MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12118	NC_015726	GGCG	3	12	443492	443503	0 %	0 %	75 %	25 %	339324597
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12120	NC_015726	TGC	2	6	443635	443640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12122	NC_015726	CTT	2	6	443668	443673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12124	NC_015726	TCG	2	6	443725	443730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324598
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12228	NC_015726	GCG	2	6	447495	447500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324601
12229	NC_015726	A	7	7	447502	447508	100 %	0 %	0 %	0 %	339324601
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12232	NC_015726	CGC	2	6	447580	447585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324601
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12235	NC_015726	GCG	2	6	447653	447658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324601
12236	NC_015726	CGGGG	2	10	447704	447713	0 %	0 %	80 %	20 %	339324601
12237	NC_015726	ACG	2	6	447760	447765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12238	NC_015726	GC	3	6	447931	447936	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12239	NC_015726	GCCG	2	8	447998	448005	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12240	NC_015726	CGG	2	6	448037	448042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324602
12241	NC_015726	GC	3	6	448106	448111	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12242	NC_015726	TGC	2	6	448213	448218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324602
12243	NC_015726	TGG	2	6	448255	448260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324602
12244	NC_015726	GCCG	2	8	448271	448278	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12245	NC_015726	CGC	2	6	448301	448306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324602
12246	NC_015726	CGA	2	6	448355	448360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324602
12247	NC_015726	CGA	2	6	448367	448372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324602
12248	NC_015726	GCC	2	6	448383	448388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324602
12249	NC_015726	TGG	2	6	448417	448422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324602
12250	NC_015726	CAGCGT	2	12	448442	448453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324602
12251	NC_015726	GCCG	2	8	448460	448467	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12252	NC_015726	GCTG	2	8	448477	448484	0 %	25 %	50 %	25 %	339324602
12253	NC_015726	CG	3	6	448497	448502	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12254	NC_015726	CGG	2	6	448514	448519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324602
12255	NC_015726	CG	3	6	448525	448530	0 %	0 %	50 %	50 %	339324602
12256	NC_015726	GGCCC	2	10	448554	448563	0 %	0 %	40 %	60 %	339324602
12257	NC_015726	GAGG	2	8	448582	448589	25 %	0 %	75 %	0 %	339324602
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12260	NC_015726	CGG	2	6	448665	448670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324603
12261	NC_015726	GTCGCT	2	12	448689	448700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12262	NC_015726	TGG	2	6	448733	448738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324603
12263	NC_015726	CG	4	8	448744	448751	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12264	NC_015726	TGCC	2	8	448765	448772	0 %	25 %	25 %	50 %	339324603
12265	NC_015726	CGAG	2	8	448814	448821	25 %	0 %	50 %	25 %	339324603
12266	NC_015726	TCGA	2	8	448837	448844	25 %	25 %	25 %	25 %	339324603
12267	NC_015726	GTC	2	6	448860	448865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12268	NC_015726	TGC	2	6	448895	448900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12269	NC_015726	CTT	2	6	448959	448964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324603
12270	NC_015726	GCGCG	2	10	449019	449028	0 %	0 %	60 %	40 %	339324603
12271	NC_015726	CG	3	6	449030	449035	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12272	NC_015726	GTG	3	9	449041	449049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324603
12273	NC_015726	CG	3	6	449090	449095	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12274	NC_015726	GCA	2	6	449096	449101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324603
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12277	NC_015726	CG	3	6	449195	449200	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12278	NC_015726	GAA	2	6	449248	449253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324603
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12280	NC_015726	ACC	2	6	449278	449283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324603
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12282	NC_015726	CG	3	6	449347	449352	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12283	NC_015726	TCG	2	6	449396	449401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12284	NC_015726	ACC	2	6	449410	449415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324603
12285	NC_015726	CTG	2	6	449463	449468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12286	NC_015726	CTT	2	6	449481	449486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324603
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12288	NC_015726	CG	3	6	449494	449499	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12289	NC_015726	GGA	2	6	449529	449534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324603
12290	NC_015726	GCTG	2	8	449543	449550	0 %	25 %	50 %	25 %	339324603
12291	NC_015726	GTG	2	6	449557	449562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324603
