MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_016788	AAC	2	6	2176796	2176801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249401
44003	NC_016788	GCG	2	6	2176837	2176842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249401
44004	NC_016788	CCAGCA	2	12	2176863	2176874	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	376249401
44005	NC_016788	AAC	2	6	2176892	2176897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249401
44006	NC_016788	TC	3	6	2176929	2176934	0 %	50 %	0 %	50 %	376249401
44007	NC_016788	GTG	2	6	2176951	2176956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249401
44008	NC_016788	CAC	2	6	2176992	2176997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249401
44009	NC_016788	ATAC	2	8	2177061	2177068	50 %	25 %	0 %	25 %	376249401
44010	NC_016788	GCCAC	2	10	2177069	2177078	20 %	0 %	20 %	60 %	376249401
44011	NC_016788	GCC	2	6	2177086	2177091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249401
44012	NC_016788	GGTTA	2	10	2177099	2177108	20 %	40 %	40 %	0 %	376249401
44013	NC_016788	CAA	2	6	2177155	2177160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249401
44014	NC_016788	GC	3	6	2177196	2177201	0 %	0 %	50 %	50 %	376249401
44015	NC_016788	CGT	2	6	2177250	2177255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249401
44016	NC_016788	CCCA	2	8	2177322	2177329	25 %	0 %	0 %	75 %	376249401
44017	NC_016788	AACA	2	8	2177403	2177410	75 %	0 %	0 %	25 %	376249401
44018	NC_016788	GCC	2	6	2177416	2177421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249401
44019	NC_016788	GGCG	2	8	2177481	2177488	0 %	0 %	75 %	25 %	376249401
44020	NC_016788	TAG	2	6	2177565	2177570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249401
44021	NC_016788	CTTGC	2	10	2177594	2177603	0 %	40 %	20 %	40 %	376249402
44022	NC_016788	CGT	2	6	2177629	2177634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249402
44023	NC_016788	GGA	2	6	2177784	2177789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249402
44024	NC_016788	TCT	2	6	2177922	2177927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249402
44025	NC_016788	GTC	2	6	2177981	2177986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249402
44026	NC_016788	ACC	2	6	2178053	2178058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249402
44027	NC_016788	CAG	2	6	2178155	2178160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249402
44028	NC_016788	ACTCGC	2	12	2178289	2178300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376249402
44029	NC_016788	TGG	2	6	2178410	2178415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249402
44030	NC_016788	CGG	2	6	2178442	2178447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249402
44031	NC_016788	CGT	2	6	2178526	2178531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249402
44032	NC_016788	GCG	2	6	2178567	2178572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249402
44033	NC_016788	CCCA	2	8	2178719	2178726	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
44034	NC_016788	TCA	2	6	2178780	2178785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249403
44035	NC_016788	AAG	2	6	2178794	2178799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249403
44036	NC_016788	CTG	2	6	2178809	2178814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249403
44037	NC_016788	CAT	2	6	2178827	2178832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249403
44038	NC_016788	TGC	2	6	2178878	2178883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249403
44039	NC_016788	CA	3	6	2178975	2178980	50 %	0 %	0 %	50 %	376249403
44040	NC_016788	TCA	2	6	2179026	2179031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249403
44041	NC_016788	GTCAT	2	10	2179089	2179098	20 %	40 %	20 %	20 %	376249403
44042	NC_016788	TAG	2	6	2179128	2179133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249403
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44044	NC_016788	CCT	2	6	2179189	2179194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249403
44045	NC_016788	CAT	2	6	2179256	2179261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249403
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44047	NC_016788	GTC	2	6	2179436	2179441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249403
44048	NC_016788	ATG	2	6	2179449	2179454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249403
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44051	NC_016788	GGA	3	9	2179586	2179594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376249403
44052	NC_016788	GCG	2	6	2179734	2179739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249403
44053	NC_016788	CGG	2	6	2179927	2179932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249403
44054	NC_016788	CAGCGA	2	12	2179972	2179983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249403
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44056	NC_016788	TGC	2	6	2180069	2180074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249403
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44058	NC_016788	CAG	3	9	2180107	2180115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249403
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44061	NC_016788	GCC	2	6	2180201	2180206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249403
44062	NC_016788	GTCA	2	8	2180279	2180286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44063	NC_016788	AGA	2	6	2180293	2180298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44064	NC_016788	AAAG	2	8	2180334	2180341	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44065	NC_016788	CAC	2	6	2180408	2180413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44066	NC_016788	TAAAA	2	10	2180515	2180524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44067	NC_016788	A	7	7	2180521	2180527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44068	NC_016788	ATT	2	6	2180566	2180571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249404
44069	NC_016788	CGA	2	6	2180638	2180643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249404
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44071	NC_016788	CAA	2	6	2180664	2180669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249404
44072	NC_016788	GA	3	6	2180796	2180801	50 %	0 %	50 %	0 %	376249404
44073	NC_016788	TAG	2	6	2180863	2180868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249404
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44075	NC_016788	AATT	2	8	2180890	2180897	50 %	50 %	0 %	0 %	376249404
44076	NC_016788	CT	3	6	2180963	2180968	0 %	50 %	0 %	50 %	376249404
44077	NC_016788	TGCA	2	8	2180982	2180989	25 %	25 %	25 %	25 %	376249404
