MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_015726	ACGC	2	8	329882	329889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9002	NC_015726	CGG	2	6	329935	329940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324485
9003	NC_015726	CGG	2	6	329974	329979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324485
9004	NC_015726	ACCCGG	2	12	330060	330071	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324485
9005	NC_015726	GCC	2	6	330104	330109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9006	NC_015726	GTT	2	6	330115	330120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324485
9007	NC_015726	CAC	2	6	330142	330147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324485
9008	NC_015726	GCC	2	6	330167	330172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9009	NC_015726	GCT	2	6	330187	330192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9010	NC_015726	CAA	2	6	330212	330217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324485
9011	NC_015726	CGC	2	6	330232	330237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9012	NC_015726	CGC	2	6	330250	330255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9013	NC_015726	GCA	2	6	330283	330288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9014	NC_015726	TGA	2	6	330354	330359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324485
9015	NC_015726	CGC	2	6	330361	330366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9016	NC_015726	CG	3	6	330383	330388	0 %	0 %	50 %	50 %	339324485
9017	NC_015726	CTG	2	6	330389	330394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9018	NC_015726	GC	3	6	330399	330404	0 %	0 %	50 %	50 %	339324485
9019	NC_015726	GC	3	6	330498	330503	0 %	0 %	50 %	50 %	339324485
9020	NC_015726	GCA	3	9	330559	330567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9021	NC_015726	CGG	2	6	330600	330605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324485
9022	NC_015726	GGC	2	6	330644	330649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324485
9023	NC_015726	GCA	2	6	330663	330668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9024	NC_015726	GCT	2	6	330681	330686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9025	NC_015726	GCAC	2	8	330695	330702	25 %	0 %	25 %	50 %	339324485
9026	NC_015726	CGC	2	6	330732	330737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324485
9027	NC_015726	GCT	2	6	330749	330754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9028	NC_015726	CTG	2	6	330792	330797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324485
9029	NC_015726	GC	3	6	330808	330813	0 %	0 %	50 %	50 %	339324485
9030	NC_015726	GCC	2	6	330869	330874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324486
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9032	NC_015726	CTGG	2	8	330938	330945	0 %	25 %	50 %	25 %	339324486
9033	NC_015726	CGC	2	6	330956	330961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324486
9034	NC_015726	GC	3	6	330970	330975	0 %	0 %	50 %	50 %	339324486
9035	NC_015726	GGCGC	2	10	331094	331103	0 %	0 %	60 %	40 %	339324486
9036	NC_015726	CGG	2	6	331126	331131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324486
9037	NC_015726	GCG	2	6	331134	331139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324486
9038	NC_015726	CCGC	2	8	331178	331185	0 %	0 %	25 %	75 %	339324487
9039	NC_015726	CGCC	2	8	331195	331202	0 %	0 %	25 %	75 %	339324487
9040	NC_015726	TCGCC	2	10	331212	331221	0 %	20 %	20 %	60 %	339324487
9041	NC_015726	GCG	2	6	331229	331234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324487
9042	NC_015726	GTA	2	6	331291	331296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324487
9043	NC_015726	CGCGC	2	10	331327	331336	0 %	0 %	40 %	60 %	339324487
9044	NC_015726	GCCTGC	2	12	331343	331354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324487
9045	NC_015726	GTGCA	2	10	331364	331373	20 %	20 %	40 %	20 %	339324487
9046	NC_015726	CG	4	8	331434	331441	0 %	0 %	50 %	50 %	339324487
9047	NC_015726	CAC	2	6	331459	331464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324487
9048	NC_015726	CGGG	2	8	331479	331486	0 %	0 %	75 %	25 %	339324487
9049	NC_015726	CGA	2	6	331656	331661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324487
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9052	NC_015726	GCC	5	15	331831	331845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324487
9053	NC_015726	GGCC	2	8	331849	331856	0 %	0 %	50 %	50 %	339324487
9054	NC_015726	GTG	2	6	331867	331872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324487
9055	NC_015726	GCC	2	6	331915	331920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324487
9056	NC_015726	CGG	2	6	331941	331946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324487
9057	NC_015726	CGG	2	6	331972	331977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324487
9058	NC_015726	CAG	2	6	331978	331983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324487
9059	NC_015726	CGG	2	6	332023	332028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324487
9060	NC_015726	CAG	2	6	332035	332040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324487
9061	NC_015726	GGT	2	6	332190	332195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324487
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9063	NC_015726	GC	3	6	332228	332233	0 %	0 %	50 %	50 %	339324487
9064	NC_015726	CGA	2	6	332274	332279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324487
9065	NC_015726	CGG	2	6	332326	332331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324487
9066	NC_015726	GCC	2	6	332404	332409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_015726	GGC	2	6	332416	332421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_015726	CAGG	2	8	332425	332432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9069	NC_015726	CGCCGG	2	12	332487	332498	0 %	0 %	50 %	50 %	339324488
9070	NC_015726	CGGCG	2	10	332508	332517	0 %	0 %	60 %	40 %	339324488
9071	NC_015726	TCC	2	6	332546	332551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324488
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9073	NC_015726	CG	3	6	332601	332606	0 %	0 %	50 %	50 %	339324488
9074	NC_015726	TCA	2	6	332637	332642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324488
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9076	NC_015726	T	7	7	332654	332660	0 %	100 %	0 %	0 %	339324488
9077	NC_015726	TCGG	2	8	332726	332733	0 %	25 %	50 %	25 %	339324488
