MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015727	CAG	2	6	508734	508739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_015727	CGG	2	6	508766	508771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_015727	CGG	2	6	508808	508813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_015727	CAG	2	6	508827	508832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_015727	CAC	2	6	508839	508844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_015727	GCCG	3	12	508944	508955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_015727	GC	3	6	508995	509000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11008	NC_015727	GTAG	2	8	509007	509014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_015727	GGCGAC	2	12	509052	509063	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_015727	CAC	2	6	509064	509069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_015727	GCC	2	6	509085	509090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_015727	GAA	3	9	509136	509144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_015727	CCA	2	6	509145	509150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_015727	AAC	2	6	509155	509160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_015727	GAA	2	6	509187	509192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_015727	GCG	2	6	509233	509238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_015727	CGG	2	6	509288	509293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_015727	GAT	2	6	509443	509448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_015727	CGC	2	6	509490	509495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11020	NC_015727	GC	3	6	509504	509509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_015727	GCG	2	6	509582	509587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328263
11022	NC_015727	CGGT	2	8	509671	509678	0 %	25 %	50 %	25 %	339328263
11023	NC_015727	CGG	2	6	509717	509722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328263
11024	NC_015727	TTC	2	6	509727	509732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328263
11025	NC_015727	GCT	2	6	509750	509755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328263
11026	NC_015727	CAG	2	6	509796	509801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328263
11027	NC_015727	CCT	2	6	509830	509835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_015727	GGT	2	6	509850	509855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_015727	CAG	2	6	509945	509950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_015727	TC	3	6	510003	510008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11031	NC_015727	GTCAC	2	10	510044	510053	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11032	NC_015727	CTG	2	6	510075	510080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11033	NC_015727	CCG	2	6	510204	510209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328264
11034	NC_015727	CG	3	6	510405	510410	0 %	0 %	50 %	50 %	339328264
11035	NC_015727	ACC	2	6	510428	510433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328264
11036	NC_015727	TCG	2	6	510459	510464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11037	NC_015727	CCAG	2	8	510512	510519	25 %	0 %	25 %	50 %	339328264
11038	NC_015727	CGC	2	6	510539	510544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328264
11039	NC_015727	CGC	2	6	510553	510558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328264
11040	NC_015727	CCG	2	6	510564	510569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328264
11041	NC_015727	CGA	2	6	510594	510599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11042	NC_015727	CAT	2	6	510622	510627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328264
11043	NC_015727	AGT	2	6	510633	510638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328264
11044	NC_015727	TGC	2	6	510655	510660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11045	NC_015727	CAC	2	6	510721	510726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328264
11046	NC_015727	GC	3	6	510742	510747	0 %	0 %	50 %	50 %	339328264
11047	NC_015727	TGC	3	9	510761	510769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11048	NC_015727	CTGG	2	8	510847	510854	0 %	25 %	50 %	25 %	339328264
11049	NC_015727	CTG	2	6	510898	510903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11050	NC_015727	TTG	2	6	510923	510928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328264
11051	NC_015727	GCTGGC	2	12	510929	510940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339328264
11052	NC_015727	GTG	3	9	510947	510955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328264
11053	NC_015727	ACC	2	6	510968	510973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328264
11054	NC_015727	TCG	2	6	510974	510979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11055	NC_015727	TCG	2	6	511025	511030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11056	NC_015727	GTC	2	6	511113	511118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328264
11057	NC_015727	T	7	7	511146	511152	0 %	100 %	0 %	0 %	339328265
11058	NC_015727	GCC	2	6	511171	511176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328265
11059	NC_015727	GCT	2	6	511217	511222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328265
11060	NC_015727	CTT	2	6	511230	511235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328265
11061	NC_015727	GTT	2	6	511256	511261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328265
11062	NC_015727	GCG	2	6	511344	511349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328265
11063	NC_015727	GCG	2	6	511379	511384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328265
11064	NC_015727	ACC	2	6	511396	511401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328265
11065	NC_015727	TCC	2	6	511411	511416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328265
11066	NC_015727	G	6	6	511551	511556	0 %	0 %	100 %	0 %	339328265
11067	NC_015727	CAT	2	6	511557	511562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328265
11068	NC_015727	TC	3	6	511584	511589	0 %	50 %	0 %	50 %	339328265
