MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015727	TTC	2	6	740449	740454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_015727	GTAG	2	8	740466	740473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_015727	AAG	2	6	740565	740570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339328474
16004	NC_015727	GCT	2	6	740627	740632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328474
16005	NC_015727	TGC	2	6	740745	740750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328474
16006	NC_015727	CG	3	6	740781	740786	0 %	0 %	50 %	50 %	339328474
16007	NC_015727	ACC	2	6	740796	740801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328474
16008	NC_015727	GCC	2	6	740873	740878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328474
16009	NC_015727	CG	3	6	740912	740917	0 %	0 %	50 %	50 %	339328474
16010	NC_015727	GCC	2	6	740927	740932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328474
16011	NC_015727	GCG	2	6	740948	740953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328474
16012	NC_015727	CG	3	6	740952	740957	0 %	0 %	50 %	50 %	339328474
16013	NC_015727	CG	4	8	740971	740978	0 %	0 %	50 %	50 %	339328474
16014	NC_015727	GAA	2	6	741008	741013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339328474
16015	NC_015727	CGC	2	6	741047	741052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328474
16016	NC_015727	GCAGGC	2	12	741059	741070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339328474
16017	NC_015727	GGGCA	2	10	741095	741104	20 %	0 %	60 %	20 %	339328474
16018	NC_015727	GGC	2	6	741113	741118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328474
16019	NC_015727	GCC	2	6	741121	741126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328474
16020	NC_015727	AGCG	2	8	741213	741220	25 %	0 %	50 %	25 %	339328474
16021	NC_015727	CG	3	6	741254	741259	0 %	0 %	50 %	50 %	339328474
16022	NC_015727	GTC	2	6	741272	741277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328474
16023	NC_015727	GCT	2	6	741391	741396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_015727	CAG	2	6	741431	741436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_015727	TGC	2	6	741438	741443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_015727	GCTT	2	8	741483	741490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16027	NC_015727	CG	3	6	741527	741532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16028	NC_015727	CCGC	2	8	741602	741609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16029	NC_015727	ATG	2	6	741664	741669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_015727	GCG	2	6	741708	741713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_015727	GCG	2	6	741744	741749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_015727	ATC	2	6	741793	741798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_015727	CAG	2	6	741807	741812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_015727	CGA	2	6	741942	741947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_015727	A	6	6	741963	741968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_015727	AAG	2	6	741975	741980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_015727	GCA	2	6	741988	741993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_015727	GAT	2	6	742003	742008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_015727	GGC	2	6	742037	742042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16040	NC_015727	CGA	2	6	742063	742068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_015727	TGGA	2	8	742089	742096	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_015727	CAA	2	6	742109	742114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_015727	CGG	2	6	742162	742167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_015727	CG	3	6	742195	742200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16045	NC_015727	AGC	2	6	742317	742322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_015727	CCG	2	6	742323	742328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_015727	CGTT	2	8	742383	742390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16048	NC_015727	GCG	2	6	742463	742468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_015727	GTGC	2	8	742568	742575	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16050	NC_015727	CGTT	2	8	742593	742600	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16051	NC_015727	CG	3	6	742601	742606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16052	NC_015727	GCC	2	6	742612	742617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16053	NC_015727	GGC	2	6	742679	742684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_015727	AGC	2	6	742719	742724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_015727	GCG	2	6	742725	742730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_015727	GC	3	6	742766	742771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_015727	CAG	2	6	742772	742777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_015727	CATC	2	8	742801	742808	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16059	NC_015727	CCG	2	6	742891	742896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_015727	GTG	2	6	742903	742908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_015727	GCA	2	6	742915	742920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16062	NC_015727	GAT	2	6	742990	742995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_015727	CGG	2	6	743081	743086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_015727	CAG	2	6	743090	743095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_015727	CGAAA	2	10	743109	743118	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16066	NC_015727	GAT	2	6	743126	743131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16067	NC_015727	CCG	2	6	743142	743147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16068	NC_015727	CGCA	2	8	743189	743196	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_015727	CG	3	6	743198	743203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_015727	GGC	2	6	743265	743270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_015727	GAC	2	6	743296	743301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16072	NC_015727	GGT	3	9	743389	743397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_015727	CGG	3	9	743419	743427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_015727	AGC	2	6	743463	743468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_015727	TTC	2	6	743489	743494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_015727	GCG	2	6	743501	743506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16077	NC_015727	TGC	2	6	743541	743546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_015727	GC	3	6	743564	743569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16079	NC_015727	TGT	2	6	743587	