MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 49319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016786	CTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244563
2	NC_016786	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244563
3	NC_016786	CGT	2	6	238	243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244563
4	NC_016786	CAC	2	6	340	345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244563
5	NC_016786	ACT	2	6	362	367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244563
6	NC_016786	ACA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244563
7	NC_016786	CGA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
8	NC_016786	TCG	3	9	531	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244563
9	NC_016786	AGC	3	9	548	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
10	NC_016786	GAA	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244563
11	NC_016786	CGC	2	6	595	600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244563
12	NC_016786	GA	3	6	603	608	50 %	0 %	50 %	0 %	376244563
13	NC_016786	CAA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244563
14	NC_016786	CGG	2	6	704	709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244563
15	NC_016786	GC	4	8	733	740	0 %	0 %	50 %	50 %	376244563
16	NC_016786	TTC	2	6	852	857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244563
17	NC_016786	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244563
18	NC_016786	CGA	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
19	NC_016786	TTC	2	6	997	1002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244563
20	NC_016786	CA	3	6	1003	1008	50 %	0 %	0 %	50 %	376244563
21	NC_016786	GCA	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
22	NC_016786	CCGC	2	8	1056	1063	0 %	0 %	25 %	75 %	376244563
23	NC_016786	CCA	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244563
24	NC_016786	CGG	2	6	1181	1186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244563
25	NC_016786	ATG	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244563
26	NC_016786	GCAG	2	8	1356	1363	25 %	0 %	50 %	25 %	376244563
27	NC_016786	CGG	2	6	1376	1381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244563
28	NC_016786	CTG	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244563
29	NC_016786	TGG	2	6	1539	1544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244563
30	NC_016786	ACG	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
31	NC_016786	ACG	2	6	1616	1621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
32	NC_016786	CAG	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
33	NC_016786	GCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244563
34	NC_016786	ACA	2	6	1726	1731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016786	A	7	7	1767	1773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016786	GT	3	6	1796	1801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016786	CCA	3	9	2012	2020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016786	CG	4	8	2137	2144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016786	AGCG	2	8	2146	2153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016786	AAG	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016786	CTC	2	6	2254	2259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016786	GATC	2	8	2279	2286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016786	GAG	2	6	2292	2297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016786	GAC	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244564
45	NC_016786	CCA	2	6	2386	2391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244564
46	NC_016786	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	376244564
47	NC_016786	TCA	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244564
48	NC_016786	CCG	2	6	2428	2433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244564
49	NC_016786	GCCA	2	8	2506	2513	25 %	0 %	25 %	50 %	376244564
50	NC_016786	CAT	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244564
51	NC_016786	TCG	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244564
52	NC_016786	TTC	2	6	2621	2626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244564
53	NC_016786	CGA	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244564
54	NC_016786	TGC	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244564
55	NC_016786	TGC	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244564
56	NC_016786	ACG	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244564
57	NC_016786	GCT	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244564
58	NC_016786	GAA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244564
59	NC_016786	ACC	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244564
60	NC_016786	GCT	2	6	3080	3085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244564
61	NC_016786	CCG	2	6	3143	3148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244564
62	NC_016786	CGA	2	6	3200	3205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244564
63	NC_016786	TC	3	6	3212	3217	0 %	50 %	0 %	50 %	376244564
64	NC_016786	TGG	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244564
65	NC_016786	CCGTG	2	10	3253	3262	0 %	20 %	40 %	40 %	376244564
66	NC_016786	AAGC	2	8	3415	3422	50 %	0 %	25 %	25 %	376244564
67	NC_016786	ACCT	2	8	3459	3466	25 %	25 %	0 %	50 %	376244564
68	NC_016786	TTG	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244565
69	NC_016786	TTG	2	6	3649	3654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244565
70	NC_016786	GT	3	6	3691	3696	0 %	50 %	50 %	0 %	376244565
71	NC_016786	AAAGA	2	10	3721	3730	80 %	0 %	20 %	0 %	376244565
72	NC_016786	GT	3	6	3739	3744	0 %	50 %	50 %	0 %	376244565
73	NC_016786	CTG	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
74	NC_016786	GCT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
75	NC_016786	GTT	2	6	3864	3869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244565
76	NC_016786	TGC	2	6	4003	4008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
77	NC_016786	CAG	2	6	4033	4038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244565
78	NC_016786	TGC	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
79	NC_016786	CGT	2	6	4050	4055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
80	NC_016786	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
81	NC_016786	TG	3	6	4094	4099	0 %	50 %	50 %	0 %	376244565
