MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015726	CGC	2	6	365619	365624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324526
10003	NC_015726	TGG	2	6	365660	365665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324526
10004	NC_015726	TC	3	6	365693	365698	0 %	50 %	0 %	50 %	339324526
10005	NC_015726	GCCG	2	8	365835	365842	0 %	0 %	50 %	50 %	339324526
10006	NC_015726	TGG	2	6	365849	365854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324526
10007	NC_015726	CG	3	6	365900	365905	0 %	0 %	50 %	50 %	339324526
10008	NC_015726	TGC	2	6	365909	365914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324526
10009	NC_015726	GCG	2	6	365918	365923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324526
10010	NC_015726	CGAC	2	8	365927	365934	25 %	0 %	25 %	50 %	339324526
10011	NC_015726	CAG	2	6	365967	365972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324526
10012	NC_015726	GCC	2	6	365992	365997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324526
10013	NC_015726	GGA	2	6	366006	366011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324526
10014	NC_015726	GGCT	2	8	366088	366095	0 %	25 %	50 %	25 %	339324527
10015	NC_015726	GCGCC	2	10	366184	366193	0 %	0 %	40 %	60 %	339324527
10016	NC_015726	GGC	2	6	366243	366248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324527
10017	NC_015726	CTG	2	6	366296	366301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324527
10018	NC_015726	GCG	2	6	366335	366340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324527
10019	NC_015726	CCA	2	6	366349	366354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324527
10020	NC_015726	CAG	2	6	366377	366382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324527
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10022	NC_015726	GGGT	2	8	366435	366442	0 %	25 %	75 %	0 %	339324527
10023	NC_015726	GCA	2	6	366493	366498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324527
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10029	NC_015726	CG	3	6	366748	366753	0 %	0 %	50 %	50 %	339324527
10030	NC_015726	CAG	3	9	366755	366763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324527
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10033	NC_015726	GC	4	8	366794	366801	0 %	0 %	50 %	50 %	339324527
10034	NC_015726	CAC	3	9	366818	366826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324527
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10038	NC_015726	CGC	2	6	367027	367032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324527
10039	NC_015726	GCA	2	6	367056	367061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324527
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10041	NC_015726	GGC	2	6	367088	367093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_015726	GCC	2	6	367134	367139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10043	NC_015726	CCG	2	6	367147	367152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_015726	CCT	2	6	367170	367175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_015726	GCT	2	6	367212	367217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324528
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10047	NC_015726	GGCCG	2	10	367336	367345	0 %	0 %	60 %	40 %	339324528
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10053	NC_015726	GC	3	6	367426	367431	0 %	0 %	50 %	50 %	339324528
10054	NC_015726	GC	3	6	367463	367468	0 %	0 %	50 %	50 %	339324528
10055	NC_015726	GC	3	6	367482	367487	0 %	0 %	50 %	50 %	339324528
10056	NC_015726	CAG	2	6	367504	367509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324528
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10058	NC_015726	GCT	2	6	367551	367556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324528
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10069	NC_015726	GGT	2	6	367801	367806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324528
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10086	NC_015726	CGC	2	6	368557	368562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324529
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10088	NC_015726	GCG	2	6	368670	368675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324529
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10092	NC_015726	CGGCG	2	10	368764	368773	0 %	0 %	60 %	40 %	339324529
10093	NC_015726	GCG	2	6	368807	368812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324529
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10108	NC_015726	CGG	2	6	369513	369518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324530
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10112	NC_015726	GCCA	2	8	369668	369675	25 %	0 %	25 %	50 %	339324530
10113	NC_015726	GTA	2	6	369676	369681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324530
10114	NC_015726	TCA	3	9	369744	369752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324530
10115	NC_015726	GAC	2	6	369800	369805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324530
10116	NC_015726	TGGCC	2	10	369813	369822	0 %	20 %	40 %	40 %	339324530
10117	NC_015726	GGTTCA	2	12	369828	369839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339324530
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10120	NC_015726	GGC	2	6	370018	370023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324530
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10133	NC_015726	GCC	2	6	370403	370408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10134	NC_015726	TGCAG	2	10	370450	370459	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10224	NC_015726	GCC	2	6	373640	373645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324534
10225	NC_015726	CAG	2	6	373702	373707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324534
10226	NC_015726	CAG	2	6	373741	373746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324534
10227	NC_015726	TTC	2	6	373759	373764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324534
10228	NC_015726	TCG	2	6	373775	373780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324534
10229	NC_015726	CGA	2	6	373791	373796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324534
10230	NC_015726	CCAGC	2	10	373852	373861	20 %	0 %	20 %	60 %	339324534
10231	NC_015726	GGGC	2	8	373878	373885	0 %	0 %	75 %	25 %	339324534
10232	NC_015726	CCGGTG	2	12	373983	373994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324534
10233	NC_015726	CTT	2	6	374107	374112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324534
10234	NC_015726	GGC	2	6	374162	374167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_015726	CAG	2	6	374177	374182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_015726	CGGC	2	8	374249	374256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10237	NC_015726	GC	3	6	374290	374295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10238	NC_015726	CGCGC	2	10	374450	374459	0 %	0 %	40 %	60 %	339324535
