MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47005	NC_016788	CA	3	6	2320290	2320295	50 %	0 %	0 %	50 %	376249501
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47103	NC_016788	TCG	2	6	2326231	2326236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249507
47104	NC_016788	TGC	2	6	2326286	2326291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249507
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47116	NC_016788	TA	3	6	2327399	2327404	50 %	50 %	0 %	0 %	376249507
47117	NC_016788	AGT	2	6	2327415	2327420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249507
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47224	NC_016788	CAC	3	9	2331140	2331148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249511
47225	NC_016788	ACG	2	6	2331200	2331205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249511
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47232	NC_016788	CGCC	2	8	2331388	2331395	0 %	0 %	25 %	75 %	376249511
47233	NC_016788	TCC	2	6	2331435	2331440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249511
47234	NC_016788	TCG	2	6	2331498	2331503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249511
47235	NC_016788	CCG	2	6	2331516	2331521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249511
47236	NC_016788	CTC	2	6	2331563	2331568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249511
47237	NC_016788	CCT	2	6	2331589	2331594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249511
47238	NC_016788	ATC	2	6	2331606	2331611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249511
47239	NC_016788	CGA	2	6	2331612	2331617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249511
47240	NC_016788	TTC	2	6	2331708	2331713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249511
47241	NC_016788	CAC	2	6	2331746	2331751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249511
47242	NC_016788	ATG	2	6	2331759	2331764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249511
47243	NC_016788	GCC	2	6	2331777	2331782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249511
47244	NC_016788	TCG	2	6	2331838	2331843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249511
47245	NC_016788	CCA	2	6	2331859	2331864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249511
47246	NC_016788	ATAA	2	8	2332040	2332047	75 %	25 %	0 %	0 %	376249511
47247	NC_016788	ACC	2	6	2332071	2332076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249511
47248	NC_016788	ACA	2	6	2332077	2332082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249511
47249	NC_016788	GCC	2	6	2332085	2332090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249511
47250	NC_016788	CG	3	6	2332151	2332156	0 %	0 %	50 %	50 %	376249511
47251	NC_016788	TGCC	2	8	2332198	2332205	0 %	25 %	25 %	50 %	376249511
47252	NC_016788	ACC	2	6	2332245	2332250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249512
47253	NC_016788	TCGT	2	8	2332266	2332273	0 %	50 %	25 %	25 %	376249512
47254	NC_016788	CGCA	2	8	2332309	2332316	25 %	0 %	25 %	50 %	376249512
47255	NC_016788	ATC	2	6	2332350	2332355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249512
47256	NC_016788	CCA	2	6	2332420	2332425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249512
47257	NC_016788	CAA	2	6	2332469	2332474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249512
47258	NC_016788	TAC	2	6	2332517	2332522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249512
47259	NC_016788	CAT	2	6	2332561	2332566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249512
47260	NC_016788	CAA	2	6	2332571	2332576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249512
47261	NC_016788	CCG	2	6	2332731	2332736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249512
47262	NC_016788	CAC	2	6	2332766	2332771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249512
47263	NC_016788	ACG	2	6	2332799	2332804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249512
47264	NC_016788	CGGG	2	8	2332821	2332828	0 %	0 %	75 %	25 %	376249512
47265	NC_016788	AC	3	6	2332857	2332862	50 %	0 %	0 %	50 %	376249512
47266	NC_016788	GAT	2	6	2332889	2332894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249512
47267	NC_016788	GCC	2	6	2332915	2332920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249512
47268	NC_016788	AACG	2	8	2332931	2332938	50 %	0 %	25 %	25 %	376249512
47269	NC_016788	CTT	2	6	2333080	2333085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249513
47270	NC_016788	CTG	2	6	2333152	2333157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47271	NC_016788	GTT	2	6	2333158	2333163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249513
47272	NC_016788	TGC	2	6	2333215	2333220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47273	NC_016788	GT	3	6	2333222	2333227	0 %	50 %	50 %	0 %	376249513
47274	NC_016788	GAC	2	6	2333262	2333267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47275	NC_016788	GGT	2	6	2333278	2333283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249513
47276	NC_016788	TCGAGG	2	12	2333289	2333300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376249513
47277	NC_016788	GCA	2	6	2333357	2333362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47278	NC_016788	CGC	2	6	2333376	2333381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249513
47279	NC_016788	CAG	2	6	2333415	2333420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47280	NC_016788	TGC	2	6	2333456	2333461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47281	NC_016788	AAAC	2	8	2333487	2333494	75 %	0 %	0 %	25 %	376249513
47282	NC_016788	ACG	2	6	2333563	2333568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47283	NC_016788	AGC	2	6	2333571	2333576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47284	NC_016788	GAT	2	6	2333617	2333622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249513
47285	NC_016788	TGG	2	6	2333630	2333635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249513
47286	NC_016788	TCA	2	6	2333678	2333683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249513
47287	NC_016788	GTA	2	6	2333692	2333697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249513
47288	NC_016788	ATC	2	6	2333768	2333773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249513
47289	NC_016788	GTA	2	6	2333854	2333859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249513
47290	NC_016788	CAC	2	6	2333868	2333873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249513
47291	NC_016788	CCA	2	6	2333999	2334004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249513
47292	NC_016788	AAC	2	6	2334019	2334024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249513
47293	NC_016788	CCT	2	6	2334078	2334083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249513
