MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2125	NC_016024	CTG	2	6	98007	98012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2126	NC_016024	TTGC	2	8	98037	98044	0 %	50 %	25 %	25 %	347753811
2127	NC_016024	CG	4	8	98105	98112	0 %	0 %	50 %	50 %	347753811
2128	NC_016024	CTCAT	2	10	98151	98160	20 %	40 %	0 %	40 %	347753811
2129	NC_016024	GAG	2	6	98248	98253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753811
2130	NC_016024	GGC	2	6	98257	98262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753811
2131	NC_016024	GCGG	2	8	98288	98295	0 %	0 %	75 %	25 %	347753811
2132	NC_016024	CCG	2	6	98302	98307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753811
2133	NC_016024	TGGT	2	8	98394	98401	0 %	50 %	50 %	0 %	347753811
2134	NC_016024	GGAGG	2	10	98402	98411	20 %	0 %	80 %	0 %	347753811
2135	NC_016024	GTGGG	2	10	98432	98441	0 %	20 %	80 %	0 %	347753811
2136	NC_016024	TGG	2	6	98446	98451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753811
2137	NC_016024	AGC	2	6	98527	98532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2138	NC_016024	TG	3	6	98589	98594	0 %	50 %	50 %	0 %	347753811
2139	NC_016024	TCGGC	2	10	98644	98653	0 %	20 %	40 %	40 %	347753811
2140	NC_016024	AGGA	2	8	98654	98661	50 %	0 %	50 %	0 %	347753811
2141	NC_016024	GGAC	2	8	98755	98762	25 %	0 %	50 %	25 %	347753811
2142	NC_016024	GCCT	2	8	98770	98777	0 %	25 %	25 %	50 %	347753811
2143	NC_016024	TGG	2	6	98914	98919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753811
2144	NC_016024	GCG	3	9	98945	98953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753811
2145	NC_016024	CTG	2	6	98964	98969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2146	NC_016024	GTC	2	6	98988	98993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2147	NC_016024	CTG	2	6	99027	99032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2148	NC_016024	CGGG	2	8	99114	99121	0 %	0 %	75 %	25 %	347753811
2149	NC_016024	GCT	2	6	99122	99127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2150	NC_016024	GTT	2	6	99128	99133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753811
2151	NC_016024	TGG	2	6	99136	99141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753811
2152	NC_016024	TAC	2	6	99333	99338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753811
2153	NC_016024	AGA	2	6	99365	99370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753811
2154	NC_016024	ACG	2	6	99394	99399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2155	NC_016024	ACT	3	9	99403	99411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753811
2156	NC_016024	G	6	6	99471	99476	0 %	0 %	100 %	0 %	347753811
2157	NC_016024	GCT	2	6	99485	99490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753811
2158	NC_016024	TGG	2	6	99557	99562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_016024	TGA	2	6	99607	99612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2160	NC_016024	CG	3	6	99722	99727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2161	NC_016024	GT	3	6	99744	99749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2162	NC_016024	CTG	2	6	99814	99819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753812
2163	NC_016024	GCTGGG	2	12	99831	99842	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347753812
2164	NC_016024	GGC	2	6	99849	99854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753812
2165	NC_016024	AT	3	6	99923	99928	50 %	50 %	0 %	0 %	347753812
2166	NC_016024	CTCAT	2	10	99958	99967	20 %	40 %	0 %	40 %	347753812
2167	NC_016024	GCC	2	6	99999	100004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753812
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2173	NC_016024	GGAGG	2	10	100209	100218	20 %	0 %	80 %	0 %	347753812
2174	NC_016024	GTGGG	2	10	100239	100248	0 %	20 %	80 %	0 %	347753812
2175	NC_016024	TGG	2	6	100253	100258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753812
2176	NC_016024	TG	3	6	100310	100315	0 %	50 %	50 %	0 %	347753812
2177	NC_016024	TG	3	6	100326	100331	0 %	50 %	50 %	0 %	347753812
2178	NC_016024	AGGA	2	8	100391	100398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2179	NC_016024	TCA	2	6	100444	100449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2180	NC_016024	ATG	2	6	100662	100667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2181	NC_016024	GTTTG	2	10	100674	100683	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2182	NC_016024	CTGCG	2	10	100687	100696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2183	NC_016024	GCG	3	9	100694	100702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2184	NC_016024	TGC	2	6	100711	100716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2185	NC_016024	GCA	2	6	100749	100754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2186	NC_016024	TCG	2	6	100801	100806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2187	NC_016024	TGGT	2	8	100815	100822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2188	NC_016024	TTTG	2	8	100877	100884	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2189	NC_016024	ACCTG	2	10	101056	101065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2190	NC_016024	TAC	2	6	101082	101087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2191	NC_016024	GAA	2	6	101115	101120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2192	NC_016024	CTGA	2	8	101133	101140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2193	NC_016024	ACT	3	9	101152	101160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2194	NC_016024	G	6	6	101220	101225	0 %	0 %	100 %	0 %	347753813
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2200	NC_016024	GTGGC	2	10	101435	101444	0 %	20 %	60 %	20 %	347753813
2201	NC_016024	TGGT	2	8	101453	101460	0 %	50 %	50 %	0 %	347753813
2202	NC_016024	GTT	2	6	101469	101474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753813
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2204	NC_016024	CCCG	2	8	101505	101512	0 %	0 %	25 %	75 %	347753813
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2208	NC_016024	CGA	2	6	101832	101837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753813
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2213	NC_016024	TCG	2	6	102179	102184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753813
