MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016024	CGA	2	6	614024	614029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754236
13502	NC_016024	GGC	2	6	614045	614050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754236
13503	NC_016024	CCCGGA	2	12	614096	614107	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347754236
13504	NC_016024	TCA	2	6	614110	614115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754236
13505	NC_016024	CGA	2	6	614123	614128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754236
13506	NC_016024	ACT	2	6	614161	614166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754236
13507	NC_016024	TCA	2	6	614167	614172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754236
13508	NC_016024	GT	3	6	614268	614273	0 %	50 %	50 %	0 %	347754236
13509	NC_016024	TGA	2	6	614278	614283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754236
13510	NC_016024	GAC	2	6	614366	614371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754236
13511	NC_016024	GGC	2	6	614372	614377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754236
13512	NC_016024	GCG	2	6	614385	614390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754236
13513	NC_016024	CTG	2	6	614406	614411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754236
13514	NC_016024	CGG	3	9	614512	614520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13515	NC_016024	GTC	2	6	614524	614529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_016024	GCT	2	6	614531	614536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_016024	CGT	2	6	614547	614552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_016024	GGC	2	6	614623	614628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13519	NC_016024	CCCG	2	8	614677	614684	0 %	0 %	25 %	75 %	347754237
13520	NC_016024	GCC	2	6	614685	614690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754237
13521	NC_016024	CGG	2	6	614713	614718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13522	NC_016024	CT	3	6	614724	614729	0 %	50 %	0 %	50 %	347754237
13523	NC_016024	TGGCCG	2	12	614766	614777	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347754237
13524	NC_016024	GGA	2	6	614779	614784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754237
13525	NC_016024	TCG	2	6	614877	614882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13526	NC_016024	GCC	2	6	614890	614895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754237
13527	NC_016024	GTT	2	6	614903	614908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754237
13528	NC_016024	GTG	2	6	614915	614920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754237
13529	NC_016024	GTC	3	9	614972	614980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13530	NC_016024	GTT	2	6	615055	615060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754237
13531	NC_016024	CGG	2	6	615103	615108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13532	NC_016024	GCAG	2	8	615130	615137	25 %	0 %	50 %	25 %	347754237
13533	NC_016024	CCG	2	6	615138	615143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754237
13534	NC_016024	CGG	2	6	615175	615180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13535	NC_016024	CTA	2	6	615193	615198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754237
13536	NC_016024	CTG	2	6	615205	615210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13537	NC_016024	GGCG	2	8	615212	615219	0 %	0 %	75 %	25 %	347754237
13538	NC_016024	ACG	3	9	615221	615229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13539	NC_016024	GGT	2	6	615288	615293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754237
13540	NC_016024	T	6	6	615307	615312	0 %	100 %	0 %	0 %	347754237
13541	NC_016024	CGG	2	6	615335	615340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13542	NC_016024	CCT	2	6	615355	615360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754237
13543	NC_016024	GGC	2	6	615370	615375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754237
13544	NC_016024	GTC	2	6	615437	615442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13545	NC_016024	TGG	2	6	615492	615497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754237
13546	NC_016024	TGC	2	6	615567	615572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754237
13547	NC_016024	ACT	2	6	615666	615671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754237
13548	NC_016024	CCGGC	2	10	615746	615755	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13549	NC_016024	GGC	2	6	615768	615773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754238
13550	NC_016024	GCA	2	6	615824	615829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754238
13551	NC_016024	GAT	2	6	615849	615854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754238
13552	NC_016024	ATG	2	6	615868	615873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754238
13553	NC_016024	AGC	2	6	615958	615963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754238
13554	NC_016024	GGGAAG	2	12	615964	615975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754238
13555	NC_016024	GTC	2	6	616107	616112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754238
13556	NC_016024	ACG	2	6	616132	616137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754238
13557	NC_016024	GTT	2	6	616231	616236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_016024	CGT	2	6	616377	616382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13559	NC_016024	AGC	2	6	616403	616408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13560	NC_016024	CGA	2	6	616440	616445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13561	NC_016024	GAG	2	6	616458	616463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754239
13562	NC_016024	GCG	2	6	616711	616716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754239
13563	NC_016024	TCAC	2	8	616853	616860	25 %	25 %	0 %	50 %	347754239
13564	NC_016024	GCGCG	2	10	616884	616893	0 %	0 %	60 %	40 %	347754239
13565	NC_016024	CG	3	6	616942	616947	0 %	0 %	50 %	50 %	347754239
13566	NC_016024	TGCC	2	8	617010	617017	0 %	25 %	25 %	50 %	347754239
13567	NC_016024	GTT	2	6	617020	617025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754239
13568	NC_016024	TCC	2	6	617027	617032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754239
13569	NC_016024	GCCAGC	2	12	617033	617044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347754239
13570	NC_016024	CGA	2	6	617124	617129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13571	NC_016024	CGCC	2	8	617193	617200	0 %	0 %	25 %	75 %	347754239
13572	NC_016024	GGCT	2	8	617220	617227	0 %	25 %	50 %	25 %	347754239
13573	NC_016024	GC	4	8	617238	617245	0 %	0 %	50 %	50 %	347754239
13574	NC_016024	GCC	2	6	617295	617300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754239
13575	NC_016024	GC	4	8	617338	617345	0 %	0 %	50 %	50 %	347754239
13576	NC_016024	CGC	2	6	617406	617411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754239
13577	NC_016024	CGTG	2	8	617448	617455	0 %	25 %	50 %	25 %	347754239
