MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 70265

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015723	CG	3	6	141225	141230	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4002	NC_015723	CGA	2	6	141232	141237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4003	NC_015723	CGG	3	9	141268	141276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4004	NC_015723	GGC	2	6	141343	141348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4005	NC_015723	CGG	2	6	141381	141386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4006	NC_015723	CCG	3	9	141393	141401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4007	NC_015723	GCT	2	6	141430	141435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4008	NC_015723	GCG	3	9	141465	141473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4009	NC_015723	CTT	2	6	141487	141492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321453
4010	NC_015723	GCC	2	6	141513	141518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4011	NC_015723	GCC	2	6	141545	141550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4012	NC_015723	GCC	2	6	141580	141585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4013	NC_015723	CGC	2	6	141613	141618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4014	NC_015723	CGCGG	2	10	141629	141638	0 %	0 %	60 %	40 %	339321453
4015	NC_015723	CCGGCG	2	12	141678	141689	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4016	NC_015723	GCC	2	6	141701	141706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4017	NC_015723	TGG	2	6	141711	141716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321453
4018	NC_015723	CTGG	2	8	141724	141731	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4019	NC_015723	GC	3	6	141753	141758	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4020	NC_015723	TGC	2	6	141765	141770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4021	NC_015723	CTG	2	6	141842	141847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4022	NC_015723	ACG	2	6	141849	141854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4023	NC_015723	CG	3	6	141853	141858	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4024	NC_015723	TGG	2	6	141890	141895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321453
4025	NC_015723	GCT	2	6	141901	141906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4026	NC_015723	GCTG	2	8	141928	141935	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4027	NC_015723	GCC	2	6	141943	141948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4028	NC_015723	CG	3	6	141975	141980	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4029	NC_015723	CGC	2	6	142020	142025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4030	NC_015723	GCT	2	6	142036	142041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4031	NC_015723	TGC	2	6	142050	142055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4032	NC_015723	GC	3	6	142064	142069	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4033	NC_015723	GCT	2	6	142162	142167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4034	NC_015723	GCC	2	6	142190	142195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4035	NC_015723	CGTG	2	8	142201	142208	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4036	NC_015723	CG	3	6	142212	142217	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4037	NC_015723	GC	3	6	142227	142232	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4038	NC_015723	TGGC	2	8	142247	142254	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4039	NC_015723	CGCA	2	8	142279	142286	25 %	0 %	25 %	50 %	339321453
4040	NC_015723	CCA	2	6	142303	142308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321453
4041	NC_015723	CAC	2	6	142313	142318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321453
4042	NC_015723	GCG	2	6	142328	142333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4043	NC_015723	GCCG	2	8	142397	142404	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4044	NC_015723	GCA	2	6	142410	142415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4046	NC_015723	TG	3	6	142437	142442	0 %	50 %	50 %	0 %	339321453
4047	NC_015723	GCT	2	6	142459	142464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4048	NC_015723	GGCG	2	8	142465	142472	0 %	0 %	75 %	25 %	339321453
4049	NC_015723	GGC	2	6	142477	142482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4050	NC_015723	CTG	2	6	142493	142498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4051	NC_015723	CTGG	2	8	142561	142568	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4052	NC_015723	CCGGC	2	10	142587	142596	0 %	0 %	40 %	60 %	339321453
4053	NC_015723	GTG	2	6	142613	142618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321453
4054	NC_015723	CTGGCG	2	12	142622	142633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339321453
4055	NC_015723	TGG	3	9	142635	142643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321453
4056	NC_015723	GCG	2	6	142691	142696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
4057	NC_015723	CG	3	6	142706	142711	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4058	NC_015723	GCC	2	6	142744	142749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321453
4059	NC_015723	CGA	2	6	142755	142760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4062	NC_015723	GGC	3	9	142987	142995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321453
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4065	NC_015723	TGC	2	6	143042	143047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4069	NC_015723	TGC	2	6	143172	143177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4071	NC_015723	CGT	2	6	143214	143219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4073	NC_015723	GGCG	2	8	143243	143250	0 %	0 %	75 %	25 %	339321453
