MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016790	CG	5	10	605769	605778	0 %	0 %	50 %	50 %	376256599
13003	NC_016790	CAA	2	6	605795	605800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256599
13004	NC_016790	GCA	2	6	605963	605968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256599
13005	NC_016790	TCA	2	6	605981	605986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256599
13006	NC_016790	GCT	2	6	606069	606074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256599
13007	NC_016790	TTG	2	6	606107	606112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256599
13008	NC_016790	CTC	2	6	606115	606120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256599
13009	NC_016790	CA	3	6	606141	606146	50 %	0 %	0 %	50 %	376256599
13010	NC_016790	TGG	2	6	606221	606226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256599
13011	NC_016790	AGATG	2	10	606237	606246	40 %	20 %	40 %	0 %	376256599
13012	NC_016790	TCA	2	6	606300	606305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256599
13013	NC_016790	GAA	2	6	606310	606315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256599
13014	NC_016790	GCT	2	6	606391	606396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256599
13015	NC_016790	GTT	2	6	606486	606491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256599
13016	NC_016790	CTG	2	6	606499	606504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256599
13017	NC_016790	ATG	2	6	606518	606523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256599
13018	NC_016790	AAC	2	6	606546	606551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256599
13019	NC_016790	TTC	2	6	606573	606578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256599
13020	NC_016790	CAT	3	9	606624	606632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256599
13021	NC_016790	CGT	2	6	606673	606678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256599
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13024	NC_016790	TGC	2	6	606942	606947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256599
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13028	NC_016790	GGA	2	6	607195	607200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256600
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13030	NC_016790	TGC	2	6	607236	607241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256600
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13033	NC_016790	TAG	2	6	607387	607392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256600
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13040	NC_016790	GTT	2	6	607687	607692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256600
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13056	NC_016790	TGA	2	6	608661	608666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256600
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13059	NC_016790	TTA	2	6	608839	608844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256601
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13062	NC_016790	TCAT	2	8	609002	609009	25 %	50 %	0 %	25 %	376256601
13063	NC_016790	CGC	2	6	609025	609030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256601
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13083	NC_016790	GCCA	2	8	610160	610167	25 %	0 %	25 %	50 %	376256602
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13087	NC_016790	AAG	2	6	610220	610225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256602
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13089	NC_016790	GAA	2	6	610464	610469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256603
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13091	NC_016790	GAG	2	6	610522	610527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256603
13092	NC_016790	CTTG	2	8	610590	610597	0 %	50 %	25 %	25 %	376256603
13093	NC_016790	CGT	2	6	610622	610627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256603
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13101	NC_016790	CT	3	6	610980	610985	0 %	50 %	0 %	50 %	376256603
13102	NC_016790	CAC	2	6	611008	611013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256603
13103	NC_016790	CGA	2	6	611049	611054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256603
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13105	NC_016790	ATC	2	6	611094	611099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256603
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13107	NC_016790	TGA	2	6	611355	611360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256603
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13109	NC_016790	ACT	2	6	611483	611488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256603
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13111	NC_016790	TGAC	2	8	611615	611622	25 %	25 %	25 %	25 %	376256603
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13116	NC_016790	TC	3	6	611739	611744	0 %	50 %	0 %	50 %	376256603
13117	NC_016790	GCT	2	6	611748	611753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256603
13118	NC_016790	CAA	2	6	611855	611860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256603
13119	NC_016790	CAT	2	6	611907	611912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256603
13120	NC_016790	GC	3	6	611995	612000	0 %	0 %	50 %	50 %	376256603
13121	NC_016790	GGA	2	6	612027	612032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256603
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13123	NC_016790	CGT	2	6	612085	612090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256603
13124	NC_016790	GTC	2	6	612119	612124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256603
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13131	NC_016790	CGT	2	6	612379	612384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256603
13132	NC_016790	GAT	2	6	612426	612431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256603
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13239	NC_016790	CAA	2	6	617911	617916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256609
13240	NC_016790	GC	3	6	617964	617969	0 %	0 %	50 %	50 %	376256609
