MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015727	CGGC	2	8	143358	143365	0 %	0 %	50 %	50 %	339327918
3003	NC_015727	GCAC	2	8	143471	143478	25 %	0 %	25 %	50 %	339327918
3004	NC_015727	CGCT	2	8	143484	143491	0 %	25 %	25 %	50 %	339327918
3005	NC_015727	TGC	2	6	143492	143497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327918
3006	NC_015727	ATGA	2	8	143513	143520	50 %	25 %	25 %	0 %	339327918
3007	NC_015727	GGT	2	6	143555	143560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327918
3008	NC_015727	TCG	2	6	143622	143627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327918
3009	NC_015727	CT	3	6	143631	143636	0 %	50 %	0 %	50 %	339327918
3010	NC_015727	CGC	2	6	143677	143682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327918
3011	NC_015727	GTC	2	6	143687	143692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327918
3012	NC_015727	CCG	2	6	143725	143730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327918
3013	NC_015727	GC	3	6	143743	143748	0 %	0 %	50 %	50 %	339327918
3014	NC_015727	GC	3	6	143780	143785	0 %	0 %	50 %	50 %	339327918
3015	NC_015727	CGGC	2	8	143797	143804	0 %	0 %	50 %	50 %	339327918
3016	NC_015727	CTC	2	6	143813	143818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327918
3017	NC_015727	GCC	2	6	143859	143864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327918
3018	NC_015727	GC	4	8	143866	143873	0 %	0 %	50 %	50 %	339327918
3019	NC_015727	CAGC	2	8	143894	143901	25 %	0 %	25 %	50 %	339327918
3020	NC_015727	GCG	2	6	143921	143926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327918
3021	NC_015727	GGA	2	6	143964	143969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327919
3022	NC_015727	CCA	2	6	144012	144017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327919
3023	NC_015727	CAT	2	6	144025	144030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327919
3024	NC_015727	CAT	2	6	144055	144060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327919
3025	NC_015727	GCC	2	6	144067	144072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327919
3026	NC_015727	GGC	2	6	144082	144087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327919
3027	NC_015727	GCG	2	6	144108	144113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327919
3028	NC_015727	CAG	2	6	144142	144147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3029	NC_015727	ACG	2	6	144197	144202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3030	NC_015727	CGA	2	6	144207	144212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3031	NC_015727	TGA	3	9	144213	144221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327919
3032	NC_015727	CGG	2	6	144261	144266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327919
3033	NC_015727	AGC	3	9	144272	144280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3034	NC_015727	GTG	2	6	144284	144289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327919
3035	NC_015727	CAG	2	6	144310	144315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
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3038	NC_015727	GAT	2	6	144544	144549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327919
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3040	NC_015727	TGCC	2	8	144646	144653	0 %	25 %	25 %	50 %	339327919
3041	NC_015727	CAG	2	6	144682	144687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3042	NC_015727	CGGC	2	8	144690	144697	0 %	0 %	50 %	50 %	339327919
3043	NC_015727	TGCC	2	8	144702	144709	0 %	25 %	25 %	50 %	339327919
3044	NC_015727	TGG	2	6	144735	144740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327919
3045	NC_015727	GAT	2	6	144751	144756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327919
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3049	NC_015727	CG	4	8	144838	144845	0 %	0 %	50 %	50 %	339327919
3050	NC_015727	GCA	3	9	144855	144863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
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3052	NC_015727	CGA	2	6	144936	144941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3053	NC_015727	CGA	2	6	144966	144971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3054	NC_015727	TGCGT	2	10	144993	145002	0 %	40 %	40 %	20 %	339327919
3055	NC_015727	TCA	2	6	145017	145022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327919
3056	NC_015727	GGC	2	6	145027	145032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327919
3057	NC_015727	CAG	2	6	145054	145059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3058	NC_015727	CTG	2	6	145087	145092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327919
3059	NC_015727	CGGCG	2	10	145108	145117	0 %	0 %	60 %	40 %	339327919
3060	NC_015727	AAGC	2	8	145134	145141	50 %	0 %	25 %	25 %	339327919
3061	NC_015727	CCA	2	6	145176	145181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327919
3062	NC_015727	AAGA	2	8	145207	145214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015727	GAC	2	6	145297	145302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327920
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3065	NC_015727	GCCG	2	8	145345	145352	0 %	0 %	50 %	50 %	339327920
3066	NC_015727	GCA	2	6	145368	145373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327920
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3069	NC_015727	GAT	2	6	145435	145440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327920
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3074	NC_015727	CGTG	2	8	145611	145618	0 %	25 %	50 %	25 %	339327920
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3089	NC_015727	TTGT	2	8	146254	146261	0 %	75 %	25 %	0 %	339327921
3090	NC_015727	ACA	2	6	146291	146296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327921
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3101	NC_015727	GCA	2	6	146801	146806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327922
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3103	NC_015727	CAGG	2	8	146823	146830	25 %	0 %	50 %	25 %	339327922
