MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 9345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015724	TGG	2	6	241494	241499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323996
5502	NC_015724	GCA	2	6	241530	241535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323996
5503	NC_015724	CGC	2	6	241611	241616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323996
5504	NC_015724	TGA	2	6	241623	241628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323996
5505	NC_015724	CGA	2	6	241656	241661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323996
5506	NC_015724	GTG	2	6	241673	241678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323996
5507	NC_015724	TCG	2	6	241683	241688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323996
5508	NC_015724	GTTC	2	8	241749	241756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_015724	CG	3	6	241784	241789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_015724	GCG	3	9	241813	241821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323997
5511	NC_015724	GCC	2	6	241824	241829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323997
5512	NC_015724	TGA	2	6	241846	241851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323997
5513	NC_015724	GCT	2	6	241939	241944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323997
5514	NC_015724	CGT	2	6	241964	241969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323997
5515	NC_015724	ATGA	2	8	242030	242037	50 %	25 %	25 %	0 %	339323997
5516	NC_015724	GCC	3	9	242058	242066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323997
5517	NC_015724	GCC	2	6	242108	242113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323997
5518	NC_015724	CGA	2	6	242119	242124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323997
5519	NC_015724	CGGC	2	8	242133	242140	0 %	0 %	50 %	50 %	339323997
5520	NC_015724	TCC	2	6	242178	242183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323997
5521	NC_015724	TCG	2	6	242277	242282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323997
5522	NC_015724	GC	3	6	242337	242342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_015724	CAC	2	6	242400	242405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323998
5524	NC_015724	ACG	2	6	242551	242556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323998
5525	NC_015724	GCGG	2	8	242557	242564	0 %	0 %	75 %	25 %	339323998
5526	NC_015724	GCTG	2	8	242663	242670	0 %	25 %	50 %	25 %	339323998
5527	NC_015724	GCC	2	6	242754	242759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323998
5528	NC_015724	CGTC	2	8	242765	242772	0 %	25 %	25 %	50 %	339323998
5529	NC_015724	GCC	2	6	242784	242789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323998
5530	NC_015724	TGC	2	6	242803	242808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323998
5531	NC_015724	GGT	2	6	242856	242861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323998
5532	NC_015724	CAGC	2	8	243008	243015	25 %	0 %	25 %	50 %	339323998
5533	NC_015724	GC	3	6	243056	243061	0 %	0 %	50 %	50 %	339323998
5534	NC_015724	AGC	2	6	243073	243078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323998
5535	NC_015724	GCCGG	2	10	243138	243147	0 %	0 %	60 %	40 %	339323998
5536	NC_015724	CGA	2	6	243152	243157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323998
5537	NC_015724	CCA	2	6	243194	243199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323998
5538	NC_015724	GC	4	8	243201	243208	0 %	0 %	50 %	50 %	339323998
5539	NC_015724	CCG	2	6	243223	243228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323998
5540	NC_015724	GAAC	2	8	243230	243237	50 %	0 %	25 %	25 %	339323998
5541	NC_015724	CAC	2	6	243240	243245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323998
5542	NC_015724	CCG	2	6	243295	243300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323998
5543	NC_015724	TGA	2	6	243314	243319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323998
5544	NC_015724	ATGA	2	8	243383	243390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015724	GCGG	2	8	243421	243428	0 %	0 %	75 %	25 %	339323999
5546	NC_015724	ATG	2	6	243432	243437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323999
5547	NC_015724	CGA	2	6	243470	243475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323999
5548	NC_015724	GCA	2	6	243499	243504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323999
5549	NC_015724	TGC	2	6	243510	243515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323999
5550	NC_015724	CACCGG	2	12	243527	243538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339323999
5551	NC_015724	CGC	2	6	243546	243551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_015724	GCT	2	6	243562	243567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015724	CCGTG	2	10	243578	243587	0 %	20 %	40 %	40 %	339324000
5554	NC_015724	CGGCAG	2	12	243593	243604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339324000
5555	NC_015724	CAGC	2	8	243661	243668	25 %	0 %	25 %	50 %	339324000
5556	NC_015724	CGA	2	6	243682	243687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324000
