MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 103346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_015726	GCC	2	6	313915	313920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8502	NC_015726	GCC	2	6	313928	313933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_015726	AGC	2	6	313953	313958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324467
8504	NC_015726	TAC	2	6	313959	313964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324467
8505	NC_015726	CAC	2	6	313968	313973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324467
8506	NC_015726	TCT	3	9	313975	313983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324467
8507	NC_015726	CTG	2	6	314012	314017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324467
8508	NC_015726	AAG	2	6	314055	314060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324467
8509	NC_015726	CGG	2	6	314084	314089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324467
8510	NC_015726	CAA	2	6	314108	314113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324467
8511	NC_015726	TGG	2	6	314152	314157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324467
8512	NC_015726	CGA	2	6	314204	314209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324467
8513	NC_015726	ATC	2	6	314211	314216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324467
8514	NC_015726	TGA	2	6	314227	314232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324467
8515	NC_015726	TGG	2	6	314257	314262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324467
8516	NC_015726	GAAC	2	8	314269	314276	50 %	0 %	25 %	25 %	339324467
8517	NC_015726	TTG	2	6	314297	314302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_015726	CGC	2	6	314314	314319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_015726	CGC	2	6	314334	314339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8520	NC_015726	T	7	7	314355	314361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_015726	GCC	2	6	314379	314384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_015726	GCTT	2	8	314389	314396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8523	NC_015726	CAT	2	6	314415	314420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324468
8524	NC_015726	CCG	2	6	314456	314461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324468
8525	NC_015726	CGAT	2	8	314465	314472	25 %	25 %	25 %	25 %	339324468
8526	NC_015726	CG	3	6	314501	314506	0 %	0 %	50 %	50 %	339324468
8527	NC_015726	TGG	2	6	314516	314521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324468
8528	NC_015726	CGCATC	2	12	314522	314533	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339324468
8529	NC_015726	CGG	2	6	314541	314546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324468
8530	NC_015726	ACA	2	6	314555	314560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324468
8531	NC_015726	GC	3	6	314578	314583	0 %	0 %	50 %	50 %	339324468
8532	NC_015726	GGC	2	6	314635	314640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324468
8533	NC_015726	GAC	2	6	314677	314682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8534	NC_015726	CTG	2	6	314683	314688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8535	NC_015726	GTG	2	6	314692	314697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324468
8536	NC_015726	CAG	2	6	314710	314715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8537	NC_015726	CAC	2	6	314784	314789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324468
8538	NC_015726	CGC	2	6	314800	314805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324468
8539	NC_015726	CTGGTG	2	12	314836	314847	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339324468
8540	NC_015726	CCG	2	6	314852	314857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324468
8541	NC_015726	GAC	2	6	314917	314922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8542	NC_015726	GCCC	2	8	314953	314960	0 %	0 %	25 %	75 %	339324468
8543	NC_015726	GTGATC	2	12	314974	314985	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339324468
8544	NC_015726	TTTC	2	8	315000	315007	0 %	75 %	0 %	25 %	339324468
8545	NC_015726	AGC	2	6	315029	315034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8546	NC_015726	TCG	2	6	315035	315040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324468
8547	NC_015726	CGC	2	6	315069	315074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8548	NC_015726	CTT	2	6	315098	315103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_015726	CGC	2	6	315167	315172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
8550	NC_015726	CGC	3	9	315176	315184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
8551	NC_015726	CGT	2	6	315185	315190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8552	NC_015726	GCC	2	6	315195	315200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
8553	NC_015726	GCC	2	6	315207	315212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
8554	NC_015726	CG	3	6	315311	315316	0 %	0 %	50 %	50 %	339324469
8555	NC_015726	TGA	2	6	315343	315348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324469
8556	NC_015726	GGT	2	6	315404	315409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324469
8557	NC_015726	CGA	2	6	315440	315445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8558	NC_015726	CAA	2	6	315467	315472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324469
8559	NC_015726	CTG	3	9	315492	315500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8560	NC_015726	ACG	2	6	315523	315528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8561	NC_015726	CGCTGG	2	12	315532	315543	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324469
8562	NC_015726	GGA	2	6	315563	315568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324469
8563	NC_015726	TCG	2	6	315574	315579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8564	NC_015726	GAT	2	6	315581	315586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324469
8565	NC_015726	GAA	2	6	315614	315619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324469
8566	NC_015726	CCCGA	2	10	315648	315657	20 %	0 %	20 %	60 %	339324469
8567	NC_015726	ACC	2	6	315666	315671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324469
8568	NC_015726	TAC	2	6	315723	315728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324469
8569	NC_015726	CAACCG	2	12	315776	315787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339324469
8570	NC_015726	CTG	2	6	315789	315794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8571	NC_015726	CGACC	2	10	315800	315809	20 %	0 %	20 %	60 %	339324469
8572	NC_015726	CCG	2	6	315841	315846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
8573	NC_015726	TCG	2	6	315861	315866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8574	NC_015726	CGC	2	6	315903	315908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
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8578	NC_015726	CTG	2	6	316155	316160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8579	NC_015726	CGG	2	6	316174	316179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324469
8580	NC_015726	CAG	2	6	316182	316187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324469
8581	NC_015726	CAA	2	6	316217	316222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324469
8582	NC_015726	GGT	2	6	316238	316243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324469
8583	NC_015726	GAA	2	6	316251	316256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324469
8584	NC_015726	CTT	2	6	316271	316276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324469
8585	NC_015726	GCC	2	6	316279	316284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324469
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8587	NC_015726	GC	3	6	316342	316347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_015726	GCG	2	6	316351	316356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8589	NC_015726	CAA	2	6	316410	316415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324470
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8591	NC_015726	TCG	2	6	316514	316519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324470
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8594	NC_015726	CGA	2	6	316638	316643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324470
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8597	NC_015726	TCG	2	6	316785	316790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8599	NC_015726	GCC	2	6	316839	316844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8600	NC_015726	TGG	2	6	316873	316878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_015726	CTG	2	6	316940	316945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324471
8602	NC_015726	CGC	2	6	316946	316951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324471
8603	NC_015726	GC	3	6	317023	317028	0 %	0 %	50 %	50 %	339324471
8604	NC_015726	GCC	2	6	317054	317059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324471
8605	NC_015726	CG	6	12	317081	317092	0 %	0 %	50 %	50 %	339324471
8606	NC_015726	TCG	2	6	317238	317243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324471
8607	NC_015726	ACT	2	6	317244	317249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324471
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8614	NC_015726	TCGA	2	8	317645	317652	25 %	25 %	25 %	25 %	339324471
8615	NC_015726	CGC	2	6	317677	317682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324471
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8617	NC_015726	GCA	2	6	317827	317832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324471
8618	NC_015726	CCGCG	2	10	317839	317848	0 %	0 %	40 %	60 %	339324471
8619	NC_015726	CG	4	8	317845	317852	0 %	0 %	50 %	50 %	339324471
8620	NC_015726	GCT	2	6	317884	317889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324471
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8872	NC_015726	AAC	2	6	325448	325453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324480
8873	NC_015726	CGC	2	6	325525	325530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324480
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8884	NC_015726	CG	3	6	325929	325934	0 %	0 %	50 %	50 %	339324481
8885	NC_015726	CGCCT	2	10	325950	325959	0 %	20 %	20 %	60 %	339324481
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8997	NC_015726	TGC	2	6	329799	329804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324484
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8999	NC_015726	GCC	2	6	329847	329852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9000	NC_015726	GGC	2	6	329857	329862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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