MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_015727	GCG	2	6	1253139	1253144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27002	NC_015727	CTT	3	9	1253146	1253154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27003	NC_015727	CGC	2	6	1253237	1253242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27004	NC_015727	CAG	2	6	1253278	1253283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27005	NC_015727	CCTCG	2	10	1253287	1253296	0 %	20 %	20 %	60 %	339328942
27006	NC_015727	CGA	2	6	1253323	1253328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27007	NC_015727	TCC	2	6	1253334	1253339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328942
27008	NC_015727	CCAC	2	8	1253343	1253350	25 %	0 %	0 %	75 %	339328942
27009	NC_015727	CCA	2	6	1253371	1253376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328942
27010	NC_015727	TGC	3	9	1253405	1253413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27011	NC_015727	CCAGCG	2	12	1253458	1253469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339328942
27012	NC_015727	GTC	2	6	1253516	1253521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27013	NC_015727	GCA	2	6	1253523	1253528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27014	NC_015727	CCAGC	2	10	1253561	1253570	20 %	0 %	20 %	60 %	339328942
27015	NC_015727	GGC	2	6	1253576	1253581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328942
27016	NC_015727	GCG	2	6	1253599	1253604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328942
27017	NC_015727	GCCC	2	8	1253615	1253622	0 %	0 %	25 %	75 %	339328942
27018	NC_015727	CGA	2	6	1253671	1253676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27019	NC_015727	CCG	2	6	1253796	1253801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328942
27020	NC_015727	GC	3	6	1253824	1253829	0 %	0 %	50 %	50 %	339328942
27021	NC_015727	CTG	2	6	1253852	1253857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27022	NC_015727	CAGCG	2	10	1253861	1253870	20 %	0 %	40 %	40 %	339328942
27023	NC_015727	TCA	3	9	1253887	1253895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328942
27024	NC_015727	CG	4	8	1253923	1253930	0 %	0 %	50 %	50 %	339328942
27025	NC_015727	GCA	3	9	1254043	1254051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328942
27026	NC_015727	GC	3	6	1254115	1254120	0 %	0 %	50 %	50 %	339328942
27027	NC_015727	AG	3	6	1254146	1254151	50 %	0 %	50 %	0 %	339328942
27028	NC_015727	TCGA	2	8	1254171	1254178	25 %	25 %	25 %	25 %	339328942
27029	NC_015727	GCG	2	6	1254201	1254206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328942
27030	NC_015727	TGG	2	6	1254237	1254242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328942
27031	NC_015727	CTT	2	6	1254290	1254295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328942
27032	NC_015727	TGTC	2	8	1254307	1254314	0 %	50 %	25 %	25 %	339328942
27033	NC_015727	GGC	2	6	1254331	1254336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328943
27034	NC_015727	ATG	2	6	1254389	1254394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328943
27035	NC_015727	GCG	2	6	1254428	1254433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328943
27036	NC_015727	GGT	2	6	1254454	1254459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328943
27037	NC_015727	GCG	2	6	1254498	1254503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328943
27038	NC_015727	TGC	2	6	1254533	1254538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328943
27039	NC_015727	CGC	2	6	1254604	1254609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328943
27040	NC_015727	TCG	2	6	1254611	1254616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328943
27041	NC_015727	AAT	2	6	1254682	1254687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339328943
27042	NC_015727	GCG	2	6	1254701	1254706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328943
27043	NC_015727	TCA	2	6	1254749	1254754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328943
27044	NC_015727	GC	3	6	1254761	1254766	0 %	0 %	50 %	50 %	339328943
27045	NC_015727	CCG	2	6	1254777	1254782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328943
27046	NC_015727	CG	3	6	1254831	1254836	0 %	0 %	50 %	50 %	339328943
27047	NC_015727	CCA	2	6	1254846	1254851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328943
27048	NC_015727	TGG	2	6	1254858	1254863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328943
27049	NC_015727	GCC	2	6	1254868	1254873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328943
27050	NC_015727	ATATTG	2	12	1254884	1254895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	339328943
27051	NC_015727	TGC	2	6	1254908	1254913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328943
27052	NC_015727	ACC	2	6	1254923	1254928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328943
27053	NC_015727	CAC	2	6	1254931	1254936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328943
27054	NC_015727	CGC	2	6	1254949	1254954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328943
27055	NC_015727	TGC	3	9	1254983	1254991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328943
27056	NC_015727	GTGCGC	2	12	1255006	1255017	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339328943
27057	NC_015727	GCCG	2	8	1255018	1255025	0 %	0 %	50 %	50 %	339328943
27058	NC_015727	CAG	2	6	1255072	1255077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328943
27059	NC_015727	GC	3	6	1255114	1255119	0 %	0 %	50 %	50 %	339328943
