MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 32101

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015727	AGGC	2	8	23916	23923	25 %	0 %	50 %	25 %	339327803
502	NC_015727	GC	3	6	23982	23987	0 %	0 %	50 %	50 %	339327803
503	NC_015727	CCA	2	6	24017	24022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327803
504	NC_015727	TAGT	2	8	24043	24050	25 %	50 %	25 %	0 %	339327803
505	NC_015727	GC	3	6	24071	24076	0 %	0 %	50 %	50 %	339327803
506	NC_015727	GCA	2	6	24138	24143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327803
507	NC_015727	CAG	2	6	24204	24209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327803
508	NC_015727	GTT	2	6	24234	24239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327803
509	NC_015727	CGC	2	6	24254	24259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327803
510	NC_015727	GCG	2	6	24274	24279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327803
511	NC_015727	CGT	2	6	24296	24301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327803
512	NC_015727	TCGC	2	8	24358	24365	0 %	25 %	25 %	50 %	339327803
513	NC_015727	TGA	2	6	24398	24403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327803
514	NC_015727	ATG	2	6	24472	24477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327803
515	NC_015727	CAGCG	2	10	24548	24557	20 %	0 %	40 %	40 %	339327804
516	NC_015727	CAAGC	2	10	24562	24571	40 %	0 %	20 %	40 %	339327804
517	NC_015727	TGGT	2	8	24602	24609	0 %	50 %	50 %	0 %	339327804
518	NC_015727	GC	3	6	24631	24636	0 %	0 %	50 %	50 %	339327804
519	NC_015727	GTG	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327804
520	NC_015727	GCC	2	6	24682	24687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
521	NC_015727	GC	3	6	24817	24822	0 %	0 %	50 %	50 %	339327804
522	NC_015727	TCA	2	6	24837	24842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327804
523	NC_015727	TGC	2	6	24857	24862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327804
524	NC_015727	GAAC	2	8	24871	24878	50 %	0 %	25 %	25 %	339327804
525	NC_015727	CGC	2	6	24922	24927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
526	NC_015727	ACCC	2	8	25011	25018	25 %	0 %	0 %	75 %	339327804
527	NC_015727	C	6	6	25016	25021	0 %	0 %	0 %	100 %	339327804
528	NC_015727	CGA	2	6	25029	25034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327804
529	NC_015727	CGC	2	6	25161	25166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
530	NC_015727	TCC	2	6	25175	25180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327804
531	NC_015727	GCC	2	6	25261	25266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
532	NC_015727	GCTC	2	8	25323	25330	0 %	25 %	25 %	50 %	339327804
533	NC_015727	AGC	2	6	25338	25343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327804
534	NC_015727	TCGCC	2	10	25347	25356	0 %	20 %	20 %	60 %	339327804
535	NC_015727	GGC	2	6	25420	25425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327804
536	NC_015727	GC	3	6	25488	25493	0 %	0 %	50 %	50 %	339327804
537	NC_015727	GGT	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327804
538	NC_015727	GCC	2	6	25519	25524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
539	NC_015727	GCA	2	6	25536	25541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327804
540	NC_015727	CCG	2	6	25544	25549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327804
541	NC_015727	GGC	2	6	25570	25575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327804
542	NC_015727	A	7	7	25833	25839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015727	G	6	6	25941	25946	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015727	CTT	2	6	26068	26073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327805
545	NC_015727	CGA	2	6	26110	26115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327805
546	NC_015727	CGG	2	6	26118	26123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327805
547	NC_015727	TTC	2	6	26154	26159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327805
548	NC_015727	CTTT	2	8	26164	26171	0 %	75 %	0 %	25 %	339327805
549	NC_015727	GCG	2	6	26216	26221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327805
550	NC_015727	GGC	2	6	26285	26290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327805
551	NC_015727	AC	3	6	26292	26297	50 %	0 %	0 %	50 %	339327805
552	NC_015727	TCG	2	6	26316	26321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327805
553	NC_015727	AGA	2	6	26334	26339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327805
554	NC_015727	TCG	2	6	26355	26360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327805
555	NC_015727	GC	3	6	26410	26415	0 %	0 %	50 %	50 %	339327805
556	NC_015727	CAT	2	6	26416	26421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327805
557	NC_015727	GCC	2	6	26510	26515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327806
558	NC_015727	CG	3	6	26595	26600	0 %	0 %	50 %	50 %	339327806
559	NC_015727	GC	3	6	26601	26606	0 %	0 %	50 %	50 %	339327806
560	NC_015727	CCG	2	6	26749	26754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327806
561	NC_015727	AAGG	2	8	26880	26887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015727	GGC	2	6	26974	26979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327807
563	NC_015727	GC	3	6	26987	26992	0 %	0 %	50 %	50 %	339327807
564	NC_015727	GTG	3	9	26993	27001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327807
