MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_016024	GTT	2	6	2503828	2503833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347755804
55003	NC_016024	AAC	2	6	2503838	2503843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755804
55004	NC_016024	AGC	2	6	2503874	2503879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55005	NC_016024	CGA	2	6	2503887	2503892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55006	NC_016024	CGA	2	6	2503959	2503964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55007	NC_016024	GAC	2	6	2503978	2503983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55008	NC_016024	GCA	2	6	2503995	2504000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55009	NC_016024	GC	3	6	2504013	2504018	0 %	0 %	50 %	50 %	347755804
55010	NC_016024	CG	3	6	2504019	2504024	0 %	0 %	50 %	50 %	347755804
55011	NC_016024	ATG	2	6	2504072	2504077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755804
55012	NC_016024	GCC	2	6	2504097	2504102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755804
55013	NC_016024	GCC	2	6	2504191	2504196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755804
55014	NC_016024	CAG	2	6	2504293	2504298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55015	NC_016024	GCC	2	6	2504303	2504308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755804
55016	NC_016024	GCC	2	6	2504312	2504317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755804
55017	NC_016024	GTG	2	6	2504351	2504356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755804
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55019	NC_016024	CAA	2	6	2504418	2504423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755804
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55021	NC_016024	GTA	2	6	2504557	2504562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755804
55022	NC_016024	GCAATC	2	12	2504576	2504587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347755804
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55024	NC_016024	TCG	2	6	2504643	2504648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55025	NC_016024	GTA	2	6	2504707	2504712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755804
55026	NC_016024	TGA	2	6	2504718	2504723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755804
55027	NC_016024	ACG	2	6	2504753	2504758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55028	NC_016024	AAG	2	6	2504768	2504773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347755804
55029	NC_016024	GGC	2	6	2504791	2504796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755804
55030	NC_016024	CAG	2	6	2504845	2504850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55031	NC_016024	CGA	2	6	2504925	2504930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55032	NC_016024	CAG	2	6	2504938	2504943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
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55034	NC_016024	GCT	2	6	2504985	2504990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755804
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55038	NC_016024	CAAA	2	8	2505075	2505082	75 %	0 %	0 %	25 %	347755804
55039	NC_016024	CCA	2	6	2505120	2505125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755804
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55041	NC_016024	CCA	2	6	2505186	2505191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755804
55042	NC_016024	CAG	2	6	2505286	2505291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
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55050	NC_016024	CCTT	2	8	2505686	2505693	0 %	50 %	0 %	50 %	347755804
55051	NC_016024	CGA	2	6	2505780	2505785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755804
55052	NC_016024	TGA	2	6	2505786	2505791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755804
55053	NC_016024	CGC	2	6	2506028	2506033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755805
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55103	NC_016024	A	7	7	2508677	2508683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55115	NC_016024	GCC	2	6	2509446	2509451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755808
55116	NC_016024	GCC	2	6	2509506	2509511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755808
55117	NC_016024	CCG	2	6	2509557	2509562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755808
55118	NC_016024	CTG	2	6	2509589	2509594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755808
55119	NC_016024	CG	3	6	2509808	2509813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55120	NC_016024	CAC	2	6	2509849	2509854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55121	NC_016024	GCC	2	6	2509862	2509867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55122	NC_016024	ACG	2	6	2509890	2509895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55123	NC_016024	CGC	2	6	2510022	2510027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755809
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55125	NC_016024	CTGAC	2	10	2510208	2510217	20 %	20 %	20 %	40 %	347755809
55126	NC_016024	CGG	2	6	2510263	2510268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755809
55127	NC_016024	TCAG	2	8	2510346	2510353	25 %	25 %	25 %	25 %	347755809