3104	NC_015727	GC	3	6	146854	146859	0 %	0 %	50 %	50 %	339327922
3105	NC_015727	ATG	2	6	146861	146866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327922
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3108	NC_015727	GGCT	2	8	147009	147016	0 %	25 %	50 %	25 %	339327922
3109	NC_015727	ACC	2	6	147041	147046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327922
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3114	NC_015727	T	6	6	147477	147482	0 %	100 %	0 %	0 %	339327922
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3116	NC_015727	GTG	2	6	147684	147689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015727	ACT	2	6	147718	147723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_015727	G	6	6	147794	147799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015727	A	6	6	147953	147958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015727	GCA	2	6	147997	148002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327923
3121	NC_015727	CGG	2	6	148011	148016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327923
3122	NC_015727	GCC	2	6	148115	148120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327923
3123	NC_015727	GCAG	2	8	148165	148172	25 %	0 %	50 %	25 %	339327923
3124	NC_015727	GAA	2	6	148175	148180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327923
3125	NC_015727	CGAA	2	8	148246	148253	50 %	0 %	25 %	25 %	339327923
3126	NC_015727	TTC	2	6	148295	148300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327923
3127	NC_015727	GGT	3	9	148379	148387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327923
3128	NC_015727	TCCCT	2	10	148456	148465	0 %	40 %	0 %	60 %	339327923
3129	NC_015727	CGTAC	2	10	148480	148489	20 %	20 %	20 %	40 %	339327923
3130	NC_015727	ATC	2	6	148583	148588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327923
3131	NC_015727	TCC	2	6	148677	148682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327923
3132	NC_015727	ACG	2	6	148746	148751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327923
3133	NC_015727	CTGAT	2	10	148758	148767	20 %	40 %	20 %	20 %	339327923
3134	NC_015727	GCGCCG	2	12	148838	148849	0 %	0 %	50 %	50 %	339327923
3135	NC_015727	GAA	2	6	148925	148930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327923
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3137	NC_015727	CAA	2	6	149093	149098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327923
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3139	NC_015727	CTG	3	9	149126	149134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327923
3140	NC_015727	GCAT	2	8	149145	149152	25 %	25 %	25 %	25 %	339327923
3141	NC_015727	CGA	2	6	149188	149193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327923
3142	NC_015727	CAT	2	6	149218	149223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327923
3143	NC_015727	GC	3	6	149227	149232	0 %	0 %	50 %	50 %	339327923
3144	NC_015727	GAGG	2	8	149244	149251	25 %	0 %	75 %	0 %	339327923
3145	NC_015727	ATG	2	6	149253	149258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327924
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3148	NC_015727	GGC	2	6	149464	149469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327924
3149	NC_015727	GC	3	6	149484	149489	0 %	0 %	50 %	50 %	339327924
3150	NC_015727	TGA	2	6	149551	149556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327924
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3153	NC_015727	AGC	2	6	149704	149709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327924
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3155	NC_015727	GCCG	2	8	149813	149820	0 %	0 %	50 %	50 %	339327924
3156	NC_015727	CGC	2	6	149827	149832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327924
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3161	NC_015727	GGC	2	6	150051	150056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327924
3162	NC_015727	ACG	2	6	150187	150192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327924
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3164	NC_015727	TTGA	2	8	150273	150280	25 %	50 %	25 %	0 %	339327924
3165	NC_015727	GGC	2	6	150284	150289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327924
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3220	NC_015727	AAGC	2	8	152544	152551	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3221	NC_015727	TCA	2	6	152554	152559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3222	NC_015727	TCG	2	6	152650	152655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327926
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3236	NC_015727	GGCC	2	8	153272	153279	0 %	0 %	50 %	50 %	339327926
3237	NC_015727	TTC	2	6	153286	153291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327926
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3240	NC_015727	CA	3	6	153357	153362	50 %	0 %	0 %	50 %	339327926
3241	NC_015727	GC	4	8	153364	153371	0 %	0 %	50 %	50 %	339327926
3242	NC_015727	GCA	2	6	153386	153391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327926
3243	NC_015727	GCA	2	6	153415	153420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327926
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3492	NC_015727	TGC	2	6	164899	164904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
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3496	NC_015727	GCT	2	6	165020	165025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936
3497	NC_015727	TGG	2	6	165052	165057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327936
3498	NC_015727	GCC	2	6	165066	165071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327936
3499	NC_015727	GCG	2	6	165076	165081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327936
3500	NC_015727	GCT	2	6	165128	165133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327936

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