MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015726	GCC	2	6	511176	511181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324660
14002	NC_015726	GCG	2	6	511249	511254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324660
14003	NC_015726	GCT	2	6	511255	511260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324660
14004	NC_015726	GAC	2	6	511305	511310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324660
14005	NC_015726	ACC	2	6	511311	511316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324660
14006	NC_015726	GCT	2	6	511337	511342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324660
14007	NC_015726	GC	3	6	511408	511413	0 %	0 %	50 %	50 %	339324660
14008	NC_015726	ACC	2	6	511443	511448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324660
14009	NC_015726	TCG	2	6	511461	511466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324660
14010	NC_015726	A	7	7	511493	511499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_015726	T	6	6	511516	511521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_015726	GCG	2	6	511544	511549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324661
14013	NC_015726	CTG	2	6	511594	511599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324661
14014	NC_015726	GCG	2	6	511617	511622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324661
14015	NC_015726	CG	3	6	511681	511686	0 %	0 %	50 %	50 %	339324661
14016	NC_015726	CGT	2	6	511821	511826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324661
14017	NC_015726	CCA	2	6	511899	511904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324661
14018	NC_015726	AGT	2	6	511977	511982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324661
14019	NC_015726	ATG	2	6	512075	512080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324661
14020	NC_015726	GCC	2	6	512096	512101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324661
14021	NC_015726	AGT	2	6	512151	512156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324661
14022	NC_015726	GAA	2	6	512161	512166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324661
14023	NC_015726	GCA	2	6	512277	512282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324661
14024	NC_015726	TGT	2	6	512340	512345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_015726	AT	3	6	512394	512399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_015726	CGC	2	6	512463	512468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324662
14027	NC_015726	GCA	2	6	512480	512485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14028	NC_015726	GCG	2	6	512491	512496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324662
14029	NC_015726	GC	3	6	512503	512508	0 %	0 %	50 %	50 %	339324662
14030	NC_015726	GTCT	2	8	512523	512530	0 %	50 %	25 %	25 %	339324662
14031	NC_015726	CT	3	6	512570	512575	0 %	50 %	0 %	50 %	339324662
14032	NC_015726	CGCC	2	8	512609	512616	0 %	0 %	25 %	75 %	339324662
14033	NC_015726	CTG	2	6	512626	512631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14034	NC_015726	GGGC	2	8	512632	512639	0 %	0 %	75 %	25 %	339324662
14035	NC_015726	GGC	2	6	512658	512663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324662
14036	NC_015726	GAC	2	6	512677	512682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14037	NC_015726	CCGG	2	8	512687	512694	0 %	0 %	50 %	50 %	339324662
14038	NC_015726	CTG	2	6	512758	512763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14039	NC_015726	GCT	2	6	512934	512939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14040	NC_015726	CCG	2	6	512942	512947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324662
14041	NC_015726	CG	3	6	513029	513034	0 %	0 %	50 %	50 %	339324662
14042	NC_015726	TGG	2	6	513119	513124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324662
14043	NC_015726	TGGCG	2	10	513135	513144	0 %	20 %	60 %	20 %	339324662
14044	NC_015726	CGGC	2	8	513161	513168	0 %	0 %	50 %	50 %	339324662
14045	NC_015726	ACG	2	6	513179	513184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324662
14046	NC_015726	GCCT	2	8	513196	513203	0 %	25 %	25 %	50 %	339324662
14047	NC_015726	CGC	2	6	513224	513229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324662
14048	NC_015726	GTG	2	6	513235	513240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324662
14049	NC_015726	GC	3	6	513244	513249	0 %	0 %	50 %	50 %	339324662
14050	NC_015726	CGC	2	6	513269	513274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324662
14051	NC_015726	GCGG	2	8	513304	513311	0 %	0 %	75 %	25 %	339324662
14052	NC_015726	CG	3	6	513360	513365	0 %	0 %	50 %	50 %	339324663
14053	NC_015726	CGG	2	6	513369	513374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14054	NC_015726	GCA	2	6	513408	513413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324663
14055	NC_015726	GCCA	2	8	513425	513432	25 %	0 %	25 %	50 %	339324663
14056	NC_015726	GCC	3	9	513547	513555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324663
14057	NC_015726	GGC	2	6	513567	513572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14058	NC_015726	GC	3	6	513571	513576	0 %	0 %	50 %	50 %	339324663
14059	NC_015726	CG	4	8	513600	513607	0 %	0 %	50 %	50 %	339324663
14060	NC_015726	AGCC	2	8	513689	513696	25 %	0 %	25 %	50 %	339324663
14061	NC_015726	GCG	2	6	513729	513734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14062	NC_015726	CAG	2	6	513769	513774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324663
14063	NC_015726	GCG	2	6	513776	513781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14064	NC_015726	GGC	2	6	513837	513842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14065	NC_015726	AGT	2	6	513849	513854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324663
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14068	NC_015726	CGC	2	6	513904	513909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324663
14069	NC_015726	GCG	2	6	514005	514010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14070	NC_015726	GCC	2	6	514018	514023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324663
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14072	NC_015726	CCA	2	6	514053	514058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324663
14073	NC_015726	CCGG	2	8	514134	514141	0 %	0 %	50 %	50 %	339324663
14074	NC_015726	CAG	2	6	514207	514212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324663
14075	NC_015726	TGC	2	6	514292	514297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324663
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14077	NC_015726	GCTG	2	8	514335	514342	0 %	25 %	50 %	25 %	339324663
14078	NC_015726	GCC	2	6	514346	514351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324663
14079	NC_015726	CGG	2	6	514356	514361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324663
14080	NC_015726	CG	3	6	514364	514369	0 %	0 %	50 %	50 %	339324663
