MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015727	GC	3	6	188570	188575	0 %	0 %	50 %	50 %	339327959
4002	NC_015727	CTG	2	6	188585	188590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327959
4003	NC_015727	CGG	2	6	188592	188597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327959
4004	NC_015727	CTA	2	6	188650	188655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327959
4005	NC_015727	TCT	2	6	188700	188705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327959
4006	NC_015727	AAG	2	6	188824	188829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015727	TCG	2	6	188904	188909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327960
4008	NC_015727	GCCG	2	8	189018	189025	0 %	0 %	50 %	50 %	339327960
4009	NC_015727	GCGT	2	8	189051	189058	0 %	25 %	50 %	25 %	339327960
4010	NC_015727	CAC	2	6	189251	189256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_015727	GAG	2	6	189293	189298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015727	GCA	2	6	189361	189366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015727	AGC	2	6	189371	189376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015727	AGC	2	6	189380	189385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015727	ATGA	2	8	189394	189401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015727	CAA	2	6	189419	189424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015727	CGA	2	6	189448	189453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015727	ATGCGC	2	12	189497	189508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_015727	GAG	2	6	189560	189565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015727	GCC	2	6	189572	189577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_015727	ACG	2	6	189610	189615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015727	CCG	2	6	189691	189696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_015727	ACCG	2	8	189697	189704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_015727	GAC	2	6	189708	189713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015727	AGG	2	6	189781	189786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015727	AT	3	6	189804	189809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015727	CTCG	2	8	189849	189856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_015727	GCG	2	6	189897	189902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015727	GCA	2	6	189914	189919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015727	GCG	2	6	190020	190025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_015727	ATA	2	6	190044	190049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015727	GCT	2	6	190089	190094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015727	TCC	2	6	190163	190168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327961
4034	NC_015727	AGC	3	9	190193	190201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327961
4035	NC_015727	GTG	2	6	190203	190208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327961
4036	NC_015727	GAT	2	6	190211	190216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327961
4037	NC_015727	ATGT	2	8	190221	190228	25 %	50 %	25 %	0 %	339327961
4038	NC_015727	TCG	2	6	190232	190237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327961
4039	NC_015727	CGG	2	6	190306	190311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327961
4040	NC_015727	CCA	2	6	190330	190335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327961
4041	NC_015727	GCG	2	6	190371	190376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327961
4042	NC_015727	AAGC	2	8	190381	190388	50 %	0 %	25 %	25 %	339327961
4043	NC_015727	CGC	2	6	190397	190402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327961
4044	NC_015727	GAA	2	6	190474	190479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327961
4045	NC_015727	CCT	2	6	190570	190575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327961
4046	NC_015727	CACG	2	8	190606	190613	25 %	0 %	25 %	50 %	339327961
4047	NC_015727	CTG	2	6	190616	190621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327961
4048	NC_015727	CGG	2	6	190639	190644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327961
4049	NC_015727	TCC	2	6	190681	190686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327961
4050	NC_015727	GTG	2	6	190695	190700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327961
4051	NC_015727	AGG	2	6	190738	190743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015727	CTT	2	6	190792	190797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015727	TCAA	2	8	190802	190809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_015727	GAAT	2	8	190852	190859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015727	AGA	2	6	190958	190963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327962
4056	NC_015727	TGT	2	6	191017	191022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327962
4057	NC_015727	TGC	2	6	191041	191046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327962
4058	NC_015727	GA	3	6	191128	191133	50 %	0 %	50 %	0 %	339327962
4059	NC_015727	GCTT	2	8	191166	191173	0 %	50 %	25 %	25 %	339327962
4060	NC_015727	CGAC	2	8	191305	191312	25 %	0 %	25 %	50 %	339327962
4061	NC_015727	TCA	2	6	191320	191325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327962