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55130	NC_016024	ATC	2	6	2510531	2510536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755809
55131	NC_016024	CCCG	2	8	2510547	2510554	0 %	0 %	25 %	75 %	347755809
55132	NC_016024	TCG	2	6	2510775	2510780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755809
55133	NC_016024	GCC	2	6	2510810	2510815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755809
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55144	NC_016024	AGGACG	2	12	2511234	2511245	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347755809
55145	NC_016024	TTC	2	6	2511262	2511267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347755809
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55149	NC_016024	ATG	4	12	2511404	2511415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755809
55150	NC_016024	CAA	2	6	2511646	2511651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755809
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55152	NC_016024	CCCG	2	8	2511711	2511718	0 %	0 %	25 %	75 %	347755809
55153	NC_016024	CG	3	6	2511765	2511770	0 %	0 %	50 %	50 %	347755809
55154	NC_016024	TTC	2	6	2511839	2511844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347755809
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55167	NC_016024	CG	4	8	2512397	2512404	0 %	0 %	50 %	50 %	347755809
55168	NC_016024	CGC	2	6	2512486	2512491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755809
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55170	NC_016024	CCGG	2	8	2512616	2512623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55171	NC_016024	AGCA	2	8	2512638	2512645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55172	NC_016024	GCC	2	6	2512655	2512660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55173	NC_016024	GGCAAC	2	12	2512753	2512764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755810
55174	NC_016024	CG	3	6	2512776	2512781	0 %	0 %	50 %	50 %	347755810
55175	NC_016024	ATC	2	6	2512784	2512789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755810
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55180	NC_016024	TGA	2	6	2512974	2512979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755810
55181	NC_016024	CGG	2	6	2513041	2513046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755810
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55184	NC_016024	ACT	2	6	2513118	2513123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755810
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55192	NC_016024	TCCG	2	8	2513596	2513603	0 %	25 %	25 %	50 %	347755810
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55197	NC_016024	GC	3	6	2513837	2513842	0 %	0 %	50 %	50 %	347755810
55198	NC_016024	CAT	2	6	2513845	2513850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755810
55199	NC_016024	GAA	2	6	2513864	2513869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347755810
55200	NC_016024	CGA	2	6	2513976	2513981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755810
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55202	NC_016024	CGG	2	6	2514043	2514048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755810
55203	NC_016024	GCG	2	6	2514107	2514112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755810
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55205	NC_016024	AC	3	6	2514187	2514192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55206	NC_016024	TCCC	2	8	2514230	2514237	0 %	25 %	0 %	75 %	347755811
55207	NC_016024	GCT	2	6	2514257	2514262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755811
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55209	NC_016024	GC	3	6	2514296	2514301	0 %	0 %	50 %	50 %	347755811
55210	NC_016024	ACC	2	6	2514306	2514311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755811
55211	NC_016024	GCG	2	6	2514328	2514333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755811
55212	NC_016024	GTG	2	6	2514339	2514344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755811
55213	NC_016024	GCG	2	6	2514359	2514364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755811
55214	NC_016024	CAT	2	6	2514365	2514370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755811
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55216	NC_016024	TCA	2	6	2514493	2514498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755811
55217	NC_016024	CACG	2	8	2514506	2514513	25 %	0 %	25 %	50 %	347755811
55218	NC_016024	CGA	2	6	2514542	2514547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755811
55219	NC_016024	CCGGG	2	10	2514620	2514629	0 %	0 %	60 %	40 %	347755811
55220	NC_016024	CGCCT	2	10	2514633	2514642	0 %	20 %	20 %	60 %	347755811
55221	NC_016024	TAC	2	6	2514687	2514692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755811
55222	NC_016024	GAC	2	6	2514699	2514704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755811
55223	NC_016024	GCC	2	6	2514723	2514728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755811
55224	NC_016024	GC	3	6	2514734	2514739	0 %	0 %	50 %	50 %	347755811
55225	NC_016024	CAT	2	6	2514755	2514760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755811
55226	NC_016024	CGC	2	6	2514787	2514792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755811
55227	NC_016024	TCA	2	6	2514850	2514855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755811