4074	NC_015723	TGGC	2	8	143294	143301	0 %	25 %	50 %	25 %	339321453
4075	NC_015723	CGCA	2	8	143321	143328	25 %	0 %	25 %	50 %	339321453
4076	NC_015723	TAC	2	6	143330	143335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321453
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4078	NC_015723	CGCGG	2	10	143370	143379	0 %	0 %	60 %	40 %	339321453
4079	NC_015723	ACA	2	6	143412	143417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321453
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4082	NC_015723	GC	3	6	143531	143536	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4083	NC_015723	CCA	2	6	143577	143582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321453
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4086	NC_015723	TGC	2	6	143661	143666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
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4088	NC_015723	TGC	2	6	143727	143732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4089	NC_015723	GCCG	2	8	143758	143765	0 %	0 %	50 %	50 %	339321453
4090	NC_015723	AGG	2	6	143805	143810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321453
4091	NC_015723	TTC	2	6	143825	143830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321453
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4093	NC_015723	CTG	2	6	143912	143917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321453
4094	NC_015723	GAG	2	6	143922	143927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321453
4095	NC_015723	GCCG	2	8	143965	143972	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4096	NC_015723	CAG	2	6	143993	143998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321454
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4099	NC_015723	CG	3	6	144073	144078	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4100	NC_015723	GGCC	2	8	144097	144104	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4101	NC_015723	GGC	3	9	144110	144118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321454
4102	NC_015723	CG	3	6	144124	144129	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4103	NC_015723	GCT	3	9	144163	144171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321454
4104	NC_015723	CGT	2	6	144191	144196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321454
4105	NC_015723	G	6	6	144199	144204	0 %	0 %	100 %	0 %	339321454
4106	NC_015723	GC	3	6	144209	144214	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4107	NC_015723	GC	3	6	144280	144285	0 %	0 %	50 %	50 %	339321454
4108	NC_015723	TCGA	2	8	144315	144322	25 %	25 %	25 %	25 %	339321454
4109	NC_015723	CAGGA	2	10	144384	144393	40 %	0 %	40 %	20 %	339321454
4110	NC_015723	CGC	2	6	144403	144408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321454
4111	NC_015723	GCG	2	6	144414	144419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321454
4112	NC_015723	TCG	2	6	144447	144452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321454
4113	NC_015723	CAC	2	6	144470	144475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321454
4114	NC_015723	AAC	2	6	144489	144494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321454
4115	NC_015723	GGC	2	6	144548	144553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321454
4116	NC_015723	ACC	2	6	144576	144581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321454
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4118	NC_015723	CAG	2	6	144653	144658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321454
4119	NC_015723	GCGCG	2	10	144730	144739	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4120	NC_015723	CGC	2	6	144770	144775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_015723	GCC	2	6	144862	144867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_015723	CCA	2	6	144874	144879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_015723	GGCCA	2	10	144965	144974	20 %	0 %	40 %	40 %	339321455
4124	NC_015723	CTCG	2	8	144982	144989	0 %	25 %	25 %	50 %	339321455
4125	NC_015723	ACC	2	6	145020	145025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321455
4126	NC_015723	CTGG	2	8	145030	145037	0 %	25 %	50 %	25 %	339321455
4127	NC_015723	GCC	2	6	145070	145075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321455
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4129	NC_015723	GCG	2	6	145134	145139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321455
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4134	NC_015723	CG	4	8	145258	145265	0 %	0 %	50 %	50 %	339321455
4135	NC_015723	GCC	2	6	145272	145277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321455
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4140	NC_015723	GC	3	6	145604	145609	0 %	0 %	50 %	50 %	339321455
4141	NC_015723	GCA	3	9	145627	145635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321455
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4143	NC_015723	GAT	2	6	145685	145690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321455
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4146	NC_015723	CGTG	2	8	145771	145778	0 %	25 %	50 %	25 %	339321455
4147	NC_015723	ACC	2	6	145845	145850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321455
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4149	NC_015723	CGC	2	6	145876	145881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321455
