MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 23066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016798	TATCT	2	10	226478	226487	20 %	60 %	0 %	20 %	376282202
5002	NC_016798	TAT	2	6	226555	226560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282202
5003	NC_016798	TGC	2	6	226561	226566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282202
5004	NC_016798	A	7	7	226658	226664	100 %	0 %	0 %	0 %	376282202
5005	NC_016798	TTTTC	2	10	226680	226689	0 %	80 %	0 %	20 %	376282202
5006	NC_016798	TC	3	6	226794	226799	0 %	50 %	0 %	50 %	376282202
5007	NC_016798	CATT	2	8	226842	226849	25 %	50 %	0 %	25 %	376282202
5008	NC_016798	A	7	7	226885	226891	100 %	0 %	0 %	0 %	376282202
5009	NC_016798	TTA	2	6	226901	226906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282202
5010	NC_016798	TAA	2	6	226941	226946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282202
5011	NC_016798	AAC	2	6	227002	227007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282202
5012	NC_016798	TTG	2	6	227155	227160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282202
5013	NC_016798	ATA	2	6	227224	227229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282202
5014	NC_016798	TAA	2	6	227233	227238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016798	AAAC	2	8	227249	227256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_016798	ACAA	2	8	227301	227308	75 %	0 %	0 %	25 %	376282203
5017	NC_016798	TTC	2	6	227362	227367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282203
5018	NC_016798	CT	3	6	227496	227501	0 %	50 %	0 %	50 %	376282203
5019	NC_016798	ATT	2	6	227526	227531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282203
5020	NC_016798	ACT	2	6	227546	227551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282203
5021	NC_016798	A	7	7	227579	227585	100 %	0 %	0 %	0 %	376282203
5022	NC_016798	ATT	2	6	227646	227651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282203
5023	NC_016798	TTA	2	6	227655	227660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282203
5024	NC_016798	CTGG	2	8	227710	227717	0 %	25 %	50 %	25 %	376282203
5025	NC_016798	TAT	2	6	227732	227737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282203
5026	NC_016798	TGT	2	6	227776	227781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282203
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5028	NC_016798	TCA	2	6	227905	227910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282203
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5030	NC_016798	CATT	2	8	227972	227979	25 %	50 %	0 %	25 %	376282203
5031	NC_016798	CTT	2	6	228002	228007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282203
5032	NC_016798	T	6	6	228018	228023	0 %	100 %	0 %	0 %	376282203
5033	NC_016798	TTA	2	6	228109	228114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282204
5034	NC_016798	GTC	2	6	228130	228135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282204
5035	NC_016798	AAC	2	6	228234	228239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282204
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5037	NC_016798	GAA	2	6	228360	228365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282204
5038	NC_016798	AGA	2	6	228468	228473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282204
5039	NC_016798	ATTGCT	2	12	228586	228597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376282204
5040	NC_016798	ATT	2	6	228619	228624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282204
5041	NC_016798	CTA	2	6	228715	228720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282204
5042	NC_016798	TCA	2	6	228722	228727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282204
5043	NC_016798	TG	3	6	228755	228760	0 %	50 %	50 %	0 %	376282204
5044	NC_016798	TCCTAG	2	12	228876	228887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376282204
5045	NC_016798	CAA	2	6	228914	228919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282204
5046	NC_016798	AAC	2	6	228991	228996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282205
5047	NC_016798	GAG	2	6	229030	229035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282205
5048	NC_016798	CT	3	6	229076	229081	0 %	50 %	0 %	50 %	376282205
5049	NC_016798	TCGA	2	8	229125	229132	25 %	25 %	25 %	25 %	376282205
5050	NC_016798	TCC	2	6	229142	229147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282205
5051	NC_016798	GAT	2	6	229175	229180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282205
5052	NC_016798	ATG	2	6	229212	229217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282205
5053	NC_016798	CAT	2	6	229250	229255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282205
5054	NC_016798	G	6	6	229256	229261	0 %	0 %	100 %	0 %	376282205
5055	NC_016798	AAG	2	6	229282	229287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282205
5056	NC_016798	TAA	2	6	229346	229351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282205
5057	NC_016798	GCAACG	2	12	229364	229375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282205
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5059	NC_016798	AATT	2	8	229411	229418	50 %	50 %	0 %	0 %	376282205
5060	NC_016798	ATTT	2	8	229474	229481	25 %	75 %	0 %	0 %	376282205
5061	NC_016798	T	6	6	229511	229516	0 %	100 %	0 %	0 %	376282205
5062	NC_016798	TCA	2	6	229519	229524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282205
5063	NC_016798	CTG	2	6	229537	229542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282205
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5066	NC_016798	T	8	8	229724	229731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016798	TCCT	2	8	229874	229881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_016798	AGA	2	6	229926	229931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_016798	ATT	2	6	229963	229968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_016798	TTC	2	6	230047	230052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282206
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5076	NC_016798	TGA	2	6	230327	230332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282206
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5082	NC_016798	GATA	2	8	230591	230598	50 %	25 %	25 %	0 %	376282206
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5088	NC_016798	TAC	2	6	230899	230904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282207
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5091	NC_016798	TTTC	2	8	231044	231051	0 %	75 %	0 %	25 %	376282207
5092	NC_016798	CTT	2	6	231106	231111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282207
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5096	NC_016798	TAT	2	6	231373	231378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282207
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5103	NC_016798	ACT	2	6	231731	231736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282207
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5106	NC_016798	TTAT	2	8	231882	231889	25 %	75 %	0 %	0 %	376282207
5107	NC_016798	CTAT	2	8	231901	231908	25 %	50 %	0 %	25 %	376282207
5108	NC_016798	TCTT	2	8	231948	231955	0 %	75 %	0 %	25 %	376282207
5109	NC_016798	TGC	2	6	231991	231996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282207
5110	NC_016798	CTTAGC	2	12	231997	232008	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376282207
5111	NC_016798	GGA	2	6	232028	232033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282207
5112	NC_016798	CA	3	6	232036	232041	50 %	0 %	0 %	50 %	376282207
5113	NC_016798	TGG	2	6	232100	232105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282207
5114	NC_016798	TTGG	2	8	232144	232151	0 %	50 %	50 %	0 %	376282207
5115	NC_016798	TGG	3	9	232163	232171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282207
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5119	NC_016798	CTT	2	6	232323	232328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282208
5120	NC_016798	CTA	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282208
5121	NC_016798	ATTT	2	8	232391	232398	25 %	75 %	0 %	0 %	376282208
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5123	NC_016798	AAT	3	9	232569	232577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282208
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5235	NC_016798	CTGT	2	8	238075	238082	0 %	50 %	25 %	25 %	376282212
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5239	NC_016798	AT	5	10	238634	238643	50 %	50 %	0 %	0 %	376282212
5240	NC_016798	TTGA	2	8	238685	238692	25 %	50 %	25 %	0 %	376282212
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5242	NC_016798	AAGT	2	8	238766	238773	50 %	25 %	25 %	0 %	376282212
5243	NC_016798	TTCCTT	2	12	238829	238840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282212
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5245	NC_016798	C	6	6	239110	239115	0 %	0 %	0 %	100 %	376282212
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