MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_015727	CATTAT	2	12	1117917	1117928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24002	NC_015727	CAC	2	6	1117945	1117950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24003	NC_015727	CCG	2	6	1117956	1117961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24004	NC_015727	GCAC	2	8	1118008	1118015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24005	NC_015727	T	7	7	1118051	1118057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_015727	GCC	2	6	1118095	1118100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328823
24007	NC_015727	CG	3	6	1118127	1118132	0 %	0 %	50 %	50 %	339328823
24008	NC_015727	CGG	2	6	1118237	1118242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328823
24009	NC_015727	GCC	2	6	1118281	1118286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328823
24010	NC_015727	G	6	6	1118315	1118320	0 %	0 %	100 %	0 %	339328823
24011	NC_015727	TC	3	6	1118335	1118340	0 %	50 %	0 %	50 %	339328823
24012	NC_015727	CTC	2	6	1118371	1118376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328824
24013	NC_015727	ATG	2	6	1118540	1118545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328824
24014	NC_015727	CTG	2	6	1118552	1118557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328824
24015	NC_015727	GAT	2	6	1118584	1118589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328824
24016	NC_015727	CGG	2	6	1118670	1118675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328824
24017	NC_015727	GAC	2	6	1118711	1118716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328824
24018	NC_015727	GGT	2	6	1118728	1118733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328824
24019	NC_015727	TGG	2	6	1118790	1118795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328824
24020	NC_015727	GCC	2	6	1118849	1118854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328824
24021	NC_015727	GGA	2	6	1118932	1118937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328824
24022	NC_015727	CA	3	6	1119021	1119026	50 %	0 %	0 %	50 %	339328824
24023	NC_015727	GGCGCG	2	12	1119052	1119063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328824
24024	NC_015727	GCC	2	6	1119146	1119151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328824
24025	NC_015727	CGGT	2	8	1119170	1119177	0 %	25 %	50 %	25 %	339328824
24026	NC_015727	TTG	2	6	1119312	1119317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328825
24027	NC_015727	CAAC	2	8	1119324	1119331	50 %	0 %	0 %	50 %	339328825
24028	NC_015727	GGC	2	6	1119335	1119340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328825
24029	NC_015727	GCA	2	6	1119352	1119357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328825
24030	NC_015727	GCT	2	6	1119448	1119453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328825
24031	NC_015727	GGCG	2	8	1119463	1119470	0 %	0 %	75 %	25 %	339328825
24032	NC_015727	GT	3	6	1119563	1119568	0 %	50 %	50 %	0 %	339328825
24033	NC_015727	CAC	2	6	1119596	1119601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328825
24034	NC_015727	TCA	2	6	1119642	1119647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328825
24035	NC_015727	CAC	2	6	1119697	1119702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328825
24036	NC_015727	TCA	2	6	1119825	1119830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328825
24037	NC_015727	TTC	2	6	1119845	1119850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328825
24038	NC_015727	CGG	2	6	1119853	1119858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328825
24039	NC_015727	CTG	2	6	1119920	1119925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328825
24040	NC_015727	CGA	2	6	1119952	1119957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328825
24041	NC_015727	TGGC	2	8	1120055	1120062	0 %	25 %	50 %	25 %	339328825
24042	NC_015727	CGC	2	6	1120073	1120078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328825
24043	NC_015727	CGC	2	6	1120114	1120119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328825
24044	NC_015727	GTG	4	12	1120184	1120195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328825
24045	NC_015727	TTG	2	6	1120205	1120210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328825
24046	NC_015727	TGATG	2	10	1120234	1120243	20 %	40 %	40 %	0 %	339328825
24047	NC_015727	GCC	2	6	1120278	1120283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328825
24048	NC_015727	TGC	2	6	1120330	1120335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328825
24049	NC_015727	CGGG	2	8	1120372	1120379	0 %	0 %	75 %	25 %	339328825
24050	NC_015727	GC	3	6	1120511	1120516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24051	NC_015727	GTG	2	6	1120593	1120598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24052	NC_015727	CGA	2	6	1120624	1120629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24053	NC_015727	TGG	2	6	1120662	1120667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24054	NC_015727	GGT	2	6	1120684	1120689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24055	NC_015727	CGG	2	6	1120701	1120706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328826
24056	NC_015727	GAG	2	6	1120751	1120756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328826