11069	NC_015727	ACA	2	6	511660	511665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_015727	TGCGC	2	10	511685	511694	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11071	NC_015727	CCA	2	6	511722	511727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_015727	CAT	2	6	511732	511737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_015727	GCA	2	6	511791	511796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_015727	CG	3	6	511811	511816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_015727	GCAT	2	8	511825	511832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11076	NC_015727	CA	3	6	511839	511844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11077	NC_015727	GCA	2	6	511860	511865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_015727	CTT	2	6	511866	511871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_015727	GCCGG	2	10	511905	511914	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11080	NC_015727	GTC	2	6	512005	512010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11081	NC_015727	TGC	2	6	512027	512032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_015727	AAG	2	6	512048	512053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_015727	TCC	2	6	512075	512080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11084	NC_015727	GCAG	2	8	512099	512106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11085	NC_015727	GCC	3	9	512165	512173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11086	NC_015727	CG	3	6	512184	512189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_015727	CG	3	6	512211	512216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_015727	GCCC	2	8	512239	512246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11089	NC_015727	TGC	2	6	512259	512264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_015727	GCT	2	6	512283	512288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_015727	TCC	2	6	512300	512305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_015727	GCG	2	6	512327	512332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_015727	CGC	2	6	512355	512360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11094	NC_015727	TTC	2	6	512376	512381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_015727	CTCG	2	8	512429	512436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_015727	CGT	2	6	512450	512455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_015727	CCG	2	6	512456	512461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11098	NC_015727	TTG	2	6	512464	512469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_015727	CGGA	2	8	512486	512493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_015727	GCC	2	6	512569	512574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328266
11101	NC_015727	CGC	2	6	512588	512593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328266
11102	NC_015727	GTC	2	6	512613	512618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328266
11103	NC_015727	GCA	2	6	512627	512632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328266
11104	NC_015727	AATC	2	8	512690	512697	50 %	25 %	0 %	25 %	339328266
11105	NC_015727	GCT	2	6	512720	512725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328266
11106	NC_015727	GA	3	6	512786	512791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_015727	GATC	2	8	512888	512895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_015727	A	6	6	512897	512902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_015727	GAT	2	6	512925	512930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_015727	AGA	2	6	512989	512994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_015727	CAG	2	6	513034	513039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_015727	CCG	2	6	513092	513097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_015727	GCA	2	6	513119	513124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_015727	GCC	2	6	513250	513255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328267
11115	NC_015727	ACT	2	6	513264	513269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328267
11116	NC_015727	TGC	3	9	513274	513282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328267
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11118	NC_015727	TCG	2	6	513319	513324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328267
11119	NC_015727	GGC	2	6	513360	513365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328267
11120	NC_015727	CAC	2	6	513414	513419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328267
11121	NC_015727	TCC	2	6	513424	513429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328267
11122	NC_015727	CTT	2	6	513450	513455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328267
11123	NC_015727	AGG	2	6	513499	513504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328267
11124	NC_015727	GAC	2	6	513528	513533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328267
11125	NC_015727	TTTCTC	2	12	513534	513545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328267
11126	NC_015727	ACG	2	6	513551	513556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328267
11127	NC_015727	CCGCCC	2	12	513604	513615	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	339328267
11128	NC_015727	CAT	2	6	513629	513634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328267
11129	NC_015727	GTC	2	6	513636	513641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328267
11130	NC_015727	TTC	2	6	513670	513675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339328267
11131	NC_015727	GC	3	6	513680	513685	0 %	0 %	50 %	50 %	339328267
11132	NC_015727	GC	4	8	513746	513753	0 %	0 %	50 %	50 %	339328267
11133	NC_015727	TGA	2	6	513811	513816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328267
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11136	NC_015727	CTG	2	6	514007	514012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328268
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11145	NC_015727	CAT	2	6	514454	514459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328268
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11149	NC_015727	GATG	2	8	514787	514794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11150	NC_015727	TGATT	2	10	514797	514806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11151	NC_015727	ATC	2	6	514850	514855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11217	NC_015727	GAT	2	6	518033	518038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11223	NC_015727	GAT	2	6	518486	518491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328272
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11231	NC_015727	GCT	2	6	518752	518757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328273
11232	NC_015727	GCG	2	6	518772	518777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328273
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11239	NC_015727	GCTG	3	12	519003	519014	0 %	25 %	50 %	25 %	339328273
11240	NC_015727	GC	3	6	519022	519027	0 %	0 %	50 %	50 %	339328273
11241	NC_015727	GA	3	6	519088	519093	50 %	0 %	50 %	0 %	339328273
11242	NC_015727	CGGC	2	8	519114	519121	0 %	0 %	50 %	50 %	339328273
11243	NC_015727	GC	3	6	519128	519133	0 %	0 %	50 %	50 %	339328273
11244	NC_015727	GAAG	2	8	519142	519149	50 %	0 %	50 %	0 %	339328273
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11246	NC_015727	CCTG	2	8	519211	519218	0 %	25 %	25 %	50 %	339328273
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11358	NC_015727	CAT	2	6	525125	525130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328279
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11363	NC_015727	GCA	2	6	525367	525372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328279
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11488	NC_015727	GCG	2	6	530160	530165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328281
11489	NC_015727	GCA	2	6	530168	530173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328281
11490	NC_015727	ATC	2	6	530224	530229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328281
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