743592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_015727	CGC	2	6	743619	743624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16081	NC_015727	CGTC	2	8	743644	743651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16082	NC_015727	GAA	2	6	743675	743680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_015727	GC	3	6	743760	743765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_015727	GC	3	6	743803	743808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16085	NC_015727	CT	3	6	743950	743955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16086	NC_015727	GAC	2	6	743966	743971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_015727	GCCC	2	8	744005	744012	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16088	NC_015727	CAG	2	6	744032	744037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_015727	GGAA	2	8	744047	744054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_015727	CAGT	2	8	744074	744081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16091	NC_015727	CTC	2	6	744101	744106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_015727	GCA	2	6	744123	744128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_015727	TCG	2	6	744262	744267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_015727	GT	3	6	744319	744324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_015727	GGC	2	6	744374	744379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_015727	CCGGC	2	10	744381	744390	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16097	NC_015727	CAG	2	6	744595	744600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_015727	AAAG	2	8	744632	744639	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_015727	GAC	2	6	744676	744681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_015727	CGG	2	6	744774	744779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_015727	GCC	2	6	744801	744806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16102	NC_015727	GGC	2	6	744814	744819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_015727	AGG	2	6	744885	744890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_015727	TCA	2	6	744909	744914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328475
16105	NC_015727	CTG	2	6	744953	744958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328475
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16109	NC_015727	GGCG	2	8	745072	745079	0 %	0 %	75 %	25 %	339328475
16110	NC_015727	CGC	2	6	745114	745119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328475
16111	NC_015727	GC	3	6	745143	745148	0 %	0 %	50 %	50 %	339328475
16112	NC_015727	TGC	2	6	745173	745178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328475
16113	NC_015727	GCA	2	6	745230	745235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_015727	CCG	2	6	745245	745250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_015727	G	6	6	745268	745273	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_015727	CT	3	6	745282	745287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_015727	ACC	2	6	745349	745354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_015727	TGT	2	6	745423	745428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_015727	CAG	2	6	745450	745455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_015727	ACC	2	6	745460	745465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_015727	ACT	2	6	745536	745541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_015727	ACT	2	6	745552	745557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_015727	CG	3	6	745561	745566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_015727	GC	3	6	745601	745606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16125	NC_015727	TCTA	2	8	745615	745622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16126	NC_015727	CCA	2	6	745660	745665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16127	NC_015727	TGGGG	2	10	745689	745698	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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16129	NC_015727	GTC	2	6	745755	745760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328476
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16251	NC_015727	GAT	2	6	751259	751264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328482
16252	NC_015727	CGG	2	6	751277	751282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328482
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16257	NC_015727	TCG	2	6	751734	751739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328482
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16283	NC_015727	CGATC	2	10	752807	752816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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16286	NC_015727	TTGTCT	2	12	752900	752911	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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16297	NC_015727	CGAT	2	8	753396	753403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16356	NC_015727	CAAC	2	8	755797	755804	50 %	0 %	0 %	50 %	339328487
16357	NC_015727	CGC	2	6	755805	755810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328487
16358	NC_015727	GCAA	2	8	755869	755876	50 %	0 %	25 %	25 %	339328487
16359	NC_015727	CGT	2	6	756041	756046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16361	NC_015727	GCG	2	6	756060	756065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16362	NC_015727	CG	3	6	756259	756264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16363	NC_015727	TCA	2	6	756292	756297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16364	NC_015727	GGC	2	6	756317	756322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16365	NC_015727	CGC	2	6	756384	756389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16366	NC_015727	CAT	2	6	756490	756495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328488
16367	NC_015727	TCG	2	6	756501	756506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328488
16368	NC_015727	GATGCG	2	12	756560	756571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339328488
16369	NC_015727	ATG	2	6	756584	756589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328488
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16371	NC_015727	GCT	2	6	756653	756658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328488
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16493	NC_015727	CTC	2	6	761383	761388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328495
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16495	NC_015727	GGC	2	6	761416	761421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328495
16496	NC_015727	GC	4	8	761420	761427	0 %	0 %	50 %	50 %	339328495
16497	NC_015727	GGC	2	6	761428	761433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328495
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