2	6	533675	533680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312392
13603	NC_017028	CGGT	2	8	533707	533714	0 %	25 %	50 %	25 %	383312392
13604	NC_017028	ATAA	2	8	533745	533752	75 %	25 %	0 %	0 %	383312392
13605	NC_017028	TTA	2	6	533759	533764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_017028	TCT	2	6	533867	533872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312393
13607	NC_017028	CAT	2	6	533909	533914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312393
13608	NC_017028	T	8	8	533940	533947	0 %	100 %	0 %	0 %	383312393
13609	NC_017028	AAAT	2	8	533954	533961	75 %	25 %	0 %	0 %	383312393
13610	NC_017028	AT	3	6	533968	533973	50 %	50 %	0 %	0 %	383312393
13611	NC_017028	TAA	2	6	534005	534010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312393
13612	NC_017028	TCG	2	6	534016	534021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312393
13613	NC_017028	CTT	2	6	534140	534145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312393
13614	NC_017028	T	6	6	534180	534185	0 %	100 %	0 %	0 %	383312393
13615	NC_017028	AT	3	6	534189	534194	50 %	50 %	0 %	0 %	383312393
13616	NC_017028	TTA	2	6	534268	534273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312393
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13618	NC_017028	TAAGC	2	10	534357	534366	40 %	20 %	20 %	20 %	383312393
13619	NC_017028	TAA	2	6	534449	534454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312393
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13624	NC_017028	GAA	2	6	534609	534614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383312393
13625	NC_017028	T	6	6	534666	534671	0 %	100 %	0 %	0 %	383312393
13626	NC_017028	GAC	2	6	534731	534736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312393
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