MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 44193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_016781	GAC	2	6	259258	259263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287826
5003	NC_016781	TGA	2	6	259358	259363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287826
5004	NC_016781	GCT	2	6	259484	259489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287827
5005	NC_016781	GAG	2	6	259515	259520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287827
5006	NC_016781	CAG	2	6	259632	259637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287827
5007	NC_016781	CTG	2	6	259690	259695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287827
5008	NC_016781	TCAA	2	8	259770	259777	50 %	25 %	0 %	25 %	375287827
5009	NC_016781	TGC	2	6	259847	259852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287827
5010	NC_016781	TGAT	2	8	259984	259991	25 %	50 %	25 %	0 %	375287827
5011	NC_016781	GGCA	2	8	260051	260058	25 %	0 %	50 %	25 %	375287827
5012	NC_016781	CCG	2	6	260068	260073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287827
5013	NC_016781	CAA	2	6	260084	260089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375287827
5014	NC_016781	TTC	2	6	260106	260111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287827
5015	NC_016781	GAC	2	6	260121	260126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287827
5016	NC_016781	ACTC	2	8	260154	260161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_016781	TCG	2	6	260299	260304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287828
5018	NC_016781	GTGG	2	8	260322	260329	0 %	25 %	75 %	0 %	375287828
5019	NC_016781	GC	3	6	260366	260371	0 %	0 %	50 %	50 %	375287828
5020	NC_016781	TGC	2	6	260388	260393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287828
5021	NC_016781	CTAC	2	8	260420	260427	25 %	25 %	0 %	50 %	375287828
5022	NC_016781	TTA	2	6	260429	260434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287828
5023	NC_016781	TGCTC	2	10	260454	260463	0 %	40 %	20 %	40 %	375287828
5024	NC_016781	TGG	2	6	260466	260471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287828
5025	NC_016781	CCA	2	6	260484	260489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375287828
5026	NC_016781	CGC	2	6	260494	260499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375287828
5027	NC_016781	ATGA	2	8	260626	260633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_016781	ATTA	2	8	260689	260696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_016781	CCT	2	6	260845	260850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375287829
5030	NC_016781	TGC	2	6	260919	260924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287829
5031	NC_016781	T	7	7	260930	260936	0 %	100 %	0 %	0 %	375287829
5032	NC_016781	TGGG	2	8	260980	260987	0 %	25 %	75 %	0 %	375287829
5033	NC_016781	GGC	2	6	260997	261002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287829
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5035	NC_016781	CG	3	6	261257	261262	0 %	0 %	50 %	50 %	375287829
5036	NC_016781	TTA	2	6	261323	261328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287829
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5039	NC_016781	GGC	2	6	261406	261411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287829
5040	NC_016781	AAG	2	6	261454	261459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287829
5041	NC_016781	GC	4	8	261501	261508	0 %	0 %	50 %	50 %	375287829
5042	NC_016781	CTT	2	6	261509	261514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287829
5043	NC_016781	TGG	2	6	261539	261544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287829
5044	NC_016781	GGCA	2	8	261614	261621	25 %	0 %	50 %	25 %	375287829
5045	NC_016781	TGA	2	6	261648	261653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287829
5046	NC_016781	TGC	2	6	261732	261737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287829
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5050	NC_016781	ATT	2	6	261943	261948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287829
5051	NC_016781	TGG	2	6	262004	262009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287829
5052	NC_016781	CTG	2	6	262131	262136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_016781	CTT	2	6	262199	262204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287830
5054	NC_016781	GGC	2	6	262207	262212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287830
5055	NC_016781	GCT	2	6	262229	262234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287830
5056	NC_016781	AGC	2	6	262255	262260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287830
5057	NC_016781	TGGG	2	8	262313	262320	0 %	25 %	75 %	0 %	375287830
5058	NC_016781	GCT	2	6	262321	262326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287830
5059	NC_016781	TTGGA	2	10	262372	262381	20 %	40 %	40 %	0 %	375287830
5060	NC_016781	GGT	3	9	262484	262492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287831
5061	NC_016781	TGA	2	6	262520	262525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287831
5062	NC_016781	GCA	2	6	262605	262610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287831