47294	NC_016788	CCG	2	6	2334084	2334089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249513
47295	NC_016788	TCT	2	6	2334162	2334167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249513
47296	NC_016788	GC	3	6	2334188	2334193	0 %	0 %	50 %	50 %	376249513
47297	NC_016788	GTC	2	6	2334196	2334201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47298	NC_016788	GAG	2	6	2334241	2334246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249513
47299	NC_016788	CCA	2	6	2334252	2334257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249513
47300	NC_016788	GAC	2	6	2334295	2334300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249513
47301	NC_016788	GGA	2	6	2334315	2334320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249513
47302	NC_016788	ATCA	2	8	2334328	2334335	50 %	25 %	0 %	25 %	376249513
47303	NC_016788	GGT	2	6	2334370	2334375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47304	NC_016788	CTGA	2	8	2334497	2334504	25 %	25 %	25 %	25 %	376249514
47305	NC_016788	GAA	2	6	2334548	2334553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249514
47306	NC_016788	GC	3	6	2334643	2334648	0 %	0 %	50 %	50 %	376249514
47307	NC_016788	CGT	2	6	2334744	2334749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249514
47308	NC_016788	CGA	2	6	2334754	2334759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249514
47309	NC_016788	GCC	2	6	2334764	2334769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249514
47310	NC_016788	CGT	2	6	2334826	2334831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249514
47311	NC_016788	CACC	2	8	2334868	2334875	25 %	0 %	0 %	75 %	376249514
47312	NC_016788	CGG	3	9	2334892	2334900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249514
47313	NC_016788	ACG	2	6	2334918	2334923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249514
47314	NC_016788	ACCTG	2	10	2334946	2334955	20 %	20 %	20 %	40 %	376249514
47315	NC_016788	ACG	2	6	2334963	2334968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249514
47316	NC_016788	TA	3	6	2334969	2334974	50 %	50 %	0 %	0 %	376249514
47317	NC_016788	CAC	2	6	2335036	2335041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249514
47318	NC_016788	GCC	2	6	2335049	2335054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249514
47319	NC_016788	CG	3	6	2335066	2335071	0 %	0 %	50 %	50 %	376249514
47320	NC_016788	ACT	2	6	2335099	2335104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249514
47321	NC_016788	CACGCA	2	12	2335118	2335129	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	376249514
47322	NC_016788	GTG	2	6	2335147	2335152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249514
47323	NC_016788	ACCG	2	8	2335169	2335176	25 %	0 %	25 %	50 %	376249514
47324	NC_016788	AGT	2	6	2335203	2335208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249514
47325	NC_016788	GCT	2	6	2335254	2335259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249515
47326	NC_016788	GCG	2	6	2335273	2335278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249515
47327	NC_016788	CGTACA	2	12	2335285	2335296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376249515
47328	NC_016788	GCC	2	6	2335353	2335358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249515
47329	NC_016788	CGG	2	6	2335415	2335420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249515
47330	NC_016788	TCC	2	6	2335476	2335481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249515
47331	NC_016788	CAA	2	6	2335520	2335525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249515
47332	NC_016788	CGC	2	6	2335526	2335531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249515
47333	NC_016788	GAA	2	6	2335566	2335571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249515
47334	NC_016788	GAT	2	6	2335710	2335715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249515
47335	NC_016788	ATC	2	6	2335728	2335733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249515
47336	NC_016788	CTG	2	6	2335791	2335796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249515
47337	NC_016788	CGC	2	6	2335802	2335807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249515
47338	NC_016788	AGT	2	6	2335862	2335867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249515
47339	NC_016788	ACC	2	6	2335921	2335926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249515
47340	NC_016788	ACA	2	6	2335928	2335933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249515
47341	NC_016788	TGG	2	6	2335964	2335969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249515
47342	NC_016788	CGA	2	6	2335970	2335975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249515
47343	NC_016788	CTA	2	6	2335982	2335987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249515
47344	NC_016788	GGT	2	6	2336037	2336042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249515
47345	NC_016788	TGC	2	6	2336098	2336103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249515
47346	NC_016788	CAT	2	6	2336213	2336218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249516
47347	NC_016788	GAG	2	6	2336235	2336240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249516
47348	NC_016788	CGA	2	6	2336255	2336260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249516
47349	NC_016788	CGC	2	6	2336267	2336272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249516
47350	NC_016788	CCGA	2	8	2336290	2336297	25 %	0 %	25 %	50 %	376249516
47351	NC_016788	GAG	2	6	2336334	2336339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249516
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47357	NC_016788	GC	3	6	2337149	2337154	0 %	0 %	50 %	50 %	376249517
47358	NC_016788	GGAT	2	8	2337249	2337256	25 %	25 %	50 %	0 %	376249517
47359	NC_016788	GC	3	6	2337257	2337262	0 %	0 %	50 %	50 %	376249517
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47382	NC_016788	CACTGC	2	12	2338287	2338298	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376249518
47383	NC_016788	CGGC	2	8	2338369	2338376	0 %	0 %	50 %	50 %	376249518
47384	NC_016788	GTC	2	6	2338377	2338382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249518
47385	NC_016788	GCG	2	6	2338444	2338449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249518
47386	NC_016788	GTT	2	6	2338495	2338500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47387	NC_016788	GCT	2	6	2338536	2338541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249519
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47454	NC_016788	TTTC	2	8	2340997	2341004	0 %	75 %	0 %	25 %	376249521
47455	NC_016788	GAA	2	6	2341020	2341025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249521
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47463	NC_016788	TCA	2	6	2341415	2341420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249522
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