4062	NC_015727	TCG	2	6	191371	191376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327962
4063	NC_015727	ATTG	2	8	191400	191407	25 %	50 %	25 %	0 %	339327962
4064	NC_015727	TCG	2	6	191476	191481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327962
4065	NC_015727	GTCG	2	8	191495	191502	0 %	25 %	50 %	25 %	339327962
4066	NC_015727	CGC	2	6	191574	191579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327962
4067	NC_015727	GGC	2	6	191595	191600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327962
4068	NC_015727	CAAC	2	8	191621	191628	50 %	0 %	0 %	50 %	339327962
4069	NC_015727	GGA	2	6	191744	191749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327962
4070	NC_015727	GCA	2	6	191888	191893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327962
4071	NC_015727	CCG	2	6	191902	191907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327962
4072	NC_015727	GCC	2	6	191925	191930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327962
4073	NC_015727	CTCGC	2	10	192081	192090	0 %	20 %	20 %	60 %	339327962
4074	NC_015727	ACG	2	6	192092	192097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327962
4075	NC_015727	GCG	2	6	192184	192189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_015727	CAA	2	6	192228	192233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015727	GTT	2	6	192236	192241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_015727	ATT	2	6	192338	192343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015727	AGGC	2	8	192489	192496	25 %	0 %	50 %	25 %	339327963
4080	NC_015727	GTG	2	6	192506	192511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327963
4081	NC_015727	GCCA	2	8	192572	192579	25 %	0 %	25 %	50 %	339327963
4082	NC_015727	GGCGCG	2	12	192610	192621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327963
4083	NC_015727	GCT	2	6	192649	192654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327963
4084	NC_015727	CAA	2	6	192655	192660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327963
4085	NC_015727	GGC	2	6	192685	192690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327963
4086	NC_015727	CAG	2	6	192692	192697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327963
4087	NC_015727	GCT	2	6	192721	192726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327963
4088	NC_015727	AGCGA	2	10	192938	192947	40 %	0 %	40 %	20 %	339327963
4089	NC_015727	GCC	2	6	192958	192963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327963
4090	NC_015727	TGG	2	6	192966	192971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327963
4091	NC_015727	GC	3	6	192993	192998	0 %	0 %	50 %	50 %	339327963
4092	NC_015727	TCT	2	6	193049	193054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327964
4093	NC_015727	TCCC	2	8	193095	193102	0 %	25 %	0 %	75 %	339327964
4094	NC_015727	GC	3	6	193142	193147	0 %	0 %	50 %	50 %	339327964
4095	NC_015727	GGC	2	6	193152	193157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327964
4096	NC_015727	CGT	2	6	193263	193268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327964
4097	NC_015727	GCT	2	6	193311	193316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327964
4098	NC_015727	CAT	2	6	193317	193322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327964
4099	NC_015727	GAC	2	6	193330	193335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327964
4100	NC_015727	CAT	2	6	193401	193406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327964
4101	NC_015727	CGA	2	6	193410	193415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327964
4102	NC_015727	GGC	2	6	193450	193455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327964
4103	NC_015727	CAT	2	6	193476	193481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327964
4104	NC_015727	AGG	2	6	193524	193529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327964
4105	NC_015727	CTG	2	6	193594	193599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327964
4106	NC_015727	CTT	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327964
4107	NC_015727	GCC	2	6	193633	193638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327964
4108	NC_015727	GCGGT	2	10	193640	193649	0 %	20 %	60 %	20 %	339327964
4109	NC_015727	TGGC	2	8	193697	193704	0 %	25 %	50 %	25 %	339327964
4110	NC_015727	CTT	2	6	193716	193721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327964
4111	NC_015727	CGG	2	6	193731	193736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327964
4112	NC_015727	CA	3	6	193739	193744	50 %	0 %	0 %	50 %	339327964
4113	NC_015727	GGC	2	6	193771	193776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327964
4114	NC_015727	CGG	2	6	193806	193811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327964
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4118	NC_015727	TGT	2	6	193997	194002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327965
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4121	NC_015727	TTG	2	6	194152	194157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327965
4122	NC_015727	CAGC	2	8	194279	194286	25 %	0 %	25 %	50 %	339327965
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4497	NC_015727	CT	3	6	211556	211561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4500	NC_015727	TGG	2	6	211667	211672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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