MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 87449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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82002	NC_015859	TGA	2	6	3218700	3218705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795806
82003	NC_015859	CAG	2	6	3218750	3218755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795806
82004	NC_015859	GCT	2	6	3218819	3218824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795806
82005	NC_015859	GCC	2	6	3218897	3218902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795806
82006	NC_015859	TGG	2	6	3218907	3218912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340795806
82007	NC_015859	GGA	2	6	3218974	3218979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340795806
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82014	NC_015859	CTG	2	6	3219236	3219241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795806
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82117	NC_015859	CTT	2	6	3223197	3223202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340795813
82118	NC_015859	GA	3	6	3223251	3223256	50 %	0 %	50 %	0 %	340795813
82119	NC_015859	GCA	2	6	3223291	3223296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795813
82120	NC_015859	CAGC	2	8	3223316	3223323	25 %	0 %	25 %	50 %	340795813
82121	NC_015859	CGC	2	6	3223326	3223331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795813
82122	NC_015859	CGT	2	6	3223439	3223444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795813
82123	NC_015859	CAG	2	6	3223455	3223460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795813
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82125	NC_015859	TTC	2	6	3223531	3223536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340795813
82126	NC_015859	CGG	2	6	3223607	3223612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795813
82127	NC_015859	GAT	2	6	3223716	3223721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795813
82128	NC_015859	CGTC	2	8	3223804	3223811	0 %	25 %	25 %	50 %	340795814
82129	NC_015859	G	6	6	3223835	3223840	0 %	0 %	100 %	0 %	340795814
82130	NC_015859	ACCT	2	8	3223947	3223954	25 %	25 %	0 %	50 %	340795814
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82164	NC_015859	CGGTG	2	10	3225468	3225477	0 %	20 %	60 %	20 %	340795815
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82171	NC_015859	CCTACG	2	12	3225898	3225909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340795816
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82216	NC_015859	GTA	2	6	3227291	3227296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795818
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82219	NC_015859	ACC	2	6	3227385	3227390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340795818
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82221	NC_015859	CGAG	2	8	3227536	3227543	25 %	0 %	50 %	25 %	340795818
82222	NC_015859	ACC	2	6	3227544	3227549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340795818
82223	NC_015859	CGA	2	6	3227569	3227574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795818
82224	NC_015859	GCC	2	6	3227633	3227638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795818
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82226	NC_015859	AGC	2	6	3227704	3227709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795818
82227	NC_015859	TGC	2	6	3227727	3227732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795818
82228	NC_015859	CGGAC	2	10	3227855	3227864	20 %	0 %	40 %	40 %	340795818
82229	NC_015859	GTCCC	2	10	3227904	3227913	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82230	NC_015859	GCG	2	6	3227928	3227933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795819
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82232	NC_015859	GTC	2	6	3227989	3227994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795819
82233	NC_015859	GGA	2	6	3228028	3228033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340795819
82234	NC_015859	CGT	2	6	3228051	3228056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795819
82235	NC_015859	TCC	2	6	3228128	3228133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340795819
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82237	NC_015859	ATG	3	9	3228275	3228283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795819
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82239	NC_015859	CTG	2	6	3228346	3228351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795819
82240	NC_015859	CG	3	6	3228519	3228524	0 %	0 %	50 %	50 %	340795819
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82302	NC_015859	GTTT	2	8	3230393	3230400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82303	NC_015859	CGT	2	6	3230529	3230534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795821
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82312	NC_015859	TTGA	2	8	3230893	3230900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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82332	NC_015859	CCCG	2	8	3231711	3231718	0 %	0 %	25 %	75 %	340795823
82333	NC_015859	TGT	2	6	3231730	3231735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340795823
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82335	NC_015859	CGA	2	6	3231769	3231774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795823
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82340	NC_015859	GAT	2	6	3232046	3232051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795823
82341	NC_015859	GCC	2	6	3232077	3232082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795823
82342	NC_015859	CCG	2	6	3232123	3232128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795823
82343	NC_015859	GCA	3	9	3232150	3232158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795823
82344	NC_015859	GCGCTC	2	12	3232211	3232222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340795823
82345	NC_015859	TGA	2	6	3232225	3232230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795823
82346	NC_015859	TCG	2	6	3232281	3232286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795823
82347	NC_015859	ACC	2	6	3232329	3232334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340795823
82348	NC_015859	CGC	2	6	3232349	3232354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795823
