MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015726	TGG	2	6	402259	402264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11002	NC_015726	GTG	2	6	402291	402296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11003	NC_015726	TCT	2	6	402310	402315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324561
11004	NC_015726	TGA	2	6	402331	402336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324561
11005	NC_015726	GTG	2	6	402351	402356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11006	NC_015726	GCG	2	6	402357	402362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324561
11007	NC_015726	CTG	3	9	402393	402401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11008	NC_015726	GGC	2	6	402416	402421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324561
11009	NC_015726	CCA	2	6	402500	402505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324561
11010	NC_015726	TGC	2	6	402538	402543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11011	NC_015726	TTC	2	6	402552	402557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324561
11012	NC_015726	TGC	2	6	402571	402576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11013	NC_015726	GCT	2	6	402620	402625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11014	NC_015726	GGT	2	6	402626	402631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11015	NC_015726	GCT	2	6	402662	402667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11016	NC_015726	TGC	2	6	402748	402753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11017	NC_015726	TGC	2	6	402817	402822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11018	NC_015726	TGC	2	6	402871	402876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11019	NC_015726	CGC	2	6	402926	402931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324561
11020	NC_015726	CAT	2	6	402959	402964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324561
11021	NC_015726	CTGGAC	2	12	403035	403046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11022	NC_015726	GCC	2	6	403065	403070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324561
11023	NC_015726	CGGC	2	8	403072	403079	0 %	0 %	50 %	50 %	339324561
11024	NC_015726	GCCG	2	8	403101	403108	0 %	0 %	50 %	50 %	339324561
11025	NC_015726	CGC	2	6	403124	403129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324561
11026	NC_015726	CGC	3	9	403142	403150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324561
11027	NC_015726	TGC	2	6	403192	403197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11028	NC_015726	GTG	2	6	403293	403298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11029	NC_015726	ATC	2	6	403305	403310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324561
11030	NC_015726	TGC	2	6	403345	403350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11031	NC_015726	GTG	2	6	403371	403376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324561
11032	NC_015726	GCA	2	6	403385	403390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11033	NC_015726	GC	3	6	403392	403397	0 %	0 %	50 %	50 %	339324561
11034	NC_015726	CG	3	6	403400	403405	0 %	0 %	50 %	50 %	339324561
11035	NC_015726	CTG	2	6	403413	403418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11036	NC_015726	CGA	2	6	403439	403444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11037	NC_015726	TGA	2	6	403445	403450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324561
11038	NC_015726	CGG	2	6	403510	403515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324561
11039	NC_015726	GCG	2	6	403520	403525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324561
11040	NC_015726	TGC	2	6	403642	403647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324561
11041	NC_015726	GCCC	2	8	403651	403658	0 %	0 %	25 %	75 %	339324561
11042	NC_015726	GCC	2	6	403706	403711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_015726	GCGT	2	8	403770	403777	0 %	25 %	50 %	25 %	339324562
11044	NC_015726	AGCG	2	8	403780	403787	25 %	0 %	50 %	25 %	339324562
11045	NC_015726	GCA	2	6	403829	403834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324562
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11047	NC_015726	CA	3	6	403852	403857	50 %	0 %	0 %	50 %	339324562
11048	NC_015726	AGGA	2	8	403861	403868	50 %	0 %	50 %	0 %	339324562
11049	NC_015726	GTC	2	6	403953	403958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324562
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11051	NC_015726	TGG	2	6	404012	404017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324562
11052	NC_015726	AGCG	2	8	404035	404042	25 %	0 %	50 %	25 %	339324562
11053	NC_015726	ACG	2	6	404057	404062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324562
11054	NC_015726	CA	3	6	404087	404092	50 %	0 %	0 %	50 %	339324562
11055	NC_015726	GCGG	2	8	404106	404113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_015726	CGGC	2	8	404116	404123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11057	NC_015726	CGC	2	6	404140	404145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_015726	G	6	6	404147	404152	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_015726	GCCA	2	8	404236	404243	25 %	0 %	25 %	50 %	339324563
11060	NC_015726	GCC	2	6	404325	404330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324563
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11063	NC_015726	CG	4	8	404477	404484	0 %	0 %	50 %	50 %	339324563
11064	NC_015726	GCC	2	6	404511	404516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324563
11065	NC_015726	CGT	2	6	404531	404536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324563
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11068	NC_015726	GGC	2	6	404670	404675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324563
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11072	NC_015726	GCC	2	6	404871	404876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_015726	GGT	2	6	404888	404893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_015726	CGG	2	6	404909	404914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_015726	GC	3	6	404954	404959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_015726	GC	3	6	404966	404971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11081	NC_015726	TCG	2	6	405229	405234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324564