9078	NC_015726	GC	3	6	332795	332800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9079	NC_015726	GC	3	6	332833	332838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9080	NC_015726	TG	3	6	332844	332849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_015726	TGGCA	2	10	333044	333053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9082	NC_015726	AGT	2	6	333059	333064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_015726	GCCT	2	8	333071	333078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9084	NC_015726	GAA	2	6	333131	333136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_015726	GAA	2	6	333143	333148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324489
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9087	NC_015726	GCCGCG	2	12	333237	333248	0 %	0 %	50 %	50 %	339324489
9088	NC_015726	CGC	2	6	333262	333267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324489
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9091	NC_015726	TGC	2	6	333526	333531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324489
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9094	NC_015726	CAAG	2	8	333854	333861	50 %	0 %	25 %	25 %	339324489
9095	NC_015726	GGC	3	9	333902	333910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324489
9096	NC_015726	GCCC	2	8	333966	333973	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9097	NC_015726	TGA	2	6	333986	333991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324490
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9102	NC_015726	TCG	2	6	334142	334147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324490
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9105	NC_015726	ATCCGC	2	12	334285	334296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339324490
9106	NC_015726	CGG	2	6	334308	334313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324490
9107	NC_015726	CACAA	2	10	334338	334347	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9108	NC_015726	CGGC	2	8	334388	334395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9109	NC_015726	CGG	2	6	334418	334423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_015726	GCCG	2	8	334440	334447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9111	NC_015726	GCCG	2	8	334461	334468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9112	NC_015726	GCC	2	6	334486	334491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_015726	CCG	2	6	334493	334498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_015726	C	6	6	334499	334504	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9115	NC_015726	GCT	2	6	334535	334540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9117	NC_015726	GCC	2	6	334574	334579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9118	NC_015726	GCC	3	9	334592	334600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_015726	GCCG	2	8	334603	334610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9120	NC_015726	CAA	2	6	334621	334626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_015726	GCT	2	6	334642	334647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9122	NC_015726	TGA	2	6	334671	334676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324491
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9125	NC_015726	TGG	2	6	334767	334772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324491
9126	NC_015726	GCT	2	6	334774	334779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324491
9127	NC_015726	CTT	2	6	334825	334830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324491
9128	NC_015726	CGG	2	6	334831	334836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324491
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9130	NC_015726	GGC	2	6	334879	334884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324491
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9134	NC_015726	CGC	2	6	335098	335103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324491
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9161	NC_015726	T	6	6	336000	336005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9162	NC_015726	GGA	2	6	336081	336086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9163	NC_015726	CTC	2	6	336096	336101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9164	NC_015726	C	6	6	336145	336150	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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9169	NC_015726	CGGC	2	8	336328	336335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9171	NC_015726	G	7	7	336402	336408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9172	NC_015726	GGAT	2	8	336468	336475	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9173	NC_015726	TCA	2	6	336489	336494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324492
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9183	NC_015726	ACCGA	2	10	336884	336893	40 %	0 %	20 %	40 %	339324492
9184	NC_015726	TGG	2	6	336924	336929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324492
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9211	NC_015726	GTG	2	6	337700	337705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324492
9212	NC_015726	GGC	2	6	337723	337728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324492
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9228	NC_015726	ACG	2	6	338357	338362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324493
9229	NC_015726	CTG	2	6	338425	338430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324493
9230	NC_015726	CGG	2	6	338433	338438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324493
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9232	NC_015726	GC	3	6	338461	338466	0 %	0 %	50 %	50 %	339324493
9233	NC_015726	CGG	2	6	338505	338510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324493
9234	NC_015726	CG	3	6	338518	338523	0 %	0 %	50 %	50 %	339324493
9235	NC_015726	CCGCGA	2	12	338538	338549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324493
9236	NC_015726	CTG	3	9	338590	338598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324493
9237	NC_015726	GGC	2	6	338694	338699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324493
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9239	NC_015726	GCCGG	2	10	338749	338758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9240	NC_015726	GCC	2	6	338775	338780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9241	NC_015726	CAT	2	6	338812	338817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324494
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9243	NC_015726	ATC	2	6	338831	338836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324494
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9245	NC_015726	GCC	2	6	338873	338878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324494
9246	NC_015726	CGT	2	6	338944	338949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324494
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