MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017028	TGATA	2	10	451304	451313	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_017028	TTTCA	2	10	451318	451327	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11503	NC_017028	ATC	2	6	451345	451350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_017028	AATT	2	8	451395	451402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_017028	ACT	2	6	451441	451446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_017028	TTAA	2	8	451492	451499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_017028	TGAT	2	8	451509	451516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_017028	ACT	2	6	451544	451549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312316
11509	NC_017028	ACC	2	6	451554	451559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383312316
11510	NC_017028	TTC	2	6	451590	451595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312316
11511	NC_017028	TAT	2	6	451706	451711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312316
11512	NC_017028	TGC	2	6	451816	451821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312316
11513	NC_017028	TACCG	2	10	451845	451854	20 %	20 %	20 %	40 %	383312316
11514	NC_017028	GTA	2	6	451888	451893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312316
11515	NC_017028	TGC	2	6	451900	451905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312316
11516	NC_017028	CCG	2	6	451906	451911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383312316
11517	NC_017028	TAT	2	6	451970	451975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312316
11518	NC_017028	TAT	2	6	452106	452111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312316
11519	NC_017028	TGCC	2	8	452132	452139	0 %	25 %	25 %	50 %	383312316
11520	NC_017028	ATT	2	6	452161	452166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312316
11521	NC_017028	ATAC	2	8	452202	452209	50 %	25 %	0 %	25 %	383312316
11522	NC_017028	CAT	2	6	452211	452216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312316
11523	NC_017028	ATT	2	6	452277	452282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312316
11524	NC_017028	AAAC	2	8	452301	452308	75 %	0 %	0 %	25 %	383312316
11525	NC_017028	GCA	2	6	452326	452331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312316
11526	NC_017028	ATG	2	6	452332	452337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312316
11527	NC_017028	T	6	6	452344	452349	0 %	100 %	0 %	0 %	383312316
11528	NC_017028	TTCGGC	2	12	452388	452399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312316
11529	NC_017028	TTC	2	6	452403	452408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_017028	TTA	2	6	452443	452448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_017028	TCT	2	6	452464	452469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_017028	T	6	6	452477	452482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_017028	CGTCAA	2	12	452573	452584	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_017028	AGT	2	6	452597	452602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_017028	T	8	8	452619	452626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_017028	ATT	2	6	452651	452656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_017028	T	6	6	452655	452660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_017028	TA	3	6	452684	452689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_017028	AAT	2	6	452816	452821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017028	AAT	2	6	452826	452831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312317
11541	NC_017028	AT	3	6	452837	452842	50 %	50 %	0 %	0 %	383312317
11542	NC_017028	AAT	2	6	452855	452860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312317
11543	NC_017028	GCG	2	6	452914	452919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383312317
11544	NC_017028	AG	4	8	452975	452982	50 %	0 %	50 %	0 %	383312317
11545	NC_017028	TA	3	6	453016	453021	50 %	50 %	0 %	0 %	383312317
11546	NC_017028	CTA	2	6	453041	453046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312317
11547	NC_017028	TAG	2	6	453095	453100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11548	NC_017028	TGC	2	6	453107	453112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312317
11549	NC_017028	AGC	2	6	453262	453267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312317
11550	NC_017028	GATT	2	8	453335	453342	25 %	50 %	25 %	0 %	383312317
11551	NC_017028	TAAA	2	8	453361	453368	75 %	25 %	0 %	0 %	383312317
11552	NC_017028	AGT	2	6	453387	453392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11553	NC_017028	TTG	2	6	453415	453420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383312317
11554	NC_017028	ATG	2	6	453504	453509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11555	NC_017028	CTA	2	6	453511	453516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312317
11556	NC_017028	A	6	6	453558	453563	100 %	0 %	0 %	0 %	383312317
11557	NC_017028	CTT	2	6	453599	453604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312317
11558	NC_017028	TGA	2	6	453656	453661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11559	NC_017028	A	7	7	453661	453667	100 %	0 %	0 %	0 %	383312317
