MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 22920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_015744	TCC	2	6	637983	637988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625948
14003	NC_015744	CGC	2	6	638038	638043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339625948
14004	NC_015744	TGTGT	2	10	638050	638059	0 %	60 %	40 %	0 %	339625948
14005	NC_015744	TGA	2	6	638064	638069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625948
14006	NC_015744	CAT	3	9	638172	638180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625948
14007	NC_015744	GTG	2	6	638219	638224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625948
14008	NC_015744	TGC	2	6	638283	638288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625948
14009	NC_015744	AAG	2	6	638293	638298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625948
14010	NC_015744	AAG	2	6	638360	638365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625948
14011	NC_015744	TAA	2	6	638394	638399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625948
14012	NC_015744	GGA	2	6	638532	638537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625948
14013	NC_015744	AAG	2	6	638576	638581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625948
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14015	NC_015744	AGA	2	6	638607	638612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625948
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14018	NC_015744	TGA	2	6	638691	638696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625948
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14020	NC_015744	TAAAG	2	10	638937	638946	60 %	20 %	20 %	0 %	339625949
14021	NC_015744	GAT	2	6	638947	638952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625949
14022	NC_015744	TCC	2	6	639023	639028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625949
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14041	NC_015744	A	7	7	639839	639845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_015744	GCC	2	6	639858	639863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_015744	AATT	2	8	639892	639899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_015744	A	6	6	639909	639914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_015744	TTG	2	6	639930	639935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_015744	A	7	7	639937	639943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_015744	ATA	2	6	639960	639965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14088	NC_015744	AAAAAG	2	12	641705	641716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14089	NC_015744	CCT	4	12	641789	641800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625951
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14105	NC_015744	CTTT	2	8	642451	642458	0 %	75 %	0 %	25 %	339625951
14106	NC_015744	ATC	2	6	642460	642465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625951
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14108	NC_015744	GTT	2	6	642512	642517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625951
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14112	NC_015744	GCT	2	6	642594	642599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625951
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14117	NC_015744	ATA	2	6	642770	642775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625951
14118	NC_015744	T	6	6	642933	642938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_015744	T	7	7	642960	642966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_015744	AAGA	2	8	643042	643049	75 %	0 %	25 %	0 %	339625952
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14493	NC_015744	ATG	2	6	660036	660041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625968
14494	NC_015744	A	7	7	660047	660053	100 %	0 %	0 %	0 %	339625968
14495	NC_015744	TAA	2	6	660075	660080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625968
14496	NC_015744	A	7	7	660089	660095	100 %	0 %	0 %	0 %	339625968
14497	NC_015744	CTTCA	2	10	660277	660286	20 %	40 %	0 %	40 %	339625968
14498	NC_015744	ATC	2	6	660331	660336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625968
14499	NC_015744	TCT	2	6	660344	660349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625968
14500	NC_015744	CATTG	2	10	660381	660390	20 %	40 %	20 %	20 %	339625968

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