5557	NC_015724	ACC	3	9	243717	243725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324000
5558	NC_015724	TCA	2	6	243751	243756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324000
5559	NC_015724	CG	3	6	243791	243796	0 %	0 %	50 %	50 %	339324000
5560	NC_015724	GACGTT	2	12	243851	243862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	339324000
5561	NC_015724	CAG	2	6	243884	243889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324000
5562	NC_015724	CTG	2	6	243900	243905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324000
5563	NC_015724	GCACGC	2	12	243925	243936	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324000
5564	NC_015724	CAGG	2	8	243941	243948	25 %	0 %	50 %	25 %	339324000
5565	NC_015724	GCC	2	6	243972	243977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324000
5566	NC_015724	AGGC	2	8	243993	244000	25 %	0 %	50 %	25 %	339324000
5567	NC_015724	GATC	2	8	244045	244052	25 %	25 %	25 %	25 %	339324000
5568	NC_015724	GCA	3	9	244115	244123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324001
5569	NC_015724	GCC	2	6	244157	244162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324001
5570	NC_015724	GGCC	2	8	244245	244252	0 %	0 %	50 %	50 %	339324001
5571	NC_015724	CCG	2	6	244275	244280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324001
5572	NC_015724	CAT	2	6	244286	244291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324001
5573	NC_015724	GCG	2	6	244397	244402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324001
5574	NC_015724	CG	3	6	244409	244414	0 %	0 %	50 %	50 %	339324001
5575	NC_015724	CAG	2	6	244443	244448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324001
5576	NC_015724	TCG	2	6	244519	244524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324001
5577	NC_015724	GC	3	6	244572	244577	0 %	0 %	50 %	50 %	339324001
5578	NC_015724	CGC	2	6	244607	244612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324001
5579	NC_015724	GCGG	2	8	244626	244633	0 %	0 %	75 %	25 %	339324001
5580	NC_015724	GGT	2	6	244649	244654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324001
5581	NC_015724	GAT	2	6	244677	244682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324002
5582	NC_015724	GC	3	6	244715	244720	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5583	NC_015724	CGA	2	6	244723	244728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324002
5584	NC_015724	GGC	2	6	244742	244747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324002
5585	NC_015724	CCA	2	6	244753	244758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324002
5586	NC_015724	GGC	2	6	244801	244806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324002
5587	NC_015724	TGG	2	6	244842	244847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324002
5588	NC_015724	GCA	2	6	244874	244879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324002
5589	NC_015724	AGC	2	6	244885	244890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324002
5590	NC_015724	CG	4	8	244964	244971	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5591	NC_015724	CAC	2	6	244979	244984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324002
5592	NC_015724	GCG	2	6	245001	245006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324002
5593	NC_015724	GCCGC	2	10	245018	245027	0 %	0 %	40 %	60 %	339324002
5594	NC_015724	GCCG	2	8	245059	245066	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5595	NC_015724	TGT	2	6	245263	245268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324002
5596	NC_015724	GC	3	6	245273	245278	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5597	NC_015724	GC	3	6	245306	245311	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5598	NC_015724	CGG	2	6	245335	245340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324002
5599	NC_015724	GC	3	6	245347	245352	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5600	NC_015724	GGT	2	6	245372	245377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324002
5601	NC_015724	CG	3	6	245403	245408	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5602	NC_015724	CCA	2	6	245464	245469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324002
5603	NC_015724	CGC	2	6	245473	245478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324002
5604	NC_015724	CGC	2	6	245500	245505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324002
5605	NC_015724	GC	3	6	245519	245524	0 %	0 %	50 %	50 %	339324002
5606	NC_015724	CGA	2	6	245575	245580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324002
5607	NC_015724	ACGC	2	8	245591	245598	25 %	0 %	25 %	50 %	339324002
5608	NC_015724	CA	3	6	245608	245613	50 %	0 %	0 %	50 %	339324002
5609	NC_015724	CTGG	2	8	245621	245628	0 %	25 %	50 %	25 %	339324002
5610	NC_015724	TGCCGA	2	12	245653	245664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324002
5611	NC_015724	GAT	2	6	245765	245770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324002
5612	NC_015724	TGG	2	6	245854	245859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324002
5613	NC_015724	GGT	2	6	245894	245899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324002