14081	NC_015726	CCA	2	6	514380	514385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324663
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14083	NC_015726	GCGCA	2	10	514506	514515	20 %	0 %	40 %	40 %	339324664
14084	NC_015726	AGC	2	6	514528	514533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324664
14085	NC_015726	CGT	2	6	514622	514627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324664
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14087	NC_015726	CTG	2	6	514809	514814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324664
14088	NC_015726	GCG	2	6	514870	514875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324664
14089	NC_015726	TGC	2	6	514891	514896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324664
14090	NC_015726	ATG	2	6	514905	514910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324664
14091	NC_015726	GCC	2	6	514926	514931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324664
14092	NC_015726	CGA	2	6	514938	514943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324664
14093	NC_015726	CG	3	6	514946	514951	0 %	0 %	50 %	50 %	339324664
14094	NC_015726	TGC	2	6	514988	514993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324664
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14104	NC_015726	CGT	2	6	515306	515311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324664
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14107	NC_015726	CG	3	6	515364	515369	0 %	0 %	50 %	50 %	339324664
14108	NC_015726	CG	3	6	515390	515395	0 %	0 %	50 %	50 %	339324664
14109	NC_015726	GGC	2	6	515397	515402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324664
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14120	NC_015726	ACC	2	6	515824	515829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324664
14121	NC_015726	CG	3	6	515836	515841	0 %	0 %	50 %	50 %	339324664
14122	NC_015726	CAC	2	6	515894	515899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14123	NC_015726	TCC	2	6	515928	515933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14124	NC_015726	GCG	2	6	515942	515947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_015726	GCC	2	6	515969	515974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14126	NC_015726	TGC	2	6	515980	515985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_015726	GGC	2	6	516061	516066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_015726	CGA	2	6	516199	516204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324665
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14134	NC_015726	CG	3	6	516444	516449	0 %	0 %	50 %	50 %	339324665
14135	NC_015726	CTA	2	6	516475	516480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324665
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14153	NC_015726	TGA	2	6	516984	516989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324665
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14229	NC_015726	GC	3	6	520017	520022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14230	NC_015726	GCGCC	2	10	520061	520070	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14231	NC_015726	GCC	2	6	520099	520104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14232	NC_015726	GCG	2	6	520147	520152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14233	NC_015726	GCT	2	6	520255	520260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324670
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14237	NC_015726	ATG	3	9	520383	520391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324670
14238	NC_015726	CGG	2	6	520411	520416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324670
14239	NC_015726	CCGA	2	8	520422	520429	25 %	0 %	25 %	50 %	339324670
14240	NC_015726	CGT	2	6	520436	520441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324670
14241	NC_015726	GTA	2	6	520445	520450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324670
14242	NC_015726	CGC	2	6	520495	520500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324670
14243	NC_015726	ACC	2	6	520503	520508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324670
14244	NC_015726	GGCC	2	8	520510	520517	0 %	0 %	50 %	50 %	339324670
14245	NC_015726	CG	3	6	520525	520530	0 %	0 %	50 %	50 %	339324670
14246	NC_015726	TGG	2	6	520582	520587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324670
14247	NC_015726	CTT	2	6	520634	520639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324670
14248	NC_015726	TGC	2	6	520675	520680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324670
14249	NC_015726	CGA	2	6	520702	520707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324670
14250	NC_015726	CGA	2	6	520743	520748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324670
14251	NC_015726	CCT	2	6	520760	520765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14252	NC_015726	GGCTGC	2	12	520804	520815	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324671
14253	NC_015726	CG	3	6	520935	520940	0 %	0 %	50 %	50 %	339324671
14254	NC_015726	GTG	3	9	521000	521008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324671
14255	NC_015726	ATG	2	6	521018	521023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324671
14256	NC_015726	GCC	2	6	521032	521037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324671
14257	NC_015726	CGG	2	6	521040	521045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14258	NC_015726	CG	3	6	521046	521051	0 %	0 %	50 %	50 %	339324671
14259	NC_015726	GCG	2	6	521108	521113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14260	NC_015726	GCG	2	6	521120	521125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14261	NC_015726	TCG	2	6	521180	521185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324671
14262	NC_015726	CG	3	6	521211	521216	0 %	0 %	50 %	50 %	339324671
14263	NC_015726	CGA	2	6	521256	521261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324671
14264	NC_015726	TGA	2	6	521271	521276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324671
14265	NC_015726	CTT	2	6	521280	521285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324671
14266	NC_015726	CCGGCG	2	12	521298	521309	0 %	0 %	50 %	50 %	339324671
14267	NC_015726	CGG	2	6	521331	521336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14268	NC_015726	GGC	2	6	521347	521352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14269	NC_015726	GCG	2	6	521360	521365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324671
14270	NC_015726	GTGCC	2	10	521418	521427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14271	NC_015726	GCA	2	6	521446	521451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14272	NC_015726	A	6	6	521512	521517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14273	NC_015726	TGC	2	6	521549	521554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14274	NC_015726	TGC	2	6	521578	521583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14275	NC_015726	GC	3	6	521590	521595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14276	NC_015726	CGC	2	6	521624	521629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324672
