MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_015744	TAC	2	6	840173	840178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626126
18503	NC_015744	TGT	2	6	840363	840368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626126
18504	NC_015744	AGC	2	6	840374	840379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626126
18505	NC_015744	TTC	2	6	840380	840385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626126
18506	NC_015744	GCC	2	6	840657	840662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626126
18507	NC_015744	AACT	2	8	840782	840789	50 %	25 %	0 %	25 %	339626126
18508	NC_015744	AGC	2	6	840800	840805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626126
18509	NC_015744	AAC	2	6	840828	840833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626126
18510	NC_015744	GA	3	6	840871	840876	50 %	0 %	50 %	0 %	339626126
18511	NC_015744	CAA	2	6	840889	840894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626126
18512	NC_015744	AAG	2	6	840955	840960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626126
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18515	NC_015744	TGT	2	6	840999	841004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626126
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18517	NC_015744	TTG	2	6	841213	841218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626126
18518	NC_015744	AAAG	2	8	841272	841279	75 %	0 %	25 %	0 %	339626126
18519	NC_015744	AAG	2	6	841294	841299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626126
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18521	NC_015744	TC	3	6	841330	841335	0 %	50 %	0 %	50 %	339626126
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18523	NC_015744	AATA	2	8	841415	841422	75 %	25 %	0 %	0 %	339626126
18524	NC_015744	TCT	2	6	841431	841436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626126
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18529	NC_015744	AT	3	6	841813	841818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_015744	AAAG	2	8	841826	841833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18531	NC_015744	T	6	6	841874	841879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_015744	TTGGA	2	10	841897	841906	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_015744	T	6	6	841920	841925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_015744	ACA	2	6	841928	841933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18535	NC_015744	AACC	2	8	841961	841968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18536	NC_015744	A	7	7	842032	842038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_015744	T	6	6	842054	842059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_015744	A	7	7	842105	842111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18541	NC_015744	CAA	2	6	842227	842232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626127
18542	NC_015744	GAACT	2	10	842384	842393	40 %	20 %	20 %	20 %	339626127
18543	NC_015744	TTG	2	6	842415	842420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339626127
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18545	NC_015744	A	7	7	842498	842504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_015744	CTAA	2	8	842519	842526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18547	NC_015744	AAT	2	6	842543	842548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_015744	ACTT	2	8	842553	842560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18549	NC_015744	GCT	2	6	842644	842649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18550	NC_015744	CAAAA	2	10	842663	842672	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18551	NC_015744	AGA	2	6	842721	842726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_015744	ATA	2	6	842755	842760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18553	NC_015744	CTA	2	6	842829	842834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_015744	TCCC	2	8	842991	842998	0 %	25 %	0 %	75 %	339626128
18555	NC_015744	CAT	3	9	843011	843019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626128
18556	NC_015744	TCG	2	6	843029	843034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626128
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18564	NC_015744	A	7	7	843450	843456	100 %	0 %	0 %	0 %	339626128
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18573	NC_015744	TTCT	2	8	844016	844023	0 %	75 %	0 %	25 %	339626129
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18606	NC_015744	TGC	2	6	845531	845536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626131
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18609	NC_015744	TCA	2	6	845581	845586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626131
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18620	NC_015744	CTAG	2	8	846203	846210	25 %	25 %	25 %	25 %	339626132
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18990	NC_015744	AAT	2	6	861690	861695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626147
18991	NC_015744	CT	3	6	861771	861776	0 %	50 %	0 %	50 %	339626147
18992	NC_015744	CGAA	2	8	861785	861792	50 %	0 %	25 %	25 %	339626147
18993	NC_015744	GCTC	2	8	861833	861840	0 %	25 %	25 %	50 %	339626147
18994	NC_015744	CCTT	2	8	861905	861912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18995	NC_015744	GGT	2	6	861957	861962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18996	NC_015744	CTT	2	6	862001	862006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18997	NC_015744	T	7	7	862012	862018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18998	NC_015744	CCT	2	6	862084	862089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626148
18999	NC_015744	TCCC	2	8	862133	862140	0 %	25 %	0 %	75 %	339626148
19000	NC_015744	GAG	2	6	862147	862152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339626148

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