MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_016024	CGGT	2	8	364364	364371	0 %	25 %	50 %	25 %	347754024
8003	NC_016024	GAC	2	6	364374	364379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8004	NC_016024	CGGC	2	8	364439	364446	0 %	0 %	50 %	50 %	347754024
8005	NC_016024	TGT	2	6	364471	364476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754024
8006	NC_016024	GCCA	2	8	364486	364493	25 %	0 %	25 %	50 %	347754024
8007	NC_016024	AGC	2	6	364570	364575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8008	NC_016024	CGT	2	6	364584	364589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8009	NC_016024	CCGG	2	8	364631	364638	0 %	0 %	50 %	50 %	347754024
8010	NC_016024	GCA	2	6	364682	364687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8011	NC_016024	GTT	2	6	364707	364712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347754024
8012	NC_016024	TCG	2	6	364760	364765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8013	NC_016024	CGG	2	6	364778	364783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754024
8014	NC_016024	TGC	2	6	364792	364797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8015	NC_016024	CG	3	6	364836	364841	0 %	0 %	50 %	50 %	347754024
8016	NC_016024	ACC	2	6	364880	364885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754024
8017	NC_016024	TCCC	2	8	364919	364926	0 %	25 %	0 %	75 %	347754024
8018	NC_016024	GTC	2	6	364927	364932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754024
8019	NC_016024	GCC	2	6	364942	364947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754024
8020	NC_016024	GCC	2	6	364960	364965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754024
8021	NC_016024	CGT	2	6	364986	364991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754024
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8024	NC_016024	C	6	6	365134	365139	0 %	0 %	0 %	100 %	347754024
8025	NC_016024	CGA	2	6	365162	365167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754024
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8032	NC_016024	GAG	2	6	365436	365441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347754024
8033	NC_016024	CCGG	2	8	365483	365490	0 %	0 %	50 %	50 %	347754024
8034	NC_016024	CG	4	8	365567	365574	0 %	0 %	50 %	50 %	347754024
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8040	NC_016024	CTGC	2	8	365829	365836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8041	NC_016024	ACC	2	6	365896	365901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754025
8042	NC_016024	CGG	2	6	365934	365939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754025
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8046	NC_016024	CCTT	2	8	366082	366089	0 %	50 %	0 %	50 %	347754025
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8050	NC_016024	ATC	2	6	366294	366299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754026
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8054	NC_016024	GGC	3	9	366420	366428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754026
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8367	NC_016024	TCG	2	6	379866	379871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754034
8368	NC_016024	TGA	2	6	379932	379937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754034
8369	NC_016024	GCT	2	6	380020	380025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754034
8370	NC_016024	CGA	2	6	380103	380108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754034
8371	NC_016024	GGC	2	6	380121	380126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754034
8372	NC_016024	GCGG	2	8	380170	380177	0 %	0 %	75 %	25 %	347754034
8373	NC_016024	GGC	2	6	380188	380193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754034
8374	NC_016024	GCG	2	6	380269	380274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754034
8375	NC_016024	TCG	2	6	380400	380405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754034
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8379	NC_016024	GCTC	2	8	380556	380563	0 %	25 %	25 %	50 %	347754034
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8381	NC_016024	TGG	2	6	380778	380783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754034
8382	NC_016024	GC	3	6	380791	380796	0 %	0 %	50 %	50 %	347754034
8383	NC_016024	CGG	3	9	380865	380873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754034
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8387	NC_016024	GTTG	2	8	381123	381130	0 %	50 %	50 %	0 %	347754035
8388	NC_016024	TCT	2	6	381163	381168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754035
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8391	NC_016024	GAT	2	6	381333	381338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754035
8392	NC_016024	GCAC	2	8	381355	381362	25 %	0 %	25 %	50 %	347754035
8393	NC_016024	TGA	2	6	381374	381379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754035
8394	NC_016024	CGT	2	6	381387	381392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754035
8395	NC_016024	GGT	2	6	381408	381413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754035
8396	NC_016024	CAT	2	6	381426	381431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754035
8397	NC_016024	CGG	3	9	381458	381466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8398	NC_016024	CAG	2	6	381521	381526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754036
8399	NC_016024	CGG	2	6	381572	381577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754036
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8401	NC_016024	CGG	2	6	381599	381604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754036
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8419	NC_016024	GCT	2	6	382397	382402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8422	NC_016024	CGT	2	6	382616	382621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754037
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8432	NC_016024	GCA	2	6	383136	383141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347754037
8433	NC_016024	GAT	2	6	383153	383158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347754037
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8438	NC_016024	GGCA	2	8	383576	383583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8439	NC_016024	TGCC	2	8	383699	383706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8440	NC_016024	C	7	7	383736	383742	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8441	NC_016024	AC	3	6	383781	383786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8442	NC_016024	GTTC	2	8	383821	383828	0 %	50 %	25 %	25 %	347754038
8443	NC_016024	ACT	2	6	383850	383855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347754038
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8455	NC_016024	CGT	2	6	384373	384378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
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8473	NC_016024	CGT	2	6	385409	385414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
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8476	NC_016024	CCG	2	6	385468	385473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754038
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8478	NC_016024	GCC	2	6	385580	385585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754038
8479	NC_016024	GATT	2	8	385595	385602	25 %	50 %	25 %	0 %	347754038
8480	NC_016024	CAGC	2	8	385613	385620	25 %	0 %	25 %	50 %	347754038
8481	NC_016024	TCG	2	6	385654	385659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
8482	NC_016024	CCTGTA	2	12	385685	385696	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347754038
8483	NC_016024	GCT	2	6	385775	385780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
8484	NC_016024	GGC	2	6	386002	386007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754038
8485	NC_016024	TCT	2	6	386020	386025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347754038
8486	NC_016024	ACC	2	6	386035	386040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347754038
8487	NC_016024	CGG	2	6	386204	386209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754038
8488	NC_016024	CTG	2	6	386211	386216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
8489	NC_016024	CG	3	6	386295	386300	0 %	0 %	50 %	50 %	347754038
8490	NC_016024	CGTCAA	2	12	386318	386329	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347754038
8491	NC_016024	CTG	2	6	386343	386348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
8492	NC_016024	CCG	2	6	386407	386412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754038
8493	NC_016024	GGT	2	6	386420	386425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347754038
8494	NC_016024	CGGA	2	8	386446	386453	25 %	0 %	50 %	25 %	347754038
8495	NC_016024	GTC	2	6	386475	386480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347754038
8496	NC_016024	AGCGA	2	10	386490	386499	40 %	0 %	40 %	20 %	347754038
8497	NC_016024	CGG	2	6	386532	386537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754038
8498	NC_016024	CGGC	2	8	386558	386565	0 %	0 %	50 %	50 %	347754038
8499	NC_016024	CCG	2	6	386590	386595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347754038
8500	NC_016024	GGC	2	6	386598	386603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347754038

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