13241	NC_016790	AC	3	6	617972	617977	50 %	0 %	0 %	50 %	376256609
13242	NC_016790	GT	3	6	617983	617988	0 %	50 %	50 %	0 %	376256609
13243	NC_016790	ACA	2	6	618003	618008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256609
13244	NC_016790	ACGT	2	8	618110	618117	25 %	25 %	25 %	25 %	376256609
13245	NC_016790	CGT	2	6	618216	618221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256610
13246	NC_016790	GTC	2	6	618228	618233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256610
13247	NC_016790	CAA	3	9	618248	618256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256610
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13252	NC_016790	CCA	2	6	618443	618448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256610
13253	NC_016790	GCC	2	6	618472	618477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256610
13254	NC_016790	GA	3	6	618522	618527	50 %	0 %	50 %	0 %	376256610
13255	NC_016790	CG	3	6	618545	618550	0 %	0 %	50 %	50 %	376256610
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13258	NC_016790	ATC	2	6	618804	618809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256610
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13261	NC_016790	GCAA	2	8	618922	618929	50 %	0 %	25 %	25 %	376256610
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13265	NC_016790	GCA	2	6	619132	619137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256610
13266	NC_016790	TGG	2	6	619184	619189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256610
13267	NC_016790	GTC	2	6	619248	619253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256610
13268	NC_016790	ACGC	2	8	619257	619264	25 %	0 %	25 %	50 %	376256610
13269	NC_016790	GC	3	6	619283	619288	0 %	0 %	50 %	50 %	376256610
13270	NC_016790	GC	3	6	619367	619372	0 %	0 %	50 %	50 %	376256610
13271	NC_016790	TTGG	2	8	619423	619430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13272	NC_016790	TCC	2	6	619458	619463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256611
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13277	NC_016790	AAC	2	6	619627	619632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256611
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13279	NC_016790	GTT	2	6	619708	619713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256611
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13281	NC_016790	ATGG	2	8	619790	619797	25 %	25 %	50 %	0 %	376256611
13282	NC_016790	CTA	2	6	619798	619803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256611
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13293	NC_016790	GAC	2	6	620313	620318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256612
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13296	NC_016790	CCT	2	6	620632	620637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13297	NC_016790	TGG	2	6	620743	620748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256613
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13312	NC_016790	CAT	2	6	621578	621583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256614
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13320	NC_016790	A	6	6	621964	621969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13321	NC_016790	TGT	2	6	622030	622035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13322	NC_016790	ACG	2	6	622087	622092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256615
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13330	NC_016790	CAT	2	6	622601	622606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13332	NC_016790	AAT	2	6	622689	622694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13333	NC_016790	GGGT	2	8	622882	622889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13334	NC_016790	ATTT	2	8	622968	622975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13335	NC_016790	TG	3	6	623063	623068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13336	NC_016790	GCT	2	6	623099	623104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13339	NC_016790	T	6	6	623350	623355	0 %	100 %	0 %	0 %	376256617
13340	NC_016790	ATG	3	9	623392	623400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256617
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13344	NC_016790	ACT	2	6	623593	623598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256618
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13350	NC_016790	GGT	2	6	624024	624029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256618
13351	NC_016790	CGT	2	6	624081	624086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256618
13352	NC_016790	TGC	2	6	624167	624172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256618
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13355	NC_016790	TCA	2	6	624410	624415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256618
13356	NC_016790	TGC	2	6	624479	624484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256618
13357	NC_016790	CAT	2	6	624485	624490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256618
13358	NC_016790	CA	3	6	624731	624736	50 %	0 %	0 %	50 %	376256618
13359	NC_016790	TTG	2	6	624855	624860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256619
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13361	NC_016790	AGGTG	2	10	624983	624992	20 %	20 %	60 %	0 %	376256619
13362	NC_016790	TCG	2	6	625032	625037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256619
13363	NC_016790	TCG	2	6	625062	625067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256619
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13402	NC_016790	GCT	2	6	627169	627174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256621
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13481	NC_016790	AACA	2	8	631199	631206	75 %	0 %	0 %	25 %	376256623
13482	NC_016790	AAC	2	6	631287	631292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256623
13483	NC_016790	GACT	2	8	631296	631303	25 %	25 %	25 %	25 %	376256623
13484	NC_016790	GAC	2	6	631351	631356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256623
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