MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016024	CA	3	6	481080	481085	50 %	0 %	0 %	50 %	347754119
10502	NC_016024	TCA	2	6	481090	481095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754119
10503	NC_016024	CGA	2	6	481102	481107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754119
10504	NC_016024	GCC	2	6	481122	481127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754119
10505	NC_016024	CCG	2	6	481181	481186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754119
10506	NC_016024	ACAA	2	8	481190	481197	75 %	0 %	0 %	25 %	347754119
10507	NC_016024	TCA	2	6	481204	481209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754119
10508	NC_016024	GGC	2	6	481284	481289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754119
10509	NC_016024	ACA	2	6	481366	481371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754119
10510	NC_016024	GAA	2	6	481374	481379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754119
10511	NC_016024	AAC	2	6	481383	481388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754119
10512	NC_016024	GCC	2	6	481567	481572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754119
10513	NC_016024	GGGC	2	8	481584	481591	0 %	0 %	75 %	25 %	347754119
10514	NC_016024	GGA	2	6	481607	481612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754119
10515	NC_016024	GAA	2	6	481707	481712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754119
10516	NC_016024	GC	3	6	481751	481756	0 %	0 %	50 %	50 %	347754119
10517	NC_016024	GC	3	6	481834	481839	0 %	0 %	50 %	50 %	347754119
10518	NC_016024	TGG	2	6	481840	481845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754119
10519	NC_016024	AG	3	6	481920	481925	50 %	0 %	50 %	0 %	347754119
10520	NC_016024	CAT	2	6	481940	481945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754119
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10522	NC_016024	CAGC	2	8	481985	481992	25 %	0 %	25 %	50 %	347754119
10523	NC_016024	CAGT	2	8	482045	482052	25 %	25 %	25 %	25 %	347754119
10524	NC_016024	CGG	2	6	482079	482084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_016024	AGC	2	6	482134	482139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754120
10526	NC_016024	AGCC	2	8	482163	482170	25 %	0 %	25 %	50 %	347754120
10527	NC_016024	CGA	2	6	482174	482179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754120
10528	NC_016024	GAG	2	6	482190	482195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754120
10529	NC_016024	ACG	2	6	482349	482354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754120
10530	NC_016024	GC	3	6	482420	482425	0 %	0 %	50 %	50 %	347754120
10531	NC_016024	CAC	2	6	482454	482459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754120
10532	NC_016024	ATCTG	2	10	482464	482473	20 %	40 %	20 %	20 %	347754120
10533	NC_016024	TG	3	6	482590	482595	0 %	50 %	50 %	0 %	347754120
10534	NC_016024	TAC	2	6	482601	482606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754120
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10537	NC_016024	GGAAG	2	10	482660	482669	40 %	0 %	60 %	0 %	347754120
10538	NC_016024	CCCG	2	8	482856	482863	0 %	0 %	25 %	75 %	347754121
10539	NC_016024	CTG	2	6	482877	482882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754121
10540	NC_016024	GGC	2	6	482912	482917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754121
10541	NC_016024	GC	4	8	482981	482988	0 %	0 %	50 %	50 %	347754121
10542	NC_016024	GGC	2	6	482993	482998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754121
10543	NC_016024	GCC	2	6	483015	483020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754121
10544	NC_016024	GCAC	2	8	483064	483071	25 %	0 %	25 %	50 %	347754121
10545	NC_016024	AAC	2	6	483261	483266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347754121
10546	NC_016024	CCG	2	6	483282	483287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754121
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10552	NC_016024	GCTG	2	8	483689	483696	0 %	25 %	50 %	25 %	347754122
10553	NC_016024	A	6	6	483707	483712	100 %	0 %	0 %	0 %	347754122
10554	NC_016024	CCAGCG	2	12	483736	483747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347754122
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10557	NC_016024	CAG	2	6	483851	483856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754122
10558	NC_016024	GC	3	6	483896	483901	0 %	0 %	50 %	50 %	347754122
10559	NC_016024	ATG	2	6	483957	483962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754122
10560	NC_016024	ATG	2	6	483966	483971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754122
10561	NC_016024	GCC	2	6	483977	483982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754122
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10568	NC_016024	CGGA	2	8	484175	484182	25 %	0 %	50 %	25 %	347754122
10569	NC_016024	AGCG	2	8	484194	484201	25 %	0 %	50 %	25 %	347754122
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10572	NC_016024	GCG	2	6	484400	484405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754122
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10580	NC_016024	GAT	3	9	484781	484789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754122
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10584	NC_016024	CCG	2	6	484986	484991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_016024	GACG	2	8	485078	485085	25 %	0 %	50 %	25 %	347754123
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10592	NC_016024	GTT	2	6	485224	485229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754123
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10616	NC_016024	G	6	6	486355	486360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10619	NC_016024	GC	3	6	486543	486548	0 %	0 %	50 %	50 %	347754124
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10621	NC_016024	GCT	2	6	486657	486662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754124
10622	NC_016024	GAT	2	6	486671	486676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754124
10623	NC_016024	GAC	2	6	486731	486736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754124
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10627	NC_016024	CGT	2	6	486853	486858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754124
10628	NC_016024	TGA	2	6	486871	486876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754124
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10632	NC_016024	CCTT	2	8	486966	486973	0 %	50 %	0 %	50 %	347754124
10633	NC_016024	CGA	2	6	486997	487002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754124
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10647	NC_016024	TTGG	2	8	487515	487522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10648	NC_016024	CGG	2	6	487549	487554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754125
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10650	NC_016024	GC	3	6	487599	487604	0 %	0 %	50 %	50 %	347754125
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10653	NC_016024	TGA	2	6	487719	487724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754125
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10661	NC_016024	GTGCT	2	10	487951	487960	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10662	NC_016024	TGC	2	6	487970	487975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10980	NC_016024	TGG	2	6	502306	502311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754139
10981	NC_016024	CGGG	2	8	502336	502343	0 %	0 %	75 %	25 %	347754139
10982	NC_016024	GGC	3	9	502569	502577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754140
10983	NC_016024	TCC	2	6	502606	502611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347754140
10984	NC_016024	GGC	2	6	502613	502618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754140
10985	NC_016024	GAA	2	6	502694	502699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754140
10986	NC_016024	CG	3	6	502828	502833	0 %	0 %	50 %	50 %	347754140
10987	NC_016024	CCG	2	6	502834	502839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754140
10988	NC_016024	CCTG	2	8	502840	502847	0 %	25 %	25 %	50 %	347754140
10989	NC_016024	CCA	2	6	502886	502891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754140
10990	NC_016024	GGC	2	6	503000	503005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754140
10991	NC_016024	GCT	2	6	503063	503068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754140
10992	NC_016024	GAA	2	6	503112	503117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347754140
10993	NC_016024	GC	3	6	503187	503192	0 %	0 %	50 %	50 %	347754140
10994	NC_016024	GGCGAC	2	12	503208	503219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347754140
10995	NC_016024	CGG	2	6	503234	503239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754140
10996	NC_016024	TGC	2	6	503638	503643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754140
10997	NC_016024	GC	3	6	503750	503755	0 %	0 %	50 %	50 %	347754140
10998	NC_016024	GCC	3	9	503763	503771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754140
10999	NC_016024	GCCT	2	8	503838	503845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11000	NC_016024	GGC	2	6	503870	503875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754141

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