MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016790	GTG	2	6	421202	421207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256420
9002	NC_016790	AG	3	6	421308	421313	50 %	0 %	50 %	0 %	376256420
9003	NC_016790	GAT	2	6	421327	421332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256420
9004	NC_016790	TTC	2	6	421355	421360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256420
9005	NC_016790	CCT	2	6	421401	421406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256420
9006	NC_016790	ACC	2	6	421473	421478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256420
9007	NC_016790	CGT	2	6	421539	421544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9008	NC_016790	CTT	2	6	421588	421593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256420
9009	NC_016790	CTT	2	6	421654	421659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256420
9010	NC_016790	GCCTTT	2	12	421721	421732	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	376256420
9011	NC_016790	AAC	2	6	421750	421755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256420
9012	NC_016790	GGA	2	6	421788	421793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256420
9013	NC_016790	AGG	2	6	421794	421799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256420
9014	NC_016790	TGA	2	6	421833	421838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256420
9015	NC_016790	TTC	2	6	421877	421882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256420
9016	NC_016790	GTT	2	6	421909	421914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256420
9017	NC_016790	GAT	2	6	422059	422064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256420
9018	NC_016790	CCG	2	6	422147	422152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256420
9019	NC_016790	GGC	2	6	422253	422258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256420
9020	NC_016790	GAC	2	6	422293	422298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9021	NC_016790	GTC	2	6	422305	422310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9022	NC_016790	CTT	2	6	422311	422316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256420
9023	NC_016790	AATG	2	8	422329	422336	50 %	25 %	25 %	0 %	376256420
9024	NC_016790	AGG	2	6	422343	422348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256420
9025	NC_016790	TTG	2	6	422360	422365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256420
9026	NC_016790	CGG	2	6	422406	422411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256420
9027	NC_016790	AGC	2	6	422563	422568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9028	NC_016790	GGT	2	6	422584	422589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256420
9029	NC_016790	TGC	2	6	422632	422637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9030	NC_016790	GCT	3	9	422669	422677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9031	NC_016790	GAA	2	6	422693	422698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256420
9032	NC_016790	GGC	2	6	422731	422736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256420
9033	NC_016790	CTG	2	6	422742	422747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256420
9034	NC_016790	GCG	2	6	422794	422799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256420
9035	NC_016790	TTTCC	2	10	422823	422832	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9036	NC_016790	CCATT	2	10	422953	422962	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9037	NC_016790	TC	3	6	423100	423105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_016790	TAG	2	6	423114	423119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_016790	GTA	2	6	423459	423464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256421
9040	NC_016790	GCA	2	6	423487	423492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256421
9041	NC_016790	CGC	2	6	423506	423511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256421
9042	NC_016790	GAA	2	6	423555	423560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256421
9043	NC_016790	ACC	2	6	423631	423636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256421
9044	NC_016790	CGT	2	6	423692	423697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256421
9045	NC_016790	GCACAC	2	12	423747	423758	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	376256421
9046	NC_016790	GCT	2	6	423794	423799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256421
9047	NC_016790	CGA	2	6	423809	423814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256421
9048	NC_016790	AACA	2	8	423865	423872	75 %	0 %	0 %	25 %	376256421
9049	NC_016790	AC	3	6	423913	423918	50 %	0 %	0 %	50 %	376256422
9050	NC_016790	CGG	2	6	423936	423941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256422
9051	NC_016790	ACC	2	6	423970	423975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256422
9052	NC_016790	CAC	2	6	423981	423986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256422
9053	NC_016790	ACG	2	6	424022	424027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256422
9054	NC_016790	ACGCG	2	10	424041	424050	20 %	0 %	40 %	40 %	376256422
9055	NC_016790	CAT	2	6	424059	424064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256422
9056	NC_016790	GC	3	6	424094	424099	0 %	0 %	50 %	50 %	376256422
9057	NC_016790	CGA	2	6	424110	424115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256422
9058	NC_016790	GTC	2	6	424129	424134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256422
9059	NC_016790	TCC	2	6	424135	424140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256422
9060	NC_016790	CCA	2	6	424145	424150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256422
9061	NC_016790	GGCTG	2	10	424156	424165	0 %	20 %	60 %	20 %	376256422
9062	NC_016790	CGC	2	6	424188	424193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256422
9063	NC_016790	ACG	2	6	424223	424228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256422
9064	NC_016790	CGG	2	6	424314	424319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256422
9065	NC_016790	GACG	2	8	424333	424340	25 %	0 %	50 %	25 %	376256422
9066	NC_016790	CAC	2	6	424357	424362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256422
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9072	NC_016790	CGG	3	9	424626	424634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256422
9073	NC_016790	CAT	2	6	424656	424661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256422
