MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015744	CA	3	6	729052	729057	50 %	0 %	0 %	50 %	339626030
16002	NC_015744	GAA	2	6	729077	729082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339626030
16003	NC_015744	ACT	2	6	729105	729110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626030
16004	NC_015744	A	6	6	729427	729432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_015744	ATA	2	6	729444	729449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16006	NC_015744	T	6	6	729530	729535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_015744	ATGC	2	8	729537	729544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16008	NC_015744	CT	4	8	729574	729581	0 %	50 %	0 %	50 %	339626031
16009	NC_015744	AT	3	6	729596	729601	50 %	50 %	0 %	0 %	339626031
16010	NC_015744	TTCT	2	8	729622	729629	0 %	75 %	0 %	25 %	339626031
16011	NC_015744	TTC	2	6	729658	729663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626031
16012	NC_015744	CT	3	6	729676	729681	0 %	50 %	0 %	50 %	339626031
16013	NC_015744	TC	3	6	729703	729708	0 %	50 %	0 %	50 %	339626031
16014	NC_015744	A	6	6	729710	729715	100 %	0 %	0 %	0 %	339626031
16015	NC_015744	CTT	3	9	729723	729731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626031
16016	NC_015744	CACT	2	8	729788	729795	25 %	25 %	0 %	50 %	339626031
16017	NC_015744	CT	3	6	729806	729811	0 %	50 %	0 %	50 %	339626031
16018	NC_015744	A	6	6	729890	729895	100 %	0 %	0 %	0 %	339626031
16019	NC_015744	T	8	8	729921	729928	0 %	100 %	0 %	0 %	339626031
16020	NC_015744	AAT	2	6	729929	729934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626031
16021	NC_015744	TTCT	3	12	730030	730041	0 %	75 %	0 %	25 %	339626031
16022	NC_015744	CT	3	6	730040	730045	0 %	50 %	0 %	50 %	339626031
16023	NC_015744	CTG	2	6	730074	730079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626031
16024	NC_015744	AATG	2	8	730081	730088	50 %	25 %	25 %	0 %	339626031
16025	NC_015744	AGCA	2	8	730145	730152	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16026	NC_015744	TTA	2	6	730236	730241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_015744	TAA	2	6	730258	730263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_015744	AGA	2	6	730286	730291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_015744	TTA	2	6	730325	730330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_015744	TGA	2	6	730336	730341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_015744	TCTCT	2	10	730423	730432	0 %	60 %	0 %	40 %	339626032
16032	NC_015744	TTC	2	6	730549	730554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626032
16033	NC_015744	GAC	2	6	730568	730573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626032
16034	NC_015744	GTC	2	6	730671	730676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626032
16035	NC_015744	AATC	2	8	730955	730962	50 %	25 %	0 %	25 %	339626032
16036	NC_015744	AAAC	2	8	731033	731040	75 %	0 %	0 %	25 %	339626032
16037	NC_015744	AAATA	2	10	731097	731106	80 %	20 %	0 %	0 %	339626032
16038	NC_015744	CGAA	2	8	731130	731137	50 %	0 %	25 %	25 %	339626032
16039	NC_015744	CT	3	6	731143	731148	0 %	50 %	0 %	50 %	339626032
16040	NC_015744	AGC	2	6	731151	731156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626032
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16042	NC_015744	TTA	2	6	731275	731280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626033
16043	NC_015744	AATTA	2	10	731283	731292	60 %	40 %	0 %	0 %	339626033
16044	NC_015744	AGCT	2	8	731370	731377	25 %	25 %	25 %	25 %	339626033
16045	NC_015744	CTT	2	6	731681	731686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626033
16046	NC_015744	CT	3	6	731889	731894	0 %	50 %	0 %	50 %	339626033
16047	NC_015744	AG	3	6	731917	731922	50 %	0 %	50 %	0 %	339626033
16048	NC_015744	C	6	6	731937	731942	0 %	0 %	0 %	100 %	339626033
16049	NC_015744	TCT	2	6	732010	732015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626033
16050	NC_015744	CCGC	2	8	732065	732072	0 %	0 %	25 %	75 %	339626033
16051	NC_015744	CAG	2	6	732139	732144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339626033
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16053	NC_015744	CT	3	6	732332	732337	0 %	50 %	0 %	50 %	339626033
16054	NC_015744	AAC	3	9	732396	732404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626033
16055	NC_015744	TCTT	2	8	732414	732421	0 %	75 %	0 %	25 %	339626033
16056	NC_015744	TCG	2	6	732441	732446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339626033
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16058	NC_015744	T	6	6	732503	732508	0 %	100 %	0 %	0 %	339626033
16059	NC_015744	CT	3	6	732527	732532	0 %	50 %	0 %	50 %	339626034
16060	NC_015744	TGA	2	6	732533	732538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626034
16061	NC_015744	TCC	2	6	732544	732549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626034
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16063	NC_015744	CCG	2	6	732647	732652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339626034
16064	NC_015744	ATC	2	6	732682	732687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626034
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16066	NC_015744	TCT	2	6	732776	732781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626034
16067	NC_015744	TC	3	6	732909	732914	0 %	50 %	0 %	50 %	339626034
16068	NC_015744	TCT	2	6	732921	732926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626034
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16072	NC_015744	TAA	2	6	733101	733106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626034
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16074	NC_015744	TTC	2	6	733126	733131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626034
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16091	NC_015744	ACA	3	9	733958	733966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626035
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16101	NC_015744	GCA	2	6	734341	734346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_015744	GTATA	2	10	734347	734356	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_015744	AGCAA	2	10	734383	734392	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16104	NC_015744	ATTT	2	8	734418	734425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_015744	AGAA	2	8	734428	734435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_015744	CAA	2	6	734507	734512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339626036
16107	NC_015744	ATG	2	6	734521	734526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626036
16108	NC_015744	TCT	2	6	734527	734532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626036
16109	NC_015744	CTC	2	6	734672	734677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339626036
16110	NC_015744	AG	3	6	734730	734735	50 %	0 %	50 %	0 %	339626036
16111	NC_015744	TCTT	2	8	734787	734794	0 %	75 %	0 %	25 %	339626036
16112	NC_015744	AACT	2	8	734859	734866	50 %	25 %	0 %	25 %	339626036
16113	NC_015744	CTT	2	6	734886	734891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626036
16114	NC_015744	AAGC	2	8	734895	734902	50 %	0 %	25 %	25 %	339626036
16115	NC_015744	TAT	2	6	734927	734932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339626036
16116	NC_015744	GC	3	6	734949	734954	0 %	0 %	50 %	50 %	339626036
16117	NC_015744	CTTCT	2	10	734966	734975	0 %	60 %	0 %	40 %	339626036
16118	NC_015744	TGA	2	6	735010	735015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339626036
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16120	NC_015744	AAT	2	6	735058	735063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626036
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16122	NC_015744	AAT	3	9	735154	735162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339626036
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16495	NC_015744	ATC	2	6	750308	750313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626049
16496	NC_015744	AATC	2	8	750406	750413	50 %	25 %	0 %	25 %	339626049
16497	NC_015744	A	6	6	750459	750464	100 %	0 %	0 %	0 %	339626049
16498	NC_015744	CAT	2	6	750473	750478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339626049
16499	NC_015744	GA	3	6	750506	750511	50 %	0 %	50 %	0 %	339626050
16500	NC_015744	CTT	2	6	750513	750518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339626050

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