14277	NC_015726	GGC	2	6	521664	521669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324672
14278	NC_015726	CG	3	6	521687	521692	0 %	0 %	50 %	50 %	339324672
14279	NC_015726	CTC	2	6	521757	521762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324672
14280	NC_015726	GCC	3	9	521799	521807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324672
14281	NC_015726	AGC	2	6	521815	521820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324672
14282	NC_015726	AGC	2	6	521830	521835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324672
14283	NC_015726	GCA	2	6	521954	521959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324672
14284	NC_015726	CG	5	10	521984	521993	0 %	0 %	50 %	50 %	339324672
14285	NC_015726	GC	3	6	522008	522013	0 %	0 %	50 %	50 %	339324672
14286	NC_015726	GCA	2	6	522035	522040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324672
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14300	NC_015726	CAG	2	6	522552	522557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324672
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14306	NC_015726	GGC	2	6	522630	522635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324672
14307	NC_015726	ATG	2	6	522655	522660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324672
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14309	NC_015726	GCC	2	6	522687	522692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14310	NC_015726	CCG	2	6	522771	522776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324673
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14312	NC_015726	GGC	2	6	522796	522801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324673
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14315	NC_015726	CAG	3	9	522919	522927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324673
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14319	NC_015726	CAG	2	6	523117	523122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324673
14320	NC_015726	CAG	2	6	523153	523158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324673
14321	NC_015726	CAG	2	6	523243	523248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324673
14322	NC_015726	TTC	2	6	523259	523264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324673
14323	NC_015726	GGA	2	6	523302	523307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14324	NC_015726	GAG	2	6	523332	523337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14325	NC_015726	GCC	2	6	523361	523366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14326	NC_015726	GC	3	6	523378	523383	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
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14331	NC_015726	CGT	2	6	523497	523502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324674
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14336	NC_015726	GC	3	6	523617	523622	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
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14343	NC_015726	GC	4	8	523893	523900	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
14344	NC_015726	TCG	2	6	524030	524035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324674
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14346	NC_015726	CG	4	8	524102	524109	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
14347	NC_015726	TGCGCT	2	12	524184	524195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324674
14348	NC_015726	TGG	2	6	524223	524228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324674
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14350	NC_015726	GGC	2	6	524332	524337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324674
14351	NC_015726	GC	3	6	524358	524363	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
14352	NC_015726	GGC	3	9	524407	524415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324674
14353	NC_015726	CGG	2	6	524433	524438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324674
14354	NC_015726	GCGCG	2	10	524473	524482	0 %	0 %	60 %	40 %	339324674
14355	NC_015726	GGCT	2	8	524562	524569	0 %	25 %	50 %	25 %	339324674
14356	NC_015726	GC	3	6	524570	524575	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
14357	NC_015726	GC	3	6	524583	524588	0 %	0 %	50 %	50 %	339324674
14358	NC_015726	GCC	2	6	524703	524708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324675
14359	NC_015726	CGC	2	6	524711	524716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324675
14360	NC_015726	TGGCA	2	10	524784	524793	20 %	20 %	40 %	20 %	339324675
14361	NC_015726	GCA	2	6	524841	524846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324675
14362	NC_015726	CAG	2	6	524848	524853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324675
14363	NC_015726	TTG	2	6	524882	524887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324675
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14365	NC_015726	CCA	2	6	524958	524963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324675
14366	NC_015726	GCCGC	2	10	524975	524984	0 %	0 %	40 %	60 %	339324675
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14368	NC_015726	GTTGAC	2	12	525016	525027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339324675
14369	NC_015726	CGC	2	6	525043	525048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324675
14370	NC_015726	CGT	2	6	525087	525092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324675
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14373	NC_015726	CGG	2	6	525348	525353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14382	NC_015726	GTC	2	6	525729	525734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324676
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14464	NC_015726	CTG	2	6	528408	528413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14465	NC_015726	CGC	2	6	528523	528528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14469	NC_015726	GCAG	2	8	528614	528621	25 %	0 %	50 %	25 %	339324679
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14471	NC_015726	CG	3	6	528683	528688	0 %	0 %	50 %	50 %	339324679
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14477	NC_015726	CCG	2	6	528869	528874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324679
14478	NC_015726	GGCCC	2	10	528972	528981	0 %	0 %	40 %	60 %	339324679
14479	NC_015726	CCG	2	6	528986	528991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324679
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14482	NC_015726	GCA	2	6	529041	529046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324679
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