MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35005	NC_016788	TTC	2	6	1745150	1745155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376248999
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35009	NC_016788	GAACCT	2	12	1745335	1745346	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376248999
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35030	NC_016788	TGA	2	6	1746406	1746411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249000
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35348	NC_016788	GCT	2	6	1761716	1761721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249014
35349	NC_016788	CTG	2	6	1761732	1761737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249014
35350	NC_016788	AGC	2	6	1761791	1761796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249014
35351	NC_016788	TGT	2	6	1761821	1761826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249014
35352	NC_016788	TGG	2	6	1761831	1761836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249014
35353	NC_016788	GGCC	2	8	1761857	1761864	0 %	0 %	50 %	50 %	376249014
35354	NC_016788	GC	3	6	1761897	1761902	0 %	0 %	50 %	50 %	376249014
35355	NC_016788	TGG	2	6	1761934	1761939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249014
35356	NC_016788	CTC	2	6	1761945	1761950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249014
35357	NC_016788	AGT	2	6	1761975	1761980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249014
35358	NC_016788	TGTT	2	8	1762015	1762022	0 %	75 %	25 %	0 %	376249014
35359	NC_016788	CAT	2	6	1762049	1762054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249014
35360	NC_016788	GC	3	6	1762228	1762233	0 %	0 %	50 %	50 %	376249014
35361	NC_016788	CTT	2	6	1762240	1762245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249014
35362	NC_016788	ATT	2	6	1762337	1762342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249015
35363	NC_016788	ACG	3	9	1762362	1762370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249015
35364	NC_016788	CGC	2	6	1762387	1762392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249015
35365	NC_016788	CTG	2	6	1762412	1762417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249015
35366	NC_016788	CAC	2	6	1762423	1762428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249015
35367	NC_016788	CGG	2	6	1762432	1762437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249015
35368	NC_016788	GTT	2	6	1762475	1762480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249015
35369	NC_016788	GTT	2	6	1762518	1762523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249015
35370	NC_016788	CGTG	2	8	1762534	1762541	0 %	25 %	50 %	25 %	376249015
35371	NC_016788	TGGAA	2	10	1762576	1762585	40 %	20 %	40 %	0 %	376249015
35372	NC_016788	CAG	2	6	1762611	1762616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249015
35373	NC_016788	TAT	2	6	1762648	1762653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249015
35374	NC_016788	CAT	2	6	1762660	1762665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249015
35375	NC_016788	GGC	2	6	1762726	1762731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249015
35376	NC_016788	GC	3	6	1762730	1762735	0 %	0 %	50 %	50 %	376249015
35377	NC_016788	AAG	2	6	1762764	1762769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249015
35378	NC_016788	GCG	2	6	1762782	1762787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249015
35379	NC_016788	AGC	2	6	1762846	1762851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249015
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35382	NC_016788	ACC	2	6	1763135	1763140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249015
35383	NC_016788	AGC	2	6	1763194	1763199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249015
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35385	NC_016788	GGC	2	6	1763343	1763348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249016
35386	NC_016788	TGCCA	2	10	1763355	1763364	20 %	20 %	20 %	40 %	376249016
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35388	NC_016788	TCG	2	6	1763483	1763488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249016
35389	NC_016788	TCC	2	6	1763503	1763508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249016
35390	NC_016788	AGT	2	6	1763532	1763537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249016
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35392	NC_016788	TGC	2	6	1763673	1763678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249016
35393	NC_016788	GCC	2	6	1763695	1763700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249016
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35395	NC_016788	CCCA	2	8	1763794	1763801	25 %	0 %	0 %	75 %	376249016
35396	NC_016788	CAC	3	9	1763892	1763900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249016
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35400	NC_016788	GAC	2	6	1764075	1764080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249016
35401	NC_016788	TGG	2	6	1764217	1764222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249017
35402	NC_016788	GTT	2	6	1764276	1764281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249017
35403	NC_016788	AGC	2	6	1764342	1764347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249017
35404	NC_016788	TCC	2	6	1764461	1764466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249017
35405	NC_016788	ACT	2	6	1764467	1764472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249017
35406	NC_016788	C	6	6	1764486	1764491	0 %	0 %	0 %	100 %	376249017
35407	NC_016788	GCA	2	6	1764550	1764555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249017
35408	NC_016788	GCA	2	6	1764580	1764585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249017
35409	NC_016788	TCC	2	6	1764587	1764592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249017
35410	NC_016788	A	7	7	1764610	1764616	100 %	0 %	0 %	0 %	376249017
35411	NC_016788	CGG	2	6	1764633	1764638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249017
35412	NC_016788	ACCT	2	8	1764679	1764686	25 %	25 %	0 %	50 %	376249017
35413	NC_016788	TGG	2	6	1764790	1764795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249017
35414	NC_016788	AGC	2	6	1764797	1764802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249017
35415	NC_016788	GCAA	2	8	1764803	1764810	50 %	0 %	25 %	25 %	376249017