27060	NC_015727	GC	4	8	1255121	1255128	0 %	0 %	50 %	50 %	339328943
27061	NC_015727	ATC	2	6	1255202	1255207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328943
27062	NC_015727	GAT	2	6	1255234	1255239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328943
27063	NC_015727	TGC	2	6	1255286	1255291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27064	NC_015727	GCT	2	6	1255293	1255298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27065	NC_015727	CACG	2	8	1255375	1255382	25 %	0 %	25 %	50 %	339328944
27066	NC_015727	CCG	2	6	1255411	1255416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328944
27067	NC_015727	GCG	2	6	1255428	1255433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328944
27068	NC_015727	CTC	2	6	1255451	1255456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328944
27069	NC_015727	TCCT	2	8	1255459	1255466	0 %	50 %	0 %	50 %	339328944
27070	NC_015727	ATG	2	6	1255485	1255490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328944
27071	NC_015727	GCTGC	2	10	1255547	1255556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27072	NC_015727	CGCC	2	8	1255615	1255622	0 %	0 %	25 %	75 %	339328945
27073	NC_015727	CGC	2	6	1255645	1255650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328945
27074	NC_015727	ATG	2	6	1255656	1255661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328945
27075	NC_015727	GCCG	2	8	1255667	1255674	0 %	0 %	50 %	50 %	339328945
27076	NC_015727	GCT	2	6	1255721	1255726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328945
27077	NC_015727	CGG	2	6	1255744	1255749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328945
27078	NC_015727	CGG	2	6	1255753	1255758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328945
27079	NC_015727	CAC	2	6	1255790	1255795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328945
27080	NC_015727	TTC	2	6	1255803	1255808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328945
27081	NC_015727	CCAC	2	8	1255839	1255846	25 %	0 %	0 %	75 %	339328945
27082	NC_015727	GAG	2	6	1255860	1255865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328945
27083	NC_015727	CGAAA	2	10	1255894	1255903	60 %	0 %	20 %	20 %	339328945
27084	NC_015727	CCG	2	6	1255933	1255938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328945
27085	NC_015727	GCA	2	6	1255939	1255944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328945
27086	NC_015727	GTCG	2	8	1255949	1255956	0 %	25 %	50 %	25 %	339328945
27087	NC_015727	GGAT	2	8	1256037	1256044	25 %	25 %	50 %	0 %	339328945
27088	NC_015727	GCC	2	6	1256066	1256071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328945
27089	NC_015727	CCT	2	6	1256191	1256196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328945
27090	NC_015727	CGT	2	6	1256230	1256235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328945
27091	NC_015727	TCG	2	6	1256256	1256261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328945
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27093	NC_015727	GAT	2	6	1256324	1256329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328945
27094	NC_015727	G	6	6	1256360	1256365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27095	NC_015727	GCCGA	2	10	1256399	1256408	20 %	0 %	40 %	40 %	339328946
27096	NC_015727	GCC	2	6	1256410	1256415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328946
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27098	NC_015727	GGC	2	6	1256511	1256516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328946
27099	NC_015727	AGCC	2	8	1256527	1256534	25 %	0 %	25 %	50 %	339328946
27100	NC_015727	GCG	2	6	1256564	1256569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328946
27101	NC_015727	CGA	2	6	1256586	1256591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328946
27102	NC_015727	TC	3	6	1256592	1256597	0 %	50 %	0 %	50 %	339328946
27103	NC_015727	TTC	2	6	1256600	1256605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328946
27104	NC_015727	CGG	2	6	1256652	1256657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328946
27105	NC_015727	GAT	2	6	1256681	1256686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328946
27106	NC_015727	CGA	2	6	1256742	1256747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328946
27107	NC_015727	GCA	2	6	1256760	1256765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328946
27108	NC_015727	GC	3	6	1256777	1256782	0 %	0 %	50 %	50 %	339328946
27109	NC_015727	CGG	2	6	1256874	1256879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328946
27110	NC_015727	GGC	2	6	1256884	1256889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328946
27111	NC_015727	CAG	2	6	1256914	1256919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328946
27112	NC_015727	TCT	2	6	1256982	1256987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328946
27113	NC_015727	CTCG	2	8	1256997	1257004	0 %	25 %	25 %	50 %	339328946
27114	NC_015727	TGC	2	6	1257020	1257025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328946
27115	NC_015727	CGT	2	6	1257051	1257056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328946
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27471	NC_015727	ATC	2	6	1273801	1273806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328964
27472	NC_015727	ATC	2	6	1273861	1273866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328964
27473	NC_015727	CGT	2	6	1273868	1273873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328964
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