MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyclobacterium marinum DSM 745 chromosome

Total Repeats: 127123

< Previous12...243244245246247248249250251252253254255Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
127001	NC_015914	ATC	2	6	6215800	6215805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087717
127002	NC_015914	TCT	2	6	6215814	6215819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087717
127003	NC_015914	GTTG	2	8	6215842	6215849	0 %	50 %	50 %	0 %	343087717
127004	NC_015914	GGA	2	6	6215858	6215863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343087717
127005	NC_015914	ATG	2	6	6215892	6215897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087717
127006	NC_015914	TAT	2	6	6215920	6215925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343087717
127007	NC_015914	A	7	7	6215966	6215972	100 %	0 %	0 %	0 %	343087717
127008	NC_015914	AATTAA	2	12	6215991	6216002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087717
127009	NC_015914	GAT	2	6	6216026	6216031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087717
127010	NC_015914	A	7	7	6216052	6216058	100 %	0 %	0 %	0 %	343087717
127011	NC_015914	GA	3	6	6216088	6216093	50 %	0 %	50 %	0 %	343087717
127012	NC_015914	CCA	2	6	6216096	6216101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343087717
127013	NC_015914	TAC	2	6	6216113	6216118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087717
127014	NC_015914	ATTT	2	8	6216130	6216137	25 %	75 %	0 %	0 %	343087717
127015	NC_015914	ACG	2	6	6216138	6216143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343087717
127016	NC_015914	TGG	2	6	6216154	6216159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343087717
127017	NC_015914	TAT	2	6	6216161	6216166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343087717
127018	NC_015914	AAG	3	9	6216171	6216179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127019	NC_015914	TGC	2	6	6216199	6216204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343087717
127020	NC_015914	GCT	2	6	6216266	6216271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	343087717
127021	NC_015914	A	7	7	6216346	6216352	100 %	0 %	0 %	0 %	343087717
127022	NC_015914	AAG	2	6	6216372	6216377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127023	NC_015914	TGT	2	6	6216450	6216455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343087717
127024	NC_015914	GGA	2	6	6216497	6216502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343087717
127025	NC_015914	A	6	6	6216557	6216562	100 %	0 %	0 %	0 %	343087717
127026	NC_015914	TGA	2	6	6216574	6216579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087717
127027	NC_015914	ACA	2	6	6216633	6216638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343087717
127028	NC_015914	GGATG	2	10	6216650	6216659	20 %	20 %	60 %	0 %	343087717
127029	NC_015914	GGT	2	6	6216671	6216676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343087717
127030	NC_015914	GGAGA	2	10	6216705	6216714	40 %	0 %	60 %	0 %	343087717
127031	NC_015914	AGG	2	6	6216718	6216723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343087717
127032	NC_015914	AGC	2	6	6216730	6216735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343087717
127033	NC_015914	ATG	2	6	6216747	6216752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087717
127034	NC_015914	AGA	2	6	6216799	6216804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127035	NC_015914	ACA	2	6	6216809	6216814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343087717
127036	NC_015914	AGG	2	6	6216829	6216834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343087717
127037	NC_015914	TTC	2	6	6216837	6216842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087717
127038	NC_015914	GAA	2	6	6216893	6216898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127039	NC_015914	TAA	2	6	6216952	6216957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087717
127040	NC_015914	GAA	2	6	6217082	6217087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127041	NC_015914	T	6	6	6217097	6217102	0 %	100 %	0 %	0 %	343087717
127042	NC_015914	A	6	6	6217140	6217145	100 %	0 %	0 %	0 %	343087717
127043	NC_015914	AATC	2	8	6217165	6217172	50 %	25 %	0 %	25 %	343087717
127044	NC_015914	CCAT	2	8	6217293	6217300	25 %	25 %	0 %	50 %	343087717
127045	NC_015914	GAA	2	6	6217323	6217328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087717
127046	NC_015914	GTA	2	6	6217329	6217334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087717
127047	NC_015914	T	7	7	6217445	6217451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127048	NC_015914	A	6	6	6217455	6217460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127049	NC_015914	ATT	2	6	6217504	6217509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127050	NC_015914	GATT	2	8	6217578	6217585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127051	NC_015914	ACA	2	6	6217594	6217599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127052	NC_015914	TAA	2	6	6217619	6217624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127053	NC_015914	TCA	2	6	6217652	6217657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127054	NC_015914	T	8	8	6217680	6217687	0 %	100 %	0 %	0 %	343087718
127055	NC_015914	AATA	2	8	6217762	6217769	75 %	25 %	0 %	0 %	343087718
127056	NC_015914	ATA	2	6	6217795	6217800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087718
127057	NC_015914	ATGG	2	8	6217845	6217852	25 %	25 %	50 %	0 %	343087718
127058	NC_015914	CAA	2	6	6217853	6217858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343087718
127059	NC_015914	ACA	2	6	6217910	6217915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343087718
127060	NC_015914	A	6	6	6218016	6218021	100 %	0 %	0 %	0 %	343087718