35416	NC_016788	GCTGTG	4	24	1764815	1764838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35417	NC_016788	GCC	2	6	1765002	1765007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249018
35418	NC_016788	TAA	2	6	1765019	1765024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376249018
35419	NC_016788	CTT	2	6	1765077	1765082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249018
35420	NC_016788	TGT	2	6	1765088	1765093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376249018
35421	NC_016788	ACT	2	6	1765110	1765115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249018
35422	NC_016788	CAT	2	6	1765313	1765318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249018
35423	NC_016788	TCT	2	6	1765421	1765426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249018
35424	NC_016788	GAA	2	6	1765467	1765472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249018
35425	NC_016788	GATG	2	8	1765481	1765488	25 %	25 %	50 %	0 %	376249018
35426	NC_016788	TCG	2	6	1765498	1765503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35427	NC_016788	ACG	2	6	1765513	1765518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35428	NC_016788	TGCG	2	8	1765581	1765588	0 %	25 %	50 %	25 %	376249018
35429	NC_016788	TGTT	2	8	1765599	1765606	0 %	75 %	25 %	0 %	376249018
35430	NC_016788	GA	3	6	1765691	1765696	50 %	0 %	50 %	0 %	376249018
35431	NC_016788	GGT	2	6	1765779	1765784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249018
35432	NC_016788	TGA	2	6	1765820	1765825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249018
35433	NC_016788	AACT	2	8	1765862	1765869	50 %	25 %	0 %	25 %	376249018
35434	NC_016788	GCAT	2	8	1765945	1765952	25 %	25 %	25 %	25 %	376249018
35435	NC_016788	CT	3	6	1766003	1766008	0 %	50 %	0 %	50 %	376249018
35436	NC_016788	AAC	2	6	1766068	1766073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249018
35437	NC_016788	CTGC	2	8	1766119	1766126	0 %	25 %	25 %	50 %	376249018
35438	NC_016788	ATCG	2	8	1766348	1766355	25 %	25 %	25 %	25 %	376249018
35439	NC_016788	CGC	2	6	1766390	1766395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249018
35440	NC_016788	ACTG	2	8	1766424	1766431	25 %	25 %	25 %	25 %	376249018
35441	NC_016788	ATT	2	6	1766466	1766471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376249018
35442	NC_016788	CCG	2	6	1766478	1766483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249018
35443	NC_016788	GCC	2	6	1766589	1766594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249018
35444	NC_016788	AT	3	6	1766597	1766602	50 %	50 %	0 %	0 %	376249018
35445	NC_016788	ACGGA	2	10	1766605	1766614	40 %	0 %	40 %	20 %	376249018
35446	NC_016788	CCA	2	6	1766635	1766640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376249018
35447	NC_016788	CTC	2	6	1766668	1766673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249018
35448	NC_016788	GCA	2	6	1766745	1766750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35449	NC_016788	TCT	2	6	1766764	1766769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249018
35450	NC_016788	CAT	2	6	1766771	1766776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249018
35451	NC_016788	CG	3	6	1766827	1766832	0 %	0 %	50 %	50 %	376249018
35452	NC_016788	GCC	2	6	1766930	1766935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376249018
35453	NC_016788	GAT	2	6	1766936	1766941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249018
35454	NC_016788	AACC	2	8	1766953	1766960	50 %	0 %	0 %	50 %	376249018
35455	NC_016788	CTT	2	6	1766976	1766981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249018
35456	NC_016788	AGA	2	6	1766987	1766992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249018
35457	NC_016788	GAA	2	6	1766997	1767002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249018
35458	NC_016788	AT	3	6	1767032	1767037	50 %	50 %	0 %	0 %	376249018
35459	NC_016788	GTC	2	6	1767176	1767181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35460	NC_016788	A	6	6	1767183	1767188	100 %	0 %	0 %	0 %	376249018
35461	NC_016788	AAG	2	6	1767201	1767206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376249018
35462	NC_016788	CGA	2	6	1767248	1767253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35463	NC_016788	AGAA	2	8	1767284	1767291	75 %	0 %	25 %	0 %	376249018
35464	NC_016788	ACA	2	6	1767472	1767477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249018
35465	NC_016788	GAT	2	6	1767498	1767503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376249018
35466	NC_016788	ACGC	2	8	1767547	1767554	25 %	0 %	25 %	50 %	376249018
35467	NC_016788	CGA	2	6	1767686	1767691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376249018
35468	NC_016788	AATC	2	8	1767750	1767757	50 %	25 %	0 %	25 %	376249019
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35483	NC_016788	CTC	2	6	1768353	1768358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249019
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35485	NC_016788	GCG	2	6	1768428	1768433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376249019
35486	NC_016788	TCA	2	6	1768560	1768565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376249019
35487	NC_016788	TGC	2	6	1768603	1768608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376249019
35488	NC_016788	TCT	2	6	1768894	1768899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376249020
35489	NC_016788	TGGCT	2	10	1769005	1769014	0 %	40 %	40 %	20 %	376249020
35490	NC_016788	TGG	2	6	1769020	1769025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249020
35491	NC_016788	TGG	2	6	1769030	1769035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376249020
35492	NC_016788	GC	3	6	1769036	1769041	0 %	0 %	50 %	50 %	376249020
35493	NC_016788	C	6	6	1769054	1769059	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35494	NC_016788	CAA	2	6	1769205	1769210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249021
35495	NC_016788	CAA	2	6	1769316	1769321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376249021
35496	NC_016788	CCTT	2	8	1769327	1769334	0 %	50 %	0 %	50 %	376249021
35497	NC_016788	T	6	6	1769360	1769365	0 %	100 %	0 %	0 %	376249021
35498	NC_016788	A	6	6	1769378	1769383	100 %	0 %	0 %	0 %	376249021
35499	NC_016788	TCC	2	6	1769480	1769485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376249021
35500	NC_016788	TG	3	6	1769543	1769548	0 %	50 %	50 %	0 %	376249021

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