10239	NC_015726	GCG	2	6	374467	374472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324535
10240	NC_015726	GCT	3	9	374485	374493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324535
10241	NC_015726	TGC	2	6	374499	374504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324535
10242	NC_015726	CGG	2	6	374517	374522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324535
10243	NC_015726	ACC	2	6	374643	374648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324535
10244	NC_015726	GC	3	6	374649	374654	0 %	0 %	50 %	50 %	339324535
10245	NC_015726	GGC	2	6	374687	374692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324535
10246	NC_015726	CAC	2	6	374710	374715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324535
10247	NC_015726	ATG	2	6	374741	374746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324535
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10249	NC_015726	TAC	2	6	374846	374851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324535
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10252	NC_015726	TCA	3	9	374916	374924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324535
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10257	NC_015726	CG	4	8	374992	374999	0 %	0 %	50 %	50 %	339324535
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10261	NC_015726	CAA	2	6	375136	375141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324535
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10270	NC_015726	GC	3	6	375556	375561	0 %	0 %	50 %	50 %	339324535
10271	NC_015726	GC	3	6	375565	375570	0 %	0 %	50 %	50 %	339324535
10272	NC_015726	AAGG	2	8	375590	375597	50 %	0 %	50 %	0 %	339324535
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10348	NC_015726	GGC	2	6	378272	378277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10349	NC_015726	CGGC	2	8	378281	378288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10350	NC_015726	AGG	2	6	378302	378307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10351	NC_015726	CCG	2	6	378374	378379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324538
10352	NC_015726	CGA	2	6	378395	378400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324538
10353	NC_015726	TGG	3	9	378403	378411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324538
10354	NC_015726	CAA	2	6	378428	378433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324538
10355	NC_015726	CAA	3	9	378545	378553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324538
10356	NC_015726	GC	3	6	378555	378560	0 %	0 %	50 %	50 %	339324538
10357	NC_015726	CGTG	2	8	378566	378573	0 %	25 %	50 %	25 %	339324538
10358	NC_015726	GC	3	6	378578	378583	0 %	0 %	50 %	50 %	339324538
10359	NC_015726	GGCA	2	8	378614	378621	25 %	0 %	50 %	25 %	339324538
10360	NC_015726	CTG	2	6	378633	378638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324538
10361	NC_015726	ACCAGT	2	12	378673	378684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339324538
10362	NC_015726	GCG	2	6	378724	378729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324538
10363	NC_015726	GCTG	2	8	378763	378770	0 %	25 %	50 %	25 %	339324538
10364	NC_015726	CGGGCG	2	12	378833	378844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10365	NC_015726	AGGA	2	8	378852	378859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_015726	TGA	2	6	378873	378878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324539
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10369	NC_015726	CAA	2	6	378970	378975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324539
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10371	NC_015726	CGA	2	6	379000	379005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324539
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10375	NC_015726	A	7	7	379146	379152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10376	NC_015726	CTG	2	6	379199	379204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10377	NC_015726	CTA	2	6	379205	379210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10379	NC_015726	CAC	2	6	379261	379266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324540
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10384	NC_015726	GTA	2	6	379429	379434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324540
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10463	NC_015726	A	8	8	381955	381962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10464	NC_015726	CCG	2	6	381963	381968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10465	NC_015726	AAG	2	6	381970	381975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10466	NC_015726	CGG	2	6	381976	381981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10468	NC_015726	CGGC	2	8	381995	382002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10469	NC_015726	GCT	2	6	382014	382019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10470	NC_015726	GTC	2	6	382118	382123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324542
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10472	NC_015726	CAGG	2	8	382222	382229	25 %	0 %	50 %	25 %	339324542
10473	NC_015726	CGGC	2	8	382231	382238	0 %	0 %	50 %	50 %	339324542
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10475	NC_015726	GC	3	6	382419	382424	0 %	0 %	50 %	50 %	339324542
10476	NC_015726	TTCCAG	2	12	382454	382465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339324542
10477	NC_015726	CGA	2	6	382469	382474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324542
10478	NC_015726	CTTC	2	8	382483	382490	0 %	50 %	0 %	50 %	339324542
10479	NC_015726	ATC	2	6	382527	382532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324542
10480	NC_015726	TTCGG	2	10	382533	382542	0 %	40 %	40 %	20 %	339324542
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10482	NC_015726	GAT	2	6	382556	382561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324542
10483	NC_015726	GGC	3	9	382588	382596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324542
10484	NC_015726	TACGC	2	10	382613	382622	20 %	20 %	20 %	40 %	339324542
10485	NC_015726	ATG	2	6	382641	382646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324542
10486	NC_015726	AAG	2	6	382658	382663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10487	NC_015726	GCG	2	6	382690	382695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10488	NC_015726	ATG	2	6	382706	382711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10495	NC_015726	GC	3	6	383002	383007	0 %	0 %	50 %	50 %	339324543
10496	NC_015726	GGC	2	6	383027	383032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324543
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