MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 2756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015736	GAGT	2	8	125128	125135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_015736	CAG	2	6	125154	125159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_015736	CAT	2	6	125275	125280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_015736	GAG	2	6	125311	125316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015736	GCC	2	6	125402	125407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2506	NC_015736	TAA	2	6	125518	125523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015736	TCA	2	6	125668	125673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_015736	CGC	2	6	125747	125752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_015736	CACAG	2	10	125816	125825	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2510	NC_015736	GTA	2	6	125887	125892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015736	C	6	6	126073	126078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2512	NC_015736	CTTT	2	8	126197	126204	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_015736	GCT	2	6	126213	126218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_015736	CCT	2	6	126229	126234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_015736	GTT	2	6	126302	126307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015736	ACG	2	6	126317	126322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_015736	GT	3	6	126339	126344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_015736	TGC	2	6	126357	126362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_015736	A	6	6	126440	126445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015736	GA	3	6	126473	126478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015736	CAT	2	6	126582	126587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_015736	CCTC	2	8	126667	126674	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2523	NC_015736	GC	3	6	126769	126774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_015736	TCGG	2	8	126843	126850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_015736	GGA	2	6	126869	126874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_015736	C	6	6	126879	126884	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2527	NC_015736	GCT	3	9	127000	127008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_015736	CTC	2	6	127028	127033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2529	NC_015736	TCGC	2	8	127039	127046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_015736	CTA	2	6	127049	127054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_015736	TCT	2	6	127072	127077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_015736	CGC	2	6	127104	127109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_015736	TA	3	6	127126	127131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_015736	ACC	2	6	127180	127185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_015736	GCC	2	6	127191	127196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_015736	TCG	2	6	127237	127242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_015736	GC	3	6	127267	127272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_015736	CGC	2	6	127307	127312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2539	NC_015736	AGG	2	6	127355	127360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_015736	CCT	2	6	127433	127438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2541	NC_015736	GCT	2	6	127461	127466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_015736	GT	3	6	127501	127506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015736	CT	3	6	127628	127633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2544	NC_015736	CCCA	2	8	127679	127686	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2545	NC_015736	ATG	2	6	127695	127700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_015736	CGT	2	6	127707	127712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_015736	CTCC	2	8	127716	127723	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2548	NC_015736	CACGA	2	10	127815	127824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2549	NC_015736	GAC	2	6	127828	127833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_015736	GCA	2	6	127840	127845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_015736	TTC	2	6	127918	127923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_015736	CAT	2	6	127945	127950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_015736	CTC	2	6	128006	128011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_015736	TCAGTG	2	12	128139	128150	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2555	NC_015736	GCCTTC	2	12	128166	128177	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_015736	TCC	2	6	128183	128188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2557	NC_015736	C	6	6	128227	128232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2558	NC_015736	GCT	2	6	128373	128378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_015736	C	6	6	128440	128445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2560	NC_015736	CTT	2	6	128482	128487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_015736	C	6	6	128517	128522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2562	NC_015736	CTG	2	6	128541	128546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_015736	TGG	2	6	128625	128630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_015736	TAT	2	6	128633	128638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_015736	TGC	2	6	128711	128716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_015736	CCA	2	6	128807	128812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_015736	TGC	2	6	128825	128830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_015736	TCTG	2	8	128902	128909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2569	NC_015736	CGG	2	6	129076	129081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_015736	GCC	2	6	129086	129091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_015736	TAG	2	6	129123	129128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_015736	CGC	2	6	129148	129153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2573	NC_015736	CCA	2	6	129178	129183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_015736	CCA	3	9	129269	129277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2575	NC_015736	CAC	2	6	129304	129309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2577	NC_015736	GCT	2	6	129352	129357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2580	NC_015736	TGCT	2	8	129535	129542	0 %	50 %	25 %	25 %	339478244
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2587	NC_015736	CAG	2	6	129910	129915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_015736	CTG	2	6	129948	129953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_015736	C	6	6	130020	130025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2590	NC_015736	CTT	2	6	130106	130111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_015736	TGC	2	6	130138	130143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339478245
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2593	NC_015736	CGGA	2	8	130228	130235	25 %	0 %	50 %	25 %	339478245
2594	NC_015736	GA	3	6	130234	130239	50 %	0 %	50 %	0 %	339478245
2595	NC_015736	CA	3	6	130288	130293	50 %	0 %	0 %	50 %	339478245
2596	NC_015736	CAG	2	6	130313	130318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339478245
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2598	NC_015736	TCT	2	6	130495	130500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339478245
2599	NC_015736	GATG	2	8	130610	130617	25 %	25 %	50 %	0 %	339478245
2600	NC_015736	CCA	2	6	130634	130639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339478245
2601	NC_015736	CG	3	6	130645	130650	0 %	0 %	50 %	50 %	339478245
2602	NC_015736	GGA	2	6	130776	130781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_015736	CTT	2	6	131098	131103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_015736	GCC	2	6	131146	131151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_015736	C	6	6	131150	131155	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2606	NC_015736	CTGC	2	8	131171	131178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_015736	GCA	2	6	131209	131214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_015736	CCT	2	6	131312	131317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2609	NC_015736	CAC	2	6	131428	131433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_015736	AGCA	2	8	131467	131474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_015736	G	7	7	131482	131488	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_015736	GC	3	6	131496	131501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_015736	CAC	2	6	131660	131665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_015736	GC	3	6	131698	131703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_015736	CGGCG	2	10	131756	131765	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2616	NC_015736	CCA	2	6	131778	131783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2617	NC_015736	AG	3	6	131861	131866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_015736	CTC	2	6	131871	131876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2619	NC_015736	TGC	2	6	131878	131883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_015736	CTT	2	6	131973	131978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_015736	TACCA	2	10	132127	132136	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2622	NC_015736	CTC	2	6	132158	132163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2623	NC_015736	GCT	2	6	132191	132196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_015736	CGC	2	6	132248	132253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2625	NC_015736	CGGCG	2	10	132319	132328	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2626	NC_015736	CAG	2	6	132373	132378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_015736	TGC	2	6	132382	132387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_015736	AGC	2	6	132495	132500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_015736	CAGC	2	8	132509	132516	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_015736	GAC	2	6	132520	132525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_015736	GCCC	2	8	132567	132574	0 %	0 %	25 %	75 %	339478246
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2633	NC_015736	AGG	2	6	132704	132709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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