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12295	NC_015726	GCT	2	6	449763	449768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
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12299	NC_015726	CGT	2	6	449888	449893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12300	NC_015726	TGA	2	6	449900	449905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324603
12301	NC_015726	GCC	2	6	449911	449916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324603
12302	NC_015726	AGCTGC	2	12	449945	449956	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324603
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12304	NC_015726	CGG	2	6	450057	450062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324603
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12306	NC_015726	CG	3	6	450116	450121	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12307	NC_015726	CGA	2	6	450201	450206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324603
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12309	NC_015726	CGGC	2	8	450273	450280	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12310	NC_015726	GAA	2	6	450283	450288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324603
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12312	NC_015726	CG	3	6	450318	450323	0 %	0 %	50 %	50 %	339324603
12313	NC_015726	GCT	2	6	450336	450341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324603
12314	NC_015726	AAC	2	6	450506	450511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12315	NC_015726	GGC	2	6	450564	450569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324604
12316	NC_015726	GGC	2	6	450571	450576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324604
12317	NC_015726	GGC	2	6	450613	450618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324604
12318	NC_015726	GGC	2	6	450661	450666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324604
12319	NC_015726	ACCTGC	2	12	450683	450694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339324604
12320	NC_015726	ACG	2	6	450746	450751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12321	NC_015726	CTA	2	6	450753	450758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324604
12322	NC_015726	CG	3	6	450867	450872	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12323	NC_015726	GCT	2	6	450885	450890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12324	NC_015726	CGA	2	6	450897	450902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12325	NC_015726	CAT	2	6	450903	450908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324604
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12328	NC_015726	AGA	2	6	450971	450976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324604
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12330	NC_015726	TGCCGC	2	12	450995	451006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324604
12331	NC_015726	CGC	3	9	451004	451012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12332	NC_015726	GCC	2	6	451021	451026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12333	NC_015726	GCA	2	6	451032	451037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12334	NC_015726	GC	3	6	451050	451055	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12335	NC_015726	TCGACG	2	12	451211	451222	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12336	NC_015726	CGCGG	2	10	451240	451249	0 %	0 %	60 %	40 %	339324604
12337	NC_015726	GAT	2	6	451269	451274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324604
12338	NC_015726	GC	3	6	451277	451282	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12339	NC_015726	CG	3	6	451287	451292	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12340	NC_015726	CCG	2	6	451293	451298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12341	NC_015726	GCT	3	9	451299	451307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12342	NC_015726	GCT	2	6	451368	451373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12343	NC_015726	AGC	2	6	451475	451480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12344	NC_015726	GCG	2	6	451484	451489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324604
12345	NC_015726	CTGGA	2	10	451513	451522	20 %	20 %	40 %	20 %	339324604
12346	NC_015726	CAC	2	6	451545	451550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324604
12347	NC_015726	CG	3	6	451551	451556	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12348	NC_015726	CGC	2	6	451604	451609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12349	NC_015726	TGG	2	6	451628	451633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324604
12350	NC_015726	CGC	2	6	451647	451652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12351	NC_015726	GGA	2	6	451662	451667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324604
12352	NC_015726	GTGCTG	2	12	451675	451686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339324604
12353	NC_015726	GCC	2	6	451702	451707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324604
12354	NC_015726	AGC	2	6	451709	451714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12355	NC_015726	GCT	2	6	451725	451730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12356	NC_015726	CG	3	6	451748	451753	0 %	0 %	50 %	50 %	339324604
12357	NC_015726	CAG	2	6	451771	451776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12358	NC_015726	CAG	2	6	451804	451809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324604
12359	NC_015726	CTG	2	6	451822	451827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324604
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