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2219	NC_016024	CTT	2	6	102465	102470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753813
2220	NC_016024	TCG	2	6	102552	102557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753813
2221	NC_016024	CCG	2	6	102587	102592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753813
2222	NC_016024	CTG	2	6	102604	102609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753813
2223	NC_016024	GC	3	6	102646	102651	0 %	0 %	50 %	50 %	347753813
2224	NC_016024	CAGC	2	8	102740	102747	25 %	0 %	25 %	50 %	347753813
2225	NC_016024	GCGG	2	8	102912	102919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2226	NC_016024	A	6	6	102928	102933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2227	NC_016024	A	6	6	102946	102951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_016024	A	7	7	102955	102961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_016024	GGT	2	6	103005	103010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2230	NC_016024	CGA	2	6	103060	103065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2231	NC_016024	CG	3	6	103070	103075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2232	NC_016024	GGC	2	6	103153	103158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2233	NC_016024	TGGG	2	8	103246	103253	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2234	NC_016024	ATA	2	6	103286	103291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2235	NC_016024	AGC	2	6	103304	103309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2236	NC_016024	CCA	2	6	103363	103368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2237	NC_016024	CGA	2	6	103372	103377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2238	NC_016024	GCA	2	6	103446	103451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2239	NC_016024	GAA	2	6	103542	103547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_016024	CAG	2	6	103588	103593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2241	NC_016024	GTT	2	6	103619	103624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2242	NC_016024	GGC	2	6	103653	103658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_016024	GTT	2	6	103908	103913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_016024	GAA	2	6	104044	104049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_016024	TGC	2	6	104119	104124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_016024	GTC	2	6	104131	104136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_016024	TCGTG	2	10	104140	104149	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2248	NC_016024	TGA	3	9	104232	104240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_016024	AC	3	6	104295	104300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2250	NC_016024	AC	3	6	104465	104470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2251	NC_016024	GAGG	2	8	104524	104531	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_016024	CCT	2	6	104608	104613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2380	NC_016024	GTG	2	6	111234	111239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753817
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2383	NC_016024	GCG	2	6	111404	111409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753817
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2444	NC_016024	TGGG	2	8	113978	113985	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2445	NC_016024	TTGCT	2	10	113998	114007	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2446	NC_016024	AG	3	6	114054	114059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2462	NC_016024	TTGA	2	8	114640	114647	25 %	50 %	25 %	0 %	347753820
2463	NC_016024	AGA	2	6	114689	114694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753820
2464	NC_016024	CGACA	2	10	114774	114783	40 %	0 %	20 %	40 %	347753820
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2470	NC_016024	CGGTG	2	10	115314	115323	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2471	NC_016024	AGC	2	6	115339	115344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753821
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2473	NC_016024	GGC	2	6	115430	115435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753821
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2476	NC_016024	GC	3	6	115599	115604	0 %	0 %	50 %	50 %	347753821
2477	NC_016024	CGG	2	6	115611	115616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753821
2478	NC_016024	GAT	2	6	115623	115628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753821
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2480	NC_016024	GTC	2	6	115689	115694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753821
2481	NC_016024	GCC	2	6	115749	115754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753821
2482	NC_016024	CCG	2	6	115776	115781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753821
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2486	NC_016024	GAC	2	6	115956	115961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753821
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2488	NC_016024	GC	3	6	116022	116027	0 %	0 %	50 %	50 %	347753821
2489	NC_016024	GCA	2	6	116171	116176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753821
2490	NC_016024	TGGTC	2	10	116210	116219	0 %	40 %	40 %	20 %	347753821
2491	NC_016024	GGT	2	6	116261	116266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753821
2492	NC_016024	ATC	2	6	116305	116310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753821
2493	NC_016024	CG	3	6	116311	116316	0 %	0 %	50 %	50 %	347753821
2494	NC_016024	AGC	2	6	116324	116329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753821
2495	NC_016024	GGC	2	6	116367	116372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753821
2496	NC_016024	CGG	2	6	116378	116383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753821
2497	NC_016024	TCT	2	6	116551	116556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2498	NC_016024	CAAC	2	8	116699	116706	50 %	0 %	0 %	50 %	347753822
2499	NC_016024	G	6	6	116713	116718	0 %	0 %	100 %	0 %	347753822
2500	NC_016024	GCC	2	6	116720	116725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753822

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