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4153	NC_015723	AG	3	6	146043	146048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4154	NC_015723	GCA	2	6	146060	146065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_015723	CCA	2	6	146088	146093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4156	NC_015723	TCA	2	6	146100	146105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_015723	CGA	2	6	146125	146130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4160	NC_015723	ACG	2	6	146234	146239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321456
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4165	NC_015723	CG	3	6	146373	146378	0 %	0 %	50 %	50 %	339321456
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4202	NC_015723	TGC	2	6	147530	147535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321456
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4226	NC_015723	CG	3	6	148171	148176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4227	NC_015723	CAGCG	2	10	148233	148242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4228	NC_015723	CTGC	2	8	148317	148324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4229	NC_015723	GC	3	6	148323	148328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4230	NC_015723	GACAAC	2	12	148361	148372	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_015723	GCA	2	6	148394	148399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321457
4232	NC_015723	GC	3	6	148407	148412	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4233	NC_015723	CAT	2	6	148432	148437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321457
4234	NC_015723	CG	4	8	148453	148460	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4235	NC_015723	CCG	2	6	148465	148470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321457
4236	NC_015723	CGCCAA	2	12	148477	148488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339321457
4237	NC_015723	TGC	2	6	148521	148526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321457
4238	NC_015723	CTG	2	6	148529	148534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321457
4239	NC_015723	GCG	2	6	148551	148556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321457
4240	NC_015723	TGA	2	6	148569	148574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321457
4241	NC_015723	CG	4	8	148681	148688	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4242	NC_015723	GAC	2	6	148691	148696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321457
4243	NC_015723	GC	3	6	148702	148707	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4244	NC_015723	CG	3	6	148708	148713	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4245	NC_015723	GCC	2	6	148736	148741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321457
4246	NC_015723	ATC	2	6	148742	148747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321457
4247	NC_015723	GCG	2	6	148755	148760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321457
4248	NC_015723	CACC	2	8	148765	148772	25 %	0 %	0 %	75 %	339321457
4249	NC_015723	GGT	2	6	148777	148782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321457
4250	NC_015723	GCG	2	6	148791	148796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321457
4251	NC_015723	CAA	2	6	148828	148833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321457
4252	NC_015723	CAT	2	6	148861	148866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321457
4253	NC_015723	CGG	2	6	148963	148968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321457
4254	NC_015723	CGC	2	6	148973	148978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321457
4255	NC_015723	TGG	2	6	148989	148994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321457
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4257	NC_015723	GCC	2	6	149057	149062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321457
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4264	NC_015723	CGGC	2	8	149263	149270	0 %	0 %	50 %	50 %	339321457
4265	NC_015723	CAGCG	2	10	149285	149294	20 %	0 %	40 %	40 %	339321457
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4270	NC_015723	CCA	2	6	149419	149424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321457
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4274	NC_015723	CCGC	2	8	149481	149488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4275	NC_015723	GACA	2	8	149529	149536	50 %	0 %	25 %	25 %	339321458
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4281	NC_015723	CGGCCA	2	12	149766	149777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339321458
4282	NC_015723	GAT	2	6	149808	149813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321458
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4317	NC_015723	GCA	2	6	150984	150989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321459
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4356	NC_015723	ATC	2	6	152580	152585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321460
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4359	NC_015723	CG	4	8	152718	152725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4360	NC_015723	GCC	2	6	152732	152737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4361	NC_015723	CAA	2	6	152830	152835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321461
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4363	NC_015723	TGA	2	6	152892	152897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321461
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4365	NC_015723	GCCG	2	8	152923	152930	0 %	0 %	50 %	50 %	339321461
4366	NC_015723	CGA	2	6	152977	152982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321461
4367	NC_015723	CG	3	6	153027	153032	0 %	0 %	50 %	50 %	339321461
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4499	NC_015723	GTC	2	6	159499	159504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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