5614	NC_015724	CCA	2	6	246007	246012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324002
5615	NC_015724	GCC	2	6	246120	246125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324003
5616	NC_015724	TGA	2	6	246139	246144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324003
5617	NC_015724	TCGA	2	8	246214	246221	25 %	25 %	25 %	25 %	339324003
5618	NC_015724	CGT	2	6	246269	246274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324003
5619	NC_015724	GGC	2	6	246291	246296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324003
5620	NC_015724	GC	3	6	246295	246300	0 %	0 %	50 %	50 %	339324003
5621	NC_015724	AGA	2	6	246332	246337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324003
5622	NC_015724	TCA	2	6	246373	246378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324003
5623	NC_015724	GCC	2	6	246394	246399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324003
5624	NC_015724	CGT	2	6	246404	246409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324003
5625	NC_015724	GC	3	6	246420	246425	0 %	0 %	50 %	50 %	339324003
5626	NC_015724	CGG	2	6	246443	246448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324003
5627	NC_015724	CGT	2	6	246482	246487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324003
5628	NC_015724	CGA	2	6	246579	246584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324003
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5630	NC_015724	GAA	2	6	246654	246659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324003
5631	NC_015724	GC	3	6	246665	246670	0 %	0 %	50 %	50 %	339324003
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5635	NC_015724	CGG	2	6	246831	246836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324003
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5654	NC_015724	GC	3	6	247858	247863	0 %	0 %	50 %	50 %	339324004
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5663	NC_015724	CAG	3	9	248215	248223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324005
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5700	NC_015724	GCT	2	6	249559	249564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5728	NC_015724	CAATA	2	10	251006	251015	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5729	NC_015724	AAT	2	6	251025	251030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339324007
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5732	NC_015724	CGCAG	2	10	251102	251111	20 %	0 %	40 %	40 %	339324007
5733	NC_015724	GTC	2	6	251125	251130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324007
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5741	NC_015724	CGA	2	6	251511	251516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324007
5742	NC_015724	GAT	2	6	251565	251570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324007
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5744	NC_015724	GC	3	6	251703	251708	0 %	0 %	50 %	50 %	339324007
5745	NC_015724	GCCG	2	8	251730	251737	0 %	0 %	50 %	50 %	339324007
5746	NC_015724	CGC	2	6	251777	251782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5749	NC_015724	CGT	2	6	251857	251862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5843	NC_015724	ATT	2	6	255965	255970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5844	NC_015724	GCCG	2	8	256009	256016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5845	NC_015724	GCG	2	6	256062	256067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5852	NC_015724	GCG	2	6	256307	256312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5853	NC_015724	CCGGCC	2	12	256371	256382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5855	NC_015724	GGA	2	6	256412	256417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5856	NC_015724	GCCGGC	2	12	256469	256480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5857	NC_015724	GCT	2	6	256490	256495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5859	NC_015724	CCGA	2	8	256556	256563	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5861	NC_015724	CGG	2	6	256577	256582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5862	NC_015724	CTG	3	9	256615	256623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324010
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5865	NC_015724	ATCGG	2	10	256761	256770	20 %	20 %	40 %	20 %	339324010
5866	NC_015724	CAG	2	6	256772	256777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324010
5867	NC_015724	AGC	2	6	256778	256783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324010
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5993	NC_015724	CGG	2	6	262667	262672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324016
5994	NC_015724	CTA	2	6	262718	262723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324016
5995	NC_015724	GCG	2	6	262771	262776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324016
5996	NC_015724	CTC	2	6	262796	262801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324016
5997	NC_015724	CCG	2	6	262813	262818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324016
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