82	NC_016786	TGG	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244565
83	NC_016786	TCAT	2	8	4132	4139	25 %	50 %	0 %	25 %	376244565
84	NC_016786	ATG	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
85	NC_016786	TGT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244565
86	NC_016786	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244565
87	NC_016786	TGCT	2	8	4297	4304	0 %	50 %	25 %	25 %	376244565
88	NC_016786	TGG	2	6	4351	4356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244565
89	NC_016786	TGA	2	6	4367	4372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
90	NC_016786	TGC	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
91	NC_016786	ATG	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
92	NC_016786	GAT	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
93	NC_016786	CGT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244565
94	NC_016786	TCA	2	6	4585	4590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244565
95	NC_016786	GGTG	2	8	4598	4605	0 %	25 %	75 %	0 %	376244565
96	NC_016786	CGG	2	6	4633	4638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244565
97	NC_016786	CGC	2	6	4697	4702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244565
98	NC_016786	ATG	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244565
99	NC_016786	CTG	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244566
100	NC_016786	AGG	2	6	4763	4768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244566
101	NC_016786	A	6	6	4771	4776	100 %	0 %	0 %	0 %	376244566
102	NC_016786	ACG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244566
103	NC_016786	AAC	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244566
104	NC_016786	GTC	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244566
105	NC_016786	GGC	3	9	4901	4909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244566
106	NC_016786	GAT	2	6	5011	5016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244566
107	NC_016786	TGG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244566
108	NC_016786	TGC	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244566
109	NC_016786	ATG	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244566
110	NC_016786	TAT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376244566
111	NC_016786	ATC	2	6	5170	5175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244566
112	NC_016786	GGC	2	6	5213	5218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244566
113	NC_016786	CAC	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244567
114	NC_016786	CGA	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244567
115	NC_016786	CGG	2	6	5586	5591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244567
116	NC_016786	GGT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244567
117	NC_016786	CGT	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244567
118	NC_016786	ACC	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244567
119	NC_016786	ACC	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244567
120	NC_016786	CTT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244567
121	NC_016786	GAA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244567
122	NC_016786	TCGATG	2	12	6083	6094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376244567
123	NC_016786	CTG	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244567
124	NC_016786	AAG	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244567
125	NC_016786	AAG	2	6	6142	6147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244567
126	NC_016786	TCT	2	6	6152	6157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244567
127	NC_016786	CCACC	2	10	6213	6222	20 %	0 %	0 %	80 %	376244567
128	NC_016786	ATC	2	6	6223	6228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244567
129	NC_016786	AAC	2	6	6280	6285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244567
130	NC_016786	TGA	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244567
131	NC_016786	GCT	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244567
132	NC_016786	AAGGAA	2	12	6415	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244567
133	NC_016786	GAC	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244567
134	NC_016786	CCG	2	6	6464	6469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244567
135	NC_016786	ATC	2	6	6616	6621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244567
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156	NC_016786	TGC	2	6	7555	7560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244568
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255	NC_016786	TCA	2	6	11734	11739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_016786	GCA	2	6	11745	11750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_016786	TAT	2	6	11766	11771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016786	CCA	2	6	11881	11886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_016786	T	6	6	12001	12006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016786	CCT	2	6	12027	12032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_016786	CG	3	6	12073	12078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_016786	TTC	2	6	12240	12245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244573
263	NC_016786	GC	3	6	12250	12255	0 %	0 %	50 %	50 %	376244573
264	NC_016786	ATG	2	6	12364	12369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244573
265	NC_016786	GTC	2	6	12459	12464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244573
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270	NC_016786	AG	3	6	12759	12764	50 %	0 %	50 %	0 %	376244573
271	NC_016786	CTT	2	6	12857	12862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244573
272	NC_016786	TAATCC	2	12	12950	12961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_016786	GAG	2	6	13050	13055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244574
274	NC_016786	ACC	2	6	13064	13069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244574
275	NC_016786	GCG	2	6	13123	13128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244574
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283	NC_016786	GTC	2	6	13497	13502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244574
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499	NC_016786	TG	4	8	23496	23503	0 %	50 %	50 %	0 %	376244583
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