55228	NC_016024	GCCG	2	8	2514857	2514864	0 %	0 %	50 %	50 %	347755811
55229	NC_016024	GC	3	6	2514889	2514894	0 %	0 %	50 %	50 %	347755811
55230	NC_016024	GCTG	2	8	2514920	2514927	0 %	25 %	50 %	25 %	347755811
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55232	NC_016024	GGC	2	6	2515154	2515159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755811
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55331	NC_016024	GC	3	6	2519008	2519013	0 %	0 %	50 %	50 %	347755814
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55336	NC_016024	GGTC	2	8	2519109	2519116	0 %	25 %	50 %	25 %	347755814
55337	NC_016024	GTC	2	6	2519162	2519167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755814
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55340	NC_016024	GAT	2	6	2519218	2519223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755814
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55342	NC_016024	GC	4	8	2519410	2519417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55343	NC_016024	CAG	2	6	2519463	2519468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755815
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55345	NC_016024	GCG	2	6	2519557	2519562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755815
55346	NC_016024	CAC	2	6	2519589	2519594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755815
55347	NC_016024	GTC	2	6	2519632	2519637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755815
55348	NC_016024	TTC	2	6	2519676	2519681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347755815
55349	NC_016024	CCG	2	6	2519689	2519694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755815
55350	NC_016024	GCC	2	6	2519720	2519725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755815
55351	NC_016024	AGGC	2	8	2519757	2519764	25 %	0 %	50 %	25 %	347755815
55352	NC_016024	CAGG	2	8	2519783	2519790	25 %	0 %	50 %	25 %	347755815
55353	NC_016024	GAC	2	6	2519928	2519933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755815
55354	NC_016024	GT	3	6	2519960	2519965	0 %	50 %	50 %	0 %	347755815
55355	NC_016024	GCC	2	6	2519998	2520003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755815
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55358	NC_016024	GCA	2	6	2520065	2520070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755815
55359	NC_016024	GGCGTC	2	12	2520075	2520086	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347755815
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55363	NC_016024	CGC	2	6	2520225	2520230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755815
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55365	NC_016024	CCA	2	6	2520257	2520262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755815
55366	NC_016024	GCC	2	6	2520272	2520277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755815
55367	NC_016024	GCCA	2	8	2520280	2520287	25 %	0 %	25 %	50 %	347755815
55368	NC_016024	A	6	6	2520387	2520392	100 %	0 %	0 %	0 %	347755815
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55370	NC_016024	CG	3	6	2520505	2520510	0 %	0 %	50 %	50 %	347755815
55371	NC_016024	CGA	2	6	2520512	2520517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755815
55372	NC_016024	CGG	2	6	2520536	2520541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55373	NC_016024	GC	3	6	2520593	2520598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55374	NC_016024	ATGA	2	8	2520705	2520712	50 %	25 %	25 %	0 %	347755816
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55378	NC_016024	CCG	2	6	2520809	2520814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755816
55379	NC_016024	CTGG	2	8	2520914	2520921	0 %	25 %	50 %	25 %	347755816
55380	NC_016024	GAT	2	6	2520924	2520929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755816
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55382	NC_016024	CGG	2	6	2520988	2520993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755816
55383	NC_016024	CGG	2	6	2521001	2521006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755816
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55386	NC_016024	CGG	2	6	2521100	2521105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755817
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55399	NC_016024	AAAGA	2	10	2521886	2521895	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55400	NC_016024	ACG	2	6	2521901	2521906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55402	NC_016024	AC	3	6	2522064	2522069	50 %	0 %	0 %	50 %	347755818
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55416	NC_016024	GTG	2	6	2522836	2522841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55417	NC_016024	GTG	2	6	2522918	2522923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55418	NC_016024	TTC	2	6	2523007	2523012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55419	NC_016024	GCT	2	6	2523018	2523023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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55421	NC_016024	GGC	2	6	2523141	2523146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755819
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55423	NC_016024	CCG	2	6	2523295	2523300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755819
55424	NC_016024	GA	3	6	2523301	2523306	50 %	0 %	50 %	0 %	347755819