127061	NC_015914	AC	3	6	6218060	6218065	50 %	0 %	0 %	50 %	343087718
127062	NC_015914	TGCC	2	8	6218075	6218082	0 %	25 %	25 %	50 %	343087718
127063	NC_015914	TAG	2	6	6218115	6218120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087718
127064	NC_015914	A	7	7	6218142	6218148	100 %	0 %	0 %	0 %	343087718
127065	NC_015914	AG	3	6	6218183	6218188	50 %	0 %	50 %	0 %	343087718
127066	NC_015914	ACCCA	2	10	6218191	6218200	40 %	0 %	0 %	60 %	343087718
127067	NC_015914	TAG	2	6	6218227	6218232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127068	NC_015914	CCAAG	2	10	6218244	6218253	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127069	NC_015914	ATTT	2	8	6218361	6218368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127070	NC_015914	CCTT	2	8	6218444	6218451	0 %	50 %	0 %	50 %	343087719
127071	NC_015914	TTC	2	6	6218479	6218484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087719
127072	NC_015914	ATTC	2	8	6218485	6218492	25 %	50 %	0 %	25 %	343087719
127073	NC_015914	TACT	2	8	6218559	6218566	25 %	50 %	0 %	25 %	343087719
127074	NC_015914	AGT	2	6	6218572	6218577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087719
127075	NC_015914	TTC	2	6	6218584	6218589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087719
127076	NC_015914	AGC	2	6	6218650	6218655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343087719
127077	NC_015914	TTC	2	6	6218665	6218670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087719
127078	NC_015914	A	7	7	6218737	6218743	100 %	0 %	0 %	0 %	343087719
127079	NC_015914	CTTC	2	8	6218768	6218775	0 %	50 %	0 %	50 %	343087719
127080	NC_015914	CTTTT	2	10	6218805	6218814	0 %	80 %	0 %	20 %	343087719
127081	NC_015914	AAT	2	6	6218824	6218829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127082	NC_015914	AATA	2	8	6218945	6218952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127083	NC_015914	CCT	2	6	6219051	6219056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343087720
127084	NC_015914	TTAA	2	8	6219083	6219090	50 %	50 %	0 %	0 %	343087720
127085	NC_015914	A	6	6	6219253	6219258	100 %	0 %	0 %	0 %	343087720
127086	NC_015914	ACA	2	6	6219281	6219286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	343087720
127087	NC_015914	TAAAAA	2	12	6219337	6219348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	343087720
127088	NC_015914	AT	3	6	6219414	6219419	50 %	50 %	0 %	0 %	343087720
127089	NC_015914	CCAA	2	8	6219430	6219437	50 %	0 %	0 %	50 %	343087720
127090	NC_015914	TCA	2	6	6219602	6219607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087720
127091	NC_015914	ATG	2	6	6219782	6219787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087720
127092	NC_015914	GAA	2	6	6219794	6219799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087720
127093	NC_015914	AATG	2	8	6219823	6219830	50 %	25 %	25 %	0 %	343087720
127094	NC_015914	A	6	6	6219891	6219896	100 %	0 %	0 %	0 %	343087720
127095	NC_015914	ATTA	2	8	6219925	6219932	50 %	50 %	0 %	0 %	343087720
127096	NC_015914	AAT	2	6	6219950	6219955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087720
127097	NC_015914	T	6	6	6219959	6219964	0 %	100 %	0 %	0 %	343087720
127098	NC_015914	TTTTA	2	10	6219985	6219994	20 %	80 %	0 %	0 %	343087720
127099	NC_015914	CAT	2	6	6219999	6220004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087720
127100	NC_015914	AAT	2	6	6220116	6220121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087720
127101	NC_015914	TGA	2	6	6220140	6220145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343087720
127102	NC_015914	GCA	2	6	6220169	6220174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343087720
127103	NC_015914	GGT	2	6	6220178	6220183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343087720
127104	NC_015914	AGA	2	6	6220232	6220237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343087720
127105	NC_015914	CAT	2	6	6220281	6220286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087720
127106	NC_015914	AATG	2	8	6220288	6220295	50 %	25 %	25 %	0 %	343087720
127107	NC_015914	T	7	7	6220308	6220314	0 %	100 %	0 %	0 %	343087720
127108	NC_015914	TATT	2	8	6220368	6220375	25 %	75 %	0 %	0 %	343087720
127109	NC_015914	A	6	6	6220436	6220441	100 %	0 %	0 %	0 %	343087720
127110	NC_015914	TAT	3	9	6220516	6220524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343087720
127111	NC_015914	CTC	3	9	6220576	6220584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343087720
127112	NC_015914	TTC	2	6	6220606	6220611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343087720
127113	NC_015914	ATC	2	6	6220723	6220728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343087720
127114	NC_015914	AAT	2	6	6220741	6220746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343087720
127115	NC_015914	CCTT	2	8	6220754	6220761	0 %	50 %	0 %	50 %	343087720
127116	NC_015914	TCC	2	6	6220875	6220880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343087720
127117	NC_015914	ATT	2	6	6220908	6220913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127118	NC_015914	ATT	2	6	6221010	6221015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343087721
127119	NC_015914	GAG	2	6	6221039	6221044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343087721
127120	NC_015914	ATT	2	6	6221156	6221161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127121	NC_015914	AAT	2	6	6221197	6221202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127122	NC_015914	A	7	7	6221246	6221252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127123	NC_015914	T	6	6	6221268	6221273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...243244245246247248249250251252253254255Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.