MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 109861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_016627	A	7	7	643421	643427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_016627	TAA	2	6	643434	643439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_016627	GATT	2	8	643464	643471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_016627	TA	3	6	643499	643504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_016627	T	6	6	643509	643514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_016627	TA	3	6	643587	643592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_016627	T	6	6	643599	643604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_016627	ACG	2	6	643618	643623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_016627	TGA	3	9	643634	643642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295007
15010	NC_016627	AAT	2	6	643662	643667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374295007
15011	NC_016627	A	6	6	643699	643704	100 %	0 %	0 %	0 %	374295007
15012	NC_016627	GTT	2	6	643719	643724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374295007
15013	NC_016627	ATATT	2	10	643839	643848	40 %	60 %	0 %	0 %	374295007
15014	NC_016627	GAT	2	6	643849	643854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295007
15015	NC_016627	AT	3	6	643859	643864	50 %	50 %	0 %	0 %	374295007
15016	NC_016627	TAG	2	6	643884	643889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295007
15017	NC_016627	AT	3	6	643897	643902	50 %	50 %	0 %	0 %	374295007
15018	NC_016627	GAA	2	6	643978	643983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374295007
15019	NC_016627	TCG	2	6	644008	644013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374295007
15020	NC_016627	ACT	2	6	644023	644028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374295007
15021	NC_016627	TTTGAT	2	12	644050	644061	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374295007
15022	NC_016627	TTTCAA	2	12	644125	644136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374295007
15023	NC_016627	AAT	2	6	644143	644148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374295007
15024	NC_016627	ATG	2	6	644200	644205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295007
15025	NC_016627	CGGA	2	8	644207	644214	25 %	0 %	50 %	25 %	374295007
15026	NC_016627	A	7	7	644252	644258	100 %	0 %	0 %	0 %	374295007
15027	NC_016627	A	6	6	644305	644310	100 %	0 %	0 %	0 %	374295007
15028	NC_016627	AT	3	6	644336	644341	50 %	50 %	0 %	0 %	374295007
15029	NC_016627	AAG	2	6	644362	644367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374295007
15030	NC_016627	AGAT	2	8	644399	644406	50 %	25 %	25 %	0 %	374295007
15031	NC_016627	CGG	2	6	644481	644486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374295007
15032	NC_016627	GATG	2	8	644505	644512	25 %	25 %	50 %	0 %	374295007
15033	NC_016627	TTA	2	6	644567	644572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374295007
15034	NC_016627	GCA	2	6	644587	644592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374295007
15035	NC_016627	AGAT	2	8	644711	644718	50 %	25 %	25 %	0 %	374295007
15036	NC_016627	AG	3	6	644883	644888	50 %	0 %	50 %	0 %	374295007
15037	NC_016627	TAC	2	6	645117	645122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374295007
15038	NC_016627	TGGG	2	8	645329	645336	0 %	25 %	75 %	0 %	374295007
15039	NC_016627	TGC	2	6	645452	645457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374295007
15040	NC_016627	TTG	2	6	645489	645494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374295007
15041	NC_016627	TGTT	2	8	645524	645531	0 %	75 %	25 %	0 %	374295007
15042	NC_016627	ATAA	2	8	645574	645581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_016627	ATGG	2	8	645656	645663	25 %	25 %	50 %	0 %	374295008
15044	NC_016627	GAA	2	6	645706	645711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374295008
15045	NC_016627	GAAAAA	2	12	645735	645746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374295008
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15047	NC_016627	TA	3	6	645958	645963	50 %	50 %	0 %	0 %	374295008
15048	NC_016627	GAA	2	6	645970	645975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374295008
15049	NC_016627	TTG	2	6	646100	646105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374295008
15050	NC_016627	CTG	2	6	646181	646186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374295008
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15052	NC_016627	TAT	2	6	646227	646232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374295008
15053	NC_016627	AAGG	2	8	646246	646253	50 %	0 %	50 %	0 %	374295008
15054	NC_016627	GGCC	2	8	646260	646267	0 %	0 %	50 %	50 %	374295008
15055	NC_016627	GATT	2	8	646406	646413	25 %	50 %	25 %	0 %	374295008
15056	NC_016627	TGA	2	6	646436	646441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295008
15057	NC_016627	AGAAA	2	10	646450	646459	80 %	0 %	20 %	0 %	374295008
15058	NC_016627	TG	3	6	646530	646535	0 %	50 %	50 %	0 %	374295008
15059	NC_016627	CCAA	2	8	646537	646544	50 %	0 %	0 %	50 %	374295008
15060	NC_016627	GGTA	2	8	646623	646630	25 %	25 %	50 %	0 %	374295008
15061	NC_016627	ATG	2	6	646646	646651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295008
15062	NC_016627	AG	3	6	646820	646825	50 %	0 %	50 %	0 %	374295008
15063	NC_016627	TGT	2	6	646860	646865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374295008
15064	NC_016627	GAAA	2	8	646908	646915	75 %	0 %	25 %	0 %	374295008
15065	NC_016627	ATA	2	6	646921	646926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374295008
15066	NC_016627	TGT	2	6	646938	646943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374295008
15067	NC_016627	TCA	2	6	646985	646990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15069	NC_016627	TGA	2	6	647040	647045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374295009
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15072	NC_016627	GATG	2	8	647238	647245	25 %	25 %	50 %	0 %	374295009
15073	NC_016627	TAT	2	6	647255	647260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374295009
15074	NC_016627	CAATG	2	10	647289	647298	40 %	20 %	20 %	20 %	374295009
15075	NC_016627	AGCA	2	8	647352	647359	50 %	0 %	25 %	25 %	374295009
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15082	NC_016627	AAG	2	6	647663	647668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374295009
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15098	NC_016627	ATA	2	6	648123	648128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_016627	TTTA	2	8	648200	648207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_016627	ATA	2	6	648212	648217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_016627	AAAAG	2	10	648219	648228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_016627	T	7	7	648239	648245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_016627	TC	3	6	648282	648287	0 %	50 %	0 %	50 %	374295010
15104	NC_016627	TTCC	2	8	648358	648365	0 %	50 %	0 %	50 %	374295010
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15107	NC_016627	T	6	6	648475	648480	0 %	100 %	0 %	0 %	374295010
15108	NC_016627	TG	3	6	648505	648510	0 %	50 %	50 %	0 %	374295010
15109	NC_016627	TAA	2	6	648518	648523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374295010
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15111	NC_016627	TTA	2	6	648688	648693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_016627	TAT	2	6	648702	648707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_016627	TAAA	2	8	648736	648743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_016627	A	6	6	648759	648764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15115	NC_016627	GT	3	6	648767	648772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15116	NC_016627	AGTT	2	8	648801	648808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15117	NC_016627	GTA	2	6	648882	648887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_016627	AT	3	6	648894	648899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_016627	TTG	2	6	648919	648924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_016627	ATT	2	6	648932	648937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_016627	TTAA	2	8	648938	648945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_016627	TAT	2	6	648950	648955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15123	NC_016627	TTTAA	2	10	648982	648991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_016627	CTT	2	6	649009	649014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15126	NC_016627	TAT	2	6	649185	649190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15499	NC_016627	AAAAC	2	10	665332	665341	80 %	0 %	0 %	20 %	374295024
15500	NC_016627	AGAA	2	8	665353	665360	75 %	0 %	25 %	0 %	374295024

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