24057	NC_015727	CGC	2	6	1120774	1120779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328826
24058	NC_015727	ACG	2	6	1120814	1120819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24059	NC_015727	GA	3	6	1120842	1120847	50 %	0 %	50 %	0 %	339328826
24060	NC_015727	CG	3	6	1120869	1120874	0 %	0 %	50 %	50 %	339328826
24061	NC_015727	GAG	2	6	1120877	1120882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328826
24062	NC_015727	ATG	2	6	1120922	1120927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328826
24063	NC_015727	GCG	2	6	1120928	1120933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328826
24064	NC_015727	TGG	2	6	1120935	1120940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24065	NC_015727	TGA	2	6	1121008	1121013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328826
24066	NC_015727	AGGC	2	8	1121046	1121053	25 %	0 %	50 %	25 %	339328826
24067	NC_015727	CGA	2	6	1121119	1121124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24068	NC_015727	TCT	2	6	1121147	1121152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328826
24069	NC_015727	GCA	2	6	1121198	1121203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24070	NC_015727	TGC	2	6	1121240	1121245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24071	NC_015727	ACCC	2	8	1121257	1121264	25 %	0 %	0 %	75 %	339328826
24072	NC_015727	GCCC	2	8	1121319	1121326	0 %	0 %	25 %	75 %	339328826
24073	NC_015727	CA	3	6	1121341	1121346	50 %	0 %	0 %	50 %	339328826
24074	NC_015727	CG	4	8	1121425	1121432	0 %	0 %	50 %	50 %	339328826
24075	NC_015727	CGC	2	6	1121491	1121496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328826
24076	NC_015727	GAT	2	6	1121668	1121673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328826
24077	NC_015727	TGG	2	6	1121691	1121696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24078	NC_015727	TTGCCG	2	12	1121729	1121740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24079	NC_015727	GC	3	6	1121773	1121778	0 %	0 %	50 %	50 %	339328826
24080	NC_015727	TGG	2	6	1121831	1121836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328826
24081	NC_015727	ATCC	2	8	1122019	1122026	25 %	25 %	0 %	50 %	339328826
24082	NC_015727	AGC	2	6	1122039	1122044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24083	NC_015727	CTA	2	6	1122086	1122091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328826
24084	NC_015727	CG	3	6	1122192	1122197	0 %	0 %	50 %	50 %	339328826
24085	NC_015727	CAGA	2	8	1122236	1122243	50 %	0 %	25 %	25 %	339328826
24086	NC_015727	GC	3	6	1122264	1122269	0 %	0 %	50 %	50 %	339328826
24087	NC_015727	GAC	2	6	1122343	1122348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328826
24088	NC_015727	AG	3	6	1122367	1122372	50 %	0 %	50 %	0 %	339328826
24089	NC_015727	CGA	2	6	1122384	1122389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328827
24090	NC_015727	CCGTG	2	10	1122399	1122408	0 %	20 %	40 %	40 %	339328827
24091	NC_015727	GCA	2	6	1122430	1122435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328827
24092	NC_015727	CGG	2	6	1122456	1122461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328827
24093	NC_015727	TTC	2	6	1122612	1122617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24094	NC_015727	TGT	2	6	1122662	1122667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24095	NC_015727	GGA	2	6	1122688	1122693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24096	NC_015727	TGCC	2	8	1122838	1122845	0 %	25 %	25 %	50 %	339328828
24097	NC_015727	CCGG	2	8	1122856	1122863	0 %	0 %	50 %	50 %	339328828
24098	NC_015727	GATC	2	8	1122871	1122878	25 %	25 %	25 %	25 %	339328828
24099	NC_015727	AAC	2	6	1122888	1122893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328828
24100	NC_015727	CTT	2	6	1122904	1122909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328828
24101	NC_015727	CTGA	2	8	1122934	1122941	25 %	25 %	25 %	25 %	339328828
24102	NC_015727	CAA	2	6	1122965	1122970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24103	NC_015727	GC	3	6	1122999	1123004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24104	NC_015727	GGT	2	6	1123043	1123048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24105	NC_015727	CG	3	6	1123113	1123118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24106	NC_015727	CG	3	6	1123156	1123161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24107	NC_015727	CAT	2	6	1123201	1123206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24108	NC_015727	CTGC	2	8	1123264	1123271	0 %	25 %	25 %	50 %	339328829
24109	NC_015727	CGA	2	6	1123291	1123296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328829
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24111	NC_015727	TGC	2	6	1123390	1123395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328829
24112	NC_015727	TGC	2	6	1123413	1123418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328829
24113	NC_015727	CG	3	6	1123422	1123427	0 %	0 %	50 %	50 %	339328829
24114	NC_015727	GCC	3	9	1123446	1123454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328829
24115	NC_015727	ATG	2	6	1123530	1123535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328829
24116	NC_015727	GTC	2	6	1123566	1123571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328829