9074	NC_016790	TCG	2	6	424754	424759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256422
9075	NC_016790	GCA	2	6	424762	424767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256422
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9080	NC_016790	CGC	2	6	424996	425001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256423
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9083	NC_016790	AAG	2	6	425232	425237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256423
9084	NC_016790	CAT	2	6	425266	425271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256423
9085	NC_016790	CCA	2	6	425274	425279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256423
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9087	NC_016790	TCG	2	6	425448	425453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256423
9088	NC_016790	ACC	2	6	425483	425488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256423
9089	NC_016790	CA	3	6	425525	425530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9090	NC_016790	GAG	2	6	425539	425544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_016790	CAG	3	9	425651	425659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256424
9092	NC_016790	ACCC	2	8	425669	425676	25 %	0 %	0 %	75 %	376256424
9093	NC_016790	TGC	2	6	425681	425686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256424
9094	NC_016790	ACG	2	6	425747	425752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256424
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9100	NC_016790	ATC	2	6	425953	425958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256424
9101	NC_016790	GGCT	2	8	426004	426011	0 %	25 %	50 %	25 %	376256424
9102	NC_016790	ATC	2	6	426055	426060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256424
9103	NC_016790	ACA	2	6	426077	426082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256424
9104	NC_016790	AC	3	6	426099	426104	50 %	0 %	0 %	50 %	376256424
9105	NC_016790	AGC	2	6	426150	426155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256424
9106	NC_016790	ACC	2	6	426206	426211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256424
9107	NC_016790	CGC	2	6	426243	426248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256424
9108	NC_016790	CA	3	6	426304	426309	50 %	0 %	0 %	50 %	376256424
9109	NC_016790	GCA	2	6	426373	426378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256424
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9111	NC_016790	ACC	3	9	426448	426456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256424
9112	NC_016790	GGC	2	6	426481	426486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256424
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9114	NC_016790	GCG	2	6	426641	426646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256424
9115	NC_016790	TCA	2	6	426668	426673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256424
9116	NC_016790	C	7	7	426700	426706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9117	NC_016790	GAC	2	6	426753	426758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256425
9118	NC_016790	CGC	2	6	426770	426775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256425
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9241	NC_016790	GCTTCA	2	12	432744	432755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	376256431
9242	NC_016790	AGA	2	6	432847	432852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256431
9243	NC_016790	CTT	2	6	432865	432870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256431
9244	NC_016790	ATG	2	6	432938	432943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256431
9245	NC_016790	GCT	2	6	432950	432955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256431
9246	NC_016790	TGG	2	6	432976	432981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256431
9247	NC_016790	TGC	2	6	432982	432987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256431
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9251	NC_016790	CGT	2	6	433121	433126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256431
9252	NC_016790	GGA	2	6	433138	433143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256431
9253	NC_016790	TGC	2	6	433161	433166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256431
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9257	NC_016790	AGC	2	6	433245	433250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256432
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9260	NC_016790	GAA	2	6	433361	433366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256432
9261	NC_016790	TAA	2	6	433379	433384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256432
9262	NC_016790	GCT	2	6	433528	433533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256433
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9264	NC_016790	GTC	2	6	433615	433620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256433
9265	NC_016790	AGC	2	6	433706	433711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256433
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9268	NC_016790	TAT	2	6	433953	433958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9269	NC_016790	GGTT	2	8	433964	433971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9270	NC_016790	CGCTAT	2	12	433978	433989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9272	NC_016790	TCC	2	6	434086	434091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256434
9273	NC_016790	GTC	2	6	434199	434204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256434
9274	NC_016790	ATG	2	6	434274	434279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256434
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9312	NC_016790	GAC	2	6	436182	436187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256436
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9348	NC_016790	TTCA	2	8	437809	437816	25 %	50 %	0 %	25 %	376256437
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9359	NC_016790	TCA	2	6	438452	438457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256437
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9483	NC_016790	CGA	2	6	444418	444423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256442
9484	NC_016790	ACG	2	6	444449	444454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256442
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