44078	NC_016788	ACT	2	6	2181095	2181100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249404
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44082	NC_016788	ATTCA	2	10	2181236	2181245	40 %	40 %	0 %	20 %	376249404
44083	NC_016788	T	6	6	2181284	2181289	0 %	100 %	0 %	0 %	376249404
44084	NC_016788	GTT	2	6	2181380	2181385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249404
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44088	NC_016788	TTAA	2	8	2181503	2181510	50 %	50 %	0 %	0 %	376249404
44089	NC_016788	GCT	2	6	2181518	2181523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249404
44090	NC_016788	TGC	2	6	2181529	2181534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249404
44091	NC_016788	CCAA	2	8	2181536	2181543	50 %	0 %	0 %	50 %	376249404
44092	NC_016788	CTT	2	6	2181581	2181586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249404
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44099	NC_016788	GTT	2	6	2182052	2182057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249404
44100	NC_016788	CTGGA	2	10	2182072	2182081	20 %	20 %	40 %	20 %	376249404
44101	NC_016788	ATT	2	6	2182082	2182087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249404
44102	NC_016788	AGC	2	6	2182105	2182110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249404
44103	NC_016788	TTC	2	6	2182124	2182129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249404
44104	NC_016788	ACG	2	6	2182223	2182228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249405
44105	NC_016788	ACT	2	6	2182242	2182247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249405
44106	NC_016788	CAC	2	6	2182276	2182281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249405
44107	NC_016788	TCA	2	6	2182308	2182313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249405
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44110	NC_016788	CGT	2	6	2182447	2182452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249405
44111	NC_016788	CCA	2	6	2182470	2182475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249405
44112	NC_016788	GCA	2	6	2182554	2182559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249405
44113	NC_016788	CAGC	2	8	2182635	2182642	25 %	0 %	25 %	50 %	376249406
44114	NC_016788	GC	3	6	2182683	2182688	0 %	0 %	50 %	50 %	376249406
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44116	NC_016788	CGC	2	6	2182703	2182708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249406
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44350	NC_016788	GATC	2	8	2193528	2193535	25 %	25 %	25 %	25 %	376249414
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44449	NC_016788	CAA	2	6	2198254	2198259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44450	NC_016788	AGT	2	6	2198357	2198362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44451	NC_016788	CCGG	2	8	2198390	2198397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44452	NC_016788	GTT	2	6	2198440	2198445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44453	NC_016788	GT	3	6	2198447	2198452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44454	NC_016788	CAC	4	12	2198500	2198511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44458	NC_016788	A	8	8	2198622	2198629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44459	NC_016788	CCA	2	6	2198641	2198646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44461	NC_016788	AC	4	8	2198663	2198670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44462	NC_016788	AC	4	8	2198680	2198687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44463	NC_016788	ATGCGC	2	12	2198688	2198699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44466	NC_016788	CATA	2	8	2198735	2198742	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44467	NC_016788	GTT	2	6	2198772	2198777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44468	NC_016788	T	6	6	2198802	2198807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44469	NC_016788	GGC	2	6	2198820	2198825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44470	NC_016788	ACC	2	6	2198924	2198929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44471	NC_016788	AC	4	8	2198931	2198938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44472	NC_016788	AACC	2	8	2198939	2198946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44473	NC_016788	TGCCA	2	10	2198965	2198974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44474	NC_016788	CAG	2	6	2198984	2198989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44475	NC_016788	CAA	2	6	2199033	2199038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44476	NC_016788	T	7	7	2199064	2199070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44477	NC_016788	AC	3	6	2199078	2199083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44478	NC_016788	TTA	2	6	2199086	2199091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44479	NC_016788	TAC	2	6	2199126	2199131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44480	NC_016788	TCCC	2	8	2199230	2199237	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44481	NC_016788	CGTC	2	8	2199291	2199298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44482	NC_016788	CTT	2	6	2199324	2199329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44483	NC_016788	CG	4	8	2199340	2199347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44484	NC_016788	ACG	2	6	2199371	2199376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44485	NC_016788	CGA	2	6	2199451	2199456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44487	NC_016788	AGG	2	6	2199702	2199707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44488	NC_016788	CCA	2	6	2199729	2199734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44489	NC_016788	CG	3	6	2199920	2199925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44490	NC_016788	CAG	2	6	2199976	2199981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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44492	NC_016788	A	6	6	2200098	2200103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44493	NC_016788	TAA	2	6	2200194	2200199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44494	NC_016788	ACC	3	9	2200226	2200234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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44497	NC_016788	CTA	2	6	2200557	2200562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44499	NC_016788	CA	3	6	2200595	2200600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44500	NC_016788	CAG	2	6	2200611	2200616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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