MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	CTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
2	NC_016788	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
3	NC_016788	CT	3	6	232	237	0 %	50 %	0 %	50 %	376247368
4	NC_016788	CGT	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
5	NC_016788	CAC	2	6	340	345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
6	NC_016788	ACT	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247368
7	NC_016788	ACA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
8	NC_016788	CGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
9	NC_016788	CAC	2	6	463	468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
10	NC_016788	CAG	2	6	508	513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
11	NC_016788	CAA	2	6	514	519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
12	NC_016788	TCG	3	9	540	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
13	NC_016788	AGC	3	9	557	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
14	NC_016788	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247368
15	NC_016788	CGC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247368
16	NC_016788	GA	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	376247368
17	NC_016788	CAA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247368
18	NC_016788	CGG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
19	NC_016788	GC	4	8	742	749	0 %	0 %	50 %	50 %	376247368
20	NC_016788	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247368
21	NC_016788	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247368
22	NC_016788	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
23	NC_016788	TTC	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247368
24	NC_016788	CA	3	6	1012	1017	50 %	0 %	0 %	50 %	376247368
25	NC_016788	GCA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
26	NC_016788	CCGC	2	8	1065	1072	0 %	0 %	25 %	75 %	376247368
27	NC_016788	CCA	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247368
28	NC_016788	CGG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
29	NC_016788	ATG	2	6	1354	1359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247368
30	NC_016788	GCAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	376247368
31	NC_016788	CGG	2	6	1385	1390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247368
32	NC_016788	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247368
33	NC_016788	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247368
34	NC_016788	ACG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
35	NC_016788	CAG	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
36	NC_016788	GCA	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247368
37	NC_016788	GGT	2	6	1717	1722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016788	ACA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016788	GT	3	6	1805	1810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016788	GCC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_016788	AGCGA	2	10	2150	2159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016788	AAG	2	6	2241	2246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016788	CTC	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016788	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016788	GAG	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016788	GAC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
47	NC_016788	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	376247369
48	NC_016788	CCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247369
49	NC_016788	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	376247369
50	NC_016788	TCA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247369
51	NC_016788	CCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247369
52	NC_016788	GCCA	2	8	2515	2522	25 %	0 %	25 %	50 %	376247369
53	NC_016788	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247369
54	NC_016788	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
55	NC_016788	TTC	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247369
56	NC_016788	CGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
57	NC_016788	TGC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
58	NC_016788	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
59	NC_016788	ACG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
60	NC_016788	GCT	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
61	NC_016788	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247369
62	NC_016788	ACC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247369
63	NC_016788	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247369
64	NC_016788	CCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247369
65	NC_016788	CGA	2	6	3209	3214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247369
66	NC_016788	TC	3	6	3221	3226	0 %	50 %	0 %	50 %	376247369
67	NC_016788	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247369
68	NC_016788	CCGTG	2	10	3262	3271	0 %	20 %	40 %	40 %	376247369
69	NC_016788	AAGC	2	8	3424	3431	50 %	0 %	25 %	25 %	376247369
70	NC_016788	ACCT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	376247369
71	NC_016788	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
72	NC_016788	TTG	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
73	NC_016788	GT	3	6	3699	3704	0 %	50 %	50 %	0 %	376247370
74	NC_016788	GT	3	6	3747	3752	0 %	50 %	50 %	0 %	376247370
75	NC_016788	GCT	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
76	NC_016788	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
77	NC_016788	TGC	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
78	NC_016788	CAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247370
79	NC_016788	TGC	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
80	NC_016788	CGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
81	NC_016788	GAT	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
82	NC_016788	TG	3	6	4102	4107	0 %	50 %	50 %	0 %	376247370
83	NC_016788	TGG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247370
84	NC_016788	TCAT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	376247370
85	NC_016788	ATG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
86	NC_016788	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247370
87	NC_016788	TGCT	2	8	4305	4312	0 %	50 %	25 %	25 %	376247370
88	NC_016788	TGG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247370
89	NC_016788	TGA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
90	NC_016788	TGT	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247370
91	NC_016788	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
92	NC_016788	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
93	NC_016788	GAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
94	NC_016788	CGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247370
95	NC_016788	GGTG	2	8	4606	4613	0 %	25 %	75 %	0 %	376247370
96	NC_016788	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247370
97	NC_016788	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247370
98	NC_016788	ATG	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247370
99	NC_016788	CTG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
100	NC_016788	AGG	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247371
101	NC_016788	A	6	6	4779	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	376247371
102	NC_016788	ACG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247371
103	NC_016788	AAC	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247371
104	NC_016788	GTC	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
105	NC_016788	GGC	3	9	4909	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247371
106	NC_016788	TGGC	2	8	4973	4980	0 %	25 %	50 %	25 %	376247371
107	NC_016788	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247371
108	NC_016788	TGG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247371
109	NC_016788	TGC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247371
110	NC_016788	ATG	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247371
111	NC_016788	ATT	2	6	5139	5144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247371
112	NC_016788	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247371
113	NC_016788	GGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247371
114	NC_016788	CAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
115	NC_016788	CGA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
116	NC_016788	CGG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247372
117	NC_016788	GGT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247372
118	NC_016788	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
119	NC_016788	CG	3	6	5867	5872	0 %	0 %	50 %	50 %	376247372
120	NC_016788	ACC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
121	NC_016788	ACC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247372
122	NC_016788	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
123	NC_016788	GAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
124	NC_016788	CTG	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
125	NC_016788	TCGATG	2	12	6091	6102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376247372
126	NC_016788	CTG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247372
127	NC_016788	AAG	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
128	NC_016788	GAA	3	9	6146	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247372
129	NC_016788	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247372
130	NC_016788	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	376247372
131	NC_016788	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247372
132	NC_016788	CGA	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247372
133	NC_016788	AAC	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247372
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261	NC_016788	T	6	6	12015	12020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016788	CCT	2	6	12022	12027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_016788	CG	3	6	12068	12073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
264	NC_016788	TTC	2	6	12235	12240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247378
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274	NC_016788	TAATCC	2	12	12936	12947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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372	NC_016788	TTG	2	6	17583	17588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247382
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