13578	NC_016024	GA	3	6	617468	617473	50 %	0 %	50 %	0 %	347754239
13579	NC_016024	GCG	2	6	617520	617525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754239
13580	NC_016024	GGA	2	6	617581	617586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754239
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13584	NC_016024	CGT	2	6	617710	617715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13585	NC_016024	CG	3	6	617806	617811	0 %	0 %	50 %	50 %	347754239
13586	NC_016024	TGT	2	6	617879	617884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754239
13587	NC_016024	ACGG	2	8	617898	617905	25 %	0 %	50 %	25 %	347754239
13588	NC_016024	AGC	2	6	617930	617935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754239
13589	NC_016024	GC	3	6	617934	617939	0 %	0 %	50 %	50 %	347754239
13590	NC_016024	TCCA	2	8	618050	618057	25 %	25 %	0 %	50 %	347754239
13591	NC_016024	CGCA	2	8	618071	618078	25 %	0 %	25 %	50 %	347754239
13592	NC_016024	TTC	2	6	618136	618141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754239
13593	NC_016024	TTG	2	6	618143	618148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754239
13594	NC_016024	CA	3	6	618228	618233	50 %	0 %	0 %	50 %	347754239
13595	NC_016024	GGT	2	6	618249	618254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754239
13596	NC_016024	ACC	2	6	618317	618322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754239
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13598	NC_016024	GTA	2	6	618424	618429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754239
13599	NC_016024	GTGGC	2	10	618540	618549	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13600	NC_016024	CGT	2	6	618604	618609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13601	NC_016024	AGCC	2	8	618626	618633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13602	NC_016024	GTG	2	6	618644	618649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_016024	CA	3	6	618834	618839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13604	NC_016024	TCG	2	6	618848	618853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_016024	GTG	2	6	618860	618865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13606	NC_016024	CAT	2	6	618957	618962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754240
13607	NC_016024	TCC	2	6	618988	618993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754240
13608	NC_016024	G	6	6	619051	619056	0 %	0 %	100 %	0 %	347754240
13609	NC_016024	CA	3	6	619077	619082	50 %	0 %	0 %	50 %	347754240
13610	NC_016024	CGG	2	6	619100	619105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754240
13611	NC_016024	GCG	2	6	619119	619124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754240
13612	NC_016024	ATT	2	6	619162	619167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347754240
13613	NC_016024	GC	3	6	619194	619199	0 %	0 %	50 %	50 %	347754240
13614	NC_016024	AG	3	6	619222	619227	50 %	0 %	50 %	0 %	347754240
13615	NC_016024	GAAG	2	8	619246	619253	50 %	0 %	50 %	0 %	347754240
13616	NC_016024	GGC	2	6	619261	619266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754240
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13618	NC_016024	GCGG	2	8	619336	619343	0 %	0 %	75 %	25 %	347754240
13619	NC_016024	GCC	2	6	619354	619359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754240
13620	NC_016024	GCTTT	2	10	619399	619408	0 %	60 %	20 %	20 %	347754240
13621	NC_016024	AAC	2	6	619463	619468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754240
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13630	NC_016024	TGGAT	2	10	620043	620052	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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13850	NC_016024	A	6	6	630508	630513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13851	NC_016024	CAT	2	6	630531	630536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13852	NC_016024	AG	3	6	630556	630561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13853	NC_016024	AAC	2	6	630581	630586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13854	NC_016024	GTT	2	6	630597	630602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13855	NC_016024	TCC	2	6	630637	630642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13856	NC_016024	AAGG	2	8	630698	630705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13857	NC_016024	GCGGG	2	10	630751	630760	0 %	0 %	80 %	20 %	347754245
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13862	NC_016024	CGGC	2	8	630942	630949	0 %	0 %	50 %	50 %	347754245
13863	NC_016024	CGC	2	6	630954	630959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754245
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13933	NC_016024	GC	4	8	635190	635197	0 %	0 %	50 %	50 %	347754246
13934	NC_016024	TTCACC	2	12	635299	635310	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	347754246
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13946	NC_016024	GCC	2	6	635875	635880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13963	NC_016024	GC	3	6	636682	636687	0 %	0 %	50 %	50 %	347754248
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13979	NC_016024	TGC	2	6	637674	637679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754249
13980	NC_016024	TCA	2	6	637710	637715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754249
13981	NC_016024	TGA	2	6	637753	637758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754249
13982	NC_016024	CAT	2	6	637768	637773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754249
13983	NC_016024	GCT	2	6	637799	637804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754249
13984	NC_016024	CAT	2	6	637852	637857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754249
13985	NC_016024	CAA	2	6	637863	637868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754249
13986	NC_016024	GC	3	6	637913	637918	0 %	0 %	50 %	50 %	347754249
13987	NC_016024	ACT	2	6	638004	638009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754249
13988	NC_016024	TGGC	2	8	638098	638105	0 %	25 %	50 %	25 %	347754249
13989	NC_016024	GGT	2	6	638152	638157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754249
13990	NC_016024	AGC	2	6	638163	638168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754249
13991	NC_016024	CG	3	6	638305	638310	0 %	0 %	50 %	50 %	347754249
13992	NC_016024	CAA	2	6	638323	638328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754249
13993	NC_016024	TGT	2	6	638370	638375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754249
13994	NC_016024	CGA	2	6	638440	638445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754249
13995	NC_016024	GAT	2	6	638452	638457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754249
13996	NC_016024	CG	3	6	638520	638525	0 %	0 %	50 %	50 %	347754249
13997	NC_016024	TCG	2	6	638529	638534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754249
13998	NC_016024	CTG	2	6	638591	638596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754249
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