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5064	NC_016781	GGCTC	2	10	262694	262703	0 %	20 %	40 %	40 %	375287831
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5067	NC_016781	GCA	2	6	262797	262802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375287831
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5071	NC_016781	TGG	2	6	263254	263259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287832
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5073	NC_016781	GCT	2	6	263310	263315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287832
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5087	NC_016781	GTTG	2	8	264271	264278	0 %	50 %	50 %	0 %	375287833
5088	NC_016781	TCG	2	6	264313	264318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287833
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5099	NC_016781	ACA	2	6	264942	264947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_016781	GC	3	6	265018	265023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_016781	GTG	2	6	265039	265044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287834
5102	NC_016781	GA	3	6	265055	265060	50 %	0 %	50 %	0 %	375287834
5103	NC_016781	GCT	3	9	265068	265076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287834
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5105	NC_016781	TGCATT	2	12	265210	265221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	375287834
5106	NC_016781	GAAT	2	8	265304	265311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_016781	TCA	2	6	265391	265396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287835
5108	NC_016781	CCATG	2	10	265497	265506	20 %	20 %	20 %	40 %	375287835
5109	NC_016781	TTGCC	2	10	265584	265593	0 %	40 %	20 %	40 %	375287835
5110	NC_016781	TG	3	6	265681	265686	0 %	50 %	50 %	0 %	375287835
5111	NC_016781	GTC	2	6	265705	265710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287835
5112	NC_016781	GTC	3	9	265717	265725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287835
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5118	NC_016781	TTGC	2	8	266155	266162	0 %	50 %	25 %	25 %	375287835
5119	NC_016781	AC	3	6	266178	266183	50 %	0 %	0 %	50 %	375287835
5120	NC_016781	GGC	2	6	266194	266199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287835
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5122	NC_016781	AGA	2	6	266313	266318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375287835
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5424	NC_016781	GTAC	2	8	281394	281401	25 %	25 %	25 %	25 %	375287850
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5473	NC_016781	CGGAGT	2	12	283509	283520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	375287853
5474	NC_016781	ATT	2	6	283798	283803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	375287853
5475	NC_016781	TTC	2	6	283813	283818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375287853
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5477	NC_016781	TAA	2	6	283854	283859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375287853
5478	NC_016781	CTG	2	6	283893	283898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287853
5479	NC_016781	AGGA	2	8	283945	283952	50 %	0 %	50 %	0 %	375287853
5480	NC_016781	T	6	6	283975	283980	0 %	100 %	0 %	0 %	375287853
5481	NC_016781	GTCTGG	2	12	284074	284085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	375287853
5482	NC_016781	GCG	3	9	284180	284188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287853
5483	NC_016781	TGC	2	6	284191	284196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287853
5484	NC_016781	CGG	2	6	284264	284269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375287853
5485	NC_016781	AGT	2	6	284392	284397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5486	NC_016781	A	6	6	284424	284429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5487	NC_016781	CGT	2	6	284622	284627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287854
5488	NC_016781	GAG	2	6	284641	284646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375287854
5489	NC_016781	TGC	2	6	284679	284684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287854
5490	NC_016781	TAGT	2	8	284694	284701	25 %	50 %	25 %	0 %	375287854
5491	NC_016781	GGT	2	6	284851	284856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_016781	GTT	2	6	284875	284880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_016781	ATGA	2	8	284929	284936	50 %	25 %	25 %	0 %	375287855
5494	NC_016781	GAT	2	6	284994	284999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375287855
5495	NC_016781	GTG	2	6	285067	285072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375287855
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5497	NC_016781	TGC	3	9	285144	285152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375287855
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5500	NC_016781	ATC	2	6	285211	285216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375287855

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