24117	NC_015727	GCC	2	6	1123586	1123591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328829
24118	NC_015727	CCAT	2	8	1123725	1123732	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24119	NC_015727	TCT	2	6	1123758	1123763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24120	NC_015727	CGG	2	6	1123773	1123778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24121	NC_015727	CAC	2	6	1123869	1123874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24126	NC_015727	TGA	2	6	1124077	1124082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24223	NC_015727	ATG	2	6	1128508	1128513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24225	NC_015727	AAT	2	6	1128574	1128579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24226	NC_015727	TG	3	6	1128604	1128609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24227	NC_015727	GAC	2	6	1128631	1128636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24228	NC_015727	ATC	2	6	1128654	1128659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24229	NC_015727	CTG	2	6	1128685	1128690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24230	NC_015727	CGA	2	6	1128750	1128755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24232	NC_015727	CCGG	2	8	1128865	1128872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24233	NC_015727	GTC	2	6	1128968	1128973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24234	NC_015727	GTCG	2	8	1129043	1129050	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24235	NC_015727	GTT	2	6	1129062	1129067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24237	NC_015727	GCA	2	6	1129220	1129225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24238	NC_015727	ACC	2	6	1129267	1129272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24240	NC_015727	AG	3	6	1129290	1129295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24241	NC_015727	CTG	2	6	1129334	1129339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328838
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24464	NC_015727	CGA	2	6	1138941	1138946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328846
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24469	NC_015727	GTC	2	6	1139107	1139112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328846
24470	NC_015727	GCC	2	6	1139119	1139124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328846
24471	NC_015727	GAT	2	6	1139155	1139160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328846
24472	NC_015727	GCG	2	6	1139170	1139175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328846
24473	NC_015727	TCG	2	6	1139180	1139185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328846
24474	NC_015727	GTT	2	6	1139320	1139325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328846
24475	NC_015727	CAGAA	2	10	1139348	1139357	60 %	0 %	20 %	20 %	339328846
24476	NC_015727	GGCATA	2	12	1139380	1139391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339328846
24477	NC_015727	GGGC	2	8	1139425	1139432	0 %	0 %	75 %	25 %	339328846
24478	NC_015727	CTG	2	6	1139455	1139460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328846
24479	NC_015727	CCT	2	6	1139478	1139483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328846
24480	NC_015727	GCA	2	6	1139505	1139510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328846
24481	NC_015727	CG	3	6	1139537	1139542	0 %	0 %	50 %	50 %	339328846
24482	NC_015727	TTGCT	2	10	1139551	1139560	0 %	60 %	20 %	20 %	339328846
24483	NC_015727	AGA	2	6	1139596	1139601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24484	NC_015727	G	6	6	1139607	1139612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24485	NC_015727	TGC	2	6	1139720	1139725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328847
24486	NC_015727	CGGC	2	8	1139736	1139743	0 %	0 %	50 %	50 %	339328847
24487	NC_015727	CTT	2	6	1139794	1139799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328847
24488	NC_015727	CAC	2	6	1139827	1139832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328847
24489	NC_015727	CAA	2	6	1139895	1139900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328847
24490	NC_015727	CCG	2	6	1139904	1139909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328847
24491	NC_015727	GCA	2	6	1139957	1139962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328847
24492	NC_015727	CTT	2	6	1140007	1140012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328847
24493	NC_015727	CTT	2	6	1140030	1140035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328847
24494	NC_015727	CGG	2	6	1140123	1140128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328847
24495	NC_015727	TGCCG	2	10	1140187	1140196	0 %	20 %	40 %	40 %	339328847
24496	NC_015727	CT	3	6	1140386	1140391	0 %	50 %	0 %	50 %	339328848
24497	NC_015727	TCA	2	6	1140582	1140587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328848
24498	NC_015727	CAT	2	6	1140672	1140677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24499	NC_015727	GGCA	3	12	1140686	1140697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24500	NC_015727	AGC	2	6	1140698	1140703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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