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11088	NC_015726	GCT	2	6	405431	405436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324564
11089	NC_015726	GGT	2	6	405455	405460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324564
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11091	NC_015726	TCG	2	6	405475	405480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324564
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11093	NC_015726	GCT	2	6	405506	405511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324564
11094	NC_015726	CGG	2	6	405518	405523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324564
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11099	NC_015726	TGG	2	6	405719	405724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324565
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11105	NC_015726	GGGC	2	8	405882	405889	0 %	0 %	75 %	25 %	339324565
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11118	NC_015726	CGC	2	6	406330	406335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11119	NC_015726	GGCG	2	8	406361	406368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11120	NC_015726	CA	3	6	406434	406439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_015726	AGC	2	6	406627	406632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324566
11122	NC_015726	CGG	2	6	406640	406645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324566
11123	NC_015726	TCG	2	6	406661	406666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324566
11124	NC_015726	CAT	2	6	406701	406706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324566
11125	NC_015726	CGC	2	6	406772	406777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324566
11126	NC_015726	ACCTG	2	10	406805	406814	20 %	20 %	20 %	40 %	339324566
11127	NC_015726	GCA	2	6	406820	406825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324566
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11129	NC_015726	CCCGT	2	10	406901	406910	0 %	20 %	20 %	60 %	339324566
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11154	NC_015726	TGC	2	6	407465	407470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324566
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11165	NC_015726	CG	3	6	407913	407918	0 %	0 %	50 %	50 %	339324566
11166	NC_015726	CACC	2	8	407919	407926	25 %	0 %	0 %	75 %	339324566
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11172	NC_015726	GCA	2	6	408162	408167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324567
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11231	NC_015726	GCG	2	6	410637	410642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324568
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11234	NC_015726	GTT	2	6	410760	410765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324568
11235	NC_015726	GGCA	2	8	410816	410823	25 %	0 %	50 %	25 %	339324568
11236	NC_015726	GC	4	8	410873	410880	0 %	0 %	50 %	50 %	339324568
11237	NC_015726	GCT	2	6	410924	410929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324568
11238	NC_015726	GC	3	6	410938	410943	0 %	0 %	50 %	50 %	339324568
11239	NC_015726	CCA	3	9	410957	410965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324568
11240	NC_015726	GGCCTC	2	12	411027	411038	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324568
11241	NC_015726	GCG	2	6	411043	411048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324568
11242	NC_015726	CCG	2	6	411049	411054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324568
11243	NC_015726	CCA	2	6	411134	411139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324568
11244	NC_015726	ATC	2	6	411151	411156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324568
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11253	NC_015726	GCCCGA	2	12	411492	411503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324568
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11258	NC_015726	GC	3	6	411723	411728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11259	NC_015726	GCC	3	9	411853	411861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11260	NC_015726	GGC	2	6	411876	411881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11262	NC_015726	CAGC	2	8	411929	411936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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11349	NC_015726	TGCTT	2	10	415087	415096	0 %	60 %	20 %	20 %	339324571
11350	NC_015726	GAC	2	6	415126	415131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324571
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11353	NC_015726	AGA	2	6	415217	415222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324571
11354	NC_015726	GGT	2	6	415241	415246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324571
11355	NC_015726	AC	3	6	415274	415279	50 %	0 %	0 %	50 %	339324571
11356	NC_015726	CCT	2	6	415314	415319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324571
11357	NC_015726	TGA	2	6	415354	415359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324571
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11359	NC_015726	GAA	2	6	415380	415385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324572
11360	NC_015726	GCT	2	6	415467	415472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324572
11361	NC_015726	AAG	2	6	415731	415736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324572
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11363	NC_015726	AGC	2	6	415886	415891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324572
11364	NC_015726	GTC	2	6	415917	415922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324572
11365	NC_015726	CTG	2	6	415938	415943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324572
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11480	NC_015726	CGC	2	6	421715	421720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324576
11481	NC_015726	TACG	2	8	421722	421729	25 %	25 %	25 %	25 %	339324576
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11483	NC_015726	GC	4	8	421788	421795	0 %	0 %	50 %	50 %	339324577
11484	NC_015726	GC	3	6	421864	421869	0 %	0 %	50 %	50 %	339324577
11485	NC_015726	GCT	2	6	421939	421944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324577
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