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55433	NC_016024	GCC	2	6	2523640	2523645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755819
55434	NC_016024	CAGCA	2	10	2523714	2523723	40 %	0 %	20 %	40 %	347755819
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55439	NC_016024	CCA	2	6	2523954	2523959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55440	NC_016024	CGG	3	9	2523961	2523969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55441	NC_016024	TCG	2	6	2524039	2524044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
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55444	NC_016024	ACG	2	6	2524134	2524139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755820
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55446	NC_016024	GC	4	8	2524204	2524211	0 %	0 %	50 %	50 %	347755820
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55449	NC_016024	TGC	2	6	2524327	2524332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
55450	NC_016024	ACC	2	6	2524356	2524361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755820
55451	NC_016024	GCT	2	6	2524369	2524374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
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55454	NC_016024	CTG	2	6	2524533	2524538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
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55456	NC_016024	GC	3	6	2524552	2524557	0 %	0 %	50 %	50 %	347755820
55457	NC_016024	GCC	2	6	2524581	2524586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755820
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55461	NC_016024	GCC	2	6	2524946	2524951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755820
55462	NC_016024	TCG	2	6	2524954	2524959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
55463	NC_016024	CTG	2	6	2524962	2524967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755820
55464	NC_016024	CA	3	6	2525053	2525058	50 %	0 %	0 %	50 %	347755820
55465	NC_016024	ACGA	2	8	2525067	2525074	50 %	0 %	25 %	25 %	347755820
55466	NC_016024	CAA	2	6	2525105	2525110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755820
55467	NC_016024	GC	3	6	2525125	2525130	0 %	0 %	50 %	50 %	347755820
55468	NC_016024	GCGG	2	8	2525183	2525190	0 %	0 %	75 %	25 %	347755820
55469	NC_016024	GGC	2	6	2525207	2525212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755820
55470	NC_016024	GA	3	6	2525227	2525232	50 %	0 %	50 %	0 %	347755820
55471	NC_016024	CAGACA	2	12	2525356	2525367	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347755821
55472	NC_016024	TGG	2	6	2525384	2525389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755821
55473	NC_016024	GGC	2	6	2525394	2525399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755821
55474	NC_016024	GGC	2	6	2525406	2525411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755821
55475	NC_016024	GGCCG	2	10	2525417	2525426	0 %	0 %	60 %	40 %	347755821
55476	NC_016024	CTGG	2	8	2525434	2525441	0 %	25 %	50 %	25 %	347755821
55477	NC_016024	TGG	2	6	2525541	2525546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755821
55478	NC_016024	TCA	2	6	2525565	2525570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755821
55479	NC_016024	CTG	2	6	2525672	2525677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755821
55480	NC_016024	GCC	2	6	2525693	2525698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755821
55481	NC_016024	CCG	2	6	2525721	2525726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755821
55482	NC_016024	AAG	2	6	2525727	2525732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347755821
55483	NC_016024	GGC	3	9	2525734	2525742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755821
55484	NC_016024	TTCC	2	8	2525766	2525773	0 %	50 %	0 %	50 %	347755821
55485	NC_016024	TTGG	2	8	2525801	2525808	0 %	50 %	50 %	0 %	347755821
55486	NC_016024	ACG	2	6	2525985	2525990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755821
55487	NC_016024	CGG	3	9	2526068	2526076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755821
55488	NC_016024	CG	3	6	2526103	2526108	0 %	0 %	50 %	50 %	347755821
55489	NC_016024	GCC	2	6	2526160	2526165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755821
55490	NC_016024	C	6	6	2526164	2526169	0 %	0 %	0 %	100 %	347755821
55491	NC_016024	GC	3	6	2526262	2526267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55492	NC_016024	CT	3	6	2526293	2526298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55493	NC_016024	ATG	2	6	2526344	2526349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755822
55494	NC_016024	CCA	2	6	2526399	2526404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755822
55495	NC_016024	CATG	2	8	2526456	2526463	25 %	25 %	25 %	25 %	347755822
55496	NC_016024	CAA	2	6	2526514	2526519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755822
55497	NC_016024	CAT	2	6	2526552	2526557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755822
55498	NC_016024	CCT	2	6	2526603	2526608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347755822
55499	NC_016024	CAT	2	6	2526856	2526861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755823
55500	NC_016024	TCT	2	6	2526897	2526902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347755823

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