MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_016024	AAAC	2	8	798154	798161	75 %	0 %	0 %	25 %	347754391
17503	NC_016024	GCC	2	6	798247	798252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17504	NC_016024	CGG	2	6	798261	798266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754392
17505	NC_016024	CCG	2	6	798453	798458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754392
17506	NC_016024	GCC	2	6	798467	798472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754392
17507	NC_016024	CCGT	2	8	798494	798501	0 %	25 %	25 %	50 %	347754392
17508	NC_016024	TCTGC	2	10	798577	798586	0 %	40 %	20 %	40 %	347754392
17509	NC_016024	AGC	2	6	798605	798610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754392
17510	NC_016024	GCA	2	6	798631	798636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754392
17511	NC_016024	CGG	2	6	798652	798657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754392
17512	NC_016024	TGA	2	6	798739	798744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754392
17513	NC_016024	GC	3	6	798828	798833	0 %	0 %	50 %	50 %	347754392
17514	NC_016024	GCGCA	2	10	798875	798884	20 %	0 %	40 %	40 %	347754392
17515	NC_016024	GC	3	6	798948	798953	0 %	0 %	50 %	50 %	347754392
17516	NC_016024	GCG	2	6	799063	799068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754392
17517	NC_016024	AGCC	2	8	799089	799096	25 %	0 %	25 %	50 %	347754392
17518	NC_016024	GCA	2	6	799222	799227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754392
17519	NC_016024	GCC	3	9	799275	799283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754392
17520	NC_016024	TGGG	2	8	799297	799304	0 %	25 %	75 %	0 %	347754392
17521	NC_016024	CCT	2	6	799561	799566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17522	NC_016024	GCG	2	6	799577	799582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17523	NC_016024	GCG	2	6	799679	799684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17524	NC_016024	GCC	2	6	799746	799751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754393
17525	NC_016024	CAT	2	6	799762	799767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754393
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17527	NC_016024	CGT	2	6	799877	799882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754393
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17529	NC_016024	CGG	2	6	800072	800077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17530	NC_016024	CGG	2	6	800152	800157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
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17534	NC_016024	GAA	2	6	800222	800227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754393
17535	NC_016024	GCAG	2	8	800251	800258	25 %	0 %	50 %	25 %	347754393
17536	NC_016024	CCGG	2	8	800313	800320	0 %	0 %	50 %	50 %	347754393
17537	NC_016024	CGG	2	6	800340	800345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
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17540	NC_016024	GGC	2	6	800505	800510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17541	NC_016024	GGGC	2	8	800535	800542	0 %	0 %	75 %	25 %	347754393
17542	NC_016024	TGG	2	6	800574	800579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754393
17543	NC_016024	GCC	2	6	800633	800638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754393
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17549	NC_016024	ACGC	2	8	800876	800883	25 %	0 %	25 %	50 %	347754393
17550	NC_016024	CCGG	2	8	800903	800910	0 %	0 %	50 %	50 %	347754393
17551	NC_016024	GC	3	6	800982	800987	0 %	0 %	50 %	50 %	347754393
17552	NC_016024	CCT	2	6	801115	801120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754393
17553	NC_016024	GCA	2	6	801148	801153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754393
17554	NC_016024	CTG	2	6	801161	801166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754393
17555	NC_016024	CAT	2	6	801230	801235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754393
17556	NC_016024	TCC	2	6	801246	801251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754393
17557	NC_016024	GGC	2	6	801252	801257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17558	NC_016024	GCC	2	6	801296	801301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754393
17559	NC_016024	CGG	2	6	801306	801311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754393
17560	NC_016024	GTC	2	6	801416	801421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754393
17561	NC_016024	GCT	2	6	801439	801444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754393
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17564	NC_016024	GGT	2	6	801566	801571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754393
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17568	NC_016024	TC	3	6	801790	801795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17569	NC_016024	GC	3	6	801860	801865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17570	NC_016024	TGC	2	6	801969	801974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754394
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17572	NC_016024	CCGT	2	8	802023	802030	0 %	25 %	25 %	50 %	347754394
17573	NC_016024	GAT	2	6	802145	802150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754394
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17576	NC_016024	GCCG	2	8	802273	802280	0 %	0 %	50 %	50 %	347754394
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17589	NC_016024	CGT	2	6	802882	802887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754394
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17593	NC_016024	TGGCT	2	10	802955	802964	0 %	40 %	40 %	20 %	347754394
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17598	NC_016024	GC	3	6	803059	803064	0 %	0 %	50 %	50 %	347754394
17599	NC_016024	CGC	2	6	803121	803126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754394
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17601	NC_016024	TGA	2	6	803160	803165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754394
17602	NC_016024	TCA	2	6	803205	803210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754394
17603	NC_016024	GCC	2	6	803245	803250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17604	NC_016024	CCGG	3	12	803284	803295	0 %	0 %	50 %	50 %	347754395
17605	NC_016024	GTG	2	6	803300	803305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754395
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17608	NC_016024	TGGCGC	2	12	803398	803409	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347754395
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17611	NC_016024	GGCT	2	8	803463	803470	0 %	25 %	50 %	25 %	347754395
17612	NC_016024	GTT	2	6	803480	803485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754395
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17619	NC_016024	GTG	3	9	803672	803680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754395
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17742	NC_016024	AAC	2	6	809707	809712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754401
17743	NC_016024	GCT	2	6	809780	809785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754401
17744	NC_016024	CCGG	2	8	809822	809829	0 %	0 %	50 %	50 %	347754401
17745	NC_016024	C	6	6	809936	809941	0 %	0 %	0 %	100 %	347754401
17746	NC_016024	CAT	2	6	809960	809965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754401
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17753	NC_016024	ACTG	2	8	810275	810282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17754	NC_016024	GCT	2	6	810321	810326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17785	NC_016024	GA	3	6	811817	811822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17848	NC_016024	GCTAAC	2	12	815244	815255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17849	NC_016024	AC	3	6	815254	815259	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17857	NC_016024	CGG	2	6	815515	815520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754405
17858	NC_016024	GAC	2	6	815532	815537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754405
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