MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_015744	CTT	2	6	1019432	1019437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626311
22503	NC_015744	C	6	6	1019439	1019444	0 %	0 %	0 %	100 %	339626311
22504	NC_015744	TCC	2	6	1019449	1019454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626311
22505	NC_015744	CTC	2	6	1019557	1019562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626311
22506	NC_015744	TGGC	2	8	1019571	1019578	0 %	25 %	50 %	25 %	339626311
22507	NC_015744	TAAA	2	8	1019625	1019632	75 %	25 %	0 %	0 %	339626311
22508	NC_015744	AGT	2	6	1019647	1019652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626311
22509	NC_015744	AAG	2	6	1019673	1019678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626311
22510	NC_015744	AAAAC	2	10	1019684	1019693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22511	NC_015744	A	6	6	1019725	1019730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22512	NC_015744	T	8	8	1019732	1019739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22513	NC_015744	TGTT	2	8	1019743	1019750	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22514	NC_015744	TAA	2	6	1019819	1019824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626312
22515	NC_015744	AGA	2	6	1019858	1019863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626312
22516	NC_015744	ATT	2	6	1019864	1019869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626312
22517	NC_015744	A	6	6	1019923	1019928	100 %	0 %	0 %	0 %	339626312
22518	NC_015744	ATG	2	6	1019983	1019988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626312
22519	NC_015744	AGTT	2	8	1020007	1020014	25 %	50 %	25 %	0 %	339626312
22520	NC_015744	TCT	2	6	1020024	1020029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626312
22521	NC_015744	TTGG	2	8	1020144	1020151	0 %	50 %	50 %	0 %	339626312
22522	NC_015744	TC	3	6	1020155	1020160	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22523	NC_015744	CAA	2	6	1020204	1020209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626312
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22525	NC_015744	TTTG	2	8	1020245	1020252	0 %	75 %	25 %	0 %	339626312
22526	NC_015744	ACT	2	6	1020261	1020266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626312
22527	NC_015744	TAG	2	6	1020268	1020273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626312
22528	NC_015744	TCCT	2	8	1020325	1020332	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22529	NC_015744	ATT	2	6	1020401	1020406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626312
22530	NC_015744	GAT	2	6	1020539	1020544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626312
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22532	NC_015744	TTC	2	6	1020641	1020646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626312
22533	NC_015744	TC	4	8	1020645	1020652	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22534	NC_015744	TATC	2	8	1020712	1020719	25 %	50 %	0 %	25 %	339626312
22535	NC_015744	TA	3	6	1020753	1020758	50 %	50 %	0 %	0 %	339626312
22536	NC_015744	CT	3	6	1020773	1020778	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22537	NC_015744	TCA	2	6	1020808	1020813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626312
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22541	NC_015744	AACT	2	8	1020922	1020929	50 %	25 %	0 %	25 %	339626312
22542	NC_015744	TGA	2	6	1020971	1020976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626312
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22552	NC_015744	CT	3	6	1021496	1021501	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22553	NC_015744	CTTC	2	8	1021506	1021513	0 %	50 %	0 %	50 %	339626312
22554	NC_015744	GATT	2	8	1021556	1021563	25 %	50 %	25 %	0 %	339626312
22555	NC_015744	CTAC	2	8	1021660	1021667	25 %	25 %	0 %	50 %	339626312
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22571	NC_015744	ATT	2	6	1022366	1022371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22572	NC_015744	AAAT	2	8	1022407	1022414	75 %	25 %	0 %	0 %	339626313
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22603	NC_015744	TGAGA	2	10	1024073	1024082	40 %	20 %	40 %	0 %	339626313
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22607	NC_015744	CAT	2	6	1024316	1024321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626313
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22613	NC_015744	CT	3	6	1024618	1024623	0 %	50 %	0 %	50 %	339626313
22614	NC_015744	TCTA	2	8	1024641	1024648	25 %	50 %	0 %	25 %	339626313
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.