82349	NC_015859	C	6	6	3232456	3232461	0 %	0 %	0 %	100 %	340795823
82350	NC_015859	GCA	3	9	3232471	3232479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795823
82351	NC_015859	CCT	2	6	3232525	3232530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340795823
82352	NC_015859	CCAG	2	8	3232567	3232574	25 %	0 %	25 %	50 %	340795823
82353	NC_015859	GCGGT	2	10	3232580	3232589	0 %	20 %	60 %	20 %	340795823
82354	NC_015859	CGA	2	6	3232627	3232632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795823
82355	NC_015859	GAC	2	6	3232652	3232657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795823
82356	NC_015859	CGG	2	6	3232669	3232674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795823
82357	NC_015859	CCG	2	6	3232687	3232692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795823
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82359	NC_015859	AGG	2	6	3232875	3232880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340795824
82360	NC_015859	ATC	2	6	3232905	3232910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340795824
82361	NC_015859	CTGG	2	8	3232958	3232965	0 %	25 %	50 %	25 %	340795824
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82363	NC_015859	TGG	2	6	3233008	3233013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340795824
82364	NC_015859	CTG	2	6	3233031	3233036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795824
82365	NC_015859	CGGC	2	8	3233085	3233092	0 %	0 %	50 %	50 %	340795824
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82368	NC_015859	GCA	2	6	3233174	3233179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795824
82369	NC_015859	CGG	2	6	3233183	3233188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795824
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82371	NC_015859	CTG	2	6	3233259	3233264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795824
82372	NC_015859	CCGA	2	8	3233277	3233284	25 %	0 %	25 %	50 %	340795824
82373	NC_015859	CACC	2	8	3233297	3233304	25 %	0 %	0 %	75 %	340795824
82374	NC_015859	GACG	2	8	3233327	3233334	25 %	0 %	50 %	25 %	340795824
82375	NC_015859	TGA	2	6	3233389	3233394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795824
82376	NC_015859	TCC	2	6	3233427	3233432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340795824
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82379	NC_015859	TCC	2	6	3233572	3233577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340795824
82380	NC_015859	TGC	2	6	3233578	3233583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795824
82381	NC_015859	TGA	2	6	3233656	3233661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795824
82382	NC_015859	TCA	2	6	3233701	3233706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340795824
82383	NC_015859	GGA	2	6	3233729	3233734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340795824
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82400	NC_015859	CGA	2	6	3234342	3234347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795825
82401	NC_015859	CGA	3	9	3234379	3234387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795825
82402	NC_015859	GTG	2	6	3234483	3234488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340795825
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82404	NC_015859	GCG	2	6	3234603	3234608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795825
82405	NC_015859	GCCGTC	2	12	3234620	3234631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340795825
82406	NC_015859	TCA	2	6	3234655	3234660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340795825
82407	NC_015859	TCT	2	6	3234664	3234669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82408	NC_015859	GACA	2	8	3234729	3234736	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82409	NC_015859	TCC	2	6	3234797	3234802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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82431	NC_015859	CGA	2	6	3235435	3235440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795826
82432	NC_015859	GACC	2	8	3235447	3235454	25 %	0 %	25 %	50 %	340795826
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82434	NC_015859	CG	4	8	3235486	3235493	0 %	0 %	50 %	50 %	340795826
82435	NC_015859	TTG	2	6	3235494	3235499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340795826
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82438	NC_015859	TCG	2	6	3235527	3235532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795826
82439	NC_015859	GCG	2	6	3235543	3235548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795826
82440	NC_015859	TGG	2	6	3235621	3235626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340795826
82441	NC_015859	CGG	2	6	3235648	3235653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795826
82442	NC_015859	CGA	3	9	3235681	3235689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795826
82443	NC_015859	C	6	6	3235763	3235768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82444	NC_015859	ACCC	2	8	3235835	3235842	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82445	NC_015859	GGGT	2	8	3235872	3235879	0 %	25 %	75 %	0 %	340795827
82446	NC_015859	AAG	2	6	3235931	3235936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340795827
82447	NC_015859	AGAC	2	8	3235941	3235948	50 %	0 %	25 %	25 %	340795827
82448	NC_015859	CGA	2	6	3235959	3235964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795827
82449	NC_015859	GCC	2	6	3235969	3235974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795827
82450	NC_015859	GAG	2	6	3236033	3236038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340795827
82451	NC_015859	AGT	2	6	3236065	3236070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340795827
82452	NC_015859	GCG	3	9	3236120	3236128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340795827
82453	NC_015859	TCATC	2	10	3236134	3236143	20 %	40 %	0 %	40 %	340795827
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82455	NC_015859	CGA	3	9	3236170	3236178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340795827
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82459	NC_015859	TCG	2	6	3236352	3236357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340795827
82460	NC_015859	GCC	2	6	3236365	3236370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340795827
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