565	NC_015727	GCG	2	6	27050	27055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327807
566	NC_015727	GGA	2	6	27056	27061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327807
567	NC_015727	CGAT	2	8	27106	27113	25 %	25 %	25 %	25 %	339327807
568	NC_015727	ATC	2	6	27152	27157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327807
569	NC_015727	CAA	2	6	27160	27165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327807
570	NC_015727	AGA	2	6	27195	27200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327807
571	NC_015727	CGA	2	6	27205	27210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327807
572	NC_015727	TGCG	2	8	27261	27268	0 %	25 %	50 %	25 %	339327807
573	NC_015727	GCAGG	2	10	27310	27319	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
574	NC_015727	TCG	2	6	27347	27352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327807
575	NC_015727	GCAGG	2	10	27374	27383	20 %	0 %	60 %	20 %	339327807
576	NC_015727	ACT	2	6	27387	27392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327807
577	NC_015727	GGC	2	6	27511	27516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327807
578	NC_015727	GTCGGC	2	12	27560	27571	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339327807
579	NC_015727	AAC	2	6	27584	27589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327807
580	NC_015727	GCC	2	6	27590	27595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327807
581	NC_015727	GCC	2	6	27612	27617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327807
582	NC_015727	GCG	2	6	27635	27640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327807
583	NC_015727	GCG	2	6	27702	27707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327807
584	NC_015727	GCAG	2	8	27731	27738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
585	NC_015727	GGAA	2	8	27753	27760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015727	CCTG	2	8	27889	27896	0 %	25 %	25 %	50 %	339327808
587	NC_015727	CGG	2	6	27966	27971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327808
588	NC_015727	TGC	2	6	27987	27992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327808
589	NC_015727	TG	3	6	28069	28074	0 %	50 %	50 %	0 %	339327808
590	NC_015727	CG	3	6	28078	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
591	NC_015727	GGC	2	6	28144	28149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327808
592	NC_015727	ATG	2	6	28155	28160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327808
593	NC_015727	CGGC	2	8	28203	28210	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
594	NC_015727	GCC	2	6	28213	28218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327808
595	NC_015727	GGC	2	6	28253	28258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327808
596	NC_015727	CTG	2	6	28280	28285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327808
597	NC_015727	CGT	2	6	28324	28329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327808
598	NC_015727	GCG	2	6	28334	28339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327808
599	NC_015727	AAG	2	6	28385	28390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327808
600	NC_015727	CG	4	8	28408	28415	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
601	NC_015727	ACA	2	6	28446	28451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327808
602	NC_015727	TGC	2	6	28518	28523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327808
603	NC_015727	CGA	2	6	28540	28545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327808
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606	NC_015727	GC	3	6	28721	28726	0 %	0 %	50 %	50 %	339327808
607	NC_015727	GCCC	2	8	28765	28772	0 %	0 %	25 %	75 %	339327808
608	NC_015727	GCAG	2	8	28831	28838	25 %	0 %	50 %	25 %	339327808
609	NC_015727	GCG	2	6	28844	28849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327808
610	NC_015727	GGCA	2	8	28898	28905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_015727	TGC	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_015727	GCT	2	6	28968	28973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327809
613	NC_015727	GGCG	2	8	28974	28981	0 %	0 %	75 %	25 %	339327809
614	NC_015727	GCG	2	6	29075	29080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327809
615	NC_015727	GCG	2	6	29172	29177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327809
616	NC_015727	GCCG	2	8	29185	29192	0 %	0 %	50 %	50 %	339327809
617	NC_015727	GGC	2	6	29236	29241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327809
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619	NC_015727	CCG	2	6	29439	29444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327809
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621	NC_015727	CG	4	8	29541	29548	0 %	0 %	50 %	50 %	339327809
622	NC_015727	GCG	2	6	29609	29614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327809
623	NC_015727	CAG	2	6	29632	29637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327809
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625	NC_015727	CAGTC	2	10	29711	29720	20 %	20 %	20 %	40 %	339327809
626	NC_015727	CG	3	6	29721	29726	0 %	0 %	50 %	50 %	339327809
627	NC_015727	GGC	2	6	29734	29739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327809
628	NC_015727	AGGA	2	8	29753	29760	50 %	0 %	50 %	0 %	339327809
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759	NC_015727	CG	4	8	35799	35806	0 %	0 %	50 %	50 %	339327816
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