11560	NC_017028	ATG	2	6	453790	453795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11561	NC_017028	GATTTA	2	12	453909	453920	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383312317
11562	NC_017028	GTG	2	6	453939	453944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383312317
11563	NC_017028	A	6	6	454012	454017	100 %	0 %	0 %	0 %	383312317
11564	NC_017028	TGA	2	6	454064	454069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11565	NC_017028	AG	3	6	454105	454110	50 %	0 %	50 %	0 %	383312317
11566	NC_017028	TA	3	6	454131	454136	50 %	50 %	0 %	0 %	383312317
11567	NC_017028	AAT	2	6	454151	454156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312317
11568	NC_017028	CAG	2	6	454395	454400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312317
11569	NC_017028	CAAG	2	8	454416	454423	50 %	0 %	25 %	25 %	383312317
11570	NC_017028	TAT	2	6	454436	454441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312317
11571	NC_017028	CGG	2	6	454493	454498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383312317
11572	NC_017028	CGTAAA	2	12	454509	454520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312317
11573	NC_017028	TGA	2	6	454616	454621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312317
11574	NC_017028	T	6	6	454629	454634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_017028	TA	3	6	454639	454644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_017028	TAA	2	6	454664	454669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_017028	GAAT	2	8	454816	454823	50 %	25 %	25 %	0 %	383312318
11578	NC_017028	GCA	2	6	454836	454841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383312318
11579	NC_017028	TTAAT	2	10	454863	454872	40 %	60 %	0 %	0 %	383312318
11580	NC_017028	TTA	2	6	454890	454895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312318
11581	NC_017028	CAA	2	6	454918	454923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383312318
11582	NC_017028	T	6	6	454971	454976	0 %	100 %	0 %	0 %	383312318
11583	NC_017028	ATC	2	6	454987	454992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383312318
11584	NC_017028	TAT	2	6	454998	455003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312318
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11587	NC_017028	ATTTAT	2	12	455046	455057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312318
11588	NC_017028	CTT	2	6	455058	455063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312318
11589	NC_017028	TTC	2	6	455068	455073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383312318
11590	NC_017028	T	6	6	455123	455128	0 %	100 %	0 %	0 %	383312318
11591	NC_017028	TTTA	2	8	455143	455150	25 %	75 %	0 %	0 %	383312318
11592	NC_017028	TAA	2	6	455171	455176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312318
11593	NC_017028	T	6	6	455179	455184	0 %	100 %	0 %	0 %	383312318
11594	NC_017028	ATT	2	6	455213	455218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312318
11595	NC_017028	ATG	2	6	455258	455263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_017028	GTA	2	6	455324	455329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_017028	T	6	6	455339	455344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_017028	TAT	2	6	455371	455376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_017028	GTTA	2	8	455415	455422	25 %	50 %	25 %	0 %	383312319
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11601	NC_017028	TCAT	2	8	455580	455587	25 %	50 %	0 %	25 %	383312320
11602	NC_017028	CTTG	2	8	455614	455621	0 %	50 %	25 %	25 %	383312320
11603	NC_017028	GGT	2	6	455728	455733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_017028	AGCT	2	8	455748	455755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_017028	TTC	2	6	455787	455792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_017028	TAT	2	6	455886	455891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_017028	TA	3	6	455944	455949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_017028	GCTT	2	8	455999	456006	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_017028	A	6	6	456018	456023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_017028	AAC	2	6	456036	456041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_017028	ATT	2	6	456069	456074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_017028	T	6	6	456073	456078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_017028	TAA	2	6	456082	456087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_017028	TAA	2	6	456092	456097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_017028	TCAAGT	2	12	456135	456146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312321
11616	NC_017028	TTA	2	6	456150	456155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312321
11617	NC_017028	AT	3	6	456173	456178	50 %	50 %	0 %	0 %	383312321
11618	NC_017028	TAT	3	9	456207	456215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312321
11619	NC_017028	AT	3	6	456214	456219	50 %	50 %	0 %	0 %	383312321
11620	NC_017028	A	6	6	456256	456261	100 %	0 %	0 %	0 %	383312321
11621	NC_017028	TAT	2	6	456309	456314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312321
11622	NC_017028	AAT	2	6	456315	456320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312321
11623	NC_017028	TC	3	6	456332	456337